# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_13 - 105 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 3.9e-05 15.4 0.0 1 1 6.8e-07 4.5e-05 15.2 0.0 75 131 20 78 13 94 0.75 # 10643 # 10957 # -1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.476 1_35 - 342 HTH_IclR PF09339.5 52 1.3e-05 17.1 0.1 1 1 5.1e-07 3.4e-05 15.8 0.1 15 40 14 39 10 40 0.86 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_20 - 877 ABC_tran PF00005.22 137 2.1e-06 20.5 0.0 1 1 3.7e-07 6.1e-06 18.9 0.0 4 42 487 525 485 610 0.83 # 13748 # 16378 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 1_28 - 344 ABC_tran PF00005.22 137 1.4e-05 17.7 0.0 1 1 1.5e-06 2.5e-05 16.9 0.0 11 61 174 224 166 293 0.67 # 21415 # 22446 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_34 - 260 ABC_tran PF00005.22 137 0.00035 13.2 0.2 1 1 8.1e-05 0.0014 11.3 0.1 8 31 98 121 95 132 0.86 # 27149 # 27928 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_39 - 526 ABC_tran PF00005.22 137 0.00037 13.2 0.1 1 1 5.1e-05 0.00085 12.0 0.1 10 32 123 145 120 167 0.87 # 36866 # 38443 # -1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_5 - 190 HTH_22 PF13309.1 64 3.4e-06 19.2 0.1 1 1 2.9e-07 9.8e-06 17.7 0.1 45 62 168 185 166 187 0.92 # 7396 # 7965 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.477 1_35 - 342 HTH_22 PF13309.1 64 6e-05 15.2 0.0 1 1 3.6e-06 0.00012 14.2 0.0 44 64 19 39 16 39 0.94 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_64 - 422 HHH_5 PF14520.1 60 1.8e-07 23.6 0.6 1 1 7.4e-08 5e-06 19.0 0.6 8 55 181 278 177 282 0.65 # 52638 # 53903 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 1_1 - 519 N6_Mtase PF02384.11 311 2.9e-116 380.2 0.3 1 1 5.7e-118 3.8e-116 379.8 0.3 2 310 171 479 170 480 0.97 # 996 # 2552 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.476 1_35 - 342 rve_3 PF13683.1 67 3.8e-09 28.4 0.0 1 1 1.2e-10 8.1e-09 27.3 0.0 2 66 216 288 215 288 0.93 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_28 - 344 Sigma54_activat PF00158.21 168 1.9e-05 16.5 0.0 1 1 6.6e-07 4.4e-05 15.3 0.0 12 76 164 231 158 242 0.79 # 21415 # 22446 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_35 - 342 HTH_DeoR PF08220.7 57 0.00028 12.8 1.2 1 1 1e-05 0.00069 11.5 0.5 9 34 13 37 4 40 0.82 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_28 - 344 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 9.7e-07 20.8 0.0 1 1 7.1e-08 1.6e-06 20.1 0.0 32 62 168 198 153 203 0.80 # 21415 # 22446 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_20 - 877 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 6.3e-06 18.1 0.0 1 1 8.2e-07 1.8e-05 16.6 0.0 36 67 480 522 451 528 0.73 # 13748 # 16378 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 1_39 - 526 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 7.5e-06 17.9 0.0 1 1 1.2e-06 2.7e-05 16.0 0.0 39 71 122 157 93 177 0.80 # 36866 # 38443 # -1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_35 - 342 HTH_38 PF13936.1 44 2.8e-11 35.2 0.8 1 1 2.7e-12 6.1e-11 34.1 0.8 5 42 2 39 1 40 0.97 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_52 - 101 HTH_38 PF13936.1 44 3.1e-06 19.1 0.1 1 1 7.4e-07 1.6e-05 16.8 0.1 17 43 33 59 2 59 0.70 # 45913 # 46215 # -1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_5 - 190 HTH_38 PF13936.1 44 7.5e-06 17.8 0.0 1 1 1.1e-06 2.4e-05 16.2 0.0 4 39 148 184 145 185 0.93 # 7396 # 7965 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.477 1_5 - 190 SpoIIID PF12116.3 82 4e-05 15.9 0.1 1 2 0.038 2.6 0.5 0.0 33 55 8 30 4 37 0.84 # 7396 # 7965 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.477 1_5 - 190 SpoIIID PF12116.3 82 4e-05 15.9 0.1 2 2 5.8e-06 0.00039 12.7 0.0 11 42 157 188 149 189 0.82 # 7396 # 7965 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.477 1_28 - 344 MobB PF03205.9 140 0.00028 13.0 0.0 1 1 9.4e-06 0.00063 11.8 0.0 3 28 177 202 175 216 0.77 # 21415 # 22446 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_24 - 57 TIGR03302 TIGR03302 239 0.00029 12.4 0.1 1 1 8e-06 0.00054 11.5 0.1 3 37 6 47 4 54 0.67 # 18492 # 18662 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.520 1_5 - 190 NanE PF04131.9 192 0.00014 13.2 0.0 1 2 0.00013 0.0085 7.4 