# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 2_55 - 357 KaiC PF06745.8 227 0.00022 15.1 0.0 1 1 2e-06 0.00037 14.4 0.0 12 52 150 189 127 196 0.78 # 47517 # 48587 # 1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.688 1_86 - 356 KaiC PF06745.8 227 0.00097 13.0 0.0 1 1 8.8e-06 0.0016 12.3 0.0 11 52 148 188 126 195 0.78 # 96752 # 97819 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 1_146 - 370 TrkA_N PF02254.13 116 0.00032 15.4 0.0 1 1 1.5e-06 0.00055 14.7 0.0 1 45 190 236 190 253 0.84 # 143840 # 144949 # -1 # ID=1_146;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 4_24 - 178 Zn_Tnp_IS1 PF03811.8 36 0.011 10.0 4.8 1 2 0.0024 0.87 3.9 0.2 8 23 39 54 33 56 0.83 # 20271 # 20804 # 1 # ID=4_24;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.425 4_24 - 178 Zn_Tnp_IS1 PF03811.8 36 0.011 10.0 4.8 2 2 0.00028 0.1 6.9 0.9 5 15 92 102 89 114 0.76 # 20271 # 20804 # 1 # ID=4_24;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.425 3_30 - 156 MADF_DNA_bdg PF10545.4 85 0.00067 14.6 0.0 1 1 4.4e-06 0.0016 13.4 0.0 31 65 27 62 23 86 0.80 # 32053 # 32520 # -1 # ID=3_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.494 4_28 - 553 K_oxygenase PF13434.1 341 4.8e-05 17.1 0.0 1 1 2.8e-07 0.0001 16.0 0.0 107 214 69 174 65 190 0.76 # 22901 # 24559 # -1 # ID=4_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 4_29 - 117 HTH_IclR PF09339.5 52 0.00034 15.0 2.2 1 1 2.9e-06 0.0011 13.3 2.2 2 50 17 75 16 77 0.94 # 24720 # 25070 # 1 # ID=4_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 1_109 - 85 Trm112p PF03966.11 68 0.0047 12.1 1.9 1 1 6.4e-05 0.023 9.8 1.9 3 65 38 74 14 76 0.83 # 115979 # 116233 # -1 # ID=1_109;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.463 4_37 - 237 ABC_tran PF00005.22 137 5.3e-33 109.0 0.0 1 1 2.1e-34 7e-33 108.6 0.0 1 137 25 176 25 176 0.92 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 2_41 - 274 ABC_tran PF00005.22 137 7.1e-28 92.4 0.0 1 1 2.9e-29 9.8e-28 91.9 0.0 2 137 32 181 31 181 0.93 # 36184 # 37005 # -1 # ID=2_41;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.612 1_86 - 356 ABC_tran PF00005.22 137 7.2e-05 17.9 0.0 1 1 2.9e-06 9.8e-05 17.4 0.0 8 67 153 216 149 313 0.85 # 96752 # 97819 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 1_151 - 572 ABC_tran PF00005.22 137 0.00013 17.0 0.0 1 1 8.6e-06 0.00029 15.9 0.0 13 51 39 77 34 139 0.80 # 147762 # 149477 # 1 # ID=1_151;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.460 2_55 - 357 ABC_tran PF00005.22 137 0.00026 16.1 0.0 1 1 1.2e-05 0.0004 15.5 0.0 8 67 154 217 150 265 0.83 # 47517 # 48587 # 1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.688 1_57 - 713 ABC_tran PF00005.22 137 0.00051 15.1 0.0 1 1 4.4e-05 0.0015 13.6 0.0 14 37 26 49 16 149 0.77 # 66432 # 68570 # -1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 2_22 - 819 ABC_tran PF00005.22 137 0.00065 14.8 3.3 1 1 9.1e-05 0.003 12.6 0.2 15 124 81 204 71 212 0.62 # 18865 # 21321 # -1 # ID=2_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_6 - 351 ABC_tran PF00005.22 137 0.00089 14.3 0.0 1 1 5.9e-05 0.002 13.2 0.0 14 116 99 224 96 230 0.54 # 5094 # 6146 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 1_69 - 213 ABC_tran PF00005.22 137 0.0029 12.6 0.0 1 1 0.00012 0.004 12.2 0.0 21 78 11 72 6 161 0.78 # 79029 # 79667 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.698 2_58 - 817 ABC_tran PF00005.22 137 0.0036 12.3 0.1 1 1 0.00058 0.019 10.0 0.0 15 37 445 467 438 481 0.86 # 49249 # 51699 # 1 # ID=2_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_89 - 817 ABC_tran PF00005.22 137 0.0037 12.3 0.1 1 1 0.0006 0.02 9.9 0.0 15 40 445 470 438 484 0.85 # 98480 # 100930 # 1 # ID=1_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 3_36 - 353 CP_ATPgrasp_1 PF04174.8 330 0.0033 10.8 0.0 1 2 0.057 21 -1.7 0.0 262 305 125 172 112 198 0.69 # 37712 # 38770 # -1 # ID=3_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.503 3_36 - 353 CP_ATPgrasp_1 PF04174.8 330 0.0033 10.8 0.0 2 2 2.7e-05 0.01 9.2 0.0 78 104 276 302 269 329 0.84 # 37712 # 38770 # -1 # ID=3_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.503 1_142 - 93 HTH_22 PF13309.1 64 0.0059 11.1 2.1 1 1 1.7e-05 0.0063 11.1 0.2 44 63 24 43 2 44 0.84 # 141153 # 141431 # 1 # ID=1_142;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 1_146 - 370 ADH_N PF08240.7 109 1.9e-29 96.4 2.2 1 1 5.2e-32 1.9e-29 96.4 2.2 2 108 28 154 27 155 0.92 # 143840 # 144949 # -1 # ID=1_146;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 1_151 - 572 DUF815 PF05673.8 250 0.00088 13.0 0.0 1 1 5.9e-06 0.0022 11.7 0.0 36 80 20 64 8 79 0.89 # 147762 # 149477 # 1 # ID=1_151;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.460 4_34 - 107 DUF134 PF02001.11 106 4.6e-23 75.9 0.0 1 1 1.4e-25 5.1e-23 75.8 0.0 10 98 3 90 1 98 0.91 # 26987 # 27307 # -1 # ID=4_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 1_49 - 559 N6_Mtase PF02384.11 311 0.00036 14.4 0.0 1 1 1.8e-06 0.00067 13.5 0.0 78 138 435 493 402 510 0.86 # 52814 # 54490 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 2_50 - 79 rve_3 PF13683.1 67 4.2e-17 56.2 0.3 1 1 5.1e-19 6.2e-17 55.7 0.3 23 67 15 59 10 59 0.96 # 42746 # 42982 # -1 # ID=2_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 1_143 - 205 rve_3 PF13683.1 67 3.6e-15 50.0 0.1 1 1 5.2e-17 6.4e-15 49.2 0.1 1 67 123 190 123 190 0.95 # 141686 # 142300 # 1 # ID=1_143;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 2_6 - 204 rve_3 PF13683.1 67 4.9e-14 46.4 0.1 1 1 6.1e-16 7.5e-14 45.8 0.1 2 67 119 185 118 185 0.96 # 5613 # 6224 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 1_6 - 351 Sigma54_activat PF00158.21 168 4.8e-05 17.6 0.0 1 1 4.9e-06 0.00059 14.1 0.0 14 114 88 183 77 218 0.60 # 5094 # 6146 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 2_55 - 357 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.0012 13.1 0.0 1 1 1.6e-05 0.0019 12.4 0.0 13 49 148 184 142 205 0.78 # 47517 # 48587 # 1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.688 1_86 - 356 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.0022 12.2 0.0 1 1 2.9e-05 0.0035 11.5 0.0 13 49 147 183 141 204 0.78 # 96752 # 97819 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 1_86 - 356 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 5.3e-08 27.3 0.0 1 1 1.3e-09 9.4e-08 26.5 0.0 34 108 152 223 139 226 0.79 # 96752 # 97819 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 2_55 - 357 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 3.7e-07 24.5 0.0 1 1 8.8e-09 6.5e-07 23.7 0.0 34 109 153 225 140 227 0.84 # 47517 # 48587 # 1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.688 3_7 - 695 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 4.5e-06 21.0 0.1 1 2 1.1e-05 0.00082 13.6 0.0 36 80 185 236 168 242 0.76 # 4674 # 6758 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 3_7 - 695 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 4.5e-06 21.0 0.1 2 2 0.0051 0.38 4.9 0.0 170 204 511 542 502 543 0.81 # 4674 # 6758 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 1_89 - 817 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.0025 12.0 0.0 1 1 6.9e-05 0.0051 11.0 0.0 30 59 433 462 406 468 0.75 # 98480 # 100930 # 1 # ID=1_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 2_58 - 817 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.0031 11.7 0.0 1 1 0.0001 0.0073 10.5 0.0 31 59 434 462 408 467 0.79 # 49249 # 51699 # 1 # ID=2_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_152 - 344 HTH_38 PF13936.1 44 0.00011 16.5 0.1 1 1 8.1e-07 0.0003 15.1 0.1 10 41 30 61 27 62 0.92 # 149561 # 150592 # 1 # ID=1_152;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_146 - 370 2-Hacid_dh_C PF02826.14 178 0.0024 11.8 0.1 1 1 1.1e-05 0.0042 11.0 0.1 36 73 187 225 176 238 0.83 # 143840 # 144949 # -1 # ID=1_146;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 4_28 - 553 FAD_oxidored PF12831.2 428 0.0033 11.2 4.6 1 2 0.00026 0.097 6.4 2.3 2 28 3 29 2 34 0.90 # 22901 # 24559 # -1 # ID=4_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 4_28 - 553 FAD_oxidored PF12831.2 428 0.0033 11.2 4.6 2 2 0.00078 0.29 4.8 0.0 45 120 144 221 138 240 0.68 # 22901 # 24559 # -1 # ID=4_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_86 - 356 MobB PF03205.9 140 4.4e-05 18.0 0.0 1 1 9.8e-07 7.2e-05 17.3 0.0 3 37 159 193 157 264 0.82 # 96752 # 97819 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 2_55 - 357 MobB PF03205.9 140 0.00013 16.5 0.1 1 1 2.9e-06 0.00021 15.7 0.1 3 46 160 199 158 268 0.79 # 47517 # 48587 # 1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.688 2_33 - 213 MobB PF03205.9 140 0.0004 14.8 0.0 1 1 8.3e-06 0.00061 14.3 0.0 10 38 11 38 1 104 0.89 # 29916 # 30554 # 1 # ID=2_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.695 1_69 - 213 MobB PF03205.9 140 0.00067 14.1 0.0 1 1 1.7e-05 0.0012 13.3 0.0 10 38 11 38 8 105 0.89 # 79029 # 79667 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.698 4_37 - 237 MobB PF03205.9 140 0.0024 12.3 0.1 1 1 6.2e-05 0.0046 11.4 0.1 2 19 37 54 36 62 0.89 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 1_56 - 600 UvrD-helicase PF00580.16 315 4.9e-45 148.9 0.1 1 2 3.6e-25 4.4e-23 76.7 0.0 1 144 9 131 9 146 0.86 # 64630 # 66429 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 1_56 - 600 UvrD-helicase PF00580.16 315 4.9e-45 148.9 0.1 2 2 7.5e-23 9.3e-21 69.1 0.5 214 304 162 255 153 265 0.89 # 64630 # 66429 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 2_5 - 680 UvrD-helicase PF00580.16 315 7.3e-39 128.6 0.2 1 1 6.6e-40 8.1e-38 125.2 0.2 2 307 6 260 5 266 0.90 # 3366 # 5405 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_10 - 603 UvrD-helicase PF00580.16 315 2.5e-30 100.5 6.8 1 3 2.8e-16 3.4e-14 47.5 0.1 2 106 5 92 4 118 0.87 # 8938 # 10746 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 1_10 - 603 UvrD-helicase PF00580.16 315 2.5e-30 100.5 6.8 2 3 4.4e-18 5.4e-16 53.5 0.3 209 314 146 248 135 249 0.87 # 8938 # 10746 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 1_10 - 603 UvrD-helicase PF00580.16 315 2.5e-30 100.5 6.8 3 3 0.024 2.9 1.8 0.1 96 186 417 490 372 601 0.57 # 8938 # 10746 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 4_29 - 117 HTH_34 PF13601.1 80 0.00095 14.0 0.0 1 1 4.1e-06 0.0015 13.3 0.0 2 46 32 75 31 82 0.88 # 24720 # 25070 # 1 # ID=4_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 4_12 - 407 TBPIP PF07106.8 169 0.087 7.1 44.4 1 3 0.0021 0.78 4.0 15.1 59 165 131 234 130 235 0.86 # 8119 # 9339 # -1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 4_12 - 407 TBPIP PF07106.8 169 0.087 7.1 44.4 2 3 0.0004 0.15 6.4 12.3 68 147 252 329 237 341 0.63 # 8119 # 9339 # -1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 4_12 - 407 TBPIP PF07106.8 169 0.087 7.1 44.4 3 3 0.0012 0.44 4.8 1.9 71 110 346 385 338 391 0.84 # 8119 # 9339 # -1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_138 - 513 DUF3584 PF12128.3 1201 0.05 5.6 7.4 1 2 2.5e-05 0.0093 8.0 2.5 305 377 13 86 4 100 0.86 # 135999 # 137537 # 1 # ID=1_138;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.603 1_138 - 513 DUF3584 PF12128.3 1201 0.05 5.6 7.4 2 2 0.0071 2.6 -0.1 0.2 738 765 373 400 333 422 0.56 # 135999 # 137537 # 1 # ID=1_138;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.603 4_28 - 553 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 2.2e-09 32.4 0.1 1 2 1.4e-05 0.005 11.6 0.0 89 196 64 179 43 185 0.73 # 22901 # 24559 # -1 # ID=4_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 4_28 - 553 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 2.2e-09 32.4 0.1 2 2 2.5e-07 9.2e-05 17.3 0.0 81 141 190 249 180 274 0.87 # 22901 # 24559 # -1 # ID=4_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 4_28 - 553 NAD_binding_7 PF13241.1 103 0.00057 14.9 0.1 1 2 0.019 6.9 1.8 0.0 9 37 2 32 1 103 0.75 # 22901 # 24559 # -1 # ID=4_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 4_28 - 553 NAD_binding_7 PF13241.1 103 0.00057 14.9 0.1 2 2 3e-05 0.011 10.7 0.0 8 75 151 250 136 279 0.64 # 22901 # 24559 # -1 # ID=4_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_89 - 817 DUF853 PF05872.7 504 6.9e-09 29.2 0.2 1 2 3.9e-05 0.0048 10.0 0.2 22 56 442 477 422 489 0.81 # 98480 # 100930 # 1 # ID=1_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 1_89 - 817 DUF853 PF05872.7 504 6.9e-09 29.2 0.2 2 2 3e-07 3.6e-05 17.0 0.0 213 310 595 684 580 700 0.81 # 98480 # 100930 # 1 # ID=1_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 2_58 - 817 DUF853 PF05872.7 504 1.1e-08 28.6 0.2 1 2 5.5e-05 0.0067 9.5 0.1 22 56 442 477 422 487 0.81 # 49249 # 51699 # 1 # ID=2_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 2_58 - 817 DUF853 PF05872.7 504 1.1e-08 28.6 0.2 2 2 3e-07 3.7e-05 16.9 0.0 220 310 602 684 585 696 0.78 # 49249 # 51699 # 1 # ID=2_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 3_7 - 695 DUF853 PF05872.7 504 0.00024 14.3 0.0 1 1 4.7e-06 0.00058 13.0 0.0 9 60 186 237 179 240 0.86 # 4674 # 6758 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 2_45 - 116 TetR_N PF00440.18 47 4.5e-15 49.8 0.3 1 1 7.1e-17 6.5e-15 49.3 0.3 1 46 36 81 36 82 0.97 # 38995 # 39342 # -1 # ID=2_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.658 1_80 - 212 TetR_N PF00440.18 47 1.3e-14 48.4 0.1 1 1 2.8e-16 2.6e-14 47.4 0.1 1 47 35 81 35 81 0.98 # 90560 # 91195 # -1 # ID=1_80;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 4_40 - 203 TetR_N PF00440.18 47 4.8e-10 33.7 0.0 1 1 1.5e-11 1.4e-09 32.2 0.0 11 47 27 63 17 63 0.86 # 32454 # 33062 # -1 # ID=4_40;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.573 2_73 - 86 TetR_N PF00440.18 47 0.00081 13.8 0.1 1 1 1.3e-05 0.0012 13.2 0.1 2 26 33 57 32 57 0.93 # 