# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 4_4 - 492 ATP-synt_ab PF00006.20 215 1.7e-05 17.0 0.1 1 2 0.044 3.6 -0.4 0.0 17 34 32 49 28 55 0.88 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 ATP-synt_ab PF00006.20 215 1.7e-05 17.0 0.1 2 2 1.5e-06 0.00012 14.2 0.1 7 66 314 380 307 402 0.80 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 7_1 - 106 HTH_IclR PF09339.5 52 3.6e-06 19.2 0.4 1 2 0.1 4.1 -0.2 0.1 7 18 29 40 27 58 0.70 # 202 # 519 # -1 # ID=7_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 7_1 - 106 HTH_IclR PF09339.5 52 3.6e-06 19.2 0.4 2 2 3.6e-07 1.5e-05 17.2 0.0 15 40 75 100 71 101 0.86 # 202 # 519 # -1 # ID=7_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 1_43 - 342 HTH_IclR PF09339.5 52 1.6e-05 17.1 0.1 1 1 1e-06 4.1e-05 15.8 0.1 15 40 14 39 10 40 0.86 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 4_4 - 492 ABC_tran PF00005.22 137 2.7e-31 101.3 8.0 1 4 1.1e-09 4.6e-08 26.1 0.1 5 37 24 56 20 66 0.85 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 ABC_tran PF00005.22 137 2.7e-31 101.3 8.0 2 4 2.1e-07 8.6e-06 18.7 0.0 101 137 94 128 73 128 0.79 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 ABC_tran PF00005.22 137 2.7e-31 101.3 8.0 3 4 0.082 3.3 0.6 0.5 51 102 203 255 163 276 0.46 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 ABC_tran PF00005.22 137 2.7e-31 101.3 8.0 4 4 6.3e-19 2.6e-17 56.0 0.1 2 136 313 436 312 437 0.81 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 1_42 - 260 ABC_tran PF00005.22 137 0.00043 13.2 0.2 1 1 4.1e-05 0.0017 11.3 0.1 8 31 98 121 95 132 0.86 # 33962 # 34741 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_43 - 342 HTH_22 PF13309.1 64 7.4e-05 15.2 0.0 1 1 3.6e-06 0.00015 14.2 0.0 44 64 19 39 16 39 0.94 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 7_1 - 106 HTH_22 PF13309.1 64 0.00013 14.3 0.6 1 1 9.2e-06 0.00038 12.9 0.2 32 63 73 99 63 100 0.76 # 202 # 519 # -1 # ID=7_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 4_4 - 492 DUF815 PF05673.8 250 2.1e-05 16.2 0.2 1 2 0.00013 0.01 7.3 0.0 58 77 35 54 27 63 0.85 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 DUF815 PF05673.8 250 2.1e-05 16.2 0.2 2 2 0.00031 0.026 6.0 0.0 55 76 324 345 315 351 0.85 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_1 - 104 DUF134 PF02001.11 106 2.9e-05 16.6 0.8 1 2 6.7e-07 5.5e-05 15.7 0.1 47 82 15 50 4 58 0.85 # 202 # 513 # 1 # ID=4_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.506 4_1 - 104 DUF134 PF02001.11 106 2.9e-05 16.6 0.8 2 2 0.071 5.9 -0.5 0.1 21 35 58 72 47 95 0.53 # 202 # 513 # 1 # ID=4_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.506 4_2 - 204 rve_3 PF13683.1 67 9.4e-18 56.2 0.1 1 1 3.7e-19 1.5e-17 55.6 0.1 2 67 119 185 118 185 0.98 # 768 # 1379 # 1 # ID=4_2;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 1_43 - 342 rve_3 PF13683.1 67 4.7e-09 28.4 0.0 1 1 2.4e-10 9.9e-09 27.3 0.0 2 66 216 288 215 288 0.93 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_43 - 342 HTH_DeoR PF08220.7 57 0.00035 12.8 1.2 1 1 1e-05 0.00085 11.5 0.5 9 34 13 37 4 40 0.82 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 7_1 - 106 HTH_40 PF14493.1 91 0.00015 14.6 0.6 1 2 0.044 3.6 0.6 0.0 49 74 33 59 23 70 0.69 # 202 # 519 # -1 # ID=7_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 7_1 - 106 HTH_40 PF14493.1 91 0.00015 14.6 0.6 2 