# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 2_10 - 232 ATP-synt_ab PF00006.20 215 0.00055 13.4 0.1 1 1 8.3e-06 0.0017 11.8 0.1 8 35 29 56 23 74 0.86 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_5 - 228 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 4.2e-05 16.9 0.0 1 2 0.00035 0.073 6.4 0.0 112 147 18 55 9 82 0.66 # 5506 # 6189 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 1_5 - 228 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 4.2e-05 16.9 0.0 2 2 7e-05 0.014 8.6 0.0 41 62 162 183 145 219 0.78 # 5506 # 6189 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 2_10 - 232 KaiC PF06745.8 227 0.00099 12.2 0.1 1 1 9.4e-06 0.002 11.2 0.1 7 35 25 52 22 66 0.88 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 4_13 - 426 K_oxygenase PF13434.1 341 6.2e-118 387.5 0.0 1 1 3.6e-120 7.5e-118 387.2 0.0 2 340 4 333 3 334 0.96 # 11620 # 12897 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 2_12 - 162 HTH_IclR PF09339.5 52 2.9e-07 24.0 0.5 1 2 0.0078 0.54 3.9 0.1 10 42 11 43 10 44 0.82 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 2_12 - 162 HTH_IclR PF09339.5 52 2.9e-07 24.0 0.5 2 2 2.5e-07 1.7e-05 18.3 0.0 16 38 66 88 61 91 0.87 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 3_4 - 341 HTH_IclR PF09339.5 52 6.2e-06 19.7 0.1 1 1 1.8e-07 1.2e-05 18.8 0.1 15 40 14 39 13 40 0.95 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 6_5 - 208 HTH_IclR PF09339.5 52 0.00033 14.2 0.1 1 1 9.2e-06 0.00063 13.3 0.1 7 48 8 48 7 51 0.91 # 1660 # 2283 # 1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.412 11_2 - 341 HHH_3 PF12836.2 65 0.00017 15.5 0.0 1 1 1.8e-06 0.00038 14.4 0.0 14 57 212 255 210 257 0.95 # 935 # 1957 # 1 # ID=11_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 2_10 - 232 ABC_tran PF00005.22 137 5e-36 118.0 0.0 1 1 1.4e-37 7.1e-36 117.5 0.0 1 136 26 171 26 172 0.92 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 4_3 - 276 ABC_tran PF00005.22 137 7.8e-30 97.9 0.0 1 1 2.2e-31 1.1e-29 97.4 0.0 1 136 23 170 23 171 0.89 # 1342 # 2169 # 1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 3_5 - 260 ABC_tran PF00005.22 137 0.0003 15.0 0.3 1 1 4.8e-05 0.0025 12.1 0.0 8 30 99 121 93 136 0.86 # 2565 # 3344 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 8_3 - 522 ABC_tran PF00005.22 137 0.00032 14.9 0.0 1 1 1.9e-05 0.00098 13.4 0.0 14 113 27 155 17 158 0.73 # 1496 # 3061 # -1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 3_17 - 119 HTH_22 PF13309.1 64 0.0013 12.4 0.0 1 1 4.1e-05 0.0042 10.8 0.0 28 64 8 39 1 39 0.80 # 15130 # 15486 # 1 # ID=3_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 3_4 - 341 HTH_22 PF13309.1 64 0.0014 12.3 0.0 1 1 2.6e-05 0.0027 11.4 0.0 46 64 21 39 10 39 0.89 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 14_4 - 183 TIGR01173 TIGR01173 452 3.6e-08 26.2 0.2 1 1 2.5e-10 5.2e-08 25.7 0.2 390 430 109 149 100 158 0.89 # 1894 # 2442 # 1 # ID=14_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 1_5 - 228 TIGR00095 TIGR00095 194 0.00079 12.7 0.0 1 2 0.0011 0.22 4.8 0.0 123 139 19 35 8 79 0.69 # 5506 # 6189 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 1_5 - 228 TIGR00095 TIGR00095 194 0.00079 12.7 0.0 2 2 0.00045 0.093 6.0 0.0 53 85 164 198 155 218 0.76 # 5506 # 6189 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 2_12 - 162 HTH_AsnC-type PF13404.1 42 2.3e-06 21.0 1.3 1 2 0.0041 0.29 4.7 0.1 9 35 10 37 10 44 0.91 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 2_12 - 162 HTH_AsnC-type PF13404.1 42 2.3e-06 21.0 1.3 2 2 8.3e-06 0.00057 13.4 0.1 12 35 63 86 60 87 0.84 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 15_2 - 102 HTH_AsnC-type PF13404.1 42 0.00069 13.1 0.2 1 1 3.9e-05 0.0027 11.2 0.0 18 36 74 92 70 96 0.89 # 666 # 971 # -1 # ID=15_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.569 3_4 - 341 HTH_AsnC-type PF13404.1 42 0.0012 12.3 0.0 1 1 4.5e-05 0.0031 11.0 0.0 18 36 18 36 15 40 0.91 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 11_2 - 341 HHH_5 PF14520.1 60 7.5e-05 16.8 0.0 1 1 1.2e-06 0.00026 15.1 0.0 6 49 213 253 210 257 0.91 # 935 # 1957 # 1 # ID=11_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_23 - 284 rve_3 PF13683.1 67 9.1e-18 57.6 0.0 1 1 4.5e-19 3.1e-17 55.9 0.0 1 67 205 271 205 271 0.98 # 16377 # 17228 # 1 # ID=1_23;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 13_5 - 283 rve_3 PF13683.1 67 8.9e-17 54.4 0.2 1 1 2.5e-18 1.7e-16 53.5 0.2 2 59 190 247 189 251 0.97 # 1986 # 2834 # 1 # ID=13_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 3_4 - 341 rve_3 PF13683.1 67 0.00089 12.7 0.1 1 1 4.8e-05 0.0033 10.9 0.0 6 65 220 287 215 288 0.87 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 3_5 - 260 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00028 14.3 0.1 1 1 8.2e-06 0.0017 11.8 0.1 18 53 98 133 82 198 0.72 # 2565 # 3344 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 3_17 - 119 HTH_DeoR PF08220.7 57 0.001 12.6 0.0 1 1 7.8e-06 0.0016 11.9 0.0 5 36 9 39 7 50 0.80 # 15130 # 15486 # 1 # ID=3_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 5_11 - 159 HTH_Tnp_Tc3_2 PF01498.13 72 0.00042 14.3 0.0 1 1 3.5e-06 0.00073 13.5 0.0 6 46 19 60 17 77 0.79 # 8125 # 8601 # 1 # ID=5_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 1_39 - 876 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 8.6e-06 19.3 0.2 1 2 4.1e-06 0.00042 13.7 0.0 39 63 476 504 463 507 0.84 # 28115 # 30742 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 1_39 - 876 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 8.6e-06 19.3 0.2 2 2 0.0077 0.79 3.0 0.1 75 167 530 626 529 632 0.85 # 28115 # 30742 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 2_10 - 232 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00027 14.4 0.0 1 1 7.6e-06 0.00079 12.9 0.0 37 60 35 58 14 77 0.81 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 2_12 - 162 HTH_40 PF14493.1 91 1.5e-05 19.1 1.1 1 1 2.3e-07 2.4e-05 18.5 0.2 9 65 63 119 56 143 0.81 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 3_4 - 341 HTH_40 PF14493.1 91 0.00038 14.6 0.0 1 1 7.6e-06 0.00079 13.6 0.0 4 35 8 39 5 69 0.91 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 13_3 - 181 Cytidylate_kin2 PF13189.1 179 0.0021 11.9 0.0 1 2 9.1e-05 0.019 8.8 0.0 1 22 2 23 2 44 0.81 # 1044 # 1586 # 1 # ID=13_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 13_3 - 181 Cytidylate_kin2 PF13189.1 179 0.0021 11.9 0.0 2 2 0.026 5.5 0.8 0.0 110 135 96 122 94 136 0.74 # 1044 # 1586 # 1 # ID=13_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 3_4 - 341 HTH_38 PF13936.1 44 2.7e-11 36.8 0.5 1 1 2.6e-12 1.1e-10 34.9 0.2 6 41 3 38 2 40 0.94 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 15_2 - 102 HTH_38 PF13936.1 44 2.3e-08 27.4 0.4 1 1 2.7e-09 1.1e-07 25.3 0.0 15 44 68 97 60 97 0.93 # 666 # 971 # -1 # ID=15_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.569 3_17 - 119 HTH_38 PF13936.1 44 5.3e-08 26.3 0.1 1 1 3.1e-09 1.3e-07 25.1 0.1 5 42 2 39 2 39 0.94 # 15130 # 15486 # 1 # ID=3_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 2_25 - 136 HTH_38 PF13936.1 44 9.3e-07 22.3 0.3 1 1 6.6e-08 2.8e-06 20.8 0.3 3 39 91 127 89 128 0.94 # 21788 # 22195 # -1 # ID=2_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.507 2_12 - 162 HTH_38 PF13936.1 44 3.5e-05 17.3 0.8 1 1 5.3e-06 0.00022 14.7 0.1 13 39 60 87 42 89 0.87 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 2_18 - 258 TIGR01830 TIGR01830 239 6.5e-47 153.8 1.0 1 1 3.7e-49 7.6e-47 153.6 1.0 2 239 11 253 10 253 0.91 # 16695 # 17468 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 1_39 - 876 MobB PF03205.9 140 0.00053 13.7 0.2 1 1 8.1e-05 0.0056 10.3 0.0 4 37 483 515 481 523 0.79 # 28115 # 30742 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 2_10 - 232 MobB PF03205.9 140 0.00055 13.6 0.0 1 1 1.4e-05 0.00099 12.8 0.0 3 20 39 56 37 108 0.84 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_57 - 730 MobB PF03205.9 140 0.0017 12.0 0.0 1 1 5.3e-05 0.0037 10.9 0.0 7 34 192 219 188 225 0.89 # 44127 # 46316 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 8_2 - 341 UvrD-helicase PF00580.16 315 2e-08 27.7 0.1 1 2 5.9e-06 0.0012 12.0 0.1 16 69 4 49 2 78 0.83 # 489 # 1511 # -1 # ID=8_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 8_2 - 341 UvrD-helicase PF00580.16 315 2e-08 27.7 0.1 2 2 2.6e-06 0.00054 13.2 0.0 242 294 115 170 96 174 0.86 # 489 # 1511 # -1 # ID=8_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 6_5 - 208 HTH_34 PF13601.1 80 2.6e-08 27.8 0.4 1 2 4.2e-08 8.7e-06 19.7 0.0 2 49 6 53 5 60 0.91 # 1660 # 2283 # 1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.412 6_5 - 208 HTH_34 PF13601.1 80 2.6e-08 27.8 0.4 2 2 0.00072 0.15 6.1 0.1 59 74 191 206 184 207 0.90 # 1660 # 2283 # 1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.412 2_12 - 162 MarR PF01047.17 59 4.6e-05 17.1 1.5 1 2 0.0012 0.13 6.0 0.2 9 41 10 43 8 44 0.84 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 2_12 - 162 MarR PF01047.17 59 4.6e-05 17.1 1.5 2 2 6.7e-05 0.007 10.1 0.1 8 37 59 88 52 89 0.83 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 6_5 - 208 MarR PF01047.17 59 0.00035 14.2 0.1 1 1 1.6e-05 0.0017 12.0 0.1 6 48 7 49 4 52 0.88 # 1660 # 2283 # 1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.412 4_13 - 426 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 4.6e-18 59.9 0.0 1 2 2e-16 4.1e-14 47.0 0.0 78 200 93 218 64 221 0.87 # 11620 # 12897 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 4_13 - 426 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 4.6e-18 59.9 0.0 2 2 2.2e-05 0.0046 10.9 0.0 48 172 234 375 225 381 0.65 # 11620 # 12897 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 6_8 - 223 TetR_N PF00440.18 47 3.3e-18 59.1 0.0 1 1 1.3e-19 5.4e-18 58.4 0.0 2 47 44 89 43 89 0.96 # 4284 # 4952 # -1 # ID=6_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.326 6_6 - 208 TetR_N PF00440.18 47 6.9e-18 58.0 0.0 1 2 4.3e-18 1.8e-16 53.5 0.0 2 47 10 55 9 55 0.97 # 2261 # 2884 # -1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 6_6 - 208 TetR_N PF00440.18 47 6.9e-18 58.0 0.0 2 2 0.04 1.7 2.4 0.0 1 15 169 183 169 185 0.86 # 2261 # 2884 # -1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 2_23 - 194 TetR_N PF00440.18 47 3.6e-13 42.9 0.0 1 1 1.6e-14 6.4e-13 42.1 0.0 1 46 9 54 9 55 0.94 # 20323 # 20904 # -1 # ID=2_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 12_4 - 