# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 2_11 - 226 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 8.4e-06 18.7 0.0 1 2 0.00019 0.028 7.2 0.0 112 167 18 75 2 82 0.67 # 5801 # 6478 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.583 2_11 - 226 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 8.4e-06 18.7 0.0 2 2 3.6e-05 0.0054 9.6 0.0 41 63 162 184 145 216 0.76 # 5801 # 6478 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.583 1_52 - 584 KaiC PF06745.8 227 0.00038 13.0 0.3 1 2 0.00063 0.093 5.2 0.0 24 60 13 48 8 114 0.77 # 46642 # 48393 # -1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.514 1_52 - 584 KaiC PF06745.8 227 0.00038 13.0 0.3 2 2 0.00069 0.1 5.1 0.2 21 57 329 364 322 493 0.71 # 46642 # 48393 # -1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.514 1_64 - 562 K_oxygenase PF13434.1 341 3.9e-06 19.4 0.2 1 3 0.0041 0.6 2.3 0.2 187 223 95 129 86 132 0.74 # 57220 # 58905 # -1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_64 - 562 K_oxygenase PF13434.1 341 3.9e-06 19.4 0.2 2 3 3.1e-06 0.00046 12.6 0.0 130 231 217 309 198 320 0.80 # 57220 # 58905 # -1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_64 - 562 K_oxygenase PF13434.1 341 3.9e-06 19.4 0.2 3 3 0.02 3 0.0 0.0 138 160 343 366 311 376 0.63 # 57220 # 58905 # -1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_48 - 191 HTH_IclR PF09339.5 52 1.7e-06 21.1 0.2 1 1 4.2e-08 6.2e-06 19.3 0.1 12 40 152 180 150 181 0.92 # 43850 # 44422 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.522 2_37 - 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511 SbcCD_C PF13558.1 90 0.00066 13.1 0.1 2 2 0.0023 0.17 5.4 0.0 31 88 398 442 372 444 0.70 # 70605 # 72137 # 1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.584 1_39 - 764 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 6.8e-13 41.4 0.0 1 1 1.2e-13 1.8e-11 36.6 0.0 141 390 291 524 247 541 0.74 # 29486 # 31777 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.523 1_52 - 584 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00051 13.7 0.2 1 2 0.019 2.8 1.7 0.0 2 18 12 28 11 50 0.80 # 46642 # 48393 # -1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.514 1_52 - 584 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00051 13.7 0.2 2 2 8.6e-05 0.013 9.2 0.0 1 25 330 354 330 378 0.86 # 46642 # 48393 # -1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.514 1_52 - 584 Gtr1_RagA PF04670.7 232 0.00059 12.5 0.4 1 2 0.018 2.7 0.5 0.1 2 16 11 25 10 27 0.87 # 46642 # 48393 # -1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.514 1_52 - 584 Gtr1_RagA PF04670.7 232 0.00059 12.5 0.4 2 2 5.5e-05 0.0081 8.7 0.1 2 19 330 347 329 376 0.89 # 46642 # 48393 # -1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.514 1_52 - 584 APS_kinase PF01583.15 157 9e-07 22.1 0.2 1 2 1.9e-05 0.0028 10.8 0.0 4 37 10 43 7 52 0.89 # 46642 # 48393 # -1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.514 1_52 - 584 APS_kinase PF01583.15 157 9e-07 22.1 0.2 2 2 7.3e-05 0.011 8.9 0.1 5 37 330 362 327 387 0.85 # 46642 # 48393 # -1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.514 1_52 - 584 NTPase_1 PF03266.10 168 1.7e-05 18.0 1.6 1 3 0.0016 0.24 4.6 0.1 2 29 11 38 10 52 0.82 # 46642 # 48393 # -1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.514 1_52 - 584 NTPase_1 PF03266.10 168 1.7e-05 18.0 1.6 2 3 0.052 7.7 -0.4 0.0 107 148 179 219 174 248 0.69 # 46642 # 48393 # -1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.514 1_52 - 584 NTPase_1 PF03266.10 168 1.7e-05 18.0 1.6 3 3 2.2e-05 0.0032 10.6 0.1 2 30 330 358 329 362 0.92 # 46642 # 48393 # -1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.514 1_64 - 562 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 1.6e-06 21.3 2.4 1 2 3.9e-06 0.00058 12.9 0.3 16 50 94 128 80 131 0.87 # 57220 # 58905 # -1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_64 - 562 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 1.6e-06 21.3 2.4 2 2 0.00014 0.021 7.8 0.1 19 60 269 310 260 341 0.84 # 57220 # 58905 # -1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 2_19 - 478 DNA_methylase PF00145.12 335 4e-79 259.5 0.0 1 1 5.5e-81 8.1e-79 258.5 0.0 1 331 96 457 96 460 0.86 # 12923 # 14356 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.480 2_39 - 282 TfoX_C PF04994.8 81 0.00075 12.9 0.1 1 1 3.1e-05 0.0046 10.4 0.0 16 36 95 115 89 120 0.89 # 36695 # 37540 # 1 # ID=2_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 1_52 - 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