2 7.8e-06 0.00064 12.6 0.1 7 33 72 98 66 103 0.89 # 202 # 519 # -1 # ID=7_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 1_43 - 342 HTH_38 PF13936.1 44 3.5e-11 35.2 0.8 1 1 1.8e-12 7.5e-11 34.1 0.8 5 42 2 39 1 40 0.97 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 7_1 - 106 HTH_38 PF13936.1 44 7.9e-07 21.3 1.4 1 1 4.3e-08 1.8e-06 20.1 0.0 9 41 67 99 65 102 0.93 # 202 # 519 # -1 # ID=7_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 3_6 - 221 MobB PF03205.9 140 1e-05 17.9 0.3 1 2 4e-05 0.0017 10.7 0.1 2 37 4 40 3 47 0.85 # 3269 # 3931 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 3_6 - 221 MobB PF03205.9 140 1e-05 17.9 0.3 2 2 0.0022 0.088 5.1 0.0 44 76 85 120 73 133 0.81 # 3269 # 3931 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 4_4 - 492 MobB PF03205.9 140 4e-05 16.0 0.4 1 2 0.0031 0.13 4.7 0.0 2 20 32 50 31 61 0.86 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 MobB PF03205.9 140 4e-05 16.0 0.4 2 2 0.00015 0.0062 8.9 0.1 3 23 325 345 323 353 0.87 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 DUF3584 PF12128.3 1201 0.0059 6.5 13.2 1 3 0.002 0.16 1.7 0.0 13 36 26 49 22 50 0.84 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 DUF3584 PF12128.3 1201 0.0059 6.5 13.2 2 3 0.0047 0.38 0.5 7.1 629 703 191 268 173 301 0.38 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 DUF3584 PF12128.3 1201 0.0059 6.5 13.2 3 3 8.7e-05 0.0071 6.2 0.3 19 37 324 342 318 343 0.88 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 1_43 - 342 HTH_8 PF02954.14 42 1.5e-05 17.1 0.6 1 1 3.3e-07 2.7e-05 16.3 0.1 12 37 11 36 5 40 0.91 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 4_4 - 492 AAA_19 PF13245.1 76 0.00014 14.3 0.1 1 1 1.5e-05 0.0006 12.2 0.0 10 48 323 360 317 370 0.75 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 1_42 - 260 AAA_19 PF13245.1 76 0.00055 12.3 0.2 1 1 5.3e-05 0.0022 10.5 0.0 11 35 103 126 95 157 0.81 # 33962 # 34741 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 3_6 - 221 CbiA PF01656.18 195 3.8e-17 54.9 0.2 1 1 1.8e-18 7.6e-17 53.9 0.2 2 174 6 161 5 182 0.74 # 3269 # 3931 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 1_42 - 260 CbiA PF01656.18 195 0.00079 11.5 0.0 1 1 2.5e-05 0.001 11.1 0.0 3 42 105 145 104 254 0.75 # 33962 # 34741 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 4_4 - 492 PRK PF00485.13 194 0.00024 13.3 0.2 1 2 0.0023 0.19 3.8 0.0 2 21 33 52 32 85 0.83 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 PRK PF00485.13 194 0.00024 13.3 0.2 2 2 0.00027 0.022 6.9 0.0 2 33 325 364 325 409 0.75 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 1_43 - 342 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 1.4e-06 20.3 0.6 1 2 1.8e-07 7.2e-06 18.1 0.0 25 48 16 39 5 40 0.92 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_43 - 342 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 1.4e-06 20.3 0.6 2 2 0.087 3.6 -0.1 0.1 3 18 95 110 93 110 0.88 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 4_1 - 104 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 2.9e-06 19.4 1.0 1 1 1e-07 4.3e-06 18.8 0.1 24 50 23 49 19 52 0.88 # 202 # 513 # 1 # ID=4_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.506 3_1 - 302 Rep_3 PF01051.16 222 9.9e-34 109.4 5.1 1 1 1.5e-35 1.2e-33 109.1 5.1 1 222 11 263 11 263 0.86 # 1 # 906 # 1 # ID=3_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.343 