195 TetR_N PF00440.18 47 6.8e-08 26.0 0.0 1 1 3.1e-09 1.3e-07 25.1 0.0 2 46 13 57 12 58 0.95 # 2359 # 2943 # 1 # ID=12_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.609 3_4 - 341 TetR_N PF00440.18 47 0.0015 12.2 0.2 1 1 8.6e-05 0.0035 10.9 0.0 16 36 17 37 16 43 0.86 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 1_58 - 1707 AAA_19 PF13245.1 76 2.5e-07 24.4 1.6 1 1 1.7e-08 8.9e-07 22.6 0.3 7 76 981 1047 974 1047 0.74 # 46316 # 51436 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 2_10 - 232 AAA_19 PF13245.1 76 0.00039 14.1 0.1 1 1 7.2e-05 0.0037 11.0 0.0 10 54 36 75 29 87 0.75 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 3_5 - 260 AAA_19 PF13245.1 76 0.00088 13.0 0.0 1 1 4.2e-05 0.0022 11.7 0.0 10 37 103 129 96 154 0.81 # 2565 # 3344 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 13_3 - 181 AAA_19 PF13245.1 76 0.00088 13.0 0.0 1 1 7e-05 0.0036 11.0 0.0 15 33 5 22 2 36 0.85 # 1044 # 1586 # 1 # ID=13_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 1_2 - 389 CbiA PF01656.18 195 2.1e-36 119.1 0.0 1 1 1.3e-38 2.8e-36 118.7 0.0 2 194 110 339 109 340 0.80 # 1344 # 2510 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 2_12 - 162 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 1.6e-08 27.9 0.6 1 2 2.3e-05 0.00096 12.6 0.0 27 51 20 44 18 47 0.90 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 2_12 - 162 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 1.6e-08 27.9 0.6 2 2 1.4e-05 0.00058 13.3 0.1 25 45 67 87 62 90 0.87 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 3_4 - 341 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 1.8e-07 24.5 0.0 1 1 9.3e-09 3.9e-07 23.4 0.0 25 48 16 39 12 40 0.94 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 15_2 - 102 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 1.6e-06 21.5 0.0 1 1 6.3e-08 2.6e-06 20.8 0.0 17 44 65 91 65 99 0.85 # 666 # 971 # -1 # ID=15_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.569 3_17 - 119 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 7.8e-05 16.1 0.0 1 1 3.1e-06 0.00013 15.4 0.0 31 47 22 38 9 39 0.92 # 15130 # 15486 # 1 # ID=3_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 1_28 - 230 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00056 13.3 0.0 1 1 2.7e-05 0.0011 12.4 0.0 26 48 169 191 159 194 0.84 # 21423 # 22112 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.338 1_1 - 252 Rep_3 PF01051.16 222 6.8e-50 163.6 0.0 1 1 7.5e-52 7.7e-50 163.4 0.0 3 222 16 242 14 242 0.91 # 1 # 756 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.474 3_15 - 326 Rep_3 PF01051.16 222 3.3e-33 109.0 0.1 1 1 4.3e-35 4.5e-33 108.6 0.1 3 214 10 265 8 271 0.90 # 13407 # 14384 # -1 # ID=3_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.522 1_23 - 284 rve PF00665.21 120 4.8e-30 98.1 0.0 1 1 1.4e-31 7.4e-30 97.5 0.0 2 120 118 234 117 234 0.97 # 16377 # 17228 # 1 # ID=1_23;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 13_5 - 283 rve PF00665.21 120 7.2e-25 81.4 0.1 1 1 4e-26 2.1e-24 79.9 0.0 2 118 104 216 103 218 0.95 # 1986 # 2834 # 1 # ID=13_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 3_4 - 341 rve PF00665.21 120 3e-22 72.9 0.0 1 1 1.1e-23 5.8e-22 72.0 0.0 3 118 118 242 117 244 0.96 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 16_1 - 235 rve PF00665.21 120 6.8e-13 42.7 0.1 1 2 0.059 3.1 1.9 0.0 78 102 27 49 6 54 0.84 # 31 # 735 # -1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 16_1 - 235 rve PF00665.21 120 6.8e-13 42.7 0.1 2 2 2.4e-13 1.3e-11 38.7 0.0 9 119 75 182 70 183 0.89 # 31 # 735 # -1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 3_5 - 260 AFG1_ATPase PF03969.11 362 0.00015 14.6 0.2 1 1 2.8e-06 0.00057 12.6 0.2 63 216 103 254 43 259 0.72 # 2565 # 3344 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_62 - 216 Terminase_5 PF06056.7 58 0.0009 12.8 0.0 1 1 2.5e-05 0.0026 11.3 0.0 16 44 115 143 113 150 0.93 # 53638 # 54285 # 1 # ID=1_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 3_4 - 341 Terminase_5 PF06056.7 58 0.0013 12.3 0.0 1 1 2.8e-05 0.0029 11.1 0.0 9 36 13 40 9 44 0.85 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 8_3 - 522 AAA_23 PF13476.1 202 6.8e-12 40.0 0.0 1 1 4.8e-13 3.3e-11 37.8 0.0 1 53 6 58 6 115 0.85 # 1496 # 3061 # -1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 4_3 - 276 AAA_23 PF13476.1 202 2.3e-05 18.7 0.2 1 1 5.7e-07 4e-05 17.9 0.2 21 40 35 54 22 64 0.86 # 1342 # 2169 # 1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 2_10 - 232 AAA_23 PF13476.1 202 0.001 13.3 0.0 1 1 2.1e-05 0.0015 12.8 0.0 19 39 36 56 18 94 0.84 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 13_3 - 181 AAA_24 PF13479.1 213 0.00021 14.9 0.0 1 1 1.2e-06 0.00026 14.5 0.0 6 33 3 34 1 99 0.87 # 1044 # 1586 # 1 # ID=13_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 1_5 - 228 Methyltransf_26 PF13659.1 117 4.5e-11 36.8 0.1 1 2 1e-06 7.2e-05 16.8 0.0 57 114 7 71 2 74 0.72 # 5506 # 6189 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 1_5 - 228 Methyltransf_26 PF13659.1 117 4.5e-11 36.8 0.1 2 2 4.3e-07 3e-05 18.0 0.0 4 44 167 206 164 222 0.82 # 5506 # 6189 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 1_15 - 84 Methyltransf_26 PF13659.1 117 2.1e-05 18.5 0.1 1 1 4.7e-07 3.2e-05 17.9 0.1 71 114 9 43 3 46 0.83 # 12207 # 12458 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.595 1_14 - 119 Methyltransf_26 PF13659.1 117 0.00018 15.5 0.1 1 1 4.9e-06 0.00034 14.6 0.0 4 44 54 95 51 114 0.89 # 11893 # 12249 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.577 13_3 - 181 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00017 14.7 0.0 1 2 2.1e-05 0.0043 10.1 0.0 19 50 3 32 1 39 0.78 # 1044 # 1586 # 1 # ID=13_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 13_3 - 181 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00017 14.7 0.0 2 2 0.0045 0.93 2.4 0.0 94 123 73 102 57 160 0.77 # 1044 # 1586 # 1 # ID=13_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 6_4 - 129 ACT_7 PF13840.1 65 0.00014 15.3 0.1 1 1 2e-06 0.00042 13.8 0.0 9 60 65 120 57 123 0.74 # 1203 # 1589 # 1 # ID=6_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.390 1_58 - 1707 AAA_30 PF13604.1 196 3.3e-42 138.2 22.3 1 2 1.8e-05 0.00094 12.7 3.7 7 132 420 539 416 559 0.83 # 46316 # 51436 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 1_58 - 1707 AAA_30 PF13604.1 196 3.3e-42 138.2 22.3 2 2 9.8e-44 5.1e-42 137.6 1.6 1 186 968 1156 968 1160 0.94 # 46316 # 51436 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 2_10 - 232 AAA_30 PF13604.1 196 0.00022 14.8 0.4 1 1 7.4e-06 0.00038 14.0 0.4 18 58 36 76 29 202 0.87 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 4_3 - 276 AAA_30 PF13604.1 196 0.0013 12.3 0.3 1 1 5.9e-05 0.003 11.0 0.1 15 53 30 68 21 83 0.74 # 1342 # 2169 # 1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 1_57 - 730 AAA_30 PF13604.1 196 0.0018 11.8 0.0 1 1 7.2e-05 0.0037 10.7 0.0 21 57 188 224 180 230 0.85 # 44127 # 46316 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 3_9 - 122 CPSase_L_D3 PF02787.14 123 0.0011 12.7 0.2 1 2 0.0027 0.56 3.9 0.0 5 31 11 37 8 49 0.85 # 7133 # 7498 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.522 3_9 - 122 CPSase_L_D3 PF02787.14 123 0.0011 12.7 0.2 2 2 0.00031 0.065 7.0 0.1 42 80 76 112 73 117 0.89 # 7133 # 7498 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.522 8_3 - 522 SMC_N PF02463.14 220 5.1e-11 36.1 0.0 1 2 4.2e-11 2.9e-09 30.4 0.0 2 69 4 67 3 79 0.85 # 1496 # 3061 # -1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 8_3 - 522 SMC_N PF02463.14 220 5.1e-11 36.1 0.0 2 2 0.0071 0.49 3.5 0.0 163 204 281 321 253 330 0.85 # 1496 # 3061 # -1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 2_10 - 232 SMC_N PF02463.14 220 5.9e-09 29.4 0.0 1 1 7e-09 4.8e-07 23.1 0.0 24 212 36 216 24 220 0.76 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 4_3 - 276 SMC_N PF02463.14 220 4.6e-08 26.4 0.2 1 1 1.7e-09 1.2e-07 25.1 0.2 25 198 34 201 22 218 0.75 # 1342 # 2169 # 1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 1_62 - 216 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 2.6e-22 72.6 0.0 1 1 2.5e-23 7.4e-22 71.1 0.0 2 69 91 162 90 169 0.87 # 53638 # 54285 # 1 # ID=1_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 3_9 - 122 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 7.7e-21 67.8 1.1 1 1 3.4e-22 1e-20 67.5 0.6 2 74 8 87 7 89 0.89 # 7133 # 7498 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.522 5_14 - 119 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 1.6e-11 38.0 0.1 1 1 8.1e-13 2.4e-11 37.4 0.0 15 50 1 37 1 71 0.81 # 9557 # 9913 # -1 # ID=5_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.499 13_4 - 104 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 6e-09 29.7 0.0 1 1 2.3e-10 6.7e-09 29.6 0.0 2 57 4 59 3 85 0.86 # 1678 # 1989 # 1 # ID=13_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.583 1_22 - 174 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 4.8e-07 23.7 0.2 1 2 6.2e-07 1.8e-05 18.6 0.0 5 49 4 49 1 63 0.87 # 15859 # 16380 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.462 1_22 - 174 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 4.8e-07 23.7 0.2 2 2 0.053 1.6 2.8 0.1 9 52 65 113 62 137 0.70 # 15859 # 16380 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.462 16_1 - 235 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.00051 13.9 0.3 1 1 3.8e-05 0.0011 12.9 0.3 4 51 6 58 4 63 0.79 # 31 # 735 # -1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 15_2 - 102 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.00055 13.8 0.3 1 1 5.3e-05 0.0016 12.4 0.1 15 41 66 91 64 100 0.84 # 666 # 971 # -1 # ID=15_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.569 3_4 - 341 GerE PF00196.14 58 3.9e-06 20.1 0.0 1 1 1.8e-07 7.4e-06 19.2 0.0 17 39 16 38 8 40 0.89 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 15_2 - 102 GerE PF00196.14 58 2.2e-05 17.7 0.0 1 1 8.1e-07 3.3e-05 17.1 0.0 11 35 66 90 65 101 0.87 # 666 # 971 # -1 # ID=15_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.569 1_28 - 230 GerE PF00196.14 58 2.8e-05 17.3 0.1 1 1 1.8e-06 7.3e-05 16.0 0.0 14 57 165 208 160 209 0.90 # 21423 # 22112 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.338 3_17 - 119 GerE PF00196.14 58 0.00021 14.6 0.0 1 1 8.8e-06 0.00036 13.8 0.0 17 40 16 39 9 40 0.83 # 15130 # 15486 # 1 # ID=3_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 