# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_41 - 318 KaiC PF06745.8 227 0.00013 13.5 0.1 1 1 3.9e-06 0.00027 12.5 0.1 21 57 119 153 113 171 0.86 # 32677 # 33630 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=8bp;gc_cont=0.371 1_61 - 367 ABC_tran PF00005.22 137 1.5e-05 17.8 0.0 1 1 1.1e-06 2.5e-05 17.0 0.0 9 35 193 219 187 303 0.83 # 51549 # 52649 # -1 # ID=1_61;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.430 1_44 - 511 ABC_tran PF00005.22 137 3.7e-05 16.4 0.2 1 1 4.1e-06 9.5e-05 15.1 0.0 12 41 233 262 228 297 0.83 # 35226 # 36758 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.412 1_64 - 304 ABC_tran PF00005.22 137 7.7e-05 15.4 0.2 1 1 9.6e-06 0.00022 13.9 0.1 12 29 11 28 5 76 0.87 # 53830 # 54741 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_61 - 367 DUF815 PF05673.8 250 0.00066 11.0 0.0 1 1 1.7e-05 0.0012 10.2 0.0 54 77 196 219 165 232 0.88 # 51549 # 52649 # -1 # ID=1_61;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.430 1_35 - 162 TIGR00406 TIGR00406 288 0.00027 12.5 0.3 1 1 5.9e-06 0.00041 11.9 0.0 221 261 91 131 74 150 0.78 # 28667 # 29152 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=12bp;gc_cont=0.276 1_61 - 367 Sigma54_activat PF00158.21 168 8.2e-05 14.5 0.0 1 1 1.9e-06 0.00013 13.8 0.0 8 46 181 219 174 248 0.75 # 51549 # 52649 # -1 # ID=1_61;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.430 1_44 - 511 AAA_PrkA PF08298.6 358 0.00021 12.4 0.0 1 1 7e-06 0.00048 11.2 0.0 90 123 234 269 224 284 0.78 # 35226 # 36758 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.412 1_61 - 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