4_2 - 204 rve PF00665.21 120 7.3e-33 105.9 0.0 1 1 3.5e-34 9.6e-33 105.5 0.0 2 120 31 147 30 147 0.98 # 768 # 1379 # 1 # ID=4_2;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 1_43 - 342 rve PF00665.21 120 4.3e-23 74.4 0.0 1 1 5.8e-24 1.6e-22 72.5 0.0 3 119 118 243 117 244 0.96 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 8_1 - 172 rve PF00665.21 120 1.4e-11 37.2 0.0 1 2 0.026 0.71 2.7 0.0 78 102 31 53 8 58 0.83 # 2 # 517 # -1 # ID=8_1;partial=11;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.552 8_1 - 172 rve PF00665.21 120 1.4e-11 37.2 0.0 2 2 1.5e-11 4.2e-10 32.4 0.0 9 89 79 155 74 162 0.85 # 2 # 517 # -1 # ID=8_1;partial=11;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.552 1_42 - 260 AFG1_ATPase PF03969.11 362 0.00025 12.5 0.0 1 1 5.8e-06 0.00048 11.6 0.0 64 214 103 251 81 258 0.78 # 33962 # 34741 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 4_4 - 492 AAA_23 PF13476.1 202 4.1e-08 26.4 8.6 1 3 3.8e-05 0.0031 10.4 0.0 24 38 35 49 25 57 0.91 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 AAA_23 PF13476.1 202 4.1e-08 26.4 8.6 2 3 0.0033 0.27 4.1 1.4 141 177 187 244 105 280 0.58 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 AAA_23 PF13476.1 202 4.1e-08 26.4 8.6 3 3 1.9e-06 0.00016 14.7 0.4 22 39 325 342 288 343 0.76 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 AAA_24 PF13479.1 213 3.1e-05 16.2 3.2 1 2 0.0014 0.055 5.6 0.0 8 38 35 64 30 111 0.76 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 AAA_24 PF13479.1 213 3.1e-05 16.2 3.2 2 2 4.3e-05 0.0018 10.5 0.1 4 23 323 342 321 356 0.86 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 1_42 - 260 AAA_24 PF13479.1 213 0.0011 11.2 0.1 1 1 6.1e-05 0.0025 10.0 0.1 5 23 103 121 99 127 0.85 # 33962 # 34741 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 4_4 - 492 Zeta_toxin PF06414.7 201 4.2e-05 15.3 1.5 1 2 0.00049 0.02 6.6 0.0 21 40 35 54 30 63 0.87 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 Zeta_toxin PF06414.7 201 4.2e-05 15.3 1.5 2 2 0.00035 0.014 7.0 0.0 20 40 326 346 309 353 0.83 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 1_21 - 348 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0003 12.5 0.0 1 1 1.3e-05 0.00053 11.7 0.0 18 60 170 213 158 239 0.76 # 15937 # 16980 # 1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.431 4_4 - 492 AAA_30 PF13604.1 196 2.6e-05 16.5 1.7 1 2 0.0022 0.18 4.0 0.0 18 39 31 51 25 61 0.81 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 AAA_30 PF13604.1 196 2.6e-05 16.5 1.7 2 2 2.4e-05 0.0019 10.4 0.0 21 133 325 467 321 469 0.59 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 SMC_N PF02463.14 220 1.8e-10 33.0 6.8 1 4 0.00018 0.015 7.1 0.0 29 43 35 49 25 65 0.86 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 SMC_N PF02463.14 220 1.8e-10 33.0 6.8 2 4 0.00018 0.015 7.2 0.0 116 203 79 160 70 173 0.81 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 SMC_N PF02463.14 220 1.8e-10 33.0 6.8 3 4 0.00011 0.0091 7.8 0.1 27 44 325 342 311 344 0.80 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 SMC_N PF02463.14 220 1.8e-10 33.0 6.8 4 4 7.9e-06 0.00064 11.6 0.2 117 211 382 478 359 485 0.81 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 2_11 - 425 DDE_Tnp_2 PF04693.7 327 0.00014 13.6 0.2 1 1 3.1e-06 0.00025 12.7 0.2 251 319 277 349 256 356 0.70 # 