0.0 47 79 9 41 1 69 0.76 # 7396 # 7965 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.477 1_5 - 190 NanE PF04131.9 192 0.00014 13.2 0.0 2 2 0.0018 0.12 3.6 0.0 58 141 83 161 75 177 0.70 # 7396 # 7965 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.477 1_35 - 342 HTH_8 PF02954.14 42 1.2e-05 17.1 0.6 1 1 3.3e-07 2.2e-05 16.3 0.1 12 37 11 36 5 40 0.91 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_13 - 105 Ribosomal_L29 PF00831.18 58 0.00051 12.1 0.8 1 1 1.1e-05 0.00071 11.6 0.8 9 32 23 46 19 59 0.87 # 10643 # 10957 # -1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.476 1_5 - 190 TetR_N PF00440.18 47 0.00017 13.6 0.0 1 1 4.9e-06 0.00033 12.7 0.0 17 36 166 185 164 185 0.94 # 7396 # 7965 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.477 1_34 - 260 AAA_19 PF13245.1 76 0.00045 12.3 0.2 1 1 2.6e-05 0.0018 10.5 0.0 11 35 103 126 95 157 0.81 # 27149 # 27928 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_34 - 260 CbiA PF01656.18 195 0.00065 11.5 0.0 1 1 1.3e-05 0.00084 11.1 0.0 3 42 105 145 104 254 0.75 # 27149 # 27928 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_35 - 342 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 1.2e-06 20.3 0.6 1 2 8.8e-08 5.9e-06 18.1 0.0 25 48 16 39 5 40 0.92 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_35 - 342 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 1.2e-06 20.3 0.6 2 2 0.044 2.9 -0.1 0.1 3 18 95 110 93 110 0.88 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_66 - 240 Rep_3 PF01051.16 222 9.1e-44 142.0 0.4 1 1 1.6e-45 1.1e-43 141.8 0.4 2 213 8 227 7 233 0.92 # 55121 # 55840 # 1 # ID=1_66;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_35 - 342 rve PF00665.21 120 3.5e-23 74.4 0.0 1 1 1.9e-24 1.3e-22 72.5 0.0 3 119 118 243 117 244 0.96 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_42 - 237 YhjQ PF06564.7 244 0.00017 13.3 0.0 1 1 5e-06 0.00033 12.4 0.0 51 129 144 224 111 235 0.85 # 39717 # 40427 # 1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.429 1_34 - 260 AFG1_ATPase PF03969.11 362 0.0002 12.5 0.0 1 1 5.8e-06 0.00039 11.6 0.0 64 214 103 251 81 258 0.78 # 27149 # 27928 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_39 - 526 AAA_23 PF13476.1 202 0.0002 14.1 0.0 1 1 5.8e-06 0.00039 13.1 0.0 24 56 129 163 126 277 0.70 # 36866 # 38443 # -1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_34 - 260 AAA_24 PF13479.1 213 0.00088 11.2 0.1 1 1 3e-05 0.002 10.0 0.1 5 23 103 121 99 127 0.85 # 27149 # 27928 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_1 - 519 Methyltransf_26 PF13659.1 117 3e-13 42.2 0.0 1 1 9.8e-15 6.6e-13 41.1 0.0 3 114 220 354 218 357 0.74 # 996 # 2552 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.476 1_51 - 141 AAA-ATPase_like PF09820.4 284 0.00046 11.7 0.8 1 2 0.053 3.6 -1.1 0.0 183 221 11 50 4 54 0.74 # 44783 # 45205 # -1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.423 1_51 - 141 AAA-ATPase_like PF09820.4 284 0.00046 11.7 0.8 2 2 1.1e-05 0.00071 11.1 0.6 134 178 64 106 19 117 0.61 # 44783 # 45205 # -1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.423 1_28 - 344 Zeta_toxin PF06414.7 201 6.2e-05 14.5 0.0 1 1 1.8e-06 0.00012 13.5 0.0 15 51 173 209 163 211 0.88 # 21415 # 22446 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_38 - 970 AAA_30 PF13604.1 196 1e-50 164.4 0.9 1 1 1.5e-52 1e-50 164.4 0.9 1 184 475 650 475 658 0.98 # 33954 # 36863 # -1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 1_35 - 342 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 5.4e-05 15.5 0.2 1 2 2.7e-05 0.0018 10.6 0.0 22 46 16 40 8 68 0.81 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_35 - 342 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 5.4e-05 15.5 0.2 2 2 0.011 0.74 2.2 0.0 35 58 284 311 275 330 0.73 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_52 - 101 GerE PF00196.14 58 0.00022 12.9 0.0 1 1 1.1e-05 0.00038 12.2 0.0 15 42 33 60 30 65 0.90 # 45913 # 46215 # -1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_35 - 342 GerE PF00196.14 58 0.00023 12.9 0.0 1 1 1.2e-05 0.00041 12.0 0.0 16 40 15 39 4 40 0.87 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_39 - 526 TraG-D_C PF12696.2 