62782 # 63039 # -1 # ID=2_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 1_56 - 600 AAA_19 PF13245.1 76 1.7e-13 44.9 0.0 1 2 1.9e-13 8.6e-12 39.5 0.0 6 69 16 80 13 91 0.76 # 64630 # 66429 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 1_56 - 600 AAA_19 PF13245.1 76 1.7e-13 44.9 0.0 2 2 0.056 2.6 2.7 0.0 42 63 341 365 326 383 0.79 # 64630 # 66429 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 2_5 - 680 AAA_19 PF13245.1 76 1.7e-10 35.3 0.1 1 1 8.1e-12 3.7e-10 34.2 0.1 14 75 21 86 11 87 0.88 # 3366 # 5405 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_10 - 603 AAA_19 PF13245.1 76 1.5e-07 25.8 0.0 1 1 1.1e-08 4.9e-07 24.2 0.0 4 74 13 85 9 87 0.77 # 8938 # 10746 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 2_55 - 357 AAA_19 PF13245.1 76 3.6e-06 21.5 0.1 1 1 2.6e-07 1.2e-05 19.7 0.1 3 49 150 192 148 196 0.85 # 47517 # 48587 # 1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.688 1_86 - 356 AAA_19 PF13245.1 76 5.8e-05 17.6 0.1 1 1 4.6e-06 0.00021 15.8 0.1 3 49 149 191 147 195 0.85 # 96752 # 97819 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 1_69 - 213 AAA_19 PF13245.1 76 0.0013 13.3 3.9 1 1 5.5e-05 0.0025 12.3 0.0 20 48 11 35 5 70 0.85 # 79029 # 79667 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.698 4_37 - 237 AAA_19 PF13245.1 76 0.0022 12.5 0.1 1 1 0.0001 0.0048 11.4 0.1 9 35 34 59 27 88 0.78 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 2_33 - 213 AAA_19 PF13245.1 76 0.013 10.1 4.7 1 1 0.00033 0.015 9.8 0.0 20 48 11 35 9 70 0.82 # 29916 # 30554 # 1 # ID=2_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.695 2_33 - 213 CbiA PF01656.18 195 3e-29 96.5 0.0 1 1 6.8e-31 4.2e-29 96.1 0.0 2 161 4 149 3 180 0.76 # 29916 # 30554 # 1 # ID=2_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.695 1_69 - 213 CbiA PF01656.18 195 6.4e-29 95.5 0.0 1 1 1.4e-30 8.7e-29 95.0 0.0 2 158 4 145 3 181 0.77 # 79029 # 79667 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.698 1_28 - 418 CbiA PF01656.18 195 9.4e-19 62.3 0.0 1 1 2.1e-20 1.3e-18 61.8 0.0 1 188 117 358 117 365 0.72 # 30918 # 32171 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 2_55 - 357 CbiA PF01656.18 195 0.0015 12.7 0.6 1 1 4.8e-05 0.003 11.7 0.6 4 33 162 191 160 192 0.89 # 47517 # 48587 # 1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.688 1_86 - 356 CbiA PF01656.18 195 0.002 12.3 0.4 1 1 6.6e-05 0.0041 11.3 0.4 4 33 161 190 159 191 0.90 # 96752 # 97819 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 2_58 - 817 CbiA PF01656.18 195 0.004 11.3 0.0 1 1 0.00015 0.0092 10.1 0.0 4 42 446 485 444 577 0.86 # 49249 # 51699 # 1 # ID=2_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_86 - 356 KTI12 PF08433.5 270 0.0015 12.5 0.0 1 1 6.2e-06 0.0023 11.9 0.0 4 38 159 193 158 210 0.89 # 96752 # 97819 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 1_47 - 275 MethyltransfD12 PF02086.10 260 6.8e-51 167.9 0.0 1 1 2.1e-53 7.8e-51 167.7 0.0 1 259 10 255 10 256 0.93 # 50210 # 51034 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 4_34 - 107 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 1.8e-07 25.3 0.1 1 1 1.7e-09 3e-07 24.6 0.1 10 51 33 74 30 77 0.92 # 26987 # 27307 # -1 # ID=4_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 1_149 - 99 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.0026 12.0 0.0 1 1 2.2e-05 0.004 11.4 0.0 22 42 21 41 17 45 0.90 # 146607 # 146903 # -1 # ID=1_149;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 1_42 - 292 Rep_3 PF01051.16 222 9.4e-26 85.5 0.7 1 1 9.5e-28 1.7e-25 84.6 0.7 4 220 24 276 21 280 0.85 # 45683 # 46558 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.439 2_32 - 282 Rep_3 PF01051.16 222 0.0017 12.7 0.0 1 1 1.9e-05 0.0034 11.7 0.0 22 97 74 153 64 162 0.71 # 28829 # 29674 # 1 # ID=2_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.671 4_29 - 117 HxlR PF01638.12 91 1.9e-05 19.0 0.1 1 1 8.4e-08 3.1e-05 18.3 0.1 8 51 33 75 27 98 0.89 # 24720 # 25070 # 1 # ID=4_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 1_143 - 205 rve PF00665.21 120 1.9e-37 122.8 0.1 1 1 2.8e-39 2.5e-37 122.4 0.1 2 119 36 151 35 152 0.98 # 141686 # 142300 # 1 # ID=1_143;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 2_6 - 204 rve PF00665.21 120 1.6e-27 90.8 0.0 1 1 2.4e-29 2.2e-27 90.3 0.0 20 120 47 147 24 147 0.93 # 5613 # 6224 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 2_3 - 235 rve PF00665.21 120 1.2e-12 42.7 0.1 1 2 0.059 5.5 1.9 0.0 78 102 27 49 6 54 0.84 # 1521 # 2225 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 2_3 - 235 rve PF00665.21 120 1.2e-12 42.7 0.1 2 2 2.4e-13 2.2e-11 38.7 0.0 9 119 75 182 70 183 0.89 # 1521 # 2225 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_152 - 344 rve PF00665.21 120 4.9e-10 34.3 0.0 1 1 1.2e-11 1.1e-09 33.2 0.0 18 119 204 306 188 307 0.87 # 149561 # 150592 # 1 # ID=1_152;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 4_24 - 178 zf-ribbon_3 PF13248.1 26 0.021 8.9 9.4 1 2 0.024 9 0.5 0.3 5 10 39 44 35 53 0.76 # 20271 # 20804 # 1 # ID=4_24;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.425 4_24 - 178 zf-ribbon_3 PF13248.1 26 0.021 8.9 9.4 2 2 1.5e-05 0.0053 10.8 3.8 3 26 93 118 91 118 0.85 # 20271 # 20804 # 1 # ID=4_24;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.425 1_102 - 294 Fe_dep_repress PF01325.14 60 0.00073 14.2 0.1 1 1 7.8e-06 0.0029 12.3 0.0 26 58 245 277 241 278 0.91 # 109491 # 110372 # -1 # ID=1_102;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_69 - 213 YhjQ PF06564.7 244 6.8e-07 23.6 1.5 1 2 7.4e-06 0.0014 12.8 0.2 3 41 2 40 1 44 0.94 # 79029 # 79667 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.698 1_69 - 213 YhjQ PF06564.7 244 6.8e-07 23.6 1.5 2 2 6.6e-05 0.012 9.7 0.1 112 232 76 204 60 209 0.74 # 79029 # 79667 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.698 2_33 - 213 YhjQ PF06564.7 244 3.1e-06 21.4 0.6 1 2 0.00013 0.024 8.7 0.1 10 41 9 40 1 44 0.91 # 29916 # 30554 # 1 # ID=2_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.695 2_33 - 213 YhjQ PF06564.7 244 3.1e-06 21.4 0.6 2 2 2.4e-05 0.0045 11.1 0.1 111 232 75 204 57 209 0.77 # 29916 # 30554 # 1 # ID=2_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.695 1_142 - 93 Terminase_5 PF06056.7 58 4e-06 21.1 0.1 1 1 1.7e-08 6.2e-06 20.5 0.1 12 55 21 64 14 67 0.87 # 141153 # 141431 # 1 # ID=1_142;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 1_57 - 713 AAA_23 PF13476.1 202 3.8e-11 38.4 3.1 1 1 7.3e-13 9e-11 37.2 3.1 1 47 5 51 5 378 0.77 # 66432 # 68570 # -1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 4_37 - 237 AAA_23 PF13476.1 202 0.00089 14.3 0.0 1 1 1.1e-05 0.0013 13.8 0.0 21 40 37 56 23 70 0.85 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 1_86 - 356 AAA_23 PF13476.1 202 0.0035 12.4 0.0 1 1 4.1e-05 0.005 11.9 0.0 19 39 156 176 145 187 0.83 # 96752 # 97819 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 1_81 - 475 TIGR00575 TIGR00575 652 0.0017 11.1 0.0 1 1 8.1e-06 0.003 10.4 0.0 247 277 378 408 365 420 0.83 # 91305 # 92729 # 1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.615 1_49 - 559 Methyltransf_26 PF13659.1 117 5.9e-11 37.2 0.1 1 1 9.6e-13 1.2e-10 36.2 0.1 1 116 421 517 421 518 0.86 # 52814 # 54490 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 1_122 - 204 Methyltransf_26 PF13659.1 117 4.1e-05 18.4 0.1 1 2 0.074 9 1.1 0.0 69 81 56 68 22 82 0.70 # 124457 # 125068 # 1 # ID=1_122;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 1_122 - 204 Methyltransf_26 PF13659.1 117 4.1e-05 18.4 0.1 2 2 3.4e-06 0.00041 15.1 0.0 3 79 82 155 80 180 0.83 # 124457 # 125068 # 1 # ID=1_122;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 1_123 - 423 Methyltransf_26 PF13659.1 117 0.0033 12.2 0.0 1 1 0.00013 0.016 10.0 0.0 68 115 125 181 32 183 0.70 # 125055 # 126323 # 1 # ID=1_123;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.565 1_86 - 356 Zeta_toxin PF06414.7 201 3.7e-05 17.6 0.0 1 1 5.6e-07 6.9e-05 16.7 0.0 14 51 154 192 142 224 0.83 # 96752 # 97819 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 2_55 - 357 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00025 14.9 0.0 1 1 3.4e-06 0.00042 14.2 0.0 14 51 155 193 143 226 0.82 # 47517 # 48587 # 1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.688 1_151 - 572 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0015 12.4 0.0 1 1 2.6e-05 0.0032 11.3 0.0 19 62 38 82 21 114 0.77 # 147762 # 149477 # 1 # ID=1_151;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.460 2_55 - 357 AAA_30 PF13604.1 196 4.9e-06 21.0 0.2 1 1 1.5e-07 9.5e-06 20.0 0.2 2 54 142 193 141 233 0.83 # 47517 # 48587 # 1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.688 1_86 - 356 AAA_30 PF13604.1 196 3.1e-05 18.4 0.1 1 1 9.7e-07 5.9e-05 17.4 0.1 2 53 141 191 140 232 0.84 # 96752 # 97819 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 1_56 - 600 AAA_30 PF13604.1 196 5.5e-05 17.5 0.0 1 1 9.6e-06 0.00059 14.2 0.0 2 67 9 73 8 99 0.69 # 64630 # 66429 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 1_10 - 603 AAA_30 PF13604.1 196 6.2e-05 17.4 0.1 1 2 5.4e-05 0.0033 11.7 0.0 4 67 6 67 4 80 0.75 # 8938 # 10746 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 1_10 - 603 AAA_30 PF13604.1 196 6.2e-05 17.4 0.1 2 2 0.045 2.7 2.2 0.0 92 133 188 228 163 286 0.76 # 8938 # 10746 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 2_5 - 680 AAA_30 PF13604.1 196 0.001 13.4 0.0 1 2 0.00049 0.03 8.6 0.0 7 43 10 43 4 85 0.71 # 3366 # 5405 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 2_5 - 680 AAA_30 PF13604.1 196 0.001 13.4 0.0 2 2 0.041 2.5 2.3 0.0 97 133 213 248 196 300 0.84 # 3366 # 5405 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 4_37 - 237 AAA_30 PF13604.1 196 0.0023 12.3 0.1 1 1 8.3e-05 0.0051 11.1 0.0 17 45 34 62 26 80 0.82 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 3_36 - 353 ATPgrasp_Ter PF15632.1 330 1.2e-129 426.5 0.0 1 1 3.7e-132 1.4e-129 426.3 0.0 1 329 4 344 4 345 0.98 # 37712 # 38770 # -1 # ID=3_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.503 1_57 - 713 SMC_N PF02463.14 220 4.1e-11 37.3 0.2 1 2 2.8e-12 3.4e-10 34.2 0.1 2 51 3 50 2 62 0.88 # 66432 # 68570 # -1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 1_57 - 713 SMC_N PF02463.14 220 4.1e-11 37.3 0.2 2 2 0.045 5.5 0.9 0.0 135 206 181 391 112 402 0.68 # 66432 # 68570 # -1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 4_37 - 237 SMC_N PF02463.14 220 1.6e-08 28.8 0.0 1 2 0.00032 0.039 7.9 0.1 26 44 37 55 23 75 0.83 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 4_37 - 237 SMC_N PF02463.14 220 1.6e-08 28.8 0.0 2 2 1.5e-07 1.8e-05 18.8 0.0 133 212 144 221 120 228 0.84 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 2_22 - 819 SMC_N PF02463.14 220 0.058 7.3 15.6 1 1 0.0023 0.28 5.1 15.6 16 206 70 644 56 657 0.84 # 18865 # 21321 # -1 # ID=2_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_136 - 126 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 2.8e-22 73.2 0.0 1 1 3e-24 3.7e-22 72.9 0.0 1 58 10 76 10 98 0.84 # 135228 # 135605 # 1 # ID=1_136;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.542 1_142 - 93 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 1.1e-19 64.9 0.2 1 1 1.1e-21 1.4e-19 64.6 0.2 1 76 1 72 1 72 0.89 # 141153 # 141431 # 1 # ID=1_142;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 2_3 - 235 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.00091 13.9 0.3 1 1 1.6e-05 0.002 12.9 0.3 4 51 6 58 4 63 0.79 # 1521 # 2225 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_132 - 352 TIGR02432 TIGR02432 189 0.00048 14.5 0.1 1 1 2.2e-06 0.0008 13.8 0.1 2 37 77 112 76 156 0.73 # 130747 # 131802 # 1 # ID=1_132;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 1_84 - 672 TraG-D_C PF12696.2 128 8.7e-33 107.7 0.0 1 1 2e-34 1.4e-32 107.0 0.0 2 127 408 528 407 529 0.88 # 94279 # 96294 # 1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.631 2_53 - 666 TraG-D_C PF12696.2 128 1.5e-32 106.9 0.0 1 1 3.4e-34 2.5e-32 106.2 0.0 2 127 404 524 403 525 0.88 # 45050 # 47047 # 1 # ID=2_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.639 3_7 - 695 TraG-D_C PF12696.2 128 2.1e-10 35.3 0.1 1 1 6.8e-12 5e-10 34.1 0.1 2 111 505 616 504 631 0.82 # 4674 # 6758 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 2_58 - 817 TraG-D_C PF12696.2 128 1.5e-06 22.8 0.0 1 1 3.4e-08 2.5e-06 22.1 0.0 4 72 644 708 634 741 0.74 # 49249 # 51699 # 1 # ID=2_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_89 - 817 TraG-D_C PF12696.2 128 1.9e-06 22.5 0.0 1 1 4.2e-08 3.1e-06 21.8 0.0 4 66 644 702 634 739 0.75 # 98480 # 100930 # 1 # ID=1_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 1_152 - 344 DDE_3 PF13358.1 146 1.9e-24 80.8 0.7 1 1 2.7e-26 5e-24 79.5 0.1 2 140 177 314 176 319 0.95 # 149561 # 150592 # 1 # ID=1_152;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 2_3 - 235 DDE_3 PF13358.1 146 0.0025 12.3 0.0 1 1 4.2e-05 0.0077 10.7 0.0 32 90 82 141 59 146 0.87 # 1521 # 2225 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 2_33 - 213 MipZ PF09140.6 261 5.4e-13 43.3 0.0 1 2 1.8e-09 2.1e-07 25.0 0.0 3 44 3 44 1 55 0.87 # 29916 # 30554 # 1 # ID=2_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.695 2_33 - 213 MipZ PF09140.6 261 5.4e-13 43.3 0.0 2 2 6.6e-07 8.1e-05 16.5 0.0 86 163 67 146 57 157 0.78 # 29916 # 30554 # 1 # ID=2_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.695 1_69 - 213 MipZ PF09140.6 261 6.7e-13 43.0 0.0 1 2 5.2e-10 6.4e-08 26.7 0.0 3 44 3 44 1 55 0.87 # 79029 # 79667 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.698 1_69 - 213 MipZ PF09140.6 261 6.7e-13 43.0 0.0 2 2 2.8e-06 0.00034 14.5 0.0 86 135 67 116 57 156 0.81 # 79029 # 79667 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.698 