2_12 - 162 GerE PF00196.14 58 0.00045 13.5 0.7 1 2 0.012 0.48 3.8 0.1 11 46 12 47 10 54 0.78 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 2_12 - 162 GerE PF00196.14 58 0.00045 13.5 0.7 2 2 0.00062 0.026 7.9 0.0 19 37 69 87 62 91 0.87 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 1_57 - 730 TraG-D_C PF12696.2 128 1.5e-20 67.3 0.0 1 1 1.4e-22 2.9e-20 66.4 0.0 1 127 419 541 419 542 0.86 # 44127 # 46316 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 16_1 - 235 DDE_3 PF13358.1 146 0.0014 12.3 0.0 1 1 2.1e-05 0.0043 10.7 0.0 32 90 82 141 59 146 0.87 # 31 # 735 # -1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 3_5 - 260 Bac_DnaA PF00308.13 219 2.2e-09 31.2 0.0 1 1 1.6e-11 3.3e-09 30.6 0.0 37 136 105 202 75 207 0.85 # 2565 # 3344 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_2 - 389 MipZ PF09140.6 261 8.9e-06 18.8 0.4 1 2 3.5e-06 0.00073 12.6 0.0 2 47 108 153 107 157 0.87 # 1344 # 2510 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 1_2 - 389 MipZ PF09140.6 261 8.9e-06 18.8 0.4 2 2 0.0011 0.23 4.4 0.0 88 134 224 270 197 292 0.84 # 1344 # 2510 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 1_5 - 228 UPF0020 PF01170.13 180 0.0001 15.8 0.0 1 2 0.00042 0.088 6.3 0.0 103 117 17 31 4 86 0.79 # 5506 # 6189 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 1_5 - 228 UPF0020 PF01170.13 180 0.0001 15.8 0.0 2 2 0.00016 0.033 7.6 0.0 28 54 163 189 158 220 0.72 # 5506 # 6189 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 2_18 - 258 Ribosomal_L12 PF00542.14 68 0.00017 15.5 0.2 1 1 1.6e-06 0.00034 14.6 0.2 23 62 16 55 6 60 0.89 # 16695 # 17468 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 10_5 - 316 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 1.2e-34 113.7 0.0 1 1 1.4e-36 1.5e-34 113.3 0.0 6 213 23 257 18 257 0.96 # 3896 # 4843 # -1 # ID=10_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.339 6_10 - 313 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 1.7e-27 90.3 0.0 1 1 2.2e-29 2.3e-27 89.9 0.0 5 210 2 238 1 241 0.92 # 5391 # 6329 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.450 6_4 - 129 ACT PF01842.20 66 2e-07 24.4 0.2 1 2 0.011 2.2 1.9 0.0 6 26 7 27 3 47 0.85 # 1203 # 1589 # 1 # ID=6_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.390 6_4 - 129 ACT PF01842.20 66 2e-07 24.4 0.2 2 2 1.6e-08 3.3e-06 20.5 0.0 9 29 78 98 74 115 0.91 # 1203 # 1589 # 1 # ID=6_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.390 1_34 - 476 DivIC PF04977.10 80 0.0018 11.7 4.6 1 1 3.6e-05 0.0038 10.7 4.6 17 66 76 124 72 125 0.92 # 24633 # 26060 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.573 3_2 - 86 DivIC PF04977.10 80 0.0052 10.2 10.0 1 3 0.015 1.5 2.3 0.5 24 46 7 29 3 32 0.74 # 512 # 769 # 1 # ID=3_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.543 3_2 - 86 DivIC PF04977.10 80 0.0052 10.2 10.0 2 3 0.00023 0.024 8.1 0.6 18 38 29 49 26 52 0.86 # 512 # 769 # 1 # ID=3_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.543 3_2 - 86 DivIC PF04977.10 80 0.0052 10.2 10.0 3 3 0.001 0.1 6.1 0.3 21 41 58 78 54 82 0.63 # 512 # 769 # 1 # ID=3_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.543 3_12 - 407 DDE_Tnp_ISL3 PF01610.12 249 2.9e-55 181.4 0.9 1 1 2e-57 4.2e-55 180.9 0.9 2 247 158 393 157 395 0.95 # 11056 # 12276 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 1_23 - 284 DDE_Tnp_1_2 PF13586.1 88 0.001 13.2 0.1 1 1 2.6e-05 0.0055 10.9 0.1 3 58 187 231 185 235 0.82 # 16377 # 17228 # 1 # ID=1_23;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 4_3 - 276 AAA_21 PF13304.1 303 1.5e-17 58.4 0.0 1 2 3.9e-09 2.7e-07 24.7 0.0 1 25 35 63 35 100 0.77 # 1342 # 2169 # 1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 4_3 - 276 AAA_21 PF13304.1 303 1.5e-17 58.4 0.0 2 2 2.5e-11 1.8e-09 31.9 0.0 232 298 138 201 107 203 0.84 # 1342 # 2169 # 1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 8_3 - 522 AAA_21 PF13304.1 303 1.3e-13 45.5 0.1 1 2 2.1e-06 0.00015 15.7 0.0 2 24 27 49 27 76 0.83 # 1496 # 3061 # -1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 8_3 - 522 AAA_21 PF13304.1 303 1.3e-13 45.5 0.1 2 2 6.2e-10 4.3e-08 27.3 0.2 261 301 280 318 243 320 0.90 # 1496 # 3061 # -1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 2_10 - 232 AAA_21 PF13304.1 303 4.8e-13 43.6 0.0 1 2 5.6e-06 0.00039 14.3 0.1 1 22 38 59 38 71 0.87 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 2_10 - 232 AAA_21 PF13304.1 303 4.8e-13 43.6 0.0 2 2 9.3e-10 6.4e-08 26.8 0.0 234 301 141 205 134 206 0.96 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 2_12 - 162 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.00013 15.3 0.4 1 2 0.053 3.6 1.0 0.0 21 38 20 37 18 48 0.79 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 2_12 - 162 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.00013 15.3 0.4 2 2 1.8e-05 0.0012 12.1 0.0 16 37 64 85 54 89 0.84 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 2_25 - 136 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.00051 13.3 0.2 1 1 2e-05 0.0014 11.9 0.2 5 37 93 125 92 134 0.93 # 21788 # 22195 # -1 # ID=2_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.507 3_4 - 341 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.00087 12.6 0.2 1 1 6.1e-05 0.0042 10.4 0.1 19 39 16 36 9 39 0.88 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 2_12 - 162 DUF2316 PF10078.4 89 0.00079 13.4 1.1 1 2 0.012 1.3 3.1 0.1 24 42 20 38 8 53 0.79 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 2_12 - 162 DUF2316 PF10078.4 89 0.00079 13.4 1.1 2 2 0.00017 0.017 9.1 0.1 14 48 59 93 46 111 0.84 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 3_4 - 341 DUF2316 PF10078.4 89 0.0011 12.9 0.0 1 1 2.2e-05 0.0023 11.9 0.0 20 82 14 85 5 91 0.82 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 3_5 - 260 AAA PF00004.24 132 3.8e-07 24.3 0.0 1 1 3.2e-09 6.6e-07 23.5 0.0 1 74 105 180 105 214 0.77 # 2565 # 3344 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 3_4 - 341 KorB PF08535.5 93 0.0017 12.5 0.0 1 1 3e-05 0.0063 10.7 0.0 2 30 16 44 15 108 0.81 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 1_30 - 122 CTP_transf_2 PF01467.21 157 0.0016 12.4 0.0 1 1 8.5e-06 0.0018 12.3 0.0 32 67 7 41 2 98 0.65 # 22639 # 23004 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 6_5 - 208 HTH_27 PF13463.1 68 0.00011 16.5 0.3 1 1 2.3e-06 0.00047 14.4 0.0 8 48 9 48 5 61 0.85 # 1660 # 2283 # 1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.412 5_12 - 74 FbpA PF05833.6 455 0.00071 12.1 3.6 1 1 3.7e-06 0.00076 12.0 3.6 396 451 9 63 2 67 0.77 # 8958 # 9179 # -1 # ID=5_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.518 1_5 - 228 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 6.3e-37 121.2 0.0 1 2 5.1e-16 1.1e-13 45.2 0.0 1 114 21 124 21 133 0.91 # 5506 # 6189 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 1_5 - 228 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 6.3e-37 121.2 0.0 2 2 6.4e-25 1.3e-22 74.3 0.0 169 228 141 200 126 203 0.90 # 5506 # 6189 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 1_23 - 284 rve_2 PF13333.1 52 3.8e-23 75.3 1.1 1 1 9.1e-25 9.4e-23 74.0 1.1 1 51 224 278 224 279 0.96 # 16377 # 17228 # 1 # ID=1_23;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 13_5 - 283 rve_2 PF13333.1 52 3.6e-09 30.6 0.2 1 1 6.3e-11 6.6e-09 29.7 0.2 1 40 208 247 208 254 0.93 # 1986 # 2834 # 1 # ID=13_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 1_2 - 389 MerR_1 PF13411.1 69 0.00074 13.2 0.0 1 1 1.1e-05 0.0022 11.7 0.0 2 44 41 88 40 105 0.75 # 1344 # 2510 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 2_10 - 232 cobW PF02492.14 178 0.001 12.4 0.0 1 1 2.5e-05 0.0017 11.7 0.0 3 21 39 57 37 80 0.85 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 13_3 - 181 cobW PF02492.14 178 0.0016 11.9 0.0 1 1 3.8e-05 0.0026 11.1 0.0 2 21 2 21 1 29 0.81 # 1044 # 1586 # 1 # ID=13_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 8_2 - 341 cobW PF02492.14 178 0.0017 11.8 0.0 1 1 4.2e-05 0.0029 11.0 0.0 4 30 5 31 3 53 0.72 # 489 # 1511 # -1 # ID=8_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_57 - 730 AAA_16 PF13191.1 185 7.5e-06 20.0 0.0 1 1 8.7e-07 4.5e-05 17.4 0.0 21 60 182 222 179 263 0.81 # 44127 # 46316 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 2_10 - 232 AAA_16 PF13191.1 185 1.3e-05 19.2 0.4 1 1 5.6e-07 2.9e-05 18.0 0.4 18 56 30 69 23 200 0.73 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 3_5 - 260 AAA_16 PF13191.1 185 0.00014 15.9 1.1 1 1 1.2e-05 0.00062 13.7 0.1 21 41 99 119 86 151 0.78 # 2565 # 3344 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 4_3 - 276 AAA_16 PF13191.1 185 0.00045 14.1 0.2 1 1 2.1e-05 0.0011 12.9 0.0 12 63 23 74 16 92 0.72 # 1342 # 2169 # 1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 3_5 - 260 AAA_22 PF13401.1 131 3.2e-06 21.3 0.2 1 2 0.00011 0.0046 11.0 0.0 5 21 103 119 99 131 0.83 # 2565 # 3344 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 3_5 - 260 AAA_22 PF13401.1 131 3.2e-06 21.3 0.2 2 2 0.0018 0.075 7.1 0.0 88 103 154 181 126 203 0.66 # 2565 # 3344 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 13_3 - 181 AAA_22 PF13401.1 131 3.2e-05 18.0 0.0 1 1 2.3e-06 9.7e-05 16.5 0.0 6 50 2 50 1 105 0.72 # 1044 # 1586 # 1 # ID=13_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 2_10 - 232 AAA_22 PF13401.1 131 4.9e-05 17.4 0.7 1 1 8.5e-06 0.00035 14.7 0.7 3 25 35 57 31 207 0.82 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 8_2 - 341 AAA_22 PF13401.1 131 6.9e-05 16.9 0.0 1 1 1.2e-05 0.00049 14.2 0.0 8 111 5 155 4 167 0.75 # 489 # 1511 # -1 # ID=8_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_64 - 524 AAA_22 PF13401.1 131 0.0048 11.0 1.4 1 1 0.0013 0.055 7.6 0.0 12 85 266 351 264 422 0.78 # 54652 # 56223 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.566 3_5 - 260 TIGR00362 TIGR00362 437 1.2e-10 34.5 0.0 1 1 7.1e-13 1.5e-10 34.3 0.0 139 240 104 203 28 210 0.86 # 2565 # 3344 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 6_9 - 139 HTH_AraC PF00165.18 42 2.2e-21 69.1 2.3 1 2 5.2e-12 5.4e-10 32.8 0.0 1 42 37 78 37 78 0.97 # 4965 # 5381 # 1 # ID=6_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.360 6_9 - 139 HTH_AraC PF00165.18 42 2.2e-21 69.1 2.3 2 2 7.1e-13 7.4e-11 35.6 1.1 2 42 90 128 89 128 0.95 # 4965 # 5381 # 1 # ID=6_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.360 1_2 - 389 HTH_AraC PF00165.18 42 0.0019 12.1 0.0 1 1 3.6e-05 0.0037 