128 2.7e-22 71.3 0.0 1 1 6.2e-24 4.2e-22 70.8 0.0 3 127 360 481 358 482 0.85 # 36866 # 38443 # -1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_34 - 260 Bac_DnaA PF00308.13 219 3.4e-09 28.9 0.0 1 1 7.8e-11 5.2e-09 28.4 0.0 36 136 103 201 90 209 0.84 # 27149 # 27928 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_28 - 344 TIGR03263 TIGR03263 180 0.00063 11.4 0.0 1 1 1.8e-05 0.0012 10.5 0.0 4 27 177 200 174 210 0.83 # 21415 # 22446 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_1 - 519 UPF0020 PF01170.13 180 1.1e-08 27.1 0.0 1 1 4.9e-10 3.3e-08 25.6 0.0 10 117 201 304 195 311 0.76 # 996 # 2552 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.476 1_32 - 440 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 2.5e-19 62.0 0.0 1 2 0.017 1.1 1.0 0.0 6 41 138 172 135 226 0.78 # 24312 # 25631 # 1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.614 1_32 - 440 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 2.5e-19 62.0 0.0 2 2 3.7e-20 2.4e-18 58.7 0.0 6 213 264 433 259 433 0.85 # 24312 # 25631 # 1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.614 1_5 - 190 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.00012 13.7 0.0 1 2 0.056 1.9 0.3 0.0 31 40 148 157 144 160 0.85 # 7396 # 7965 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.477 1_5 - 190 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.00012 13.7 0.0 2 2 3.1e-05 0.001 10.8 0.0 18 37 163 182 148 188 0.88 # 7396 # 7965 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.477 1_35 - 342 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.0002 13.0 0.6 1 1 1.5e-05 0.00052 11.7 0.6 18 40 15 37 3 40 0.82 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_34 - 260 AAA PF00004.24 132 1.4e-08 27.3 0.0 1 1 8.2e-10 2.7e-08 26.4 0.0 1 70 104 175 104 207 0.82 # 27149 # 27928 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_38 - 970 AAA PF00004.24 132 3.7e-06 19.5 0.0 1 1 3.2e-07 1.1e-05 18.0 0.0 3 74 497 575 495 593 0.66 # 33954 # 36863 # -1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 1_60 - 166 RepA_C PF04796.7 161 4.5e-14 44.7 0.0 1 1 9e-16 6e-14 44.3 0.0 44 127 54 131 48 142 0.82 # 50560 # 51057 # -1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.578 1_1 - 519 Eco57I PF07669.6 106 3.2e-07 23.1 0.1 1 2 2.3e-07 1.5e-05 17.7 0.0 3 104 294 406 291 408 0.81 # 996 # 2552 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.476 1_1 - 519 Eco57I PF07669.6 106 3.2e-07 23.1 0.1 2 2 0.015 1 2.2 0.0 54 85 412 444 409 451 0.85 # 996 # 2552 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.476 1_5 - 190 MRP-L20 PF12824.2 164 2.2e-06 20.1 0.0 1 1 4.5e-08 3e-06 19.6 0.0 70 123 133 184 116 189 0.78 # 7396 # 7965 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.477 1_38 - 970 Torsin PF06309.6 127 1.8e-05 17.0 0.0 1 1 5.9e-07 4e-05 15.9 0.0 55 88 494 527 473 553 0.82 # 33954 # 36863 # -1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 1_5 - 190 MerR_1 PF13411.1 69 9.8e-05 14.5 0.4 1 2 0.0072 0.48 2.7 0.0 45 66 78 99 76 102 0.82 # 7396 # 7965 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.477 1_5 - 190 MerR_1 PF13411.1 69 9.8e-05 14.5 0.4 2 2 6.5e-05 0.0044 9.2 0.1 1 23 166 188 166 189 0.94 # 7396 # 7965 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.477 1_28 - 344 cobW PF02492.14 178 0.0001 14.1 0.0 1 1 3.1e-06 0.00021 13.1 0.0 3 43 177 216 175 342 0.87 # 21415 # 22446 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_34 - 260 AAA_16 PF13191.1 185 9.8e-06 18.0 2.4 1 1 4.8e-06 8e-05 15.0 0.1 23 51 100 128 86 149 0.80 # 27149 # 27928 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_28 - 344 AAA_16 PF13191.1 185 3.2e-05 16.3 0.0 1 1 3.7e-06 6.2e-05 15.4 0.0 25 51 175 201 155 225 0.81 # 21415 # 22446 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_38 - 970 AAA_16 PF13191.1 185 3.3e-05 16.2 0.6 1 1 1.7e-05 0.00028 13.2 0.0 12 59 481 527 472 553 0.72 # 33954 # 36863 # -1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 1_20 - 877 AAA_16 PF13191.1 185 0.00069 12.0 0.0 1 1 0.00052 0.0086 8.4 0.0 27 49 497 519 488 547 0.85 # 13748 # 16378 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 1_34 - 260 AAA_22 PF13401.1 131 8.4e-07 21.6 