1_28 - 418 MipZ PF09140.6 261 2.8e-08 27.8 0.0 1 2 2.5e-06 0.00031 14.6 0.0 2 26 116 140 115 158 0.81 # 30918 # 32171 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 1_28 - 418 MipZ PF09140.6 261 2.8e-08 27.8 0.0 2 2 4.4e-05 0.0054 10.5 0.0 71 126 230 287 215 297 0.74 # 30918 # 32171 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 4_24 - 178 zinc-ribbons_6 PF07191.7 70 0.002 12.7 1.7 1 2 0.022 8.2 1.1 0.1 3 12 38 47 31 73 0.75 # 20271 # 20804 # 1 # ID=4_24;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.425 4_24 - 178 zinc-ribbons_6 PF07191.7 70 0.002 12.7 1.7 2 2 2.3e-05 0.0083 10.7 0.1 3 27 94 118 92 132 0.87 # 20271 # 20804 # 1 # ID=4_24;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.425 5_1 - 243 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 8.5e-24 79.0 0.0 1 1 1.3e-25 1.6e-23 78.1 0.0 5 104 138 242 135 243 0.98 # 69 # 797 # 1 # ID=5_1;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 2_1 - 125 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 1.3e-16 55.5 0.0 1 1 1.4e-18 1.7e-16 55.2 0.0 66 212 6 110 1 111 0.81 # 3 # 377 # 1 # ID=2_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.549 3_1 - 125 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 6.2e-16 53.3 0.0 1 1 6.5e-18 8e-16 52.9 0.0 66 212 6 110 1 111 0.81 # 3 # 377 # 1 # ID=3_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.544 1_142 - 93 DivIC PF04977.10 80 0.0013 12.9 0.3 1 1 9.1e-06 0.0017 12.6 0.3 20 45 57 82 38 90 0.58 # 141153 # 141431 # 1 # ID=1_142;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 1_138 - 513 DivIC PF04977.10 80 0.017 9.4 8.5 1 2 0.0011 0.2 6.0 1.4 21 51 18 48 9 52 0.72 # 135999 # 137537 # 1 # ID=1_138;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.603 1_138 - 513 DivIC PF04977.10 80 0.017 9.4 8.5 2 2 0.00053 0.097 7.0 0.0 21 49 58 86 54 88 0.87 # 135999 # 137537 # 1 # ID=1_138;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.603 3_1 - 125 DDE_Tnp_1_2 PF13586.1 88 0.00063 14.7 0.0 1 1 5.1e-06 0.00095 14.1 0.0 1 86 15 109 15 111 0.81 # 3 # 377 # 1 # ID=3_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.544 2_1 - 125 DDE_Tnp_1_2 PF13586.1 88 0.00086 14.2 0.1 1 1 7.2e-06 0.0013 13.6 0.1 1 86 15 109 15 111 0.75 # 3 # 377 # 1 # ID=2_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.549 1_10 - 603 AAA_12 PF13087.1 200 3.6e-08 27.7 0.0 1 3 0.0002 0.072 7.2 0.0 99 152 34 86 15 95 0.84 # 8938 # 10746 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 1_10 - 603 AAA_12 PF13087.1 200 3.6e-08 27.7 0.0 2 3 0.0055 2 2.4 0.0 5 37 240 272 237 372 0.81 # 8938 # 10746 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 1_10 - 603 AAA_12 PF13087.1 200 3.6e-08 27.7 0.0 3 3 1.5e-06 0.00056 14.0 0.0 143 195 499 562 426 567 0.81 # 8938 # 10746 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 1_57 - 713 AAA_21 PF13304.1 303 2.5e-20 68.3 11.8 1 1 2.6e-21 3.2e-19 64.7 11.8 1 301 25 386 25 388 0.85 # 66432 # 68570 # -1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 4_37 - 237 AAA_21 PF13304.1 303 2.6e-12 42.0 0.0 1 2 2.1e-07 2.5e-05 19.1 0.0 3 22 39 58 37 106 0.83 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 4_37 - 237 AAA_21 PF13304.1 303 2.6e-12 42.0 0.0 2 2 4.5e-08 5.5e-06 21.2 0.0 234 302 145 211 141 212 0.92 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 2_41 - 274 AAA_21 PF13304.1 303 4.7e-09 31.3 0.0 1 2 0.0013 0.16 6.6 0.0 3 25 45 69 43 107 0.82 # 36184 # 37005 # -1 # ID=2_41;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.612 2_41 - 274 AAA_21 PF13304.1 303 4.7e-09 31.3 0.0 2 2 1.4e-08 1.7e-06 22.9 0.0 233 299 149 213 122 216 0.86 # 36184 # 37005 # -1 # ID=2_41;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.612 1_149 - 99 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.00077 13.5 0.0 1 1 6.5e-06 0.0012 12.9 0.0 15 36 20 41 7 48 0.83 # 146607 # 146903 # -1 # ID=1_149;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 4_34 - 107 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.0018 12.4 0.0 1 1 1.5e-05 0.0028 11.7 0.0 4 36 33 65 32 76 0.92 # 26987 # 27307 # -1 # ID=4_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 1_27 - 335 Phage_CI_repr PF07022.8 66 1.5e-05 19.8 0.0 1 1 7.5e-08 2.8e-05 18.9 0.0 7 45 168 239 166 274 0.84 # 29917 # 30921 # -1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.412 1_6 - 351 AAA PF00004.24 132 0.00017 16.5 0.0 1 1 2.6e-06 0.00032 15.6 0.0 1 74 99 178 99 237 0.72 # 5094 # 6146 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 1_151 - 572 AAA PF00004.24 132 0.0015 13.4 0.1 1 2 0.00052 0.064 8.2 0.0 3 49 42 87 40 98 0.77 # 147762 # 149477 # 1 # ID=1_151;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.460 1_151 - 572 AAA PF00004.24 132 0.0015 13.4 0.1 2 2 0.029 3.6 2.5 0.0 57 74 240 259 201 290 0.75 # 147762 # 149477 # 1 # ID=1_151;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.460 1_69 - 213 AAA PF00004.24 132 0.0035 12.3 0.0 1 1 5.9e-05 0.0072 11.3 0.0 7 28 10 34 4 85 0.80 # 79029 # 79667 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.698 1_184 - 402 KorB PF08535.5 93 0.00024 16.0 0.1 1 1 1.2e-05 0.0023 12.9 0.0 5 48 170 213 166 247 0.83 # 167351 # 168556 # 1 # ID=1_184;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.541 1_48 - 385 KorB PF08535.5 93 0.0035 12.3 0.8 1 1 9.3e-05 0.017 10.1 0.0 3 53 182 231 181 262 0.78 # 51395 # 52549 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.491 4_43 - 94 HTH_37 PF13744.1 80 2.9e-13 44.2 0.0 1 1 3e-15 3.6e-13 43.9 0.0 12 73 25 85 14 89 0.90 # 35168 # 35449 # 1 # ID=4_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_149 - 99 HTH_37 PF13744.1 80 5.4e-06 20.9 0.0 1 1 5.8e-08 7.1e-06 20.5 0.0 23 77 17 70 7 72 0.91 # 146607 # 146903 # -1 # ID=1_149;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 1_64 - 111 HTH_37 PF13744.1 80 0.00058 14.4 0.1 1 1 9.8e-06 0.0012 13.4 0.1 10 38 11 39 5 72 0.75 # 75423 # 75755 # -1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 4_29 - 117 Rrf2 PF02082.15 83 0.00028 15.8 0.1 1 1 1.2e-06 0.00045 15.1 0.1 14 59 34 77 29 87 0.84 # 24720 # 25070 # 1 # ID=4_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 2_5 - 680 Herpes_ori_bp PF02399.10 824 0.0011 11.7 0.0 1 1 5.6e-06 0.0021 10.8 0.0 52 108 20 82 9 122 0.81 # 3366 # 5405 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 4_24 - 178 zf-C4_Topoisom PF01396.14 39 8.8e-11 35.9 14.3 1 2 9.4e-13 3.5e-10 34.0 3.7 4 34 39 70 36 74 0.90 # 20271 # 20804 # 1 # ID=4_24;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.425 4_24 - 178 zf-C4_Topoisom PF01396.14 39 8.8e-11 35.9 14.3 2 2 0.0003 0.11 6.8 3.0 3 21 94 110 92 118 0.79 # 20271 # 20804 # 1 # ID=4_24;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.425 4_29 - 117 HTH_27 PF13463.1 68 0.00091 14.3 0.1 1 1 7.6e-06 0.0014 13.7 0.1 8 58 35 77 18 88 0.84 # 24720 # 25070 # 1 # ID=4_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 3_30 - 156 HTH_27 PF13463.1 68 0.0013 13.8 0.3 1 2 7.3e-05 0.013 10.6 0.0 1 44 3 48 3 49 0.87 # 32053 # 32520 # -1 # ID=3_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.494 3_30 - 156 HTH_27 PF13463.1 68 0.0013 13.8 0.3 2 2 0.074 14 0.9 0.1 17 42 112 138 106 149 0.81 # 32053 # 32520 # -1 # ID=3_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.494 1_6 - 351 TIGR00382 TIGR00382 414 0.0021 11.5 0.0 1 1 8.5e-06 0.0031 10.9 0.0 120 194 99 174 60 181 0.69 # 5094 # 6146 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 1_123 - 423 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 1.4e-20 68.5 0.0 1 1 6e-23 2.2e-20 67.9 0.0 1 224 128 386 128 393 0.80 # 125055 # 126323 # 1 # ID=1_123;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.565 1_143 - 205 rve_2 PF13333.1 52 1.3e-18 61.5 4.3 1 1 1.2e-20 2.1e-18 60.9 4.3 1 51 142 197 142 198 0.94 # 141686 # 142300 # 1 # ID=1_143;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 2_6 - 204 rve_2 PF13333.1 52 4.1e-08 28.0 0.1 1 1 4.8e-10 8.9e-08 26.9 0.0 1 49 137 190 137 192 0.86 # 5613 # 6224 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 1_109 - 85 Ribosomal_L37ae PF01780.14 90 0.001 13.7 0.4 1 1 4.7e-06 0.0017 13.0 0.4 25 63 32 72 11 73 0.85 # 115979 # 116233 # -1 # ID=1_109;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.463 1_22 - 345 Hydantoinase_A PF01968.13 290 1.7e-07 25.3 0.2 1 2 2.3e-06 0.00085 13.2 0.1 74 101 188 214 178 221 0.83 # 25635 # 26669 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.420 1_22 - 345 Hydantoinase_A PF01968.13 290 1.7e-07 25.3 0.2 2 2 2.5e-05 0.0091 9.8 0.0 209 275 272 332 232 342 0.75 # 25635 # 26669 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.420 1_27 - 335 Crp PF00325.15 32 0.0033 11.7 0.0 1 1 2.2e-05 0.008 10.4 0.0 4 20 175 191 174 193 0.95 # 29917 # 30921 # -1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.412 4_43 - 94 HTH_25 PF13413.1 62 0.00033 15.0 0.0 1 1 1.4e-06 0.00051 14.4 0.0 2 35 36 69 35 88 0.91 # 35168 # 35449 # 1 # ID=4_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_151 - 572 AAA_16 PF13191.1 185 3.2e-06 22.0 0.2 1 2 0.00013 0.0042 11.8 0.0 21 65 34 77 16 103 0.71 # 147762 # 149477 # 1 # ID=1_151;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.460 1_151 - 572 AAA_16 PF13191.1 185 3.2e-06 22.0 0.2 2 2 0.0039 0.13 7.0 0.0 133 166 225 259 198 281 0.78 # 147762 # 149477 # 1 # ID=1_151;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.460 1_86 - 356 AAA_16 PF13191.1 185 5.2e-06 21.3 0.1 1 1 3.1e-07 1.1e-05 20.3 0.1 16 57 153 189 144 307 0.81 # 96752 # 97819 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 1_89 - 817 AAA_16 PF13191.1 185 1.2e-05 20.1 6.7 1 1 4e-07 1.3e-05 20.0 1.2 22 185 439 670 433 670 0.58 # 98480 # 100930 # 1 # ID=1_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 2_58 - 817 AAA_16 PF13191.1 185 2.3e-05 19.2 4.9 1 1 3.1e-06 0.0001 17.0 1.9 22 185 439 670 433 670 0.48 # 49249 # 51699 # 1 # ID=2_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 2_55 - 357 AAA_16 PF13191.1 185 3.1e-05 18.8 0.1 1 1 1.8e-06 6e-05 17.8 0.1 16 57 154 190 145 304 0.81 # 47517 # 48587 # 1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.688 4_37 - 237 AAA_16 PF13191.1 185 4.7e-05 18.2 1.5 1 1 3.3e-06 0.00011 17.0 1.5 23 51 34 62 23 208 0.83 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 2_41 - 274 AAA_16 PF13191.1 185 0.00047 14.9 1.3 1 1 2.2e-05 0.00075 14.3 1.2 12 51 30 68 26 209 0.73 # 36184 # 37005 # -1 # ID=2_41;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.612 2_22 - 819 AAA_16 PF13191.1 185 0.00063 14.5 1.1 1 1 0.00025 0.0084 10.8 0.0 24 143 77 204 66 233 0.57 # 18865 # 21321 # -1 # ID=2_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_69 - 213 AAA_16 PF13191.1 185 0.0018 13.0 3.6 1 1 0.00057 0.019 9.7 3.6 34 119 11 97 9 211 0.74 # 79029 # 79667 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.698 2_33 - 213 AAA_16 PF13191.1 185 0.0022 12.7 2.5 1 1 0.00014 0.0048 11.6 0.1 34 81 11 61 9 113 0.59 # 29916 # 30554 # 1 # ID=2_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.695 1_6 - 351 AAA_16 PF13191.1 185 0.0049 11.6 0.4 1 1 0.0009 0.03 9.0 0.0 9 40 83 112 79 138 0.82 # 5094 # 6146 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 3_36 - 353 ATP-grasp_3 PF02655.9 161 0.00046 14.8 0.0 1 2 0.027 9.8 0.7 0.0 109 146 75 115 29 121 0.74 # 37712 # 38770 # -1 # ID=3_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.503 3_36 - 353 ATP-grasp_3 PF02655.9 161 0.00046 14.8 0.0 2 2 1e-05 0.0038 11.8 0.0 2 87 115 232 114 239 0.84 # 37712 # 38770 # -1 # ID=3_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.503 1_151 - 572 AAA_22 PF13401.1 131 3.4e-06 22.0 0.1 1 2 3.2e-05 0.0012 13.8 0.0 7 68 40 98 36 126 0.76 # 147762 # 149477 # 1 # ID=1_151;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.460 1_151 - 572 AAA_22 PF13401.1 131 3.4e-06 22.0 0.1 2 2 0.013 0.49 5.3 0.0 82 109 238 264 217 282 0.78 # 147762 # 149477 # 1 # ID=1_151;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.460 4_37 - 237 AAA_22 PF13401.1 131 1.3e-05 20.1 0.1 1 1 3.7e-06 0.00014 16.8 0.1 9 100 40 179 35 211 0.55 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 1_89 - 817 AAA_22 PF13401.1 131 1.5e-05 19.9 0.0 1 2 4.7e-05 0.0017 13.2 0.1 5 30 442 467 438 494 0.88 # 98480 # 100930 # 1 # ID=1_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 1_89 - 817 AAA_22 PF13401.1 131 1.5e-05 19.9 0.0 2 2 0.058 2.1 3.2 0.0 78 123 625 673 597 678 0.63 # 98480 # 100930 # 1 # ID=1_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 2_5 - 680 AAA_22 PF13401.1 131 1.6e-05 19.8 0.2 1 2 0.00038 0.014 10.3 0.0 4 66 17 76 13 106 0.80 # 3366 # 5405 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 2_5 - 680 AAA_22 PF13401.1 131 1.6e-05 19.8 0.2 2 2 0.004 0.15 7.0 0.0 36 108 139 232 112 246 0.64 # 3366 # 5405 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 2_58 - 817 AAA_22 PF13401.1 131 5e-05 18.2 0.1 1 2 0.00015 0.0056 11.6 0.0 5 30 442 467 438 497 0.87 # 49249 # 51699 # 1 # ID=2_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 2_58 - 817 AAA_22 PF13401.1 131 5e-05 18.2 0.1 2 2 0.038 1.4 3.8 0.0 75 123 622 673 589 678 0.67 # 49249 # 51699 # 1 # ID=2_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_56 - 600 AAA_22 PF13401.1 131 0.00022 16.1 0.1 1 2 0.00029 0.011 10.7 0.0 4 28 20 44 14 127 0.65 # 64630 # 66429 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 1_56 - 600 AAA_22 PF13401.1 131 0.00022 16.1 0.1 2 2 0.091 3.3 2.6 0.0 71 125 179 243 111 247 0.67 # 64630 # 66429 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 3_7 - 695 AAA_22 PF13401.1 131 0.00026 15.9 0.1 1 2 0.00041 0.015 10.2 0.0 5 24 199 218 198 296 0.73 # 4674 # 6758 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 3_7 - 695 AAA_22 PF13401.1 