11.1 0.0 4 26 35 57 33 62 0.81 # 1344 # 2510 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 3_4 - 341 NUMOD1 PF07453.8 37 0.00053 13.8 0.1 1 1 4.9e-06 0.001 12.9 0.1 20 37 21 38 19 38 0.91 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 8_3 - 522 AAA_29 PF13555.1 62 2e-07 24.5 0.0 1 1 7.4e-09 3.8e-07 23.5 0.0 2 49 5 50 4 57 0.84 # 1496 # 3061 # -1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 4_3 - 276 AAA_29 PF13555.1 62 1.5e-06 21.6 0.2 1 1 6.9e-08 3.5e-06 20.4 0.2 18 44 29 54 14 63 0.83 # 1342 # 2169 # 1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 2_10 - 232 AAA_29 PF13555.1 62 5.6e-06 19.8 0.1 1 1 2e-07 1.1e-05 18.9 0.1 16 42 30 55 24 71 0.78 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 3_5 - 260 AAA_29 PF13555.1 62 0.0015 12.0 0.0 1 1 5.7e-05 0.003 11.1 0.0 19 59 98 139 89 141 0.72 # 2565 # 3344 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_62 - 216 LZ_Tnp_IS481 PF13011.1 85 0.0001 16.6 0.0 1 2 0.0052 1.1 3.7 0.0 27 55 20 48 11 52 0.84 # 53638 # 54285 # 1 # ID=1_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_62 - 216 LZ_Tnp_IS481 PF13011.1 85 0.0001 16.6 0.0 2 2 3.5e-05 0.0073 10.6 0.0 15 54 102 141 99 166 0.87 # 53638 # 54285 # 1 # ID=1_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 3_17 - 119 HTH_Tnp_Tc3_1 PF11427.3 50 0.00045 13.8 0.0 1 1 3.6e-06 0.00075 13.1 0.0 12 44 9 41 2 43 0.92 # 15130 # 15486 # 1 # ID=3_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 2_18 - 258 adh_short_C2 PF13561.1 241 3.5e-35 115.8 0.7 1 1 1.9e-37 3.9e-35 115.6 0.7 5 240 16 252 13 253 0.91 # 16695 # 17468 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 2_10 - 232 AAA_28 PF13521.1 163 1.5e-06 22.1 0.1 1 2 1.7e-06 0.00012 16.0 0.0 2 21 39 58 38 94 0.79 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 2_10 - 232 AAA_28 PF13521.1 163 1.5e-06 22.1 0.1 2 2 0.0086 0.59 4.0 0.0 19 79 111 168 104 174 0.63 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 13_3 - 181 AAA_28 PF13521.1 163 0.00032 14.6 0.0 1 1 1.4e-05 0.00097 13.0 0.0 2 29 3 33 2 58 0.77 # 1044 # 1586 # 1 # ID=13_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 3_5 - 260 AAA_28 PF13521.1 163 0.0025 11.7 1.8 1 1 8.9e-05 0.0062 10.4 0.2 1 43 104 151 104 172 0.70 # 2565 # 3344 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 3_2 - 86 Mnd1 PF03962.10 188 0.0062 10.1 5.4 1 1 5.1e-05 0.011 9.4 4.7 92 154 9 73 2 76 0.71 # 512 # 769 # 1 # ID=3_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.543 2_18 - 258 adh_short PF00106.20 167 1.1e-23 77.9 1.3 1 1 7.3e-26 1.5e-23 77.4 1.3 3 166 10 175 8 176 0.89 # 16695 # 17468 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 1_22 - 174 HTH_32 PF13565.1 77 8.3e-10 33.3 0.3 1 2 3.2e-06 0.00022 15.9 0.0 2 57 39 88 38 92 0.82 # 15859 # 16380 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.462 1_22 - 174 HTH_32 PF13565.1 77 8.3e-10 33.3 0.3 2 2 4.6e-06 0.00031 15.5 0.2 1 45 96 141 96 167 0.71 # 15859 # 16380 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.462 16_1 - 235 HTH_32 PF13565.1 77 2.7e-06 22.1 0.2 1 1 1.7e-07 1.2e-05 20.0 0.0 26 76 5 50 2 51 0.83 # 31 # 735 # -1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 5_11 - 159 HTH_32 PF13565.1 77 0.00039 15.2 0.1 1 1 1.1e-05 0.00079 14.2 0.1 33 77 10 53 6 53 0.77 # 8125 # 8601 # 1 # ID=5_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 3_4 - 341 HTH_3 PF01381.17 55 1.9e-06 21.6 0.1 1 1 3.5e-08 3.7e-06 20.7 0.1 7 37 15 45 8 48 0.91 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 2_12 - 162 HTH_3 PF01381.17 55 0.001 12.8 0.8 1 1 3.1e-05 0.0032 11.3 0.2 9 29 68 88 61 89 0.88 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 10_5 - 316 DDE_Tnp_1_4 PF13701.1 449 6.6e-27 87.6 0.9 1 1 4.9e-29 1e-26 87.0 0.9 140 438 20 313 10 315 0.83 # 3896 # 4843 # -1 # ID=10_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.339 2_18 - 258 Epimerase PF01370.16 236 0.00013 15.3 0.1 1 1 2.2e-06 0.00045 13.6 0.1 2 227 11 238 10 248 0.74 # 16695 # 17468 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 1_22 - 174 HTH_23 PF13384.1 50 8.7e-13 41.5 0.6 1 2 4.2e-09 6.6e-08 26.0 0.0 5 49 9 54 6 55 0.89 # 15859 # 16380 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.462 1_22 - 174 HTH_23 PF13384.1 50 8.7e-13 41.5 0.6 2 2 6.1e-05 0.00097 12.8 0.4 3 50 64 113 62 113 0.90 # 15859 # 16380 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.462 1_62 - 216 HTH_23 PF13384.1 50 1.3e-10 34.6 0.0 1 2 0.00013 0.002 11.7 0.0 10 46 10 47 7 48 0.85 # 53638 # 54285 # 1 # ID=1_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_62 - 216 HTH_23 PF13384.1 50 1.3e-10 34.6 0.0 2 2 2e-07 3.1e-06 20.7 0.0 10 46 104 141 99 145 0.83 # 53638 # 54285 # 1 # ID=1_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 3_4 - 341 HTH_23 PF13384.1 50 1.7e-08 27.9 0.0 1 1 3.3e-09 5.3e-08 26.3 0.0 9 40 9 40 2 43 0.89 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 15_2 - 102 HTH_23 PF13384.1 50 3.8e-08 26.8 0.2 1 1 4.4e-09 7.1e-08 25.9 0.2 10 42 66 98 60 101 0.92 # 666 # 971 # -1 # ID=15_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.569 3_17 - 119 HTH_23 PF13384.1 50 1.3e-07 25.1 0.1 1 1 1.5e-08 2.4e-07 24.2 0.1 9 39 9 39 8 40 0.92 # 15130 # 15486 # 1 # ID=3_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 5_14 - 119 HTH_23 PF13384.1 50 2.1e-07 24.4 0.0 1 1 1.8e-08 2.9e-07 24.0 0.0 11 45 2 37 1 43 0.87 # 9557 # 9913 # -1 # ID=5_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.499 3_9 - 122 HTH_23 PF13384.1 50 4.8e-07 23.3 0.1 1 1 6e-08 9.6e-07 22.3 0.1 3 48 14 60 12 62 0.90 # 7133 # 7498 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.522 2_12 - 162 HTH_23 PF13384.1 50 5.7e-06 19.9 1.0 1 2 0.0098 0.16 5.8 0.1 18 36 20 38 10 46 0.85 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 2_12 - 162 HTH_23 PF13384.1 50 5.7e-06 19.9 1.0 2 2 7.4e-05 0.0012 12.5 0.1 7 37 57 88 51 92 0.82 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 16_1 - 235 HTH_23 PF13384.1 50 1.3e-05 18.8 0.7 1 1 2.4e-05 0.00039 14.0 0.1 28 42 41 55 40 62 0.87 # 31 # 735 # -1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 2_25 - 136 HTH_23 PF13384.1 50 1.3e-05 18.7 0.2 1 1 2.6e-06 4.2e-05 17.1 0.1 4 38 95 129 93 133 0.84 # 21788 # 22195 # -1 # ID=2_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.507 6_6 - 208 HTH_23 PF13384.1 50 0.00051 13.6 0.0 1 1 8.5e-05 0.0014 12.3 0.0 10 39 13 47 11 56 0.81 # 2261 # 2884 # -1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 13_4 - 104 HTH_23 PF13384.1 50 0.00076 13.1 0.0 1 1 6.3e-05 0.001 12.7 0.0 7 48 14 55 8 57 0.82 # 1678 # 1989 # 1 # ID=13_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.583 2_22 - 113 HTH_23 PF13384.1 50 0.0017 12.0 0.0 1 1 0.00019 0.003 11.2 0.0 13 30 71 88 63 90 0.80 # 19980 # 20318 # -1 # ID=2_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 1_52 - 131 zf-DHHC PF01529.15 174 0.016 8.6 3.7 1 1 0.00011 0.022 8.1 3.7 90 166 28 107 24 123 0.43 # 38050 # 38442 # 1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 2_25 - 136 HTH_7 PF02796.10 45 1.3e-16 54.2 0.1 1 1 7e-18 2.9e-16 53.1 0.0 1 43 88 130 88 132 0.98 # 21788 # 22195 # -1 # ID=2_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.507 3_4 - 341 HTH_7 PF02796.10 45 5.4e-11 36.2 0.3 1 1 3.4e-12 1.4e-10 34.9 0.3 13 44 9 40 5 41 0.93 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 3_17 - 119 HTH_7 PF02796.10 45 3.2e-06 20.9 0.2 1 1 1.5e-07 6.3e-06 20.0 0.2 7 42 3 38 1 40 0.91 # 15130 # 15486 # 1 # ID=3_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 15_2 - 102 HTH_7 PF02796.10 45 1e-05 19.3 0.0 1 1 6.6e-07 2.7e-05 17.9 0.0 13 38 65 90 54 90 0.92 # 666 # 971 # -1 # ID=15_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.569 1_28 - 230 HTH_7 PF02796.10 45 1.3e-05 19.0 0.1 1 1 7.5e-07 3.1e-05 17.7 0.1 11 37 159 185 128 188 0.87 # 21423 # 22112 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.338 3_4 - 341 HTH_19 PF12844.2 64 3.2e-05 17.9 0.0 1 1 2.7e-07 5.5e-05 17.1 0.0 7 52 12 58 11 70 0.82 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 2_10 - 232 NB-ARC PF00931.17 287 0.0013 11.6 0.1 1 1 9.7e-06 0.002 10.9 0.1 18 37 35 54 24 65 0.87 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 2_18 - 258 NAD_binding_10 PF13460.1 183 8.4e-05 16.6 1.5 1 1 3.5e-06 0.00073 13.5 1.5 2 179 11 232 10 236 0.54 # 16695 # 17468 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 1_22 - 174 HTH_29 PF13551.1 112 1e-12 42.2 0.3 1 2 1.7e-07 4.4e-06 20.8 0.0 16 76 26 81 11 88 0.82 # 15859 # 16380 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.462 1_22 - 174 HTH_29 PF13551.1 112 1e-12 42.2 0.3 2 2 2.8e-08 7.2e-07 23.3 0.3 1 76 68 145 68 167 0.78 # 15859 # 16380 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.462 3_4 - 341 HTH_29 PF13551.1 112 5.4e-06 20.5 0.0 1 1 6.7e-07 1.7e-05 18.9 0.0 6 35 12 40 8 98 0.73 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 2_25 - 136 HTH_29 PF13551.1 112 2.2e-05 18.5 0.3 1 2 0.0022 0.056 7.6 0.1 39 68 75 103 66 106 0.83 # 21788 # 22195 # -1 # ID=2_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.507 2_25 - 136 HTH_29 PF13551.1 112 2.2e-05 18.5 0.3 2 2 0.00028 0.0072 10.4 0.0 6 34 103 130 100 135 0.87 # 21788 # 22195 # -1 # ID=2_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.507 3_9 - 122 HTH_29 PF13551.1 112 4.7e-05 17.5 0.2 1 1 2.7e-06 7.1e-05 16.9 0.2 11 71 29 88 18 109 0.67 # 7133 # 7498 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.522 1_62 - 216 HTH_29 PF13551.1 112 0.00015 15.8 0.0 1 2 0.056 1.4 3.0 0.0 4 42 10 48 8 59 0.85 # 53638 # 54285 # 1 # ID=1_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_62 - 216 HTH_29 PF13551.1 112 0.00015 15.8 0.0 2 2 0.00033 0.0086 10.2 0.0 15 41 115 141 101 164 0.84 # 53638 # 54285 # 1 # ID=1_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 3_17 - 119 HTH_29 PF13551.1 112 0.00021 15.4 0.0 1 1 1.4e-05 0.00036 14.6 0.0 8 34 14 39 8 51 0.84 # 15130 # 15486 # 1 # ID=3_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 5_14 - 119 HTH_29 PF13551.1 112 0.00022 15.3 0.0 1 1 9.3e-06 0.00024 15.2 0.0 11 40 9 37 1 87 0.79 # 9557 # 9913 # -1 # ID=5_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.499 15_2 - 102 HTH_29 PF13551.1 112 0.00054 14.0 0.6 1 1 4e-05 0.001 13.1 0.1 3 36 65 97 64 100 0.90 # 666 # 971 # -1 # ID=15_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.569 4_13 - 426 NAD_binding_9 PF13454.1 156 7.2e-09 29.5 0.0 1 3 5.8e-08 1.2e-05 19.1 0.0 3 