0.0 1 2 1.7e-05 0.00028 13.4 0.1 4 28 101 125 98 148 0.75 # 27149 # 27928 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_34 - 260 AAA_22 PF13401.1 131 8.4e-07 21.6 0.0 2 2 0.0033 0.055 6.0 0.0 77 101 151 178 124 201 0.64 # 27149 # 27928 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_38 - 970 AAA_22 PF13401.1 131 3.8e-05 16.2 0.2 1 1 0.00024 0.0041 9.6 0.0 5 56 493 551 489 602 0.67 # 33954 # 36863 # -1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 1_28 - 344 AAA_22 PF13401.1 131 6.8e-05 15.4 0.0 1 1 1e-05 0.00018 14.0 0.0 4 29 174 199 171 243 0.83 # 21415 # 22446 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_20 - 877 AAA_22 PF13401.1 131 0.00036 13.0 0.1 1 1 0.00018 0.0031 10.0 0.0 6 29 496 519 494 584 0.86 # 13748 # 16378 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 1_34 - 260 TIGR00362 TIGR00362 437 1.6e-10 32.6 0.0 1 1 3.3e-12 2.2e-10 32.1 0.0 140 240 104 202 94 210 0.89 # 27149 # 27928 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_35 - 342 NUMOD1 PF07453.8 37 1.3e-05 17.3 0.1 1 1 6.8e-07 4.6e-05 15.6 0.0 17 37 18 38 15 38 0.95 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_39 - 526 AAA_29 PF13555.1 62 7.9e-05 14.6 0.1 1 1 7.7e-06 0.00017 13.5 0.1 18 40 119 141 112 154 0.84 # 36866 # 38443 # -1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_28 - 344 AAA_29 PF13555.1 62 8.9e-05 14.4 0.2 1 1 9e-06 0.0002 13.2 0.2 24 39 174 190 164 195 0.78 # 21415 # 22446 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_20 - 877 AAA_29 PF13555.1 62 0.00013 13.9 0.0 1 1 1.4e-05 0.0003 12.7 0.0 25 41 496 512 484 524 0.81 # 13748 # 16378 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 1_35 - 342 HTH_Tnp_Tc3_1 PF11427.3 50 9.5e-07 20.8 0.0 1 1 2.8e-08 1.8e-06 19.9 0.0 13 45 10 42 3 46 0.90 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_35 - 342 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 0.00039 12.4 0.0 1 1 1.7e-05 0.0011 11.0 0.0 16 57 15 56 8 76 0.77 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_34 - 260 AAA_28 PF13521.1 163 0.00017 13.9 0.0 1 1 1e-05 0.00033 13.0 0.0 1 49 103 156 103 171 0.73 # 27149 # 27928 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_28 - 344 AAA_28 PF13521.1 163 0.00053 12.3 0.0 1 1 3.6e-05 0.0012 11.1 0.0 1 33 176 212 176 237 0.78 # 21415 # 22446 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_5 - 190 HTH_32 PF13565.1 77 7.3e-07 22.3 0.5 1 2 0.041 2.7 1.3 0.0 24 51 36 68 15 81 0.66 # 7396 # 7965 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.477 1_5 - 190 HTH_32 PF13565.1 77 7.3e-07 22.3 0.5 2 2 1e-07 7e-06 19.2 0.2 7 76 127 185 121 186 0.71 # 7396 # 7965 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.477 1_35 - 342 GntR PF00392.16 64 0.00016 13.5 0.0 1 1 1.2e-05 0.00077 11.3 0.0 26 45 19 38 15 40 0.88 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_35 - 342 HTH_3 PF01381.17 55 7.8e-05 14.9 0.0 1 1 2.4e-06 0.00016 13.9 0.0 7 32 15 40 9 57 0.83 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_35 - 342 HTH_23 PF13384.1 50 1.7e-09 29.5 0.4 1 1 7.5e-11 1.7e-09 29.5 0.4 13 39 13 39 8 44 0.91 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_5 - 190 HTH_23 PF13384.1 50 8.6e-06 17.7 0.0 1 1 1.2e-06 2.7e-05 16.1 0.0 12 37 160 185 151 188 0.84 # 7396 # 7965 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.477 1_52 - 101 HTH_23 PF13384.1 50 0.00011 14.2 0.1 1 1 8.8e-06 0.0002 13.4 0.1 14 40 32 59 7 63 0.86 # 45913 # 46215 # -1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_5 - 190 HTH_7 PF02796.10 45 7.3e-18 56.6 0.1 1 1 1.1e-18 3.6e-17 54.4 0.1 1 44 144 188 144 189 0.98 # 7396 # 7965 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.477 1_35 - 342 HTH_7 PF02796.10 45 7.4e-09 27.8 0.1 1 1 4.5e-10 1.5e-08 26.8 0.1 12 44 8 40 2 41 0.89 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_35 - 342 HTH_29 PF13551.1 112 2.5e-06 20.0 1.1 1 1 2.4e-07 8.1e-06 18.4 0.0 7 35 13 40 8 72 0.86 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_5 - 190 HTH_29 PF13551.1 112 0.00034 13.1 3.1 1 2 0.0022 0.073 5.6 0.3 37 71 129 162 122 166 0.75 # 7396 # 7965 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.477 1_5 - 190 HTH_29 PF13551.1 