131 0.00026 15.9 0.1 2 2 0.072 2.7 2.9 0.0 88 124 504 537 459 545 0.77 # 4674 # 6758 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 1_6 - 351 AAA_22 PF13401.1 131 0.0017 13.3 0.3 1 1 0.00028 0.01 10.7 0.0 6 30 98 122 96 159 0.81 # 5094 # 6146 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 1_57 - 713 AAA_22 PF13401.1 131 0.0019 13.1 0.0 1 1 0.00014 0.0052 11.7 0.0 3 37 22 64 18 141 0.74 # 66432 # 68570 # -1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 2_41 - 274 AAA_22 PF13401.1 131 0.0027 12.6 0.2 1 1 0.00057 0.021 9.7 0.1 4 26 41 63 38 88 0.85 # 36184 # 37005 # -1 # ID=2_41;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.612 1_10 - 603 TIGR01074 TIGR01074 668 6e-53 174.5 1.9 1 1 8.9e-54 1.1e-51 170.3 1.9 5 610 7 563 4 591 0.79 # 8938 # 10746 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 2_5 - 680 TIGR01074 TIGR01074 668 4.1e-51 168.4 0.0 1 2 3.5e-38 4.2e-36 118.8 0.0 2 304 5 308 4 404 0.84 # 3366 # 5405 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 2_5 - 680 TIGR01074 TIGR01074 668 4.1e-51 168.4 0.0 2 2 1.3e-16 1.7e-14 47.4 0.0 533 610 517 607 502 613 0.80 # 3366 # 5405 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_56 - 600 TIGR01074 TIGR01074 668 1.3e-37 123.8 0.0 1 2 2.6e-34 3.2e-32 106.0 0.0 2 285 9 287 8 301 0.83 # 64630 # 66429 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 1_56 - 600 TIGR01074 TIGR01074 668 1.3e-37 123.8 0.0 2 2 5.4e-07 6.6e-05 15.7 0.0 551 618 511 577 502 589 0.81 # 64630 # 66429 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 1_49 - 559 Methyltransf_27 PF13708.1 194 3.2e-57 187.9 0.1 1 1 2.8e-59 5.2e-57 187.2 0.1 2 194 93 296 92 296 0.95 # 52814 # 54490 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 4_13 - 271 Methyltransf_27 PF13708.1 194 2.9e-36 119.6 0.0 1 1 1.9e-38 3.5e-36 119.3 0.0 3 194 72 266 70 266 0.91 # 9342 # 10154 # -1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.480 1_27 - 335 NUMOD1 PF07453.8 37 0.0023 12.6 0.0 1 1 1.5e-05 0.0057 11.3 0.0 20 37 177 194 173 194 0.88 # 29917 # 30921 # -1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.412 4_37 - 237 AAA_29 PF13555.1 62 1e-06 23.0 0.0 1 1 2.3e-08 1.7e-06 22.2 0.0 17 50 30 62 23 67 0.79 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 1_57 - 713 AAA_29 PF13555.1 62 3.7e-06 21.2 0.0 1 1 4.4e-07 3.3e-05 18.1 0.0 2 47 4 47 3 57 0.88 # 66432 # 68570 # -1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 1_86 - 356 AAA_29 PF13555.1 62 0.00015 16.0 0.0 1 1 4e-06 0.00029 15.1 0.0 22 45 155 178 146 186 0.84 # 96752 # 97819 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 2_55 - 357 AAA_29 PF13555.1 62 0.0016 12.7 0.0 1 1 4.5e-05 0.0033 11.7 0.0 22 45 156 179 147 187 0.84 # 47517 # 48587 # 1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.688 1_89 - 817 AAA_29 PF13555.1 62 0.0024 12.2 0.0 1 1 7.3e-05 0.0054 11.0 0.0 23 45 442 462 433 472 0.84 # 98480 # 100930 # 1 # ID=1_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 4_28 - 553 Pyr_redox PF00070.22 80 3.6e-18 60.6 7.3 1 3 0.002 0.73 5.1 1.0 1 29 2 30 2 35 0.93 # 22901 # 24559 # -1 # ID=4_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 4_28 - 553 Pyr_redox PF00070.22 80 3.6e-18 60.6 7.3 2 3 0.032 12 1.2 0.0 51 77 67 92 62 98 0.80 # 22901 # 24559 # -1 # ID=4_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 4_28 - 553 Pyr_redox PF00070.22 80 3.6e-18 60.6 7.3 3 3 2.2e-19 8.3e-17 56.2 0.2 3 77 154 228 152 231 0.92 # 22901 # 24559 # -1 # ID=4_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_82 - 315 HTH_1 PF00126.22 60 5.8e-24 78.4 1.2 1 1 6.5e-25 8e-23 74.8 2.1 1 60 3 62 3 62 0.98 # 92804 # 93748 # 1 # ID=1_82;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.550 2_47 - 307 HTH_1 PF00126.22 60 1.8e-23 76.8 7.4 1 2 2e-25 2.5e-23 76.4 3.5 1 60 8 67 8 67 0.98 # 40925 # 41845 # 1 # ID=2_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.592 2_47 - 307 HTH_1 PF00126.22 60 1.8e-23 76.8 7.4 2 2 0.052 6.4 1.4 0.1 5 21 75 92 74 98 0.88 # 40925 # 41845 # 1 # ID=2_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.592 2_52 - 302 HTH_1 PF00126.22 60 3.8e-21 69.4 0.8 1 1 7e-23 8.6e-21 68.3 0.8 1 59 9 67 9 68 0.97 # 43839 # 44744 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.584 1_107 - 233 Ribonuclease_P PF00825.13 111 0.0011 13.6 0.1 1 1 6.4e-06 0.0024 12.5 0.1 58 109 126 179 125 181 0.92 # 114861 # 115559 # -1 # ID=1_107;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.544 1_142 - 93 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 7.4e-05 17.2 0.4 1 1 2.4e-07 8.9e-05 16.9 0.4 13 73 17 77 5 90 0.71 # 141153 # 141431 # 1 # ID=1_142;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 2_55 - 357 AAA_28 PF13521.1 163 3e-05 18.8 0.1 1 1 2.9e-07 5.3e-05 18.0 0.1 2 22 160 180 159 205 0.80 # 47517 # 48587 # 1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.688 1_86 - 356 AAA_28 PF13521.1 163 0.00014 16.6 0.0 1 1 1.3e-06 0.00023 15.9 0.0 2 22 159 179 158 202 0.79 # 96752 # 97819 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 5_1 - 243 DDE_Tnp_1_3 PF13612.1 155 1.3e-09 32.7 0.1 1 1 7.2e-12 2.7e-09 31.7 0.0 5 106 137 238 134 243 0.85 # 69 # 797 # 1 # ID=5_1;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 4_28 - 553 HI0933_like PF03486.9 409 2.1e-06 21.1 5.2 1 3 0.0028 1 2.4 0.6 2 32 2 34 1 38 0.74 # 22901 # 24559 # -1 # ID=4_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 4_28 - 553 HI0933_like PF03486.9 409 2.1e-06 21.1 5.2 2 3 0.0022 0.82 2.7 0.1 4 35 154 185 151 189 0.90 # 22901 # 24559 # -1 # ID=4_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 4_28 - 553 HI0933_like PF03486.9 409 2.1e-06 21.1 5.2 3 3 6.6e-08 2.4e-05 17.6 0.1 105 165 190 246 160 273 0.81 # 22901 # 24559 # -1 # ID=4_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_138 - 513 Mnd1 PF03962.10 188 0.024 9.0 7.5 1 2 2.5e-05 0.0093 10.4 2.9 65 139 17 91 11 101 0.78 # 135999 # 137537 # 1 # ID=1_138;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.603 1_138 - 513 Mnd1 PF03962.10 188 0.024 9.0 7.5 2 2 0.028 10 0.4 0.1 116 142 377 403 347 441 0.58 # 135999 # 137537 # 1 # ID=1_138;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.603 1_152 - 344 HTH_32 PF13565.1 77 8.6e-11 37.3 0.3 1 1 4.7e-13 8.6e-11 37.3 0.3 1 77 56 136 56 136 0.89 # 149561 # 150592 # 1 # ID=1_152;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 2_3 - 235 HTH_32 PF13565.1 77 4.8e-06 22.1 0.2 1 1 1.1e-07 2.1e-05 20.0 0.0 26 76 5 50 2 51 0.83 # 1521 # 2225 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_56 - 600 TIGR00609 TIGR00609 1175 3.7e-21 69.3 4.6 1 3 0.00026 0.032 6.6 0.0 10 64 21 74 16 125 0.89 # 64630 # 66429 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 1_56 - 600 TIGR00609 TIGR00609 1175 3.7e-21 69.3 4.6 2 3 1.9e-19 2.4e-17 56.7 2.4 344 449 179 286 166 299 0.85 # 64630 # 66429 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 1_56 - 600 TIGR00609 TIGR00609 1175 3.7e-21 69.3 4.6 3 3 0.0016 0.19 4.0 0.0 683 744 466 528 454 537 0.85 # 64630 # 66429 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 2_5 - 680 TIGR00609 TIGR00609 1175 1e-16 54.6 0.0 1 3 0.004 0.5 2.7 0.1 10 63 18 69 12 81 0.85 # 3366 # 5405 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 2_5 - 680 TIGR00609 TIGR00609 1175 1e-16 54.6 0.0 2 3 5.5e-11 6.7e-09 28.7 0.0 331 419 179 255 79 259 0.77 # 3366 # 5405 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 2_5 - 680 TIGR00609 TIGR00609 1175 1e-16 54.6 0.0 3 3 4e-08 4.9e-06 19.3 0.0 731 813 539 609 529 627 0.81 # 3366 # 5405 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_10 - 603 TIGR00609 TIGR00609 1175 9.2e-16 51.5 4.1 1 3 1.5e-06 0.00018 14.0 0.0 11 67 18 71 12 82 0.86 # 8938 # 10746 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 1_10 - 603 TIGR00609 TIGR00609 1175 9.2e-16 51.5 4.1 2 3 2e-10 2.4e-08 26.9 0.1 376 458 194 276 190 315 0.88 # 8938 # 10746 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 1_10 - 603 TIGR00609 TIGR00609 1175 9.2e-16 51.5 4.1 3 3 4.9e-05 0.006 9.0 0.1 781 812 533 564 498 570 0.84 # 8938 # 10746 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 4_43 - 94 HTH_3 PF01381.17 55 6.7e-15 49.5 0.0 1 1 1.3e-16 9.8e-15 49.0 0.0 1 51 36 86 36 89 0.96 # 35168 # 35449 # 1 # ID=4_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_149 - 99 HTH_3 PF01381.17 55 1.6e-13 45.1 0.0 1 1 3.4e-15 2.5e-13 44.5 0.0 5 53 21 69 20 70 0.96 # 146607 # 146903 # -1 # ID=1_149;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 1_64 - 111 HTH_3 PF01381.17 55 6.6e-08 27.1 0.0 1 1 1.2e-09 9.1e-08 26.6 0.0 1 52 24 73 24 76 0.95 # 75423 # 75755 # -1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 4_34 - 107 HTH_3 PF01381.17 55 2.9e-06 21.8 0.0 1 1 6.2e-08 4.6e-06 21.2 0.0 4 31 42 71 39 76 0.86 # 26987 # 27307 # -1 # ID=4_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 2_28 - 79 HTH_3 PF01381.17 55 0.00091 13.8 0.0 1 1 1.8e-05 0.0014 13.3 0.0 11 52 2 41 1 44 0.83 # 26365 # 26601 # -1 # ID=2_28;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.586 1_152 - 344 HTH_23 PF13384.1 50 1.1e-12 42.1 0.4 1 1 4.6e-13 2.4e-11 37.7 0.1 3 50 26 73 24 73 0.95 # 149561 # 150592 # 1 # ID=1_152;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_142 - 93 HTH_23 PF13384.1 50 2.9e-07 24.8 0.3 1 1 9.9e-09 5.2e-07 24.0 0.1 7 41 11 46 5 59 0.86 # 141153 # 141431 # 1 # ID=1_142;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 4_34 - 107 HTH_23 PF13384.1 50 1.3e-06 22.7 0.0 1 1 4.3e-08 2.3e-06 21.9 0.0 9 40 40 72 36 83 0.92 # 26987 # 27307 # -1 # ID=4_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 2_3 - 235 HTH_23 PF13384.1 50 2.2e-05 18.8 0.7 1 1 1.3e-05 0.00068 14.0 0.1 28 42 41 55 40 62 0.87 # 1521 # 2225 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_136 - 126 HTH_23 PF13384.1 50 0.00015 16.1 0.0 1 1 4.2e-06 0.00022 15.6 0.0 5 44 19 59 15 63 0.90 # 135228 # 135605 # 1 # ID=1_136;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.542 1_149 - 99 HTH_23 PF13384.1 50 0.00019 15.8 0.0 1 1 6.3e-06 0.00033 15.0 0.0 16 37 24 45 15 49 0.87 # 146607 # 146903 # -1 # ID=1_149;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 4_43 - 94 HTH_23 PF13384.1 50 0.00026 15.4 0.0 1 1 7.6e-06 0.0004 14.8 0.0 10 37 35 64 23 86 0.78 # 35168 # 35449 # 1 # ID=4_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_69 - 213 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.00064 13.7 0.0 1 1 1e-05 0.0013 12.7 0.0 7 42 8 43 3 73 0.90 # 79029 # 79667 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.698 1_28 - 418 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.0022 11.9 0.1 1 1 3.7e-05 0.0046 10.9 0.0 7 61 122 179 116 208 0.72 # 30918 # 32171 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 2_33 - 213 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.0041 11.0 0.0 1 1 5.4e-05 0.0066 10.4 0.0 7 42 8 43 2 72 0.90 # 29916 # 30554 # 1 # ID=2_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.695 4_19 - 186 HTH_7 PF02796.10 45 0.00029 15.5 0.3 1 1 3e-06 0.0011 13.6 0.1 1 41 141 178 141 181 0.88 # 16155 # 16712 # 1 # ID=4_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.450 4_43 - 94 HTH_19 PF12844.2 64 2e-12 41.8 0.0 1 1 3.2e-14 3e-12 41.2 0.0 2 54 34 86 34 90 0.97 # 35168 # 35449 # 1 # ID=4_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_149 - 99 HTH_19 PF12844.2 64 2.8e-09 31.7 0.0 1 1 4.8e-11 4.4e-09 31.1 0.0 7 55 20 68 19 70 0.95 # 146607 # 146903 # -1 # ID=1_149;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 1_64 - 111 HTH_19 PF12844.2 64 1.2e-07 26.5 0.0 1 1 1.8e-09 1.7e-07 26.0 0.0 4 60 24 78 21 81 0.90 # 75423 # 75755 # -1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 2_28 - 79 HTH_19 PF12844.2 64 0.00082 14.2 0.0 1 1 1.4e-05 0.0013 13.6 0.0 15 60 3 46 1 49 0.80 # 26365 # 26601 # -1 # ID=2_28;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.586 1_150 - 69 DUF1870 PF08965.5 118 0.00087 13.7 0.1 1 1 2.5e-06 0.00092 13.6 0.1 71 113 16 62 1 66 0.74 # 147190 # 147396 # -1 # ID=1_150;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.454 2_41 - 274 NB-ARC PF00931.17 287 0.0054 10.3 0.2 1 1 2.2e-05 0.008 9.8 0.2 7 40 29 62 26 70 0.86 # 36184 # 37005 # -1 # ID=2_41;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.612 1_142 - 93 Val_tRNA-synt_C PF10458.4 66 0.0011 13.8 0.6 1 1 3.1e-06 0.0011 13.8 0.6 1 23 58 80 58 89 0.87 # 141153 # 141431 # 1 # ID=1_142;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 1_6 - 351 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.00013 16.0 0.1 1 2 0.002 0.37 4.6 0.0 24 47 98 121 88 140 0.84 # 5094 # 6146 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 1_6 - 351 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.00013 16.0 0.1 2 2 7.9e-05 0.015 9.2 0.0 88 158 142 215 135 239 0.74 # 5094 # 6146 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 4_37 - 237 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.0021 12.0 0.0 1 1 1.8e-05 0.0032 11.4 0.0 18 52 31 65 21 88 0.80 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 1_152 - 344 HTH_29 PF13551.1 112 1.3e-16 55.5 0.1 1 1 1.3e-18 2.4e-16 54.7 0.1 1 109 30 137 30 140 0.93 # 149561 # 150592 # 1 # ID=1_152;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 4_34 - 107 HTH_29 PF13551.1 112 0.00092 14.1 0.0 1 1 6.9e-06 0.0013 13.7 0.0 11 46 49 83 39 99 0.81 # 26987 # 27307 # -1 # ID=4_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 4_28 - 553 NAD_binding_9 PF13454.1 156 0.00075 14.0 6.4 1 4 0.021 7.7 1.0 0.1 1 33 4 33 4 46 0.82 # 22901 # 24559 # -1 # ID=4_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 4_28 - 553 NAD_binding_9 PF13454.1 156 0.00075 14.0 6.4 2 4 0.092 34 -1.1 0.0 114 154 69 113 57 115 0.66 # 22901 # 24559 # -1 # ID=4_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 4_28 - 553 NAD_binding_9 PF13454.1 156 0.00075 14.0 6.4 3 4 0.0026 0.94 4.0 0.2 2 32 155 180 154 194 0.81 # 22901 # 24559 # -1 # ID=4_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 4_28 - 553 NAD_binding_9 PF13454.1 156 0.00075 14.0 6.4 4 4 4e-05 0.015 9.9 0.1 113 154 204 244 191 246 0.79 # 22901 # 24559 # -1 # ID=4_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_146 - 370 Met_10 PF02475.11 200 0.0012 13.2 0.0 1 1 5.8e-06 0.0021 12.4 0.0 98 164 183 255 178 310 0.80 # 143840 # 144949 # -1 # ID=1_146;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 4_28 - 553 NAD_binding_8 PF13450.1 68 4.3e-08 27.9 5.8 1 2 7.3e-07 0.00027 15.7 0.3 1 32 5 38 5 53 0.90 # 22901 # 24559 # -1 # ID=4_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 4_28 - 553 NAD_binding_8 PF13450.1 68 4.3e-08 27.9 5.8 2 2 2.5e-06 0.00091 14.0 0.1 2 30 156 184 155 185 0.95 # 22901 # 24559 # -1 # ID=4_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_138 - 513 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 3.4e-103 339.3 0.1 1 1 1.9e-105 3.4e-103 339.3 0.1 1 271 175 462 175 462 0.98 # 135999 # 137537 # 1 # ID=1_138;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.603 2_3 - 235 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 8.6e-12 39.5 0.3 1 1 6e-14 1.1e-11 39.2 0.3 5 132 10 144 6 174 0.87 # 1521 # 2225 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_122 - 204 Spermine_synth PF01564.12 246 0.00061 13.5 0.0 1 1 2.4e-06 0.00087 13.0 0.0 79 157 82 153 68 165 0.88 # 124457 # 125068 # 1 # ID=1_122;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 1_56 - 600 PhoH PF02562.11 205 0.00015 15.8 0.0 1 2 0.0069 1.3 2.9 0.0 15 54 16 56 9 80 0.76 # 64630 # 66429 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 1_56 - 600 PhoH PF02562.11 205 0.00015 15.8 0.0 2 2 3.8e-05 0.0069 10.3 0.0 121 194 206 280 203 287 0.74 # 64630 # 66429 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 1_10 - 603 PhoH PF02562.11 205 0.0002 15.3 0.2 1 2 0.0001 0.019 8.9 0.0 6 61 5 61 2 79 0.77 # 8938 # 10746 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 1_10 - 603 PhoH PF02562.11 205 0.0002 15.3 0.2 2 2 0.0034 0.62 4.0 0.0 118 174 188 243 150 258 0.71 # 8938 # 10746 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 1_6 - 351 AAA_5 PF07728.9 139 3.1e-38 125.4 0.0 1 1 1.3e-40 5e-38 124.7 0.0 1 139 98 238 98 238 0.97 # 5094 # 6146 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 1_86 - 356 ResIII PF04851.10 184 1.7e-05 19.5 0.0 1 1 2.6e-07 2.4e-05 18.9 0.0 9 63 146 197 127 210 0.84 # 96752 # 97819 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 2_55 - 357 ResIII PF04851.10 184 0.00014 16.4 0.0 1 1 2.3e-06 0.00021 15.9 0.0 8 63 146 198 129 212 0.85 # 47517 # 48587 # 1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.688 1_10 - 603 ResIII PF04851.10 184 0.00076 14.1 0.3 1 1 2.4e-05 0.0022 12.6 0.0 19 76 12 76 5 97 0.74 # 8938 # 10746 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 2_5 - 680 ResIII PF04851.10 184 0.0038 11.8 0.0 1 1 0.00012 0.011 10.3 0.0 24 60 16 58 4 146 0.84 # 3366 # 5405 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_132 - 352 PAPS_reduct PF01507.14 174 6.6e-09 30.5 0.0 1 1 3.1e-11 1.2e-08 29.8 0.0 3 149 78 263 76 267 0.79 # 130747 # 131802 # 1 # ID=1_132;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 1_84 - 672 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 4.6e-32 105.8 0.0 1 1 7.4e-33 3.9e-31 102.7 0.0 44 381 171 543 140 548 0.78 # 94279 # 96294 # 1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.631 2_53 - 666 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 3e-31 103.1 0.0 1 1 1.6e-32 8.4e-31 101.6 0.0 46 380 173 538 144 544 0.80 # 45050 # 47047 # 1 # ID=2_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.639 3_7 - 695 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.2e-14 48.5 0.0 1 2 5.8e-06 0.00031 14.2 0.1 16 52 199 235 189 341 0.86 # 4674 # 6758 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 3_7 - 695 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.2e-14 48.5 0.0 2 2 2.6e-11 1.4e-09 31.8 0.0 195 375 445 640 404 647 0.69 # 4674 # 6758 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 1_86 - 356 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 5.1e-08 26.6 0.0 1 1 1.5e-09 7.7e-08 26.0 0.0 13 50 154 191 146 197 0.92 # 96752 # 97819 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 2_55 - 357 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 5.9e-08 26.4 0.0 1 1 1.7e-09 8.9e-08 25.8 0.0 13 50 155 192 147 198 0.92 # 47517 # 48587 # 1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.688 1_89 - 817 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 9.6e-05 15.8 0.1 1 2 0.00019 0.01 9.2 0.1 15 50 441 477 436 485 0.81 # 98480 # 100930 # 1 # ID=1_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 1_89 - 817 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 9.6e-05 15.8 0.1 2 2 0.0067 0.35 4.1 0.0 245 311 642 702 639 714 0.84 # 98480 # 100930 # 1 # ID=1_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 2_58 - 817 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 0.00042 13.7 0.1 1 2 0.00075 0.04 7.2 0.1 15 50 441 477 436 486 0.83 # 49249 # 51699 # 1 # ID=2_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 2_58 - 817 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 0.00042 13.7 0.1 2 2 0.0068 0.36 4.1 0.0 245 311 642 702 639 713 0.84 # 49249 # 51699 # 1 # ID=2_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_69 - 213 TIGR01968 TIGR01968 261 3.1e-12 40.8 0.2 1 2 2.8e-09 3.5e-07 24.2 0.1 5 40 4 39 1 47 0.87 # 79029 # 79667 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.698 1_69 - 213 TIGR01968 TIGR01968 261 3.1e-12 40.8 0.2 2 2 2.1e-06 0.00026 14.8 0.0 97 173 65 145 60 161 0.82 # 79029 # 79667 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.698 2_33 - 213 TIGR01968 TIGR01968 261 1.8e-11 38.3 0.2 1 2 4.1e-08 5e-06 20.4 0.0 9 40 8 39 2 47 0.89 # 29916 # 30554 # 1 # ID=2_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.695 2_33 - 213 TIGR01968 TIGR01968 261 1.8e-11 38.3 0.2 2 2 8.6e-07 0.00011 16.1 0.0 97 173 65 145 60 161 0.83 # 29916 # 30554 # 1 # ID=2_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.695 1_28 - 418 TIGR01968 TIGR01968 261 5.5e-05 17.0 0.1 1 2 2.3e-05 0.0028 11.4 0.1 2 39 115 155 114 185 0.83 # 30918 # 32171 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 1_28 - 418 TIGR01968 TIGR01968 261 5.5e-05 17.0 0.1 2 2 0.0081 1 3.1 0.0 103 143 251 291 221 320 0.77 # 30918 # 32171 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 3_1 - 125 DDE_Tnp_4 PF13359.1 158 4.2e-05 17.9 0.0 1 1 2.9e-07 5.4e-05 17.6 0.0 73 155 10 106 1 109 0.63 # 3 # 377 # 1 # ID=3_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.544 2_1 - 125 DDE_Tnp_4 PF13359.1 158 5.8e-05 17.5 0.0 1 1 4e-07 7.4e-05 17.1 0.0 73 155 10 106 1 109 0.64 # 3 # 377 # 1 # ID=2_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.549 1_151 - 572 AAA_18 PF13238.1 129 2.4e-05 19.4 0.0 1 1 1.1e-06 8.3e-05 17.7 0.0 1 36 40 71 40 94 0.73 # 147762 # 149477 # 1 # ID=1_151;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.460 4_37 - 237 AAA_18 PF13238.1 129 0.00018 16.6 0.0 1 1 3.2e-05 0.0024 13.0 0.0 1 18 38 55 38 99 0.76 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 1_86 - 356 AAA_18 PF13238.1 129 0.00042 15.4 0.0 1 1 1e-05 0.00074 14.6 0.0 1 25 159 186 159 205 0.78 # 96752 # 97819 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 2_55 - 357 AAA_18 PF13238.1 129 0.0021 13.1 0.0 1 1 4.6e-05 0.0034 12.5 0.0 1 25 160 187 160 206 0.78 # 47517 # 48587 # 1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.688 1_69 - 213 AAA_18 PF13238.1 129 0.0044 12.1 0.0 1 1 0.00013 0.0097 11.0 0.0 8 42 11 49 9 102 0.58 # 79029 # 79667 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.698 1_22 - 345 MutL PF13941.1 457 0.0014 11.7 0.2 1 2 1.3e-05 0.0048 9.9 0.1 246 271 189 214 164 220 0.78 # 25635 # 26669 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.420 1_22 - 345 MutL PF13941.1 457 0.0014 11.7 0.2 2 2 0.03 11 -1.2 0.0 39 58 270 289 258 307 0.72 # 25635 # 26669 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.420 1_57 - 713 TIGR00611 TIGR00611 365 1.6e-13 44.9 0.2 1 2 8.2e-14 3e-11 37.4 0.1 1 48 1 48 1 62 0.90 # 66432 # 68570 # -1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 1_57 - 713 TIGR00611 TIGR00611 365 1.6e-13 44.9 0.2 2 2 0.00077 0.28 4.6 0.0 277 355 320 397 315 405 0.88 # 66432 # 68570 # -1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 2_1 - 125 DDE_Tnp_1_6 PF13751.1 125 5.2e-09 30.9 0.2 1 1 3.6e-11 6.6e-09 30.6 0.2 58 123 50 112 41 114 0.82 # 3 # 377 # 1 # ID=2_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.549 3_1 - 125 DDE_Tnp_1_6 PF13751.1 125 6.2e-09 30.7 0.2 1 1 4.8e-11 8.8e-09 30.2 0.2 62 123 54 112 41 113 0.80 # 3 # 377 # 1 # ID=3_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.544 1_151 - 572 DUF258 PF03193.11 161 1.1e-05 19.4 0.0 1 1 1.7e-07 2.1e-05 18.5 0.0 26 99 25 101 8 112 0.83 # 147762 # 149477 # 1 # ID=1_151;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.460 4_37 - 237 DUF258 PF03193.11 161 0.00032 14.7 0.0 1 1 4.1e-06 0.00051 14.0 0.0 32 56 31 56 20 68 0.80 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 2_41 - 274 DUF258 PF03193.11 161 0.0044 11.0 0.1 1 1 5.3e-05 0.0065 10.4 0.1 21 60 26 66 10 78 0.77 # 36184 # 37005 # -1 # ID=2_41;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.612 3_7 - 695 DUF87 PF01935.12 229 0.00039 15.0 0.0 1 1 8.4e-06 0.001 13.6 0.0 25 68 200 242 184 277 0.87 # 4674 # 6758 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 1_31 - 894 DUF87 PF01935.12 229 0.0034 11.9 0.1 1 1 0.00019 0.024 9.2 0.0 26 53 459 487 437 494 0.70 # 34576 # 37257 # -1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.422 2_33 - 213 DUF87 PF01935.12 229 0.0048 11.4 0.1 1 1 6.6e-05 0.0081 10.7 0.1 33 60 11 37 9 41 0.94 # 29916 # 30554 # 1 # ID=2_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.695 1_152 - 344 HTH_28 PF13518.1 52 4e-09 31.1 1.1 1 1 3.5e-10 1.8e-08 29.0 0.1 1 50 29 82 29 84 0.89 # 149561 # 150592 # 1 # ID=1_152;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_142 - 93 HTH_28 PF13518.1 52 4.1e-07 24.7 0.0 1 1 1.3e-08 7e-07 23.9 0.0 1 36 10 46 10 49 0.92 # 141153 # 141431 # 1 # ID=1_142;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 2_3 - 235 HTH_28 PF13518.1 52 0.00021 16.0 1.2 1 1 1.8e-05 0.00093 14.0 1.2 22 36 40 54 13 55 0.76 # 1521 # 2225 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 4_34 - 107 HTH_28 PF13518.1 52 0.00025 15.8 0.0 1 1 9.3e-06 0.00049 14.9 0.0 4 36 40 73 39 76 0.84 # 26987 # 27307 # -1 # ID=4_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 1_136 - 126 HTH_28 PF13518.1 52 0.0004 15.1 0.0 1 1 9.8e-06 0.00052 14.8 0.0 5 40 24 60 20 70 0.79 # 135228 # 135605 # 1 # ID=1_136;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.542 4_19 - 186 HTH_28 PF13518.1 52 0.0014 13.4 0.3 1 1 7.1e-05 0.0037 12.0 0.0 4 34 149 180 146 181 0.90 # 16155 # 16712 # 1 # ID=4_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.450 2_52 - 302 HTH_28 PF13518.1 52 0.0027 12.5 0.0 1 1 0.00027 0.014 10.2 0.0 3 40 12 50 12 60 0.86 # 43839 # 44744 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.584 2_39 - 232 DUF330 PF03886.8 161 5e-19 63.0 0.8 1 1 1.7e-21 6.3e-19 62.7 0.8 3 161 38 200 36 200 0.87 # 34471 # 35166 # -1 # ID=2_39;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 4_43 - 94 HTH_24 PF13412.1 48 0.00058 14.0 0.0 1 1 4.9e-06 0.0009 13.4 0.0 3 36 30 63 28 64 0.91 # 35168 # 35449 # 1 # ID=4_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 2_47 - 307 HTH_24 PF13412.1 48 0.0022 12.1 0.0 1 1 2.4e-05 0.0044 11.2 0.0 23 44 26 47 14 47 0.89 # 40925 # 41845 # 1 # ID=2_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.592 1_6 - 351 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 0.0012 13.7 0.0 1 1 8.2e-06 0.003 12.3 0.0 21 94 96 187 80 195 0.70 # 5094 # 6146 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 2_52 - 302 HTH_30 PF13556.1 59 0.00092 13.6 0.1 1 1 5.1e-06 0.0019 12.6 0.1 1 44 11 53 11 60 0.90 # 43839 # 44744 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.584 1_49 - 559 TIGR03534 TIGR03534 253 0.0024 11.8 0.0 1 1 1.1e-05 0.0042 11.0 0.0 136 172 458 496 442 505 0.75 # 52814 # 54490 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 4_24 - 178 Terminase_GpA PF05876.7 557 0.0016 11.5 0.5 1 2 2e-05 0.0074 9.3 0.2 174 214 66 106 60 132 0.86 # 20271 # 20804 # 1 # ID=4_24;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.425 4_24 - 178 Terminase_GpA PF05876.7 557 0.0016 11.5 0.5 2 2 0.0093 3.4 0.5 0.0 277 312 117 158 110 167 0.74 # 20271 # 20804 # 1 # ID=4_24;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.425 2_32 - 282 RPA PF10134.4 229 5.1e-91 298.7 0.0 1 1 3.2e-93 5.8e-91 298.5 0.0 1 228 28 256 28 257 0.98 # 28829 # 29674 # 1 # ID=2_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.671 1_68 - 281 RPA PF10134.4 229 1.8e-88 290.4 0.0 1 1 1.1e-90 2e-88 290.2 0.0 1 228 27 255 27 256 0.98 # 77921 # 78763 # 1 # ID=1_68;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.669 1_27 - 335 HTH_10 PF04967.7 53 0.0018 12.7 0.1 1 1 2.8e-05 0.0051 11.2 0.1 25 48 175 198 174 200 0.90 # 29917 # 30921 # -1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.412 4_34 - 107 HTH_10 PF04967.7 53 0.0023 12.3 0.0 1 1 1.9e-05 0.0035 11.7 0.0 28 52 54 78 49 79 0.88 # 26987 # 27307 # -1 # ID=4_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 4_28 - 553 TIGR01292 TIGR01292 300 2.1e-09 31.0 0.9 1 1 4.5e-11 1.7e-08 28.1 0.9 3 276 3 286 1 293 0.63 # 22901 # 24559 # -1 # ID=4_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_152 - 344 HTH_33 PF13592.1 60 1.9e-06 22.1 2.3 1 1 1.1e-08 3.9e-06 21.1 0.1 2 52 107 157 106 161 0.95 # 149561 # 150592 # 1 # ID=1_152;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_86 - 356 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.00013 16.6 0.0 1 1 1.8e-06 0.00022 15.9 0.0 2 37 159 193 158 218 0.82 # 96752 # 97819 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 2_55 - 357 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.00053 14.7 0.0 1 1 7.1e-06 0.00087 14.0 0.0 2 37 160 194 159 219 0.82 # 47517 # 48587 # 1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.688 4_37 - 237 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.0012 13.5 0.0 1 1 3.8e-05 0.0047 11.7 0.0 2 19 38 55 37 98 0.90 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 1_86 - 356 DEAD PF00270.24 169 3.1e-06 21.5 0.0 1 1 6.8e-08 5e-06 20.8 0.0 2 57 143 197 142 313 0.86 # 96752 # 97819 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 2_55 - 357 DEAD PF00270.24 169 2.8e-05 18.4 0.0 1 1 5.7e-07 4.2e-05 17.8 0.0 1 57 143 198 143 312 0.88 # 47517 # 48587 # 1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.688 2_58 - 817 DEAD PF00270.24 169 0.00042 14.6 0.0 1 2 0.0013 0.094 6.9 0.0 15 37 442 464 430 558 0.78 # 49249 # 51699 # 1 # ID=2_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 2_58 - 817 DEAD PF00270.24 169 0.00042 14.6 0.0 2 2 0.004 0.3 5.3 0.0 121 161 635 675 612 682 0.77 # 49249 # 51699 # 1 # ID=2_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_10 - 603 DEAD PF00270.24 169 0.00043 14.5 0.3 1 1 2.7e-05 0.002 12.4 0.3 5 64 9 117 5 214 0.58 # 8938 # 10746 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 1_89 - 817 DEAD PF00270.24 169 0.0011 13.3 0.0 1 2 0.0032 0.24 5.6 0.0 15 37 442 464 430 523 0.89 # 98480 # 100930 # 1 # ID=1_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 1_89 - 817 DEAD PF00270.24 169 0.0011 13.3 0.0 2 2 0.0042 0.31 5.2 0.0 121 161 635 675 613 682 0.77 # 98480 # 100930 # 1 # ID=1_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 2_41 - 274 Miro PF08477.8 119 0.0014 13.9 0.0 1 1 6.7e-06 0.0025 13.1 0.0 3 25 45 67 44 88 0.89 # 36184 # 37005 # -1 # ID=2_41;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.612 2_21 - 170 Ribosomal_L16 PF00252.13 133 0.0023 12.5 0.0 1 2 0.00012 0.046 8.2 0.0 46 65 31 50 18 66 0.82 # 18289 # 18798 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.614 2_21 - 170 Ribosomal_L16 PF00252.13 133 0.0023 12.5 0.0 2 2 0.017 6.2 1.3 0.0 48 81 129 163 126 167 0.85 # 18289 # 18798 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.614 4_43 - 94 HTH_31 PF13560.1 64 6.8e-14 46.6 0.0 1 1 9.5e-16 8.7e-14 46.3 0.0 2 56 32 85 31 91 0.95 # 35168 # 35449 # 1 # ID=4_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_64 - 111 HTH_31 PF13560.1 64 7.9e-08 27.2 0.1 1 1 1.3e-09 1.2e-07 26.6 0.1 2 58 20 73 19 87 0.91 # 75423 # 75755 # -1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 1_149 - 99 HTH_31 PF13560.1 64 9.5e-06 20.5 0.0 1 1 1.3e-07 1.2e-05 20.2 0.0 10 56 21 66 10 73 0.82 # 146607 # 146903 # -1 # ID=1_149;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 4_34 - 107 HTH_31 PF13560.1 64 0.00024 16.1 0.1 1 1 5.3e-06 0.00049 15.0 0.0 12 39 47 74 28 77 0.87 # 26987 # 27307 # -1 # ID=4_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 1_10 - 603 UvrD_C_2 PF13538.1 104 2.8e-11 38.3 0.0 1 1 5.5e-13 6.8e-11 37.0 0.0 47 103 496 562 454 563 0.78 # 8938 # 10746 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 2_5 - 680 UvrD_C_2 PF13538.1 104 7.4e-11 36.9 0.0 1 1 2.2e-12 2.7e-10 35.1 0.0 23 104 505 607 490 607 0.83 # 3366 # 5405 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_56 - 600 UvrD_C_2 PF13538.1 104 1.6e-08 29.4 0.0 1 1 3.8e-10 4.7e-08 27.9 0.0 20 104 479 568 461 568 0.63 # 64630 # 66429 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 1_122 - 204 TIGR00755 TIGR00755 256 1.3e-05 19.0 0.2 1 2 0.0078 1.4 2.5 0.0 96 106 58 69 40 80 0.75 # 124457 # 125068 # 1 # ID=1_122;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 1_122 - 204 TIGR00755 TIGR00755 256 1.3e-05 19.0 0.2 2 2 1.8e-06 0.00034 14.4 0.0 33 86 83 138 70 143 0.86 # 124457 # 125068 # 1 # ID=1_122;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 1_121 - 212 TIGR00755 TIGR00755 256 0.00019 15.2 0.1 1 1 2.5e-06 0.00046 13.9 0.0 31 87 82 140 62 150 0.85 # 123760 # 124395 # 1 # ID=1_121;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_6 - 351 TIP49 PF06068.8 398 0.0011 12.4 0.1 1 2 8.4e-06 0.0031 11.0 0.0 40 82 87 128 79 144 0.78 # 5094 # 6146 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 1_6 - 351 TIP49 PF06068.8 398 0.0011 12.4 0.1 2 2 0.073 27 -2.0 0.0 336 363 234 261 223 292 0.81 # 5094 # 6146 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 1_28 - 418 HTH_OrfB_IS605 PF12323.3 46 0.00035 14.6 0.1 1 2 0.00072 0.27 5.4 0.1 24 37 40 53 39 54 0.89 # 30918 # 32171 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 1_28 - 418 HTH_OrfB_IS605 PF12323.3 46 0.00035 14.6 0.1 2 2 0.00014 0.053 7.7 0.0 17 38 53 74 51 76 0.86 # 30918 # 32171 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 1_102 - 294 HTH_36 PF13730.1 55 3.6e-05 18.6 0.0 1 2 0.0045 0.82 4.7 0.0 28 48 119 139 94 139 0.87 # 109491 # 110372 # -1 # ID=1_102;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_102 - 294 HTH_36 PF13730.1 55 3.6e-05 18.6 0.0 2 2 3.4e-05 0.0062 11.4 0.0 6 55 218 271 216 271 0.72 # 109491 # 110372 # -1 # ID=1_102;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_28 - 418 HTH_36 PF13730.1 55 0.0004 15.2 0.1 1 1 8.2e-06 0.0015 13.4 0.0 28 55 52 79 40 79 0.92 # 30918 # 32171 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 2_55 - 357 T2SE PF00437.15 272 5.2e-84 276.1 0.0 1 1 5e-86 6.1e-84 275.8 0.0 4 270 33 299 30 301 0.98 # 47517 # 48587 # 1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.688 1_86 - 356 T2SE PF00437.15 272 7.5e-84 275.5 0.1 1 1 7.3e-86 9e-84 275.3 0.1 4 270 32 298 29 300 0.98 # 96752 # 97819 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 1_151 - 572 T2SE PF00437.15 272 0.0019 11.8 0.0 1 1 2.9e-05 0.0035 11.0 0.0 109 155 20 64 1 71 0.78 # 147762 # 149477 # 1 # ID=1_151;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.460 1_22 - 345 StbA PF06406.6 318 1.4e-122 403.3 1.3 1 1 4.5e-125 1.7e-122 403.0 1.3 1 317 22 340 22 341 0.98 # 25635 # 26669 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.420 1_151 - 572 NACHT PF05729.7 166 0.00025 15.5 0.0 1 2 0.00057 0.053 7.9 0.0 3 26 40 63 38 73 0.88 # 147762 # 149477 # 1 # ID=1_151;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.460 1_151 - 572 NACHT PF05729.7 166 0.00025 15.5 0.0 2 2 0.0044 0.41 5.0 0.0 75 99 237 261 214 333 0.61 # 147762 # 149477 # 1 # ID=1_151;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.460 1_89 - 817 NACHT PF05729.7 166 0.0013 13.1 0.2 1 1 7.2e-05 0.0066 10.8 0.0 4 26 445 467 443 487 0.83 # 98480 # 100930 # 1 # ID=1_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 2_58 - 817 NACHT PF05729.7 166 0.0031 11.9 0.1 1 1 0.0003 0.028 8.8 0.0 4 25 445 466 443 484 0.87 # 49249 # 51699 # 1 # ID=2_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 4_37 - 237 NACHT PF05729.7 166 0.0052 11.2 0.3 1 1 0.00013 0.012 10.0 0.2 2 19 37 54 36 59 0.87 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 1_151 - 572 UPF0079 PF02367.12 123 0.00023 15.5 0.0 1 1 2.9e-06 0.00053 14.4 0.0 3 41 23 63 21 77 0.82 # 147762 # 149477 # 1 # ID=1_151;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.460 4_37 - 237 UPF0079 PF02367.12 123 0.0017 12.8 0.0 1 1 1.9e-05 0.0035 11.7 0.0 10 39 30 59 22 67 0.85 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 4_37 - 237 AAA_17 PF13207.1 121 6.3e-06 21.8 0.0 1 1 3.3e-07 1.7e-05 20.4 0.0 1 47 37 87 37 139 0.72 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 2_33 - 213 AAA_17 PF13207.1 121 2.9e-05 19.6 0.0 1 1 9.8e-07 5.1e-05 18.8 0.0 9 78 11 139 10 201 0.61 # 29916 # 30554 # 1 # ID=2_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.695 1_151 - 572 AAA_17 PF13207.1 121 5.3e-05 18.8 0.1 1 1 4.8e-06 0.00025 16.6 0.0 1 33 39 74 39 153 0.75 # 147762 # 149477 # 1 # ID=1_151;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.460 1_69 - 213 AAA_17 PF13207.1 121 0.00017 17.2 0.0 1 1 6.1e-06 0.00032 16.3 0.0 9 78 11 143 10 198 0.58 # 79029 # 79667 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.698 1_86 - 356 AAA_17 PF13207.1 121 0.00026 16.6 0.0 1 1 1e-05 0.00052 15.6 0.0 2 32 159 192 158 236 0.75 # 96752 # 97819 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 1_6 - 351 AAA_17 PF13207.1 121 0.002 13.7 0.0 1 1 8.3e-05 0.0043 12.6 0.0 2 46 99 141 98 195 0.74 # 5094 # 6146 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 2_55 - 357 AAA_17 PF13207.1 121 0.0022 13.6 0.0 1 1 8.5e-05 0.0045 12.6 0.0 2 32 160 193 159 236 0.76 # 47517 # 48587 # 1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.688 4_24 - 178 DZR PF12773.2 50 0.00087 13.9 6.0 1 2 0.016 5.8 1.6 0.1 11 18 35 42 28 54 0.62 # 20271 # 20804 # 1 # ID=4_24;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.425 4_24 - 178 DZR PF12773.2 50 0.00087 13.9 6.0 2 2 4.9e-06 0.0018 12.9 2.6 23 50 71 115 64 115 0.71 # 20271 # 20804 # 1 # ID=4_24;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.425 4_37 - 237 TIGR02211 TIGR02211 221 1.8e-57 188.8 0.0 1 1 1.2e-59 2.2e-57 188.5 0.0 3 218 7 224 6 227 0.95 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 2_41 - 274 TIGR02211 TIGR02211 221 3.4e-36 119.2 0.0 1 1 2.4e-38 4.4e-36 118.9 0.0 18 218 28 230 18 233 0.90 # 36184 # 37005 # -1 # ID=2_41;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.612 3_27 - 214 Bd3614-deam PF14439.1 136 0.00041 15.0 0.1 1 1 1.6e-06 0.0006 14.4 0.1 3 68 47 112 45 122 0.77 # 30287 # 30928 # -1 # ID=3_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.477 4_37 - 237 AAA_25 PF13481.1 194 5.5e-08 27.1 0.1 1 2 2.7e-07 1.6e-05 19.1 0.0 16 61 19 65 8 86 0.74 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 4_37 - 237 AAA_25 PF13481.1 194 5.5e-08 27.1 0.1 2 2 0.0029 0.18 5.9 0.0 161 188 180 206 172 209 0.85 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 2_55 - 357 AAA_25 PF13481.1 194 1.8e-05 18.9 0.2 1 1 5.1e-07 3.1e-05 18.2 0.2 31 112 155 252 139 287 0.75 # 47517 # 48587 # 1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.688 1_86 - 356 AAA_25 PF13481.1 194 1.9e-05 18.9 0.1 1 1 5.4e-07 3.3e-05 18.1 0.1 31 111 154 249 138 286 0.73 # 96752 # 97819 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 1_69 - 213 AAA_25 PF13481.1 194 0.00016 15.9 0.4 1 1 6.4e-06 0.00039 14.6 0.1 41 97 9 55 3 104 0.65 # 79029 # 79667 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.698 2_33 - 213 AAA_25 PF13481.1 194 0.00044 14.4 0.0 1 1 1.6e-05 0.00098 13.3 0.0 42 97 10 55 3 105 0.65 # 29916 # 30554 # 1 # ID=2_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.695 1_89 - 817 AAA_25 PF13481.1 194 0.0016 12.6 0.1 1 1 0.00018 0.011 9.8 0.0 34 57 442 465 425 493 0.79 # 98480 # 100930 # 1 # ID=1_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 2_58 - 817 Zot PF05707.7 193 5e-05 17.6 0.0 1 1 5.9e-07 0.00011 16.5 0.0 78 131 631 681 592 689 0.78 # 49249 # 51699 # 1 # ID=2_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_89 - 817 Zot PF05707.7 193 6.4e-05 17.2 0.0 1 1 7e-07 0.00013 16.2 0.0 78 131 631 681 600 689 0.80 # 98480 # 100930 # 1 # ID=1_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 2_5 - 680 Viral_helicase1 PF01443.13 234 1.2e-10 36.0 0.0 1 3 2.1e-06 0.00026 15.3 0.0 2 59 21 77 20 88 0.79 # 3366 # 5405 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 2_5 - 680 Viral_helicase1 PF01443.13 234 1.2e-10 36.0 0.0 2 3 0.00034 0.041 8.1 0.0 62 118 209 263 183 343 0.73 # 3366 # 5405 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 2_5 - 680 Viral_helicase1 PF01443.13 234 1.2e-10 36.0 0.0 3 3 0.0016 0.2 5.9 0.0 213 232 572 606 528 608 0.62 # 3366 # 5405 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_10 - 603 Viral_helicase1 PF01443.13 234 3.3e-07 24.8 0.0 1 3 0.011 1.4 3.1 0.0 2 21 20 39 19 80 0.72 # 8938 # 10746 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 1_10 - 603 Viral_helicase1 PF01443.13 234 3.3e-07 24.8 0.0 2 3 0.021 2.6 2.2 0.0 33 137 160 263 140 297 0.71 # 8938 # 10746 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 1_10 - 603 Viral_helicase1 PF01443.13 234 3.3e-07 24.8 0.0 3 3 1.7e-06 0.00021 15.6 0.0 181 233 504 563 468 564 0.86 # 8938 # 10746 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 1_56 - 600 Viral_helicase1 PF01443.13 234 1.2e-06 23.0 0.1 1 3 0.0094 1.2 3.3 0.0 5 51 27 73 24 81 0.66 # 64630 # 66429 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 1_56 - 600 Viral_helicase1 PF01443.13 234 1.2e-06 23.0 0.1 2 3 0.00085 0.1 6.8 0.0 63 104 205 250 193 258 0.78 # 64630 # 66429 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 1_56 - 600 Viral_helicase1 PF01443.13 234 1.2e-06 23.0 0.1 3 3 0.00019 0.023 8.9 0.0 157 233 489 568 449 569 0.70 # 64630 # 66429 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 1_57 - 713 AAA_15 PF13175.1 415 1.1e-24 82.0 4.0 1 2 5.6e-11 1e-08 29.3 0.1 1 43 3 49 3 94 0.89 # 66432 # 68570 # -1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 1_57 - 713 AAA_15 PF13175.1 415 1.1e-24 82.0 4.0 2 2 2.5e-18 4.7e-16 53.5 1.0 308 414 286 386 213 387 0.77 # 66432 # 68570 # -1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 4_37 - 237 AAA_15 PF13175.1 415 3.8e-06 20.9 0.0 1 2 0.00028 0.051 7.3 0.0 27 43 40 56 19 77 0.83 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 4_37 - 237 AAA_15 PF13175.1 415 3.8e-06 20.9 0.0 2 2 1.2e-05 0.0022 11.8 0.0 371 415 165 211 144 211 0.90 