155 10 151 7 152 0.68 # 11620 # 12897 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 4_13 - 426 NAD_binding_9 PF13454.1 156 7.2e-09 29.5 0.0 2 3 0.02 4.1 1.1 0.0 2 31 186 214 185 229 0.79 # 11620 # 12897 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 4_13 - 426 NAD_binding_9 PF13454.1 156 7.2e-09 29.5 0.0 3 3 0.00086 0.18 5.5 0.0 116 155 287 332 254 333 0.73 # 11620 # 12897 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 3_2 - 86 ABC_tran_2 PF12848.2 85 0.0094 9.8 6.4 1 1 5.8e-05 0.012 9.4 6.4 20 76 17 76 13 84 0.75 # 512 # 769 # 1 # ID=3_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.543 3_8 - 657 Plug PF07715.10 108 8e-24 78.0 1.9 1 1 2.3e-25 2.3e-23 76.5 1.9 3 108 46 149 44 149 0.94 # 4881 # 6851 # -1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.489 4_14 - 733 Plug PF07715.10 108 8.4e-20 65.1 2.2 1 1 9.6e-22 9.9e-20 64.9 0.6 3 107 44 145 42 146 0.94 # 12982 # 15180 # 1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 1_64 - 524 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 7.1e-104 340.7 0.2 1 2 0.035 1.8 1.6 2.4 159 205 35 84 14 125 0.53 # 54652 # 56223 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.566 1_64 - 524 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 7.1e-104 340.7 0.2 2 2 1.4e-105 7.1e-104 340.7 0.2 1 270 186 472 186 473 0.99 # 54652 # 56223 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.566 3_3 - 253 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 6.9e-47 153.8 0.0 1 1 1.8e-48 9.5e-47 153.3 0.0 1 127 92 229 92 232 0.98 # 771 # 1529 # 1 # ID=3_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.611 3_6 - 144 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 5.9e-31 101.6 0.2 1 1 1.3e-32 6.8e-31 101.4 0.2 181 271 3 93 1 93 0.98 # 3589 # 4020 # 1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 16_1 - 235 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 4.8e-12 39.5 0.3 1 1 1.2e-13 6.2e-12 39.2 0.3 5 132 10 144 6 174 0.87 # 31 # 735 # -1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 2_17 - 408 TIGR00508 TIGR00508 419 0.0021 10.2 0.0 1 1 1.5e-05 0.003 9.7 0.0 213 246 192 225 189 247 0.89 # 15286 # 16509 # 1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 3_5 - 260 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.0019 11.8 0.1 1 2 3.4e-05 0.0071 9.9 0.0 8 37 90 119 87 140 0.79 # 2565 # 3344 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 3_5 - 260 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.0019 11.8 0.1 2 2 0.071 15 -0.9 0.0 121 150 167 192 144 203 0.68 # 2565 # 3344 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 3_5 - 260 PhoH PF02562.11 205 2.2e-07 24.2 0.1 1 1 3.6e-09 7.4e-07 22.5 0.0 11 48 94 131 83 159 0.83 # 2565 # 3344 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 3_5 - 260 AAA_5 PF07728.9 139 6.1e-05 16.7 0.3 1 2 3.6e-06 0.00075 13.2 0.2 1 74 104 173 104 180 0.72 # 2565 # 3344 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 3_5 - 260 AAA_5 PF07728.9 139 6.1e-05 16.7 0.3 2 2 0.053 11 -0.3 0.0 90 123 225 258 218 259 0.63 # 2565 # 3344 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 3_5 - 260 ResIII PF04851.10 184 0.00076 13.3 0.0 1 2 6.9e-05 0.014 9.1 0.0 8 50 89 127 49 135 0.78 # 2565 # 3344 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 3_5 - 260 ResIII PF04851.10 184 0.00076 13.3 0.0 2 2 0.0088 1.8 2.3 0.0 112 163 131 181 127 202 0.72 # 2565 # 3344 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_57 - 730 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 4.2e-150 493.5 0.0 1 1 4.9e-152 5.1e-150 493.2 0.0 2 386 172 561 171 561 0.99 # 44127 # 46316 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 1_39 - 876 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 8.4e-07 21.8 0.1 1 2 4.8e-08 4.9e-06 19.2 0.0 15 53 479 517 470 547 0.80 # 28115 # 30742 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 1_39 - 876 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 8.4e-07 21.8 0.1 2 2 0.041 4.2 -0.3 0.0 261 317 713 769 684 772 0.92 # 28115 # 30742 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 1_2 - 389 TIGR01968 TIGR01968 261 9.1e-08 25.3 0.1 1 2 2.6e-06 0.00054 13.0 0.0 3 37 108 142 106 145 0.93 # 1344 # 2510 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 1_2 - 389 TIGR01968 TIGR01968 261 9.1e-08 25.3 0.1 2 2 1.5e-05 0.0032 10.4 0.0 104 145 227 268 215 340 0.81 # 1344 # 2510 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 13_3 - 181 AAA_18 PF13238.1 129 4.1e-09 30.8 0.0 1 1 7.8e-11 8.1e-09 29.8 0.0 1 126 3 134 3 137 0.76 # 1044 # 1586 # 1 # ID=13_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 2_10 - 232 AAA_18 PF13238.1 129 8.8e-05 16.8 0.7 1 1 6.1e-06 0.00063 14.0 0.7 1 19 39 57 39 214 0.88 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 8_3 - 522 TIGR00611 TIGR00611 365 1.3e-08 27.9 2.7 1 3 2.2e-10 4.5e-08 26.2 0.0 3 56 4 57 2 79 0.92 # 1496 # 3061 # -1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 8_3 - 522 TIGR00611 TIGR00611 365 1.3e-08 27.9 2.7 2 3 0.04 8.3 -1.0 0.1 322 345 297 319 270 330 0.72 # 1496 # 3061 # -1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 8_3 - 522 TIGR00611 TIGR00611 365 1.3e-08 27.9 2.7 3 3 0.02 4.2 -0.0 0.2 150 191 453 493 402 508 0.46 # 1496 # 3061 # -1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 1_22 - 174 HTH_psq PF05225.11 45 0.00089 12.8 0.2 1 2 0.018 3.8 1.1 0.0 23 31 29 37 28 37 0.87 # 15859 # 16380 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.462 1_22 - 174 HTH_psq PF05225.11 45 0.00089 12.8 0.2 2 2 7e-05 0.015 8.9 0.1 10 26 73 89 72 89 0.85 # 15859 # 16380 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.462 1_15 - 84 Methyltrans_SAM PF10672.4 286 0.00036 13.3 0.0 1 1 2e-06 0.0004 13.2 0.0 196 261 9 69 4 77 0.78 # 12207 # 12458 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.595 2_10 - 232 DUF258 PF03193.11 161 2.9e-06 20.5 0.0 1 1 6.1e-08 4.2e-06 19.9 0.0 19 61 19 62 4 91 0.83 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 3_5 - 260 DUF258 PF03193.11 161 2.7e-05 17.3 0.0 1 1 5.9e-07 4e-05 16.8 0.0 21 78 88 157 70 192 0.71 # 2565 # 3344 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 4_3 - 276 DUF258 PF03193.11 161 0.0005 13.2 0.1 1 1 1.3e-05 0.0009 12.4 0.1 25 67 22 65 2 71 0.79 # 1342 # 2169 # 1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 1_39 - 876 DUF87 PF01935.12 229 2.4e-07 24.7 0.0 1 1 6.5e-09 6.8e-07 23.2 0.0 26 222 482 669 468 676 0.77 # 28115 # 30742 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 2_10 - 232 DUF87 PF01935.12 229 0.00047 13.9 0.0 1 2 3.4e-05 0.0035 11.1 0.1 26 44 39 57 21 59 0.91 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 2_10 - 232 DUF87 PF01935.12 229 0.00047 13.9 0.0 2 2 0.054 5.6 0.6 0.0 136 184 128 196 95 215 0.65 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_22 - 174 HTH_28 PF13518.1 52 8.9e-25 80.3 0.3 1 2 6.4e-13 1.2e-11 38.4 0.0 1 50 10 60 10 61 0.93 # 15859 # 16380 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.462 1_22 - 174 HTH_28 PF13518.1 52 8.9e-25 80.3 0.3 2 2 2.3e-13 4.3e-12 39.8 0.2 2 47 68 115 67 121 0.93 # 15859 # 16380 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.462 1_62 - 216 HTH_28 PF13518.1 52 9.1e-09 29.2 0.0 1 2 0.0062 0.12 6.5 0.0 5 41 10 47 8 52 0.83 # 53638 # 54285 # 1 # ID=1_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_62 - 216 HTH_28 PF13518.1 52 9.1e-09 29.2 0.0 2 2 3e-07 5.6e-06 20.3 0.0 3 41 102 141 100 145 0.82 # 53638 # 54285 # 1 # ID=1_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 15_2 - 102 HTH_28 PF13518.1 52 3.7e-08 27.2 0.4 1 1 2e-09 3.7e-08 27.2 0.4 4 38 65 99 65 101 0.92 # 666 # 971 # -1 # ID=15_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.569 3_9 - 122 HTH_28 PF13518.1 52 3.8e-08 27.2 0.5 1 1 4.3e-09 8.1e-08 26.2 0.0 1 43 17 60 17 63 0.93 # 7133 # 7498 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.522 3_4 - 341 HTH_28 PF13518.1 52 1e-07 25.8 0.1 1 1 1.3e-08 2.5e-07 24.6 0.1 7 34 12 39 8 40 0.89 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 13_4 - 104 HTH_28 PF13518.1 52 1.9e-07 25.0 0.0 1 1 1.7e-08 3.2e-07 24.2 0.0 1 41 13 53 13 58 0.93 # 1678 # 1989 # 1 # ID=13_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.583 2_25 - 136 HTH_28 PF13518.1 52 3.8e-05 17.6 0.2 1 1 4.8e-06 9e-05 16.4 0.1 9 33 105 129 97 135 0.80 # 21788 # 22195 # -1 # ID=2_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.507 16_1 - 235 HTH_28 PF13518.1 52 0.00012 16.0 1.2 1 1 2.8e-05 0.00052 14.0 1.2 22 36 40 54 13 55 0.76 # 31 # 735 # -1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 5_14 - 119 HTH_28 PF13518.1 52 0.00016 15.6 0.1 1 1 1.3e-05 0.00024 15.1 0.1 15 41 12 38 2 42 0.91 # 9557 # 9913 # -1 # ID=5_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.499 3_17 - 119 HTH_28 PF13518.1 52 0.00087 13.3 0.1 1 1 0.0001 0.0019 12.2 0.1 14 34 19 39 8 40 0.74 # 15130 # 15486 # 1 # ID=3_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 2_12 - 162 HTH_28 PF13518.1 52 0.0025 11.8 0.6 1 1 0.00043 0.008 10.2 0.1 8 31 63 87 54 90 0.79 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 2_10 - 232 TIGR00041 TIGR00041 196 0.00021 14.6 0.1 1 1 2.8e-06 0.00058 13.2 0.1 2 26 34 58 33 81 0.85 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 6_6 - 208 HTH_Tnp_1_2 PF13022.1 142 0.00021 15.1 0.0 1 1 1.7e-06 0.00034 14.3 0.0 26 77 15 64 2 68 0.78 # 2261 # 2884 # -1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 2_12 - 162 HTH_24 PF13412.1 48 4.1e-09 29.7 2.4 1 2 0.00016 0.0067 9.8 0.2 9 35 10 37 10 44 0.92 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 2_12 - 162 HTH_24 PF13412.1 48 4.1e-09 29.7 2.4 2 2 2.8e-07 1.2e-05 18.6 0.0 11 38 62 89 60 90 0.91 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 3_4 - 341 HTH_24 PF13412.1 48 9.4e-07 22.1 0.1 1 1 3.9e-08 1.6e-06 21.4 0.1 10 40 11 40 10 43 0.89 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 6_5 - 208 HTH_24 PF13412.1 48 1.3e-06 21.6 0.1 1 1 6.5e-08 2.7e-06 20.7 0.1 3 48 4 49 2 49 0.90 # 1660 # 2283 # 1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.412 15_2 - 102 HTH_24 PF13412.1 48 2.2e-05 17.8 0.0 1 1 8.7e-07 3.6e-05 17.1 0.0 16 40 72 96 68 96 0.89 # 666 # 971 # -1 # ID=15_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.569 3_17 - 119 HTH_24 PF13412.1 48 0.0018 11.7 0.0 1 1 8.9e-05 0.0037 10.6 0.0 21 39 21 39 20 40 0.94 # 15130 # 15486 # 1 # ID=3_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 