112 0.00034 13.1 3.1 2 2 0.00028 0.0093 8.5 0.0 6 32 159 185 154 188 0.80 # 7396 # 7965 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.477 1_1 - 519 Methyltransf_31 PF13847.1 152 0.00017 13.5 0.0 1 1 4.1e-06 0.00028 12.9 0.0 5 110 219 355 215 439 0.68 # 996 # 2552 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.476 1_38 - 970 PhoH PF02562.11 205 1.7e-08 26.2 0.9 1 3 1.5e-05 0.00051 11.6 0.0 8 46 479 518 474 526 0.73 # 33954 # 36863 # -1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 1_38 - 970 PhoH PF02562.11 205 1.7e-08 26.2 0.9 2 3 0.00011 0.0036 8.8 0.0 121 161 561 602 559 628 0.82 # 33954 # 36863 # -1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 1_38 - 970 PhoH PF02562.11 205 1.7e-08 26.2 0.9 3 3 0.03 0.99 0.9 0.0 111 179 856 923 849 933 0.80 # 33954 # 36863 # -1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 1_34 - 260 PhoH PF02562.11 205 2.1e-07 22.7 0.1 1 1 1e-08 3.3e-07 22.0 0.1 14 56 96 138 84 163 0.80 # 27149 # 27928 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_34 - 260 AAA_5 PF07728.9 139 1.2e-05 17.4 0.0 1 1 4.6e-07 3.1e-05 16.1 0.0 1 74 103 172 103 177 0.80 # 27149 # 27928 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_44 - 257 SprT-like PF10263.4 157 2.2e-30 97.7 0.0 1 1 6.5e-32 4.4e-30 96.8 0.0 1 151 12 231 12 238 0.93 # 41011 # 41781 # 1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 1_3 - 1039 ResIII PF04851.10 184 2.8e-35 114.1 0.1 1 1 2.3e-36 1.5e-34 111.7 0.1 3 183 271 439 269 440 0.89 # 3871 # 6987 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.466 1_3 - 1039 SNF2_N PF00176.18 299 1.8e-05 15.9 0.0 1 1 6.2e-07 4.1e-05 14.8 0.0 1 173 275 439 275 448 0.77 # 3871 # 6987 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.466 1_39 - 526 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 7.4e-117 382.5 0.0 1 1 3.9e-118 8.8e-117 382.2 0.0 1 384 110 499 110 501 0.98 # 36866 # 38443 # -1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_20 - 877 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 8.3e-07 20.2 0.0 1 2 9.4e-07 2.1e-05 15.6 0.0 15 54 494 533 488 540 0.89 # 13748 # 16378 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 1_20 - 877 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 8.3e-07 20.2 0.0 2 2 0.012 0.26 2.1 0.0 241 320 704 784 691 817 0.80 # 13748 # 16378 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 1_28 - 344 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 6.3e-05 14.0 0.0 1 1 4.2e-06 9.5e-05 13.4 0.0 14 40 173 199 168 235 0.88 # 21415 # 22446 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_28 - 344 AAA_18 PF13238.1 129 1.2e-05 18.0 0.0 1 1 7.2e-07 2.4e-05 17.0 0.0 1 33 177 221 177 252 0.75 # 21415 # 22446 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_39 - 526 AAA_18 PF13238.1 129 0.00027 13.6 0.0 1 1 1.7e-05 0.00057 12.6 0.0 1 40 127 168 127 210 0.73 # 36866 # 38443 # -1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_64 - 422 IMS_HHH PF11798.3 32 3.1e-07 22.6 0.0 1 1 1.4e-08 9.1e-07 21.2 0.0 4 32 171 199 168 199 0.85 # 52638 # 53903 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 1_32 - 440 DDE_Tnp_1_6 PF13751.1 125 2.7e-19 61.8 0.2 1 1 4e-21 2.7e-19 61.8 0.2 52 125 364 437 356 437 0.92 # 24312 # 25631 # 1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.614 1_35 - 342 HTH_Tnp_IS1 PF12759.2 46 1.3e-05 17.0 0.1 1 1 3.6e-07 2.4e-05 16.1 0.1 17 43 13 39 3 41 0.83 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_28 - 344 DUF258 PF03193.11 161 4.2e-05 15.1 0.0 1 2 0.011 0.24 2.9 0.0 13 59 45 95 37 141 0.75 # 21415 # 22446 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_28 - 344 DUF258 PF03193.11 161 4.2e-05 15.1 0.0 2 2 8.6e-05 0.0019 9.7 0.0 29 59 167 198 145 222 0.75 # 21415 # 22446 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_20 - 877 DUF258 PF03193.11 161 4.7e-05 15.0 0.0 1 1 4.1e-06 9.2e-05 14.0 0.0 37 59 496 518 469 548 0.88 # 13748 # 16378 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 1_34 - 260 DUF258 PF03193.11 161 0.00014 13.4 0.0 1 1 1.1e-05 0.00025 12.6 0.0 26 59 92 125 80 153 0.82 # 27149 # 27928 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_39 - 526 DUF87 PF01935.12 229 1.2e-09 