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 1_69 - 213 RuvB_N PF05496.7 234 0.00058 13.7 0.3 1 2 0.00033 0.061 7.0 0.1 54 76 5 27 3 33 0.85 # 79029 # 79667 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.698 1_69 - 213 RuvB_N PF05496.7 234 0.00058 13.7 0.3 2 2 0.0026 0.48 4.1 0.0 47 73 77 103 66 130 0.81 # 79029 # 79667 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.698 2_33 - 213 RuvB_N PF05496.7 234 0.0013 12.5 0.3 1 2 0.00068 0.12 6.0 0.0 57 76 8 27 3 32 0.84 # 29916 # 30554 # 1 # ID=2_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.695 2_33 - 213 RuvB_N PF05496.7 234 0.0013 12.5 0.3 2 2 0.0032 0.59 3.8 0.0 47 73 77 103 66 131 0.77 # 29916 # 30554 # 1 # ID=2_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.695 1_151 - 572 AAA_14 PF13173.1 128 2e-05 19.3 0.1 1 1 1.7e-06 0.00016 16.4 0.0 4 47 39 80 36 119 0.80 # 147762 # 149477 # 1 # ID=1_151;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.460 1_89 - 817 AAA_14 PF13173.1 128 0.00046 14.8 0.0 1 2 0.016 1.5 3.5 0.0 6 27 445 466 442 485 0.76 # 98480 # 100930 # 1 # ID=1_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 1_89 - 817 AAA_14 PF13173.1 128 0.00046 14.8 0.0 2 2 0.00037 0.034 8.8 0.0 61 103 640 681 603 696 0.73 # 98480 # 100930 # 1 # ID=1_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 2_58 - 817 AAA_14 PF13173.1 128 0.00065 14.4 0.0 1 2 0.03 2.8 2.6 0.0 6 26 445 465 442 484 0.77 # 49249 # 51699 # 1 # ID=2_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 2_58 - 817 AAA_14 PF13173.1 128 0.00065 14.4 0.0 2 2 0.00031 0.028 9.1 0.0 61 103 640 681 603 696 0.71 # 49249 # 51699 # 1 # ID=2_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_86 - 356 AAA_14 PF13173.1 128 0.0041 11.8 0.0 1 1 7e-05 0.0064 11.1 0.0 2 27 156 181 155 216 0.83 # 96752 # 97819 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 2_33 - 213 VirC1 PF07015.6 231 2e-06 21.8 0.0 1 1 1.8e-08 3.3e-06 21.1 0.0 5 191 4 186 1 205 0.79 # 29916 # 30554 # 1 # ID=2_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.695 1_69 - 213 VirC1 PF07015.6 231 2.4e-06 21.5 0.0 1 1 2.2e-08 4e-06 20.8 0.0 6 191 5 186 1 206 0.73 # 79029 # 79667 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.698 4_35 - 335 Transposase_20 PF02371.11 87 3.8e-24 79.4 0.2 1 1 4.6e-26 8.5e-24 78.3 0.2 2 78 210 286 209 296 0.94 # 27767 # 28771 # -1 # ID=4_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.491 4_41 - 335 Transposase_20 PF02371.11 87 4.1e-24 79.3 0.2 1 1 4.6e-26 8.5e-24 78.3 0.2 2 78 210 286 209 296 0.94 # 33250 # 34254 # 1 # ID=4_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.483 4_37 - 237 AAA_33 PF13671.1 143 0.00023 15.8 0.6 1 1 5.2e-06 0.00064 14.4 0.6 1 19 37 55 37 209 0.92 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 1_69 - 213 AAA_33 PF13671.1 143 0.0011 13.6 0.0 1 1 1.5e-05 0.0018 12.9 0.0 9 78 11 88 9 133 0.83 # 79029 # 79667 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.698 1_86 - 356 AAA_33 PF13671.1 143 0.0018 12.9 0.0 1 1 3e-05 0.0037 11.9 0.0 2 43 159 204 159 232 0.74 # 96752 # 97819 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 1_142 - 93 CENP-B_N PF04218.8 53 0.00068 13.8 0.0 1 1 4.2e-06 0.0016 12.7 0.0 17 45 17 45 10 46 0.88 # 141153 # 141431 # 1 # ID=1_142;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 2_41 - 274 ABC_ATPase PF09818.4 448 0.0037 10.6 1.3 1 2 0.0015 0.57 3.4 0.1 241 264 37 61 26 70 0.87 # 36184 # 37005 # -1 # ID=2_41;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.612 2_41 - 274 ABC_ATPase PF09818.4 448 0.0037 10.6 1.3 2 2 0.00083 0.31 4.2 0.1 324 351 154 181 141 240 0.83 # 36184 # 37005 # -1 # ID=2_41;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.612 4_37 - 237 ArgK PF03308.11 267 0.00053 13.5 0.1 1 1 2.2e-06 0.00082 12.9 0.1 19 53 25 59 11 68 0.82 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 2_24 - 690 TIGR00020 TIGR00020 365 0.00072 13.0 0.8 1 1 2.9e-06 0.0011 12.4 0.8 57 115 316 374 303 414 0.80 # 22622 # 24691 # 1 # ID=2_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.675 4_37 - 237 SbcCD_C PF13558.1 90 0.0014 13.3 0.1 1 1 0.00013 0.047 8.4 0.1 25 89 140 191 124 192 0.67 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 1_84 - 672 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 7.9e-106 349.1 0.0 1 1 5.9e-108 1.1e-105 348.6 0.0 2 459 112 562 111 570 0.91 # 94279 # 96294 # 1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.631 2_53 - 666 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 4.2e-102 336.8 0.0 1 1 3.1e-104 5.6e-102 336.4 0.0 42 459 128 558 91 564 0.89 # 45050 # 47047 # 1 # ID=2_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.639 1_49 - 559 MTS PF05175.9 170 4.4e-06 20.9 0.0 1 1 2.1e-08 7.7e-06 20.1 0.0 93 140 475 516 436 533 0.75 # 52814 # 54490 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 4_29 - 117 Arg_repressor PF01316.16 70 0.00035 14.9 0.1 1 1 1.4e-06 0.00052 14.3 0.1 31 65 50 87 35 91 0.79 # 24720 # 25070 # 1 # ID=4_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 1_6 - 351 AAA_2 PF07724.9 171 6.9e-07 24.0 0.0 1 1 5.8e-09 2.1e-06 22.5 0.0 5 83 98 177 96 184 0.71 # 5094 # 6146 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 1_86 - 356 APS_kinase PF01583.15 157 0.00085 13.7 0.0 1 1 1.2e-05 0.0015 13.0 0.0 5 37 159 191 155 199 0.91 # 96752 # 97819 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 2_33 - 213 APS_kinase PF01583.15 157 0.0021 12.5 0.0 1 1 3.1e-05 0.0038 11.6 0.0 9 39 8 38 2 48 0.88 # 29916 # 30554 # 1 # ID=2_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.695 1_69 - 213 APS_kinase PF01583.15 157 0.0023 12.4 0.0 1 1 3.3e-05 0.004 11.6 0.0 11 39 10 38 2 48 0.89 # 79029 # 79667 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.698 4_8 - 476 DNA_methylase PF00145.12 335 2.2e-75 248.6 0.0 1 1 9.4e-78 3.5e-75 247.9 0.0 1 331 92 453 92 456 0.88 # 4781 # 6208 # 1 # ID=4_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_148 - 168 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 1.3e-74 243.2 1.4 1 1 4.4e-77 1.6e-74 242.9 1.4 1 131 37 167 37 167 0.99 # 145373 # 145876 # -1 # ID=1_148;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.530 3_12 - 171 Auto_anti-p27 PF06677.7 41 0.00079 14.0 2.1 1 1 3.5e-06 0.0013 13.3 2.1 18 40 130 152 129 153 0.95 # 12568 # 13080 # 1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 4_28 - 553 3HCDH_N PF02737.13 180 0.0012 13.2 0.1 1 1 5.8e-06 0.0021 12.4 0.1 3 75 154 226 152 243 0.82 # 22901 # 24559 # -1 # ID=4_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_132 - 352 ATP_bind_3 PF01171.15 182 0.0023 12.2 0.1 1 1 1e-05 0.0037 11.5 0.1 2 40 77 115 76 151 0.78 # 130747 # 131802 # 1 # ID=1_132;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 1_109 - 85 zinc_ribbon_5 PF13719.1 37 0.0022 12.3 1.5 1 1 7.6e-05 0.028 8.8 1.5 5 35 45 72 42 74 0.76 # 115979 # 116233 # -1 # ID=1_109;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.463 2_3 - 235 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 2.8e-52 171.2 0.0 1 1 3.2e-54 3.9e-52 170.7 0.0 4 139 75 212 73 213 0.99 # 1521 # 2225 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_143 - 205 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 1e-10 36.5 0.4 1 1 9.9e-13 1.2e-10 36.2 0.4 2 139 41 182 40 183 0.85 # 141686 # 142300 # 1 # ID=1_143;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 2_6 - 204 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 1.8e-07 25.9 0.0 1 1 2e-09 2.4e-07 25.6 0.0 16 139 50 177 46 178 0.86 # 5613 # 6224 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 4_43 - 94 HTH_26 PF13443.1 63 6.1e-06 21.1 0.0 1 1 4.8e-08 8.9e-06 20.6 0.0 1 52 31 85 31 87 0.88 # 35168 # 35449 # 1 # ID=4_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_149 - 99 HTH_26 PF13443.1 63 6e-05 18.0 0.0 1 1 5.2e-07 9.6e-05 17.3 0.0 9 54 24 68 19 70 0.93 # 146607 # 146903 # -1 # ID=1_149;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 1_57 - 713 TIGR00634 TIGR00634 563 0.0031 10.9 0.0 1 1 1.4e-05 0.0053 10.1 0.0 5 46 6 47 2 58 0.82 # 66432 # 68570 # -1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 1_42 - 292 TrfA PF07042.6 282 0.00087 12.9 0.1 1 1 2.9e-06 0.0011 12.6 0.1 84 203 77 197 35 268 0.79 # 45683 # 46558 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.439 4_24 - 178 Toprim_Crpt PF13342.1 62 1.1e-25 83.8 5.1 1 1 4.6e-28 1.7e-25 83.2 5.1 1 62 112 176 112 176 0.96 # 20271 # 20804 # 1 # ID=4_24;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.425 1_151 - 572 KAP_NTPase PF07693.9 325 5.6e-20 66.3 0.0 1 1 7.1e-22 1.3e-19 65.0 0.0 2 322 22 376 21 379 0.80 # 147762 # 149477 # 1 # ID=1_151;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.460 4_37 - 237 KAP_NTPase PF07693.9 325 0.00099 12.9 0.1 1 2 4.2e-05 0.0077 9.9 0.0 14 40 29 55 22 84 0.89 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 4_37 - 237 KAP_NTPase PF07693.9 325 0.00099 12.9 0.1 2 2 0.026 4.8 0.8 0.1 184 225 178 219 168 228 0.86 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 1_67 - 95 HTH_17 PF12728.2 51 6.1e-12 40.4 0.0 1 1 4.2e-14 7.7e-12 40.1 0.0 1 50 22 72 22 73 0.94 # 77610 # 77894 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.691 2_31 - 95 HTH_17 PF12728.2 51 1.8e-11 38.9 0.0 1 1 1.2e-13 2.2e-11 38.6 0.0 1 50 22 72 22 73 0.94 # 28518 # 28802 # 1 # ID=2_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.698 1_109 - 85 Zn-ribbon_8 PF09723.5 42 7.8e-05 17.4 1.9 1 2 9e-06 0.0033 12.1 0.1 9 38 27 54 24 57 0.87 # 115979 # 116233 # -1 # ID=1_109;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.463 1_109 - 85 Zn-ribbon_8 PF09723.5 42 7.8e-05 17.4 1.9 2 2 0.0018 0.66 4.8 0.1 6 15 63 72 60 80 0.82 # 115979 # 116233 # -1 # ID=1_109;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.463 4_24 - 178 TF_Zn_Ribbon PF08271.7 43 0.012 9.7 7.1 1 2 0.0066 2.4 2.3 0.1 3 10 39 46 37 57 0.83 # 20271 # 20804 # 1 # ID=4_24;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.425 4_24 - 178 TF_Zn_Ribbon PF08271.7 43 0.012 9.7 7.1 2 2 1.3e-05 0.0047 11.0 0.5 3 29 95 118 93 128 0.83 # 20271 # 20804 # 1 # ID=4_24;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.425 1_109 - 85 Zn_Tnp_IS1595 PF12760.2 46 0.00036 15.1 1.1 1 1 1.5e-06 0.00055 14.5 1.1 14 45 38 70 24 71 0.85 # 115979 # 116233 # -1 # ID=1_109;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.463 3_30 - 156 HTH_11 PF08279.7 55 1.1e-05 19.7 0.0 1 1 6.5e-08 2.4e-05 18.7 0.0 4 42 9 49 6 62 0.82 # 32053 # 32520 # -1 # ID=3_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.494 4_34 - 107 Sigma70_ECF PF07638.6 185 0.00068 14.1 0.1 1 1 2.4e-06 0.0009 13.7 0.1 136 180 34 78 23 83 0.83 # 26987 # 27307 # -1 # ID=4_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 4_29 - 117 MarR_2 PF12802.2 62 6.6e-07 23.7 0.7 1 1 1.9e-08 1.2e-06 22.9 0.7 13 56 26 78 15 80 0.77 # 24720 # 25070 # 1 # ID=4_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 4_43 - 94 MarR_2 PF12802.2 62 0.00024 15.5 0.0 1 1 6.4e-06 0.00039 14.8 0.0 10 41 35 64 32 72 0.89 # 35168 # 35449 # 1 # ID=4_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 2_47 - 307 MarR_2 PF12802.2 62 0.00066 14.1 0.5 1 2 0.00063 0.038 8.4 0.2 14 47 15 46 5 65 0.83 # 40925 # 41845 # 1 # ID=2_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.592 2_47 - 307 MarR_2 PF12802.2 62 0.00066 14.1 0.5 2 2 0.034 2.1 2.9 0.0 2 21 105 124 104 139 0.83 # 40925 # 41845 # 1 # ID=2_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.592 2_52 - 302 MarR_2 PF12802.2 62 0.00079 13.9 0.7 1 1 4e-05 0.0024 12.3 0.2 8 47 9 47 3 48 0.83 # 43839 # 44744 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.584 3_30 - 156 MarR_2 PF12802.2 62 0.00088 13.7 0.1 1 1 3.9e-05 0.0024 12.3 0.1 11 47 13 48 5 49 0.84 # 32053 # 32520 # -1 # ID=3_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.494 1_74 - 661 MarR_2 PF12802.2 62 0.082 7.4 7.9 1 2 0.0069 0.43 5.1 0.1 34 54 534 554 534 557 0.92 # 81514 # 83496 # 1 # ID=1_74;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.670 1_74 - 661 MarR_2 PF12802.2 62 0.082 7.4 7.9 2 2 0.011 0.65 4.5 0.1 8 35 562 588 560 589 0.85 # 81514 # 83496 # 1 # ID=1_74;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.670 1_109 - 85 Elf1 PF05129.8 81 0.00053 14.4 1.3 1 1 2.1e-06 0.00076 13.9 1.3 13 59 33 75 19 82 0.75 # 115979 # 116233 # -1 # ID=1_109;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.463 4_24 - 178 zinc_ribbon_2 PF13240.1 23 0.023 9.0 11.2 1 2 0.002 0.72 4.3 0.2 8 19 31 42 29 46 0.82 # 20271 # 20804 # 1 # ID=4_24;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.425 4_24 - 178 zinc_ribbon_2 PF13240.1 23 0.023 9.0 11.2 2 2 0.0011 0.4 5.1 6.0 2 23 95 118 94 118 0.78 # 20271 # 20804 # 1 # ID=4_24;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.425 4_29 - 117 HTH_5 PF01022.15 47 8.8e-13 42.5 0.2 1 1 3.8e-15 1.4e-12 41.9 0.2 2 47 30 75 29 75 0.96 # 24720 # 25070 # 1 # ID=4_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 4_29 - 117 TrmB PF01978.14 68 7.4e-05 17.2 0.0 1 1 3e-07 0.00011 16.6 0.0 18 63 39 84 19 88 0.90 # 24720 # 25070 # 1 # ID=4_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 4_28 - 553 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 2.4e-31 103.9 0.0 1 1 1.6e-33 5.8e-31 102.7 0.0 1 199 2 287 2 289 0.91 # 22901 # 24559 # -1 # ID=4_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_57 - 713 DUF2813 PF11398.3 373 4.9e-12 40.3 0.1 1 2 6.6e-10 2.4e-07 24.8 0.1 1 106 1 107 1 147 0.84 # 66432 # 68570 # -1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 1_57 - 713 DUF2813 PF11398.3 373 4.9e-12 40.3 0.1 2 2 2.1e-06 0.00076 13.3 0.0 269 348 331 409 323 423 0.85 # 66432 # 68570 # -1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 3_36 - 353 ATP-grasp_4 PF13535.1 184 1.3e-26 88.2 