6_9 - 139 HTH_18 PF12833.2 81 1.7e-23 76.5 2.0 1 1 1.1e-25 2.2e-23 76.1 2.0 1 81 50 129 50 129 0.97 # 4965 # 5381 # 1 # ID=6_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.360 3_4 - 341 HTH_30 PF13556.1 59 0.00019 14.9 0.0 1 1 1.9e-06 0.0004 13.9 0.0 10 34 15 39 10 43 0.86 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 1_14 - 119 TIGR03534 TIGR03534 253 0.0002 14.5 0.0 1 1 1e-06 0.00021 14.4 0.0 80 133 44 95 6 107 0.90 # 11893 # 12249 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.577 5_11 - 159 FUR PF01475.14 120 5.2e-05 17.1 0.0 1 1 3.9e-07 8e-05 16.5 0.0 13 55 16 59 11 76 0.78 # 8125 # 8601 # 1 # ID=5_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 15_2 - 102 HTH_10 PF04967.7 53 0.00043 13.8 0.0 1 1 1.4e-05 0.00096 12.7 0.0 27 46 77 96 73 99 0.86 # 666 # 971 # -1 # ID=15_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.569 3_4 - 341 HTH_10 PF04967.7 53 0.00048 13.6 0.0 1 1 1.3e-05 0.00091 12.8 0.0 24 45 18 39 15 43 0.89 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 6_5 - 208 HTH_10 PF04967.7 53 0.0014 12.2 0.3 1 1 7.1e-05 0.0049 10.4 0.0 22 46 17 41 15 44 0.92 # 1660 # 2283 # 1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.412 4_13 - 426 TIGR01292 TIGR01292 300 0.0018 10.7 0.0 1 2 0.0001 0.021 7.2 0.0 57 111 97 152 91 157 0.80 # 11620 # 12897 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 4_13 - 426 TIGR01292 TIGR01292 300 0.0018 10.7 0.0 2 2 0.013 2.6 0.3 0.0 141 178 181 222 178 232 0.65 # 11620 # 12897 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 2_10 - 232 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.00039 14.3 0.2 1 1 6.3e-06 0.00066 13.6 0.2 2 20 39 57 38 201 0.91 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 4_3 - 276 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.00077 13.4 0.5 1 1 1.3e-05 0.0013 12.6 0.5 2 21 36 55 35 200 0.75 # 1342 # 2169 # 1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 3_4 - 341 HTH_31 PF13560.1 64 6.6e-05 17.0 0.0 1 1 2.1e-06 0.00014 16.0 0.0 12 54 15 60 13 61 0.85 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 2_12 - 162 HTH_31 PF13560.1 64 0.00019 15.6 0.4 1 1 0.00043 0.03 8.5 0.4 6 31 10 36 8 89 0.74 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 1_2 - 389 HTH_31 PF13560.1 64 0.00027 15.1 0.4 1 1 1.1e-05 0.00079 13.6 0.2 12 45 37 69 31 73 0.87 # 1344 # 2510 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 1_58 - 1707 UvrD_C_2 PF13538.1 104 2.9e-07 24.6 0.7 1 2 0.025 2.6 2.2 0.0 6 44 1227 1265 1223 1295 0.74 # 46316 # 51436 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 1_58 - 1707 UvrD_C_2 PF13538.1 104 2.9e-07 24.6 0.7 2 2 1e-07 1e-05 19.6 0.2 3 102 1341 1444 1339 1446 0.77 # 46316 # 51436 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 8_2 - 341 UvrD_C_2 PF13538.1 104 0.00016 15.8 0.0 1 1 3e-06 0.00032 14.8 0.0 37 103 247 329 224 330 0.65 # 489 # 1511 # -1 # ID=8_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_14 - 119 TIGR00755 TIGR00755 256 1.1e-06 21.7 0.0 1 1 7e-09 1.4e-06 21.3 0.0 8 74 29 97 24 105 0.89 # 11893 # 12249 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.577 3_17 - 119 HTH_36 PF13730.1 55 0.00067 13.8 0.0 1 1 5.7e-06 0.0012 12.9 0.0 28 47 20 39 3 40 0.88 # 15130 # 15486 # 1 # ID=3_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 13_3 - 181 NACHT PF05729.7 166 0.00017 15.2 0.1 1 1 4.2e-06 0.00044 13.9 0.0 2 21 2 21 1 29 0.91 # 1044 # 1586 # 1 # ID=13_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 2_10 - 232 NACHT PF05729.7 166 0.00039 14.0 0.1 1 1 1.7e-05 0.0018 11.9 0.0 3 20 39 56 37 76 0.86 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 13_3 - 181 AAA_17 PF13207.1 121 4.9e-06 21.3 0.0 1 1 1.4e-07 1e-05 20.3 0.0 1 32 2 34 2 175 0.59 # 1044 # 1586 # 1 # ID=13_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 2_10 - 232 AAA_17 PF13207.1 121 5.8e-05 17.9 0.2 1 1 1.3e-06 9e-05 17.2 0.2 2 19 39 56 38 219 0.85 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_57 - 730 AAA_17 PF13207.1 121 0.00069 14.4 0.0 1 1 2.4e-05 0.0017 13.2 0.0 3 28 189 218 187 336 0.74 # 44127 # 46316 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 3_3 - 253 DZR PF12773.2 50 7.9e-05 16.4 0.7 1 1 7.1e-07 0.00015 15.5 0.7 10 41 32 83 27 87 0.88 # 771 # 1529 # 1 # ID=3_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.611 2_10 - 232 TIGR02211 TIGR02211 221 8.5e-64 208.7 0.1 1 1 9.9e-66 1e-63 208.4 0.1 16 218 21 219 10 222 0.93 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 4_3 - 276 TIGR02211 TIGR02211 221 8.6e-25 81.1 0.0 1 1 1.2e-26 1.2e-24 80.6 0.0 19 212 21 212 7 221 0.84 # 1342 # 2169 # 1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 2_10 - 232 AAA_25 PF13481.1 194 1.3e-05 18.6 0.0 1 2 1.5e-06 0.00011 15.6 0.0 29 58 32 62 14 131 0.78 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 2_10 - 232 AAA_25 PF13481.1 194 1.3e-05 18.6 0.0 2 2 0.051 3.5 0.9 0.0 161 188 175 201 165 206 0.69 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 3_5 - 260 AAA_25 PF13481.1 194 5.1e-05 16.6 0.0 1 1 1.2e-06 8.6e-05 15.9 0.0 22 58 90 127 71 183 0.79 # 2565 # 3344 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 4_3 - 276 AAA_25 PF13481.1 194 0.0013 12.0 0.1 1 1 6.5e-05 0.0045 10.3 0.1 30 57 30 57 23 87 0.85 # 1342 # 2169 # 1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 8_2 - 341 Viral_helicase1 PF01443.13 234 1.3e-11 38.3 0.1 1 2 3.9e-07 4e-05 17.1 0.0 2 30 5 38 4 59 0.76 # 489 # 1511 # -1 # ID=8_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 8_2 - 341 Viral_helicase1 PF01443.13 234 1.3e-11 38.3 0.1 2 2 1.4e-07 1.5e-05 18.5 0.1 63 233 133 330 122 331 0.67 # 489 # 1511 # -1 # ID=8_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_58 - 1707 Viral_helicase1 PF01443.13 234 0.0018 11.7 0.0 1 2 0.00064 0.066 6.6 0.0 1 23 988 1011 988 1151 0.76 # 46316 # 51436 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 1_58 - 1707 Viral_helicase1 PF01443.13 234 0.0018 11.7 0.0 2 2 0.013 1.3 2.3 0.0 171 234 1387 1447 1342 1447 0.63 # 46316 # 51436 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 2_20 - 369 Oxidored_FMN PF00724.15 341 1.9e-83 274.2 0.0 1 1 1.1e-85 2.2e-83 274.0 0.0 1 339 3 339 3 341 0.87 # 18301 # 19407 # -1 # ID=2_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 8_3 - 522 AAA_15 PF13175.1 415 7e-17 55.4 0.1 1 2 5.1e-09 3.5e-07 23.5 0.0 2 45 5 47 4 63 0.90 # 1496 # 3061 # -1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 8_3 - 522 AAA_15 PF13175.1 415 7e-17 55.4 0.1 2 2 5e-11 3.4e-09 30.1 0.1 332 414 235 318 183 319 0.74 # 1496 # 3061 # -1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 4_3 - 276 AAA_15 PF13175.1 415 4.2e-07 23.2 0.0 1 2 4.5e-05 0.0031 10.5 0.0 23 42 34 53 19 86 0.82 # 1342 # 2169 # 1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 4_3 - 276 AAA_15 PF13175.1 415 4.2e-07 23.2 0.0 2 2 3.6e-05 0.0025 10.8 0.0 370 410 160 200 151 202 0.91 # 1342 # 2169 # 1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 2_10 - 232 AAA_15 PF13175.1 415 0.00051 13.1 0.0 1 2 0.00012 0.0083 9.1 0.0 25 46 34 60 9 93 0.72 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 2_10 - 232 AAA_15 PF13175.1 415 0.00051 13.1 0.0 2 2 0.017 1.2 2.0 0.0 372 414 164 205 140 205 0.89 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_39 - 876 Pox_A32 PF04665.7 241 0.0018 11.5 0.0 1 1 2.3e-05 0.0048 10.1 0.0 7 38 473 504 469 519 0.85 # 28115 # 30742 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 3_5 - 260 RuvB_N PF05496.7 234 0.00076 12.5 0.0 1 1 6.5e-06 0.0013 11.7 0.0 50 119 102 182 92 190 0.65 # 2565 # 3344 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 3_5 - 260 AAA_14 PF13173.1 128 2.5e-06 21.4 0.0 1 1 4.5e-08 4.7e-06 20.5 0.0 2 96 102 203 101 221 0.67 # 2565 # 3344 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 2_10 - 232 AAA_14 PF13173.1 128 0.0011 12.8 0.0 1 1 2.5e-05 0.0025 11.6 0.0 2 41 36 75 35 131 0.63 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_2 - 389 VirC1 PF07015.6 231 0.00014 14.9 0.1 1 2 0.00028 0.058 6.3 0.0 4 42 109 147 107 154 0.91 # 1344 # 2510 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 1_2 - 389 VirC1 PF07015.6 231 0.00014 14.9 0.1 2 2 0.0003 0.062 6.2 0.1 84 139 235 290 222 312 0.77 # 1344 # 2510 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 11_2 - 341 Transposase_20 PF02371.11 87 7.2e-30 96.9 0.1 1 1 1.5e-31 1.6e-29 95.9 0.1 2 76 212 286 211 297 0.94 # 935 # 1957 # 1 # ID=11_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 2_14 - 335 Transposase_20 PF02371.11 87 2.3e-24 79.3 0.2 1 1 4.6e-26 4.8e-24 78.3 0.2 2 78 210 286 209 296 0.94 # 11845 # 12849 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 3_12 - 407 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 1.7e-15 49.9 0.0 1 1 1.4e-16 4.2e-15 48.6 0.0 2 52 92 141 91 141 0.98 # 11056 # 12276 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 15_2 - 102 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 3.6e-05 16.9 0.2 1 1 2.1e-06 6.2e-05 16.1 0.2 29 51 75 97 65 98 0.84 # 666 # 971 # -1 # ID=15_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.569 3_4 - 341 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 4.4e-05 16.6 0.1 1 1 5.4e-06 0.00016 14.8 0.0 21 49 11 39 2 40 0.82 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 13_4 - 104 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.00018 14.6 0.0 1 1 1.2e-05 0.00037 13.6 0.0 7 44 4 42 4 45 0.93 # 1678 # 1989 # 1 # ID=13_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.583 3_17 - 119 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.00026 14.1 0.0 1 1 2.2e-05 0.00064 12.9 0.0 31 49 21 39 20 40 0.90 # 15130 # 15486 # 1 # ID=3_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 2_12 - 162 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.00032 13.8 0.1 1 2 0.028 0.83 2.9 0.0 29 48 21 40 15 43 0.79 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 2_12 - 162 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.00032 13.8 0.1 2 2 0.00042 0.012 8.7 0.0 25 45 66 86 55 90 0.83 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 3_9 - 122 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.00072 12.7 1.6 1 1 5e-05 0.0015 11.7 0.1 7 42 8 44 8 46 0.92 # 7133 # 7498 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.522 1_22 - 174 DUF1153 PF06627.6 90 1.3e-07 25.4 0.1 1 2 0.00077 0.16 5.9 0.0 58 81 31 54 20 57 0.87 # 15859 # 16380 