30.6 0.0 1 1 1e-10 2.3e-09 29.7 0.0 24 79 125 188 103 388 0.88 # 36866 # 38443 # -1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_28 - 344 DUF87 PF01935.12 229 1.6e-05 17.2 0.0 1 1 1.4e-06 3.1e-05 16.2 0.0 28 47 179 198 167 211 0.91 # 21415 # 22446 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_20 - 877 DUF87 PF01935.12 229 0.0001 14.5 0.1 1 1 4.7e-05 0.0011 11.2 0.0 25 60 496 530 494 533 0.92 # 13748 # 16378 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 1_35 - 342 HTH_28 PF13518.1 52 8.8e-07 21.3 1.6 1 1 3.9e-08 1.3e-06 20.7 0.3 9 34 14 39 10 40 0.89 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_5 - 190 HTH_28 PF13518.1 52 3.8e-05 16.1 0.0 1 1 4.8e-06 0.00016 14.0 0.0 13 32 166 185 159 188 0.87 # 7396 # 7965 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.477 1_35 - 342 DUF2089 PF09862.4 113 8.8e-05 14.7 0.0 1 1 2.3e-06 0.00015 13.9 0.0 34 70 2 38 1 45 0.94 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_5 - 190 HTH_24 PF13412.1 48 1.5e-05 16.7 0.0 1 2 0.074 2.5 0.0 0.0 30 46 74 90 69 91 0.88 # 7396 # 7965 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.477 1_5 - 190 HTH_24 PF13412.1 48 1.5e-05 16.7 0.0 2 2 3.9e-06 0.00013 13.7 0.0 9 38 157 186 157 188 0.92 # 7396 # 7965 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.477 1_35 - 342 HTH_24 PF13412.1 48 3.3e-05 15.6 0.1 1 1 1.8e-06 6e-05 14.8 0.1 11 39 12 39 10 40 0.87 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_28 - 344 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 0.00023 13.6 0.0 1 1 3e-05 0.001 11.5 0.0 15 63 168 216 161 223 0.84 # 21415 # 22446 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_34 - 260 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 0.00026 13.4 0.0 1 1 1.3e-05 0.00042 12.7 0.0 9 64 87 144 84 229 0.70 # 27149 # 27928 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_35 - 342 HTH_30 PF13556.1 59 1.1e-05 17.3 0.4 1 1 4.1e-07 2.8e-05 16.1 0.4 6 34 11 39 10 40 0.90 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_1 - 519 TIGR03533 TIGR03533 284 4.2e-07 21.5 0.0 1 1 1.7e-08 1.2e-06 20.1 0.0 118 200 214 304 201 314 0.83 # 996 # 2552 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.476 1_1 - 519 TIGR03534 TIGR03534 253 2.8e-10 32.0 0.0 1 1 7.2e-12 4.8e-10 31.3 0.0 84 166 210 303 196 350 0.76 # 996 # 2552 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.476 1_35 - 342 HTH_10 PF04967.7 53 0.00043 12.3 0.0 1 1 1.5e-05 0.001 11.0 0.0 25 45 19 39 16 41 0.92 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_3 - 1039 DEAD PF00270.24 169 2.2e-09 29.4 0.0 1 1 1.5e-10 1e-08 27.2 0.0 22 142 308 424 294 440 0.73 # 3871 # 6987 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.466 1_28 - 344 Miro PF08477.8 119 0.00022 14.1 0.0 1 1 7e-06 0.00047 13.0 0.0 2 25 177 200 176 230 0.74 # 21415 # 22446 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_38 - 970 UvrD_C_2 PF13538.1 104 5.8e-16 50.9 1.2 1 2 0.017 1.2 1.8 0.1 31 67 228 271 212 287 0.68 # 33954 # 36863 # -1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 1_38 - 970 UvrD_C_2 PF13538.1 104 5.8e-16 50.9 1.2 2 2 2.9e-16 1.9e-14 46.0 0.1 3 103 796 895 794 896 0.76 # 33954 # 36863 # -1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 1_28 - 344 IIGP PF05049.8 376 0.00024 12.3 0.0 1 1 5.9e-06 0.0004 11.6 0.0 32 55 171 194 161 203 0.84 # 21415 # 22446 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_35 - 342 HTH_36 PF13730.1 55 4.7e-05 15.9 0.0 1 1 1.4e-06 9.4e-05 14.9 0.0 27 47 19 39 11 40 0.93 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_28 - 344 T2SE PF00437.15 272 1.9e-48 157.0 0.0 1 1 3.4e-50 2.3e-48 156.7 0.0 2 269 25 323 24 326 0.91 # 21415 # 22446 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_34 - 260 NACHT PF05729.7 166 8.6e-05 14.6 0.0 1 1 4.1e-06 0.00014 13.9 0.0 3 49 104 151 102 200 0.81 # 27149 # 27928 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_20 - 877 NACHT PF05729.7 166 0.00056 11.9 0.0 1 1 4.6e-05 0.0015 10.5 0.0 4 80 498 574 496 620 0.81 # 13748 # 16378 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 1_28 - 344 UPF0079 PF02367.12 123 0.00043 12.3 0.0 1 1 1.7e-05 0.0011 10.9 0.0 18 44 177 203 164 210 0.80 # 21415 # 22446 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_28 - 344 AAA_17 PF13207.1 121 1.9e-05 17.8 0.0 1 1 2.6e-06 5.8e-05 16.3 0.0 2 27 177 200 176 261 0.79 # 21415 # 22446 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_34 - 260 AAA_17 PF13207.1 121 0.00026 14.2 0.0 1 1 2e-05 0.00044 13.4 0.0 2 26 104 131 103 216 0.74 # 27149 # 27928 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_39 - 526 AAA_17 PF13207.1 121 0.00028 14.1 0.0 1 2 0.00028 0.0063 9.7 0.0 2 21 127 146 126 240 0.74 # 36866 # 38443 # -1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_39 - 526 AAA_17 PF13207.1 121 0.00028 14.1 0.0 2 2 0.08 1.8 1.8 0.0 15 97 292 370 286 390 0.58 # 36866 # 38443 # -1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_34 - 260 AAA_25 PF13481.1 194 4.8e-07 21.7 0.1 1 1 4.4e-08 1.5e-06 20.1 0.1 9 60 72 128 68 201 0.77 # 27149 # 27928 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_39 - 526 AAA_25 PF13481.1 194 6.8e-05 14.7 0.0 1 1 1.9e-05 0.00064 11.5 0.0 32 60 123 152 95 203 0.77 # 36866 # 38443 # -1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_46 - 86 Zot PF05707.7 193 0.00062 11.6 0.0 1 1 1e-05 0.00069 11.4 0.0 77 140 11 76 2 83 0.86 # 42015 # 42272 # -1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 1_38 - 970 Viral_helicase1 PF01443.13 234 3.5e-19 61.5 0.3 1 2 1.3e-11 4.3e-10 31.8 0.0 2 104 496 603 495 654 0.85 # 33954 # 36863 # -1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 1_38 - 970 Viral_helicase1 PF01443.13 234 3.5e-19 61.5 0.3 2 2 2.8e-10 9.3e-09 27.4 0.1 184 234 851 897 780 897 0.79 # 33954 # 36863 # -1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 1_28 - 344 Viral_helicase1 PF01443.13 234 9.3e-05 14.3 0.0 1 1 4.7e-06 0.00016 13.6 0.0 1 22 177 198 177 224 0.79 # 21415 # 22446 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_28 - 344 Pox_A32 PF04665.7 241 0.00034 12.3 0.2 1 1 1.1e-05 0.00072 11.2 0.0 11 37 172 198 165 206 0.85 # 21415 # 22446 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_34 - 260 AAA_14 PF13173.1 128 2.4e-07 23.1 0.0 1 2 3.4e-08 1.2e-06 20.9 0.0 3 97 102 203 100 219 0.64 # 27149 # 27928 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_34 - 260 AAA_14 PF13173.1 128 2.4e-07 23.1 0.0 2 2 0.096 3.2 0.0 0.0 14 46 215 247 212 257 0.80 # 27149 # 27928 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_39 - 526 AAA_14 PF13173.1 128 1.7e-05 17.1 0.0 1 2 1.3e-05 0.00043 12.5 0.0 5 82 127 213 123 226 0.66 # 36866 # 38443 # -1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_39 - 526 AAA_14 PF13173.1 128 1.7e-05 17.1 0.0 2 2 0.024 0.79 2.0 0.0 33 100 321 396 304 410 0.62 # 36866 # 38443 # -1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_35 - 342 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 2e-05 16.1 0.3 1 1 7e-07 4.7e-05 14.9 0.3 23 50 13 40 9 40 0.87 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_28 - 344 AAA_33 PF13671.1 143 4.9e-06 18.8 0.0 1 1 2.8e-07 1.9e-05 16.9 0.0 2 32 177 210 177 268 0.79 # 21415 # 22446 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_39 - 526 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 8e-16 49.9 0.0 1 1 2.4e-17 1.6e-15 48.9 0.0 304 438 358 494 306 501 0.82 # 36866 # 38443 # -1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_1 - 519 MTS PF05175.9 170 5.9e-07 21.3 0.0 1 1 1.9e-08 1.2e-06 20.3 0.0 30 140 215 355 198 374 0.83 # 996 # 2552 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.476 1_28 - 344 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00018 14.1 0.0 1 1 6.4e-06 0.00043 12.8 0.0 1 23 177 199 177 229 0.83 # 21415 # 22446 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_34 - 260 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00015 13.8 0.1 1 2 0.0015 0.1 4.6 0.1 2 30 104 132 103 143 0.82 # 27149 # 27928 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_34 - 260 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00015 13.8 0.1 2 2 0.0003 0.02 6.9 0.0 87 108 155 176 141 202 0.77 # 27149 # 27928 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_20 - 877 PduV-EutP PF10662.4 143 7e-05 14.7 0.1 1 1 3e-06 0.0002 13.2 0.1 4 29 497 522 494 525 0.92 # 13748 # 16378 