0.0 1 2 0.06 22 -0.6 0.0 106 155 34 77 21 91 0.65 # 37712 # 38770 # -1 # ID=3_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.503 3_36 - 353 ATP-grasp_4 PF13535.1 184 1.3e-26 88.2 0.0 2 2 1.8e-28 6.7e-26 85.9 0.0 2 182 114 293 113 296 0.93 # 37712 # 38770 # -1 # ID=3_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.503 1_28 - 418 HTH_Crp_2 PF13545.1 76 0.00011 16.7 0.0 1 1 2.1e-06 0.00026 15.5 0.0 21 58 42 79 29 89 0.90 # 30918 # 32171 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 1_27 - 335 HTH_Crp_2 PF13545.1 76 0.0015 13.1 0.0 1 1 4.5e-05 0.0055 11.3 0.0 29 51 174 196 165 202 0.88 # 29917 # 30921 # -1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.412 4_34 - 107 HTH_Crp_2 PF13545.1 76 0.0017 12.9 0.1 1 1 2.8e-05 0.0034 11.9 0.0 27 51 48 72 30 76 0.87 # 26987 # 27307 # -1 # ID=4_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 1_67 - 95 HTH_Mga PF08280.6 59 0.0045 11.5 0.0 1 1 1.7e-05 0.0063 11.1 0.0 17 37 20 40 18 42 0.89 # 77610 # 77894 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.691 4_28 - 553 DAO PF01266.19 358 2.5e-10 34.5 11.0 1 4 0.00036 0.13 5.8 0.5 1 33 2 37 2 45 0.89 # 22901 # 24559 # -1 # ID=4_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 4_28 - 553 DAO PF01266.19 358 2.5e-10 34.5 11.0 2 4 0.037 14 -0.8 0.1 163 201 73 114 67 118 0.88 # 22901 # 24559 # -1 # ID=4_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 4_28 - 553 DAO PF01266.19 358 2.5e-10 34.5 11.0 3 4 4.5e-07 0.00017 15.3 0.2 5 32 156 183 152 187 0.92 # 22901 # 24559 # -1 # ID=4_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 4_28 - 553 DAO PF01266.19 358 2.5e-10 34.5 11.0 4 4 4.2e-08 1.6e-05 18.7 0.1 149 214 193 259 189 458 0.85 # 22901 # 24559 # -1 # ID=4_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_62 - 689 Seryl_tRNA_N PF02403.17 108 5.2e-05 18.0 1.0 1 1 7.3e-07 0.00013 16.7 1.0 39 99 322 384 303 392 0.86 # 71929 # 73995 # 1 # ID=1_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.669 2_24 - 690 Seryl_tRNA_N PF02403.17 108 0.00017 16.3 1.6 1 1 2.3e-06 0.00042 15.1 1.6 42 101 325 386 303 392 0.86 # 22622 # 24691 # 1 # ID=2_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.675 1_31 - 894 AAA_10 PF12846.2 304 4.3e-65 214.8 0.1 1 1 2.1e-66 6.4e-65 214.3 0.1 1 303 456 812 456 813 0.95 # 34576 # 37257 # -1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.422 1_89 - 817 AAA_10 PF12846.2 304 8.8e-36 118.6 0.0 1 1 1e-36 3.1e-35 116.8 0.0 2 297 442 710 442 719 0.92 # 98480 # 100930 # 1 # ID=1_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 2_58 - 817 AAA_10 PF12846.2 304 2.9e-35 116.8 0.0 1 1 3.7e-36 1.1e-34 114.9 0.0 2 298 442 711 442 719 0.90 # 49249 # 51699 # 1 # ID=2_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 3_7 - 695 AAA_10 PF12846.2 304 1.1e-16 55.8 0.0 1 1 9.2e-18 2.8e-16 54.5 0.0 2 300 199 582 198 586 0.76 # 4674 # 6758 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 1_84 - 672 AAA_10 PF12846.2 304 1.8e-07 25.6 0.0 1 1 4.4e-08 1.3e-06 22.7 0.0 193 300 373 484 144 488 0.68 # 94279 # 96294 # 1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.631 2_53 - 666 AAA_10 PF12846.2 304 5.1e-07 24.1 0.0 1 1 1.5e-07 4.7e-06 20.9 0.0 203 300 379 480 353 484 0.86 # 45050 # 47047 # 1 # ID=2_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.639 4_37 - 237 AAA_10 PF12846.2 304 1.3e-06 22.7 0.2 1 2 4.3e-05 0.0013 12.9 0.1 6 21 40 55 37 76 0.85 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 4_37 - 237 AAA_10 PF12846.2 304 1.3e-06 22.7 0.2 2 2 0.0012 0.037 8.2 0.0 218 267 163 212 107 222 0.79 # 29392 # 30102 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 1_86 - 356 AAA_10 PF12846.2 304 1.7e-05 19.1 0.0 1 1 8.8e-07 2.7e-05 18.4 0.0 2 36 157 192 156 206 0.92 # 96752 # 97819 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 1_69 - 213 AAA_10 PF12846.2 304 8.7e-05 16.8 0.0 1 1 4.5e-06 0.00014 16.1 0.0 11 47 11 49 9 66 0.92 # 79029 # 79667 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.698 2_55 - 357 AAA_10 PF12846.2 304 0.0002 15.6 0.0 1 1 1e-05 0.00031 15.0 0.0 2 36 158 193 157 217 0.92 # 47517 # 48587 # 1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.688 2_33 - 213 AAA_10 PF12846.2 304 0.00039 14.6 0.0 1 1 1.9e-05 0.00057 14.1 0.0 11 47 11 49 9 86 0.92 # 29916 # 30554 # 1 # ID=2_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.695 1_10 - 603 AAA_10 PF12846.2 304 0.00087 13.5 0.0 1 1 9.5e-05 0.0029 11.8 0.0 1 22 16 37 16 47 0.84 # 8938 # 10746 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 4_29 - 117 HTH_20 PF12840.2 61 1e-08 29.7 1.0 1 1 7.9e-11 1.5e-08 29.2 1.0 2 60 22 79 17 80 0.92 # 24720 # 25070 # 1 # ID=4_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 3_30 - 156 HTH_20 PF12840.2 61 0.00022 15.8 0.4 1 2 4.3e-05 0.008 10.8 0.0 19 50 17 48 7 49 0.91 # 32053 # 32520 # -1 # ID=3_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.494 3_30 - 156 HTH_20 PF12840.2 61 0.00022 15.8 0.4 2 2 0.018 3.3 2.4 0.1 7 20 108 121 103 142 0.72 # 32053 # 32520 # -1 # ID=3_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.494 1_86 - 356 Dynamin_N PF00350.18 168 0.00092 13.8 0.0 1 1 7.7e-06 0.0014 13.2 0.0 1 21 159 179 159 201 0.89 # 96752 # 97819 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 2_55 - 357 Dynamin_N PF00350.18 168 0.0046 11.5 0.0 1 1 3.7e-05 0.0068 11.0 0.0 1 21 160 180 160 202 0.89 # 47517 # 48587 # 1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.688 1_122 - 204 RrnaAD PF00398.15 262 1.1e-05 19.3 0.0 1 1 1.6e-07 2.9e-05 17.9 0.0 47 92 97 143 78 165 0.84 # 124457 # 125068 # 1 # ID=1_122;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 1_121 - 212 RrnaAD PF00398.15 262 0.00031 14.6 0.0 1 1 2.5e-06 0.00047 14.0 0.0 52 92 104 144 83 168 0.85 # 123760 # 124395 # 1 # ID=1_121;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_122 - 204 Methyltransf_18 PF12847.2 112 0.00037 15.8 0.0 1 1 2.1e-06 0.00078 14.8 0.0 6 83 84 156 79 187 0.70 # 124457 # 125068 # 1 # ID=1_122;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 1_115 - 156 DnaJ_CXXCXGXG PF00684.14 66 2.7e-06 22.1 20.1 1 2 1.6e-06 0.0003 15.6 6.5 39 66 30 59 9 59 0.71 # 119968 # 120435 # 1 # ID=1_115;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.464 1_115 - 156 DnaJ_CXXCXGXG PF00684.14 66 2.7e-06 22.1 20.1 2 2 1.5e-07 2.7e-05 18.9 5.6 1 33 35 67 35 75 0.86 # 119968 # 120435 # 1 # ID=1_115;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.464 1_45 - 240 DnaJ_CXXCXGXG PF00684.14 66 2.7e-05 18.9 1.2 1 1 2.4e-07 4.4e-05 18.3 1.2 35 66 27 57 19 57 0.87 # 48388 # 49107 # 1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.428 1_10 - 603 UvrD_C PF13361.1 351 1e-42 141.6 0.0 1 1 3.9e-44 4.8e-42 139.3 0.0 2 348 254 564 253 567 0.90 # 8938 # 10746 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 2_5 - 680 UvrD_C PF13361.1 351 1e-22 75.8 0.0 1 2 0.0027 0.33 5.0 0.0 74 118 332 377 289 388 0.79 # 3366 # 5405 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 2_5 - 680 UvrD_C PF13361.1 351 1e-22 75.8 0.0 2 2 3e-22 3.6e-20 67.4 0.0 290 347 538 607 519 611 0.91 # 3366 # 5405 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_56 - 600 UvrD_C PF13361.1 351 5.9e-12 40.4 0.0 1 2 0.0004 0.049 7.8 0.0 2 97 273 361 272 373 0.77 # 64630 # 66429 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 1_56 - 600 UvrD_C PF13361.1 351 5.9e-12 40.4 0.0 2 2 5e-11 6.1e-09 30.5 0.0 283 347 507 568 476 571 0.90 # 64630 # 66429 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 2_22 - 819 AAA_13 PF13166.1 712 3.5e-178 589.0 27.6 1 1 3.2e-180 4e-178 588.8 27.6 2 712 62 799 61 799 0.91 # 18865 # 21321 # -1 # ID=2_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_138 - 513 AAA_13 PF13166.1 712 0.0012 12.0 1.1 1 2 3.8e-05 0.0047 10.1 0.2 361 441 5 85 2 102 0.89 # 135999 # 137537 # 1 # ID=1_138;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.603 1_138 - 513 AAA_13 PF13166.1 712 0.0012 12.0 1.1 2 2 0.035 4.3 0.3 0.1 427 469 374 416 348 423 0.77 # 135999 # 137537 # 1 # ID=1_138;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.603 4_12 - 407 AAA_13 PF13166.1 712 0.061 6.4 37.6 1 2 0.00018 0.022 7.9 30.0 291 468 144 314 81 330 0.44 # 8119 # 9339 # -1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 4_12 - 407 AAA_13 PF13166.1 712 0.061 6.4 37.6 2 2 0.021 2.6 1.0 2.4 406 454 339 384 315 389 0.55 # 8119 # 9339 # -1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 2_33 - 213 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.5e-07 25.4 0.0 1 1 1.8e-09 2.2e-07 24.9 0.0 3 42 3 42 1 59 0.89 # 29916 # 30554 # 1 # ID=2_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.695 1_69 - 213 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.7e-07 25.3 0.0 1 1 2e-09 2.5e-07 24.7 0.0 6 42 6 42 1 60 0.88 # 79029 # 79667 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.698 1_28 - 418 ArsA_ATPase PF02374.10 305 2.3e-06 21.6 0.4 1 1 2e-07 2.5e-05 18.2 0.1 8 72 122 190 115 274 0.58 # 30918 # 32171 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 1_69 - 213 AAA_31 PF13614.1 157 6.7e-10 33.9 0.0 1 2 1.8e-09 2.2e-07 25.7 0.0 2 46 2 46 1 70 0.84 # 79029 # 79667 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.698 1_69 - 213 AAA_31 PF13614.1 157 6.7e-10 33.9 0.0 2 2 0.0014 0.18 6.5 0.0 114 154 76 115 64 118 0.88 # 79029 # 79667 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.698 2_33 - 213 AAA_31 PF13614.1 157 9.8e-10 33.3 0.0 1 2 2.6e-09 3.2e-07 25.2 0.0 2 45 2 45 1 63 0.84 # 29916 # 30554 # 1 # ID=2_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.695 2_33 - 213 AAA_31 PF13614.1 157 9.8e-10 33.3 0.0 2 2 0.0016 0.2 6.3 0.0 114 153 76 114 64 118 0.88 # 29916 # 30554 # 1 # ID=2_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.695 1_28 - 418 AAA_31 PF13614.1 157 7.2e-06 20.8 0.1 1 2 2e-05 0.0024 12.6 0.0 9 127 123 269 121 289 0.82 # 30918 # 32171 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 1_28 - 418 AAA_31 PF13614.1 157 7.2e-06 20.8 0.1 2 2 0.0064 0.79 4.4 0.1 14 116 299 408 284 411 0.82 # 30918 # 32171 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 1_86 - 356 SRPRB PF09439.5 181 0.0017 12.3 0.0 1 1 6.7e-06 0.0025 11.8 0.0 3 26 156 179 154 204 0.79 # 96752 # 97819 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 1_146 - 370 ADH_zinc_N PF00107.21 130 1e-21 71.6 0.1 1 1 4.4e-24 1.6e-21 70.9 0.1 1 128 197 330 197 332 0.86 # 143840 # 144949 # -1 # ID=1_146;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 2_55 - 357 IstB_IS21 PF01695.12 178 1.1e-05 19.6 0.0 1 1 8.8e-08 1.6e-05 19.1 0.0 44 80 154 190 139 220 0.86 # 47517 # 48587 # 1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.688 1_86 - 356 IstB_IS21 PF01695.12 178 8.1e-05 16.8 0.0 1 1 6.9e-07 0.00013 16.2 0.0 44 80 153 189 140 217 0.88 # 96752 # 97819 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 1_123 - 423 FaeA PF04703.7 62 1.5e-05 19.9 0.2 1 1 9.8e-08 3.6e-05 18.6 0.2 30 54 58 82 53 86 0.92 # 125055 # 126323 # 1 # ID=1_123;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.565 1_56 - 600 AAA_11 PF13086.1 236 2.5e-06 21.9 0.0 1 2 3.9e-06 0.00072 13.9 0.0 5 75 12 74 7 85 0.77 # 64630 # 66429 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 1_56 - 600 AAA_11 PF13086.1 236 2.5e-06 21.9 0.0 2 2 0.0017 0.31 5.3 0.0 191 228 203 245 191 246 0.79 # 64630 # 66429 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 2_5 - 680 AAA_11 PF13086.1 236 0.0005 14.4 0.2 1 1 1.2e-05 0.0021 12.3 0.0 17 75 17 70 4 169 0.77 # 3366 # 5405 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_8 - 126 SSB PF00436.20 104 0.0017 13.0 0.0 1 2 2.8e-05 0.01 10.5 0.0 2 82 8 86 7 94 0.79 # 7253 # 7630 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_8 - 126 SSB PF00436.20 104 0.0017 13.0 0.0 2 2 0.028 10 0.8 0.0 42 60 91 109 85 112 0.84 # 7253 # 7630 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_146 - 370 ADH_zinc_N_2 PF13602.1 127 6.8e-05 18.5 0.0 1 1 4.4e-07 0.00016 17.3 0.0 2 121 231 362 230 363 0.63 # 143840 # 144949 # -1 # ID=1_146;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 1_49 - 559 MetW PF07021.7 193 2.1e-05 18.7 0.0 1 1 1.1e-07 4e-05 17.8 0.0 13 91 420 496 409 507 0.85 # 52814 # 54490 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 4_28 - 553 Lycopene_cycl PF05834.7 374 0.00025 14.7 2.5 1 3 0.00072 0.26 4.8 0.2 2 40 3 41 2 42 0.90 # 22901 # 24559 # -1 # ID=4_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 4_28 - 553 Lycopene_cycl PF05834.7 374 0.00025 14.7 2.5 2 3 0.00087 0.32 4.5 0.1 4 38 155 187 153 191 0.92 # 22901 # 24559 # -1 # ID=4_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 4_28 - 553 Lycopene_cycl PF05834.7 374 0.00025 14.7 2.5 3 3 0.0013 0.49 3.9 0.0 90 149 194 254 189 263 0.80 # 22901 # 24559 # -1 # ID=4_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 4_19 - 186 Phage_AlpA PF05930.7 51 0.0033 11.9 0.0 1 1 1.7e-05 0.0063 11.0 0.0 6 25 161 180 156 183 0.85 # 16155 # 16712 # 1 # ID=4_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.450 1_86 - 356 GTP_EFTU PF00009.22 188 0.0028 11.8 0.0 1 1 2.3e-05 0.0043 11.2 0.0 4 30 157 183 154 200 0.85 # 96752 # 97819 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 2_55 - 357 GTP_EFTU PF00009.22 188 0.0041 11.3 0.0 1 1 3.4e-05 0.0062 10.7 0.0 4 30 158 184 155 203 0.85 # 47517 # 48587 # 1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.688 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/a159df59-90b4-4e9c-899d-8d2de1924fbe # Target file: checkm_output/bins/pm1413/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm1413/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/a159df59-90b4-4e9c-899d-8d2de1924fbe checkm_output/bins/pm1413/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 09:42:35 2017 # [ok]