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.462 1_22 - 174 DUF1153 PF06627.6 90 1.3e-07 25.4 0.1 2 2 2e-07 4.1e-05 17.4 0.2 39 86 69 117 66 121 0.89 # 15859 # 16380 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.462 1_2 - 389 MerR PF00376.18 38 7.8e-07 22.6 0.0 1 1 1.8e-08 1.8e-06 21.4 0.0 1 28 41 68 41 74 0.95 # 1344 # 2510 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 3_17 - 119 MerR PF00376.18 38 0.0019 11.8 3.0 1 2 0.00027 0.028 8.0 0.1 4 21 22 39 19 49 0.84 # 15130 # 15486 # 1 # ID=3_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 3_17 - 119 MerR PF00376.18 38 0.0019 11.8 3.0 2 2 0.0054 0.56 3.8 0.7 14 22 90 98 89 110 0.69 # 15130 # 15486 # 1 # ID=3_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 3_2 - 86 ACT_5 PF13710.1 63 0.0013 12.5 1.6 1 1 8.8e-06 0.0018 12.0 0.3 42 57 32 47 29 48 0.89 # 512 # 769 # 1 # ID=3_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.543 13_3 - 181 AAA_33 PF13671.1 143 6.3e-10 33.0 0.0 1 1 1.3e-11 8.8e-10 32.6 0.0 2 127 3 130 2 151 0.73 # 1044 # 1586 # 1 # ID=13_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 4_3 - 276 AAA_33 PF13671.1 143 1.6e-05 18.7 0.1 1 1 1e-06 7e-05 16.7 0.1 3 33 37 82 35 203 0.61 # 1342 # 2169 # 1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 2_10 - 232 AAA_33 PF13671.1 143 0.00078 13.3 1.4 1 1 9.2e-05 0.0063 10.3 1.4 2 19 39 56 38 214 0.73 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 3_9 - 122 CENP-B_N PF04218.8 53 6.5e-06 19.5 0.0 1 1 3e-07 1.2e-05 18.6 0.0 3 44 9 51 8 55 0.86 # 7133 # 7498 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.522 3_4 - 341 CENP-B_N PF04218.8 53 0.00015 15.2 0.1 1 1 6.6e-06 0.00027 14.3 0.1 20 47 15 42 2 43 0.83 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 15_2 - 102 CENP-B_N PF04218.8 53 0.00015 15.1 0.0 1 1 6.3e-06 0.00026 14.4 0.0 21 45 72 96 65 99 0.87 # 666 # 971 # -1 # ID=15_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.569 2_25 - 136 CENP-B_N PF04218.8 53 0.00022 14.6 0.1 1 1 1.3e-05 0.00052 13.4 0.1 10 43 96 129 91 134 0.89 # 21788 # 22195 # -1 # ID=2_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.507 6_6 - 208 CENP-B_N PF04218.8 53 0.001 12.4 0.0 1 1 5e-05 0.0021 11.5 0.0 26 51 28 53 23 55 0.90 # 2261 # 2884 # -1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 11_2 - 341 HHH PF00633.18 30 0.002 11.8 0.1 1 1 2.7e-05 0.0056 10.4 0.1 13 24 214 225 214 230 0.92 # 935 # 1957 # 1 # ID=11_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 4_3 - 276 SbcCD_C PF13558.1 90 1.4e-06 22.1 0.0 1 1 9.5e-08 9.8e-06 19.4 0.0 26 89 136 186 119 187 0.79 # 1342 # 2169 # 1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 2_10 - 232 SbcCD_C PF13558.1 90 1.8e-05 18.6 0.2 1 1 2.6e-06 0.00027 14.8 0.2 32 89 143 187 126 188 0.76 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_57 - 730 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 1.2e-09 31.2 0.0 1 1 3.2e-11 3.3e-09 29.7 0.0 264 361 382 476 198 500 0.83 # 44127 # 46316 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 1_39 - 876 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 0.00043 12.8 0.0 1 2 0.0031 0.32 3.3 0.0 105 184 533 606 470 625 0.82 # 28115 # 30742 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 1_39 - 876 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 0.00043 12.8 0.0 2 2 0.00021 0.022 7.2 0.0 319 378 711 769 662 771 0.90 # 28115 # 30742 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 6_9 - 139 Ribosomal_S8 PF00410.14 129 0.0027 11.5 1.8 1 2 0.0059 1.2 2.9 0.1 41 73 2 29 1 35 0.56 # 4965 # 5381 # 1 # ID=6_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.360 6_9 - 139 Ribosomal_S8 PF00410.14 129 0.0027 11.5 1.8 2 2 0.00012 0.025 8.4 0.1 50 87 90 128 50 135 0.79 # 4965 # 5381 # 1 # ID=6_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.360 1_15 - 84 MTS PF05175.9 170 9.8e-05 15.7 0.0 1 1 5.3e-07 0.00011 15.5 0.0 98 142 8 46 2 65 0.81 # 12207 # 12458 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.595 5_11 - 159 Arg_repressor PF01316.16 70 1.2e-15 50.9 0.2 1 1 9.1e-18 1.9e-15 50.2 0.2 10 67 17 75 8 78 0.90 # 8125 # 8601 # 1 # ID=5_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 6_5 - 208 HTH_45 PF14947.1 77 0.00014 15.6 0.2 1 2 9e-06 0.0019 12.0 0.0 10 53 8 55 5 76 0.75 # 1660 # 2283 # 1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.412 6_5 - 208 HTH_45 PF14947.1 77 0.00014 15.6 0.2 2 2 0.045 9.3 0.2 0.0 55 65 190 200 177 204 0.79 # 1660 # 2283 # 1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.412 2_18 - 258 Eno-Rase_NADH_b PF12242.3 78 0.00016 15.4 0.1 1 1 3e-06 0.00062 13.5 0.2 37 65 6 32 1 44 0.77 # 16695 # 17468 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 13_3 - 181 APS_kinase PF01583.15 157 2.7e-05 17.8 0.0 1 2 1e-05 0.0021 11.6 0.0 4 24 2 22 1 30 0.89 # 1044 # 1586 # 1 # ID=13_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 13_3 - 181 APS_kinase PF01583.15 157 2.7e-05 17.8 0.0 2 2 0.0021 0.43 4.1 0.1 34 72 107 147 91 157 0.86 # 1044 # 1586 # 1 # ID=13_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 2_10 - 232 NTPase_1 PF03266.10 168 0.0002 15.0 0.1 1 2 6.9e-05 0.0071 10.0 0.0 2 44 39 83 38 91 0.80 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 2_10 - 232 NTPase_1 PF03266.10 168 0.0002 15.0 0.1 2 2 0.0085 0.88 3.2 0.0 87 151 153 219 115 230 0.73 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 3_5 - 260 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00048 13.8 0.1 1 2 0.0032 0.33 4.5 0.1 2 30 105 133 104 153 0.83 # 2565 # 3344 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 3_5 - 260 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00048 13.8 0.1 2 2 0.00049 0.051 7.2 0.0 88 112 157 181 144 204 0.72 # 2565 # 3344 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 3_4 - 341 GcrA PF07750.6 162 0.00023 15.3 0.0 1 1 2.4e-06 0.0005 14.2 0.0 6 36 5 34 2 49 0.93 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 6_11 - 131 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 9.5e-77 249.3 1.6 1 1 4.1e-78 1e-76 249.2 1.6 2 131 1 130 1 130 0.99 # 6569 # 6961 # -1 # ID=6_11;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 6_3 - 126 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 7e-76 246.5 1.5 1 1 3e-77 7.7e-76 246.4 1.5 7 131 1 125 1 125 1.00 # 573 # 950 # 1 # ID=6_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.540 3_19 - 78 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 7.3e-44 143.0 0.3 1 1 3.1e-45 8e-44 142.9 0.3 55 131 1 77 1 77 0.99 # 16313 # 16546 # -1 # ID=3_19;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.513 5_15 - 78 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 7.3e-44 143.0 0.3 1 1 3.1e-45 8e-44 142.9 0.3 55 131 1 77 1 77 0.99 # 10028 # 10261 # -1 # ID=5_15;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.509 8_1 - 78 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 7.3e-44 143.0 0.3 1 1 3.1e-45 8e-44 142.9 0.3 55 131 1 77 1 77 0.99 # 2 # 235 # 1 # ID=8_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.509 17_1 - 65 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 1.1e-38 126.2 0.5 1 1 4.6e-40 1.2e-38 126.1 0.5 7 71 1 65 1 65 0.99 # 242 # 436 # 1 # ID=17_1;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.569 18_1 - 67 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 7e-36 117.2 0.1 1 1 2.9e-37 7.5e-36 117.1 0.1 31 96 2 67 1 67 0.98 # 1 # 201 # -1 # ID=18_1;partial=11;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.552 1_65 - 90 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 1.6e-25 83.6 0.2 1 1 8.2e-27 2.1e-25 83.3 0.2 55 105 1 51 1 70 0.92 # 56144 # 56413 # -1 # ID=1_65;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.533 2_18 - 258 3HCDH_N PF02737.13 180 0.0012 12.4 1.1 1 2 1.6e-05 0.0033 11.0 0.5 6 70 15 80 9 94 0.78 # 16695 # 17468 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 2_18 - 258 3HCDH_N PF02737.13 180 0.0012 12.4 1.1 2 2 0.055 11 -0.5 0.0 12 30 169 187 162 231 0.71 # 16695 # 17468 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 16_1 - 235 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 1.6e-52 171.2 0.0 1 1 3.2e-54 2.2e-52 170.7 0.0 4 139 75 212 73 213 0.99 # 31 # 735 # -1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 13_5 - 283 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 2.3e-12 41.0 0.1 1 1 4.5e-14 3.1e-12 40.6 0.1 2 139 109 247 108 248 0.92 # 1986 # 2834 # 1 # ID=13_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 1_23 - 284 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 1.1e-11 38.7 0.0 1 1 3e-13 2.1e-11 37.9 0.0 2 137 123 261 122 264 0.92 # 16377 # 17228 # 1 # ID=1_23;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 3_4 - 341 HTH_26 PF13443.1 63 3.6e-06 21.1 0.0 1 1 6.7e-08 6.9e-06 20.2 0.0 4 41 11 48 10 58 0.90 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 5_11 - 159 HTH_26 PF13443.1 63 0.00021 15.4 0.0 1 1 3.5e-06 0.00037 14.7 0.0 4 32 19 54 18 62 0.87 # 8125 # 8601 # 1 # ID=5_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 8_3 - 522 TIGR00634 TIGR00634 563 0.00047 12.7 0.2 1 1 4.2e-06 0.00087 11.9 0.0 1 46 3 48 3 69 0.93 # 1496 # 3061 # -1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 2_12 - 162 TFIIE_alpha PF02002.12 105 0.00058 13.3 0.8 1 2 1.1e-05 0.0022 11.4 0.1 24 61 16 54 6 64 0.78 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 2_12 - 162 TFIIE_alpha PF02002.12 105 0.00058 13.3 0.8 2 2 0.027 5.7 0.5 0.1 57 102 88 133 51 136 0.65 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 2_12 - 162 HTH_17 PF12728.2 51 1.7e-05 19.0 1.0 1 2 5.9e-05 0.004 11.4 0.1 2 31 20 48 19 60 0.78 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 2_12 - 162 HTH_17 PF12728.2 51 1.7e-05 19.0 1.0 2 2 0.002 0.14 6.5 0.1 2 22 69 89 68 119 0.84 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 3_17 - 119 HTH_17 PF12728.2 51 0.00055 14.1 1.4 1 2 4.6e-05 0.0032 11.7 0.0 6 41 22 56 20 65 0.77 # 15130 # 15486 # 1 # ID=3_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 3_17 - 119 HTH_17 PF12728.2 51 0.00055 14.1 1.4 2 2 0.085 5.9 1.2 0.4 14 34 88 109 82 116 0.81 # 15130 # 15486 # 1 # ID=3_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 3_4 - 341 HTH_17 PF12728.2 51 0.0025 12.0 0.9 1 1 7.6e-05 0.0052 11.0 0.1 6 26 22 43 18 86 0.88 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 5_8 - 304 TIGR02075 TIGR02075 233 0.00089 12.5 0.1 1 2 0.013 2.7 1.1 0.0 5 90 8 98 4 128 0.67 # 4590 # 5501 # 1 # ID=5_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.577 5_8 - 304 TIGR02075 TIGR02075 233 0.00089 12.5 0.1 2 2 0.0001 0.021 8.0 0.1 135 166 206 236 158 252 0.70 # 4590 # 5501 # 1 # ID=5_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.577 3_4 - 341 HTH_11 PF08279.7 55 3.1e-06 20.8 0.1 1 1 1.8e-07 7.3e-06 19.5 0.1 8 37 12 39 5 40 0.80 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 3_17 - 119 HTH_11 PF08279.7 55 3.6e-05 17.3 0.0 1 1 1.7e-06 7.2e-05 16.4 0.0 18 37 20 39 5 40 0.80 # 15130 # 15486 # 1 # ID=3_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 2_12 - 162 HTH_11 PF08279.7 55 0.00015 15.3 3.0 1 2 0.0011 0.047 7.4 0.3 6 34 10 38 8 52 0.89 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 2_12 - 162 HTH_11 PF08279.7 55 0.00015 15.3 3.0 2 2 0.00062 0.026 8.2 0.2 6 33 60 86 55 87 0.80 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 2_25 - 136 HTH_11 PF08279.7 55 0.001 12.7 1.2 1 1 3.2e-05 0.0013 12.3 0.3 16 34 109 127 97 130 0.85 # 21788 # 22195 # -1 # ID=2_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.507 6_5 - 208 HTH_11 PF08279.7 55 0.0022 11.6 0.1 1 1 0.00017 0.0071 10.0 0.0 4 43 8 46 6 60 0.82 # 1660 # 2283 # 1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.412 3_17 - 119 Sigma70_ECF PF07638.6 185 0.0005 13.7 0.0 1 1 3.8e-06 0.00078 13.1 0.0 143 174 9 40 2 52 0.86 # 15130 # 15486 # 1 # ID=3_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 2_12 - 162 MarR_2 PF12802.2 62 1.7e-05 18.4 0.2 1 2 0.025 2.6 1.8 0.1 11 38 10 36 9 44 0.79 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 2_12 - 162 MarR_2 PF12802.2 62 1.7e-05 18.4 0.2 2 2 4.2e-06 0.00044 13.9 0.0 13 42 62 89 60 90 0.93 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 6_5 - 208 MarR_2 PF12802.2 62 0.00017 15.2 0.1 1 1 4.2e-06 0.00043 13.9 0.1 10 55 9 52 2 57 0.83 # 1660 # 2283 # 1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.412 6_5 - 208 HTH_5 PF01022.15 47 1.4e-10 34.7 0.1 1 1 1.5e-12 3.2e-10 33.5 0.1 3 46 5 49 3 50 0.92 # 1660 # 2283 # 1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.412 6_5 - 208 TrmB PF01978.14 68 2e-07 24.6 0.0 1 1 4.3e-09 4.4e-07 23.5 0.0 11 62 7 58 6 62 0.93 # 1660 # 2283 # 1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.412 3_4 - 341 TrmB PF01978.14 68 0.00054 13.6 0.0 1 1 1.1e-05 0.0012 12.5 0.0 16 44 11 39 10 40 0.93 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 12_2 - 302 LYTB PF02401.13 281 0.0014 11.5 0.0 1 1 2e-05 0.0041 9.9 0.0 236 272 81 117 70 124 0.91 # 219 # 1124 # 1 # ID=12_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.656 3_17 - 119 LacI PF00356.16 46 0.00056 13.5 0.0 1 1 5.9e-06 0.0012 12.4 0.0 2 34 20 52 19 62 0.91 # 15130 # 15486 # 1 # ID=3_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 8_3 - 522 DUF2813 PF11398.3 373 6.7e-05 16.0 1.2 1 2 4.6e-06 0.00096 12.2 0.0 11 49 12 51 3 56 0.79 # 1496 # 3061 # -1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 8_3 - 522 DUF2813 PF11398.3 373 6.7e-05 16.0 1.2 2 2 0.0067 1.4 1.8 0.0 287 333 279 326 250 333 0.82 # 1496 # 3061 # -1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 6_8 - 223 UPF0122 PF04297.9 101 0.0001 16.3 1.4 1 1 1.1e-06 0.00023 15.1 1.4 3 76 29 102 26 125 0.83 # 4284 # 4952 # -1 # ID=6_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.326 2_12 - 162 HTH_Mga PF08280.6 59 5.4e-05 16.9 0.0 1 1 5.9e-07 0.00012 15.7 0.0 13 39 62 88 55 90 0.91 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 13_4 - 104 Phage_terminase PF10668.4 60 0.00067 13.4 0.0 1 1 4.9e-06 0.001 12.8 0.0 11 44 14 47 1 49 0.77 # 1678 # 1989 # 1 # ID=13_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.583 3_4 - 341 DUF1670 PF07900.6 220 0.002 11.3 0.1 1 1 1.8e-05 0.0037 10.4 0.1 189 219 9 39 4 40 0.92 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 1_39 - 876 AAA_10 PF12846.2 304 8e-49 160.6 0.0 1 1 3.3e-50 1.4e-48 159.8 0.0 1 294 479 768 479 774 0.88 # 28115 # 30742 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 1_57 - 730 AAA_10 PF12846.2 304 2e-10 34.5 0.0 1 1 9e-11 3.7e-09 30.3 0.0 3 296 187 494 186 500 0.69 # 44127 # 46316 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 3_5 - 260 AAA_10 PF12846.2 304 1.6e-05 18.3 0.7 1 1 4.8e-06 0.0002 14.8 0.1 1 33 102 134 102 171 0.89 # 2565 # 3344 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 2_10 - 232 AAA_10 PF12846.2 304 2.7e-05 17.6 0.0 1 1 1.7e-06 6.9e-05 16.3 0.0 4 29 39 65 37 85 0.76 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 4_3 - 276 AAA_10 PF12846.2 304 0.00038 13.9 1.4 1 1 5e-05 0.0021 11.4 1.0 4 34 36 66 33 159 0.89 # 1342 # 2169 # 1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 6_5 - 208 HTH_20 PF12840.2 61 3.1e-11 36.9 0.3 1 1 2.3e-12 7.9e-11 35.6 0.0 11 61 5 55 1 55 0.94 # 1660 # 2283 # 1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.412 3_15 - 326 HTH_20 PF12840.2 61 0.00016 15.4 0.0 1 2 0.0044 0.15 5.9 0.0 24 47 102 125 97 125 0.89 # 13407 # 14384 # -1 # ID=3_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.522 3_15 - 326 HTH_20 PF12840.2 61 0.00016 15.4 0.0 2 2 0.0021 0.071 6.9 0.1 19 58 213 259 185 262 0.77 # 13407 # 14384 # -1 # ID=3_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.522 1_23 - 284 HTH_20 PF12840.2 61 0.00025 14.8 0.0 1 1 1.4e-05 0.00049 13.9 0.0 27 50 13 36 1 41 0.80 # 16377 # 17228 # 1 # ID=1_23;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 2_12 - 162 HTH_20 PF12840.2 61 0.00068 13.4 0.4 1 2 0.02 0.67 3.8 0.1 25 46 20 44 10 45 0.72 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 2_12 - 162 HTH_20 PF12840.2 61 0.00068 13.4 0.4 2 2 0.0017 0.058 7.2 0.0 17 43 61 87 55 88 0.91 # 10074 # 10559 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 3_4 - 341 HTH_20 PF12840.2 61 0.00083 13.1 0.0 1 1 4.9e-05 0.0017 12.1 0.0 19 46 13 39 10 40 0.89 # 1543 # 2565 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 6_6 - 208 HTH_20 PF12840.2 61 0.0012 12.6 0.0 1 1 8.2e-05 0.0028 11.4 0.0 21 46 21 46 12 61 0.84 # 2261 # 2884 # -1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 1_14 - 119 RrnaAD PF00398.15 262 1.5e-05 18.0 0.0 1 1 9.1e-08 1.9e-05 17.7 0.0 9 73 29 95 23 104 0.92 # 11893 # 12249 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.577 1_14 - 119 Methyltransf_18 PF12847.2 112 0.00019 15.9 0.0 1 1 2.4e-06 0.00051 14.6 0.0 5 46 54 95 50 113 0.87 # 11893 # 12249 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.577 4_3 - 276 AAA_13 PF13166.1 712 0.0025 10.2 0.1 1 2 0.0015 0.16 4.2 0.2 23 36 40 53 29 66 0.83 # 1342 # 2169 # 1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 4_3 - 276 AAA_13 PF13166.1 712 0.0025 10.2 0.1 2 2 0.0021 0.22 3.8 0.0 529 572 162 203 152 210 0.90 # 1342 # 2169 # 1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 2_10 - 232 AAA_13 PF13166.1 712 0.0034 9.7 0.0 1 1 6.8e-05 0.0071 8.7 0.0 20 42 40 62 25 94 0.83 # 8882 # 9577 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_2 - 389 ArsA_ATPase PF02374.10 305 3.6e-06 20.1 0.4 1 2 1.7e-06 0.00034 13.6 0.1 9 36 115 142 109 151 0.89 # 1344 # 2510 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 1_2 - 389 ArsA_ATPase PF02374.10 305 3.6e-06 20.1 0.4 2 2 0.0011 0.23 4.3 0.0 123 136 231 244 221 251 0.84 # 1344 # 2510 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 1_2 - 389 AAA_31 PF13614.1 157 2e-09 31.5 0.0 1 2 1.4e-08 2.8e-06 21.3 0.0 2 49 108 155 107 195 0.91 # 1344 # 2510 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 1_2 - 389 AAA_31 PF13614.1 157 2e-09 31.5 0.0 2 2 0.00018 0.037 7.9 0.1 110 152 227 268 223 272 0.84 # 1344 # 2510 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 9_3 - 280 Pterin_bind PF00809.17 210 5.3e-58 189.7 0.0 1 1 3e-60 6.3e-58 189.5 0.0 1 210 7 216 7 216 0.98 # 805 # 1644 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.617 4_13 - 426 FMO-like PF00743.14 532 5.7e-06 18.6 0.0 1 2 3.9e-06 0.00081 11.5 0.0 142 200 143 198 95 219 0.87 # 11620 # 12897 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 4_13 - 426 FMO-like PF00743.14 532 5.7e-06 18.6 0.0 2 2 0.00035 0.073 5.1 0.0 317 342 319 344 311 377 0.81 # 11620 # 12897 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 3_5 - 260 IstB_IS21 PF01695.12 178 9.4e-73 237.3 0.1 1 2 0.049 10 -0.6 0.0 64 97 25 57 24 61 0.64 # 2565 # 3344 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 3_5 - 260 IstB_IS21 PF01695.12 178 9.4e-73 237.3 0.1 2 2 9.8e-75 2e-72 236.2 0.1 1 178 56 235 56 235 0.98 # 2565 # 3344 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 2_18 - 258 KR PF08659.5 181 3.7e-11 36.9 1.9 1 1 3.8e-13 7.8e-11 35.9 1.9 4 162 11 170 9 190 0.79 # 16695 # 17468 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 1_58 - 1707 AAA_11 PF13086.1 236 0.00033 14.2 2.3 1 1 3e-06 0.00061 13.3 0.0 2 75 969 1039 968 1060 0.80 # 46316 # 51436 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 1_17 - 180 SSB PF00436.20 104 5.8e-41 132.6 0.4 1 1 3.5e-43 7.3e-41 132.2 0.4 1 101 6 109 6 112 0.96 # 13332 # 13871 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 2_25 - 136 UxuA PF03786.8 351 0.0013 11.2 0.0 1 1 7.5e-06 0.0016 11.0 0.0 76 174 11 110 5 122 0.84 # 21788 # 22195 # -1 # ID=2_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.507 4_13 - 426 Lycopene_cycl PF05834.7 374 5.7e-05 16.0 0.0 1 1 4.5e-07 9.3e-05 15.3 0.0 1 144 6 157 6 182 0.73 # 11620 # 12897 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 1_22 - 174 BrkDBD PF09607.5 58 0.0017 11.9 0.0 1 1 3.6e-05 0.0074 9.8 0.0 11 47 11 44 2 51 0.80 # 15859 # 16380 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.462 1_23 - 284 HTH_21 PF13276.1 60 8.8e-17 54.9 4.2 1 2 8.5e-19 8.8e-17 54.9 4.2 6 60 43 96 38 97 0.90 # 16377 # 17228 # 1 # ID=1_23;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 1_23 - 284 HTH_21 PF13276.1 60 8.8e-17 54.9 4.2 2 2 0.081 8.4 0.5 0.1 44 56 199 211 185 215 0.73 # 16377 # 17228 # 1 # ID=1_23;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 13_5 - 283 HTH_21 PF13276.1 60 8.8e-11 35.7 0.2 1 1 2.4e-12 2.5e-10 34.2 0.2 4 59 36 89 34 90 0.93 # 1986 # 2834 # 1 # ID=13_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/dd9309cd-c547-4f01-9b87-9af79e7ab3a3 # Target file: checkm_output/bins/pm1592/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm1592/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/dd9309cd-c547-4f01-9b87-9af79e7ab3a3 checkm_output/bins/pm1592/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 09:47:09 2017 # [ok]