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 1_35 - 342 HTH_17 PF12728.2 51 0.0001 14.9 0.0 1 1 8.7e-06 0.00029 13.4 0.0 4 24 20 40 19 50 0.88 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_5 - 190 HTH_17 PF12728.2 51 0.00015 14.3 0.1 1 1 9.7e-06 0.00032 13.3 0.1 2 22 166 186 165 188 0.93 # 7396 # 7965 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.477 1_5 - 190 HTH_11 PF08279.7 55 1e-06 20.7 0.1 1 1 9.3e-08 3.1e-06 19.2 0.0 6 35 157 185 154 187 0.84 # 7396 # 7965 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.477 1_35 - 342 HTH_11 PF08279.7 55 3.7e-06 18.9 0.4 1 1 2.3e-07 7.7e-06 17.9 0.4 4 37 6 39 3 40 0.81 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_35 - 342 Sigma70_ECF PF07638.6 185 0.00027 13.0 0.0 1 1 8.2e-06 0.00055 12.0 0.0 140 172 4 38 2 46 0.82 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_38 - 970 PIF1 PF05970.9 364 7.5e-06 17.4 0.6 1 2 5.4e-07 3.6e-05 15.1 0.1 5 60 479 530 475 586 0.77 # 33954 # 36863 # -1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 1_38 - 970 PIF1 PF05970.9 364 7.5e-06 17.4 0.6 2 2 0.063 4.2 -1.6 0.0 333 362 792 820 781 822 0.86 # 33954 # 36863 # -1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 1_5 - 190 TrmB PF01978.14 68 2.8e-05 16.2 0.0 1 1 8.4e-07 5.6e-05 15.2 0.0 6 42 149 185 146 188 0.92 # 7396 # 7965 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.477 1_35 - 342 LacI PF00356.16 46 2.3e-05 16.4 0.2 1 1 1.2e-06 7.9e-05 14.6 0.0 2 25 20 43 19 50 0.86 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_20 - 877 AAA_10 PF12846.2 304 2.3e-35 114.8 0.1 1 2 0.033 0.56 1.8 0.0 56 114 304 371 285 413 0.79 # 13748 # 16378 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 1_20 - 877 AAA_10 PF12846.2 304 2.3e-35 114.8 0.1 2 2 8.4e-35 1.4e-33 108.9 0.0 2 304 495 790 494 790 0.87 # 13748 # 16378 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 1_39 - 526 AAA_10 PF12846.2 304 3.3e-09 28.9 0.1 1 2 3e-07 5.1e-06 18.4 0.1 3 43 126 175 124 192 0.89 # 36866 # 38443 # -1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_39 - 526 AAA_10 PF12846.2 304 3.3e-09 28.9 0.1 2 2 0.00033 0.0056 8.4 0.0 240 289 373 425 322 439 0.76 # 36866 # 38443 # -1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_34 - 260 AAA_10 PF12846.2 304 2.5e-05 16.1 0.2 1 2 0.058 0.96 1.1 0.0 106 155 28 69 4 89 0.61 # 27149 # 27928 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_34 - 260 AAA_10 PF12846.2 304 2.5e-05 16.1 0.2 2 2 1.8e-05 0.00029 12.6 0.1 3 35 103 135 101 172 0.84 # 27149 # 27928 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_28 - 344 AAA_10 PF12846.2 304 6.4e-05 14.8 0.0 1 1 6.1e-06 0.0001 14.1 0.0 3 26 176 199 174 234 0.82 # 21415 # 22446 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_35 - 342 HTH_20 PF12840.2 61 5.1e-05 15.4 0.0 1 1 2e-06 0.00013 14.1 0.0 18 46 12 39 10 40 0.91 # 27925 # 28950 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_28 - 344 Septin PF00735.13 281 0.00022 12.6 0.0 1 1 5.3e-06 0.00035 11.9 0.0 4 33 174 203 172 228 0.82 # 21415 # 22446 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_34 - 260 IstB_IS21 PF01695.12 178 5.8e-66 213.6 0.0 1 1 2.2e-67 1.5e-65 212.3 0.0 2 177 56 233 55 234 0.96 # 27149 # 27928 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_64 - 422 DNA_pol_lambd_f PF10391.4 52 1.5e-06 20.1 0.1 1 2 3e-07 2e-05 16.5 0.0 6 35 182 211 180 216 0.84 # 52638 # 53903 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 1_64 - 422 DNA_pol_lambd_f PF10391.4 52 1.5e-06 20.1 0.1 2 2 0.048 3.2 -0.2 0.0 6 20 265 279 256 283 0.80 # 52638 # 53903 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 1_53 - 179 SSB PF00436.20 104 1.5e-44 142.5 0.8 1 1 2.9e-46 1.9e-44 142.2 0.8 1 103 25 131 25 132 0.97 # 46283 # 46819 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.523 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/ddbb1719-5131-4c5c-af8c-577d917bab01 # Target file: checkm_output/bins/pm1584/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm1584/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/ddbb1719-5131-4c5c-af8c-577d917bab01 checkm_output/bins/pm1584/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 09:46:57 2017 # [ok]