6498 # 7772 # 1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.503 4_1 - 104 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 1.2e-15 49.9 0.8 1 1 5.5e-17 1.5e-15 49.6 0.8 3 76 5 79 3 79 0.92 # 202 # 513 # 1 # ID=4_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.506 1_43 - 342 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 6.6e-05 15.5 0.2 1 2 8.1e-05 0.0022 10.6 0.0 22 46 16 40 8 68 0.81 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_43 - 342 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 6.6e-05 15.5 0.2 2 2 0.033 0.91 2.2 0.0 35 58 284 311 275 330 0.73 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 8_1 - 172 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.00012 14.6 0.5 1 1 1e-05 0.00028 13.5 0.5 4 51 10 62 8 68 0.79 # 2 # 517 # -1 # ID=8_1;partial=11;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.552 1_43 - 342 GerE PF00196.14 58 0.00028 12.9 0.0 1 1 1.2e-05 0.00051 12.0 0.0 16 40 15 39 4 40 0.87 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 7_1 - 106 GerE PF00196.14 58 0.00031 12.7 0.1 1 1 1.4e-05 0.00058 11.8 0.1 11 35 71 95 69 98 0.93 # 202 # 519 # -1 # ID=7_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 1_22 - 612 TraG-D_C PF12696.2 128 2.8e-28 91.0 0.0 1 1 6.2e-30 5.1e-28 90.2 0.0 2 126 416 533 415 535 0.87 # 16983 # 18818 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.419 8_1 - 172 DDE_3 PF13358.1 146 0.00028 13.3 0.0 1 2 0.069 5.7 -0.7 0.0 44 79 29 65 15 81 0.73 # 2 # 517 # -1 # ID=8_1;partial=11;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.552 8_1 - 172 DDE_3 PF13358.1 146 0.00028 13.3 0.0 2 2 1e-05 0.00085 11.7 0.0 32 90 86 145 63 152 0.87 # 2 # 517 # -1 # ID=8_1;partial=11;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.552 1_42 - 260 Bac_DnaA PF00308.13 219 4.2e-09 28.9 0.0 1 1 7.8e-11 6.4e-09 28.4 0.0 36 136 103 201 90 209 0.84 # 33962 # 34741 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 3_6 - 221 MipZ PF09140.6 261 9.1e-12 37.1 0.5 1 3 1.2e-06 9.6e-05 14.1 0.0 2 41 4 43 3 57 0.86 # 3269 # 3931 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 3_6 - 221 MipZ PF09140.6 261 9.1e-12 37.1 0.5 2 3 1.2e-08 1e-06 20.6 0.0 87 131 68 112 59 136 0.86 # 3269 # 3931 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 3_6 - 221 MipZ PF09140.6 261 9.1e-12 37.1 0.5 3 3 0.084 6.9 -1.8 0.0 30 48 153 171 132 201 0.71 # 3269 # 3931 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 2_11 - 425 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 1.5e-24 79.3 0.0 1 1 5.7e-26 2.3e-24 78.7 0.0 3 212 117 343 115 344 0.93 # 6498 # 7772 # 1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.503 1_39 - 440 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 3.3e-19 61.9 0.0 1 2 0.037 1.5 0.9 0.0 6 41 138 172 135 227 0.77 # 31125 # 32444 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.615 1_39 - 440 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 3.3e-19 61.9 0.0 2 2 7.3e-20 3e-18 58.7 0.0 6 213 264 433 259 433 0.85 # 31125 # 32444 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.615 2_11 - 425 DDE_Tnp_1_2 PF13586.1 88 0.00073 12.4 3.4 1 1 1.1e-05 0.00088 12.1 1.5 15 85 274 342 264 345 0.74 # 6498 # 7772 # 1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.503 4_4 - 492 AAA_21 PF13304.1 303 1.6e-18 60.3 5.1 1 4 3.9e-07 3.2e-05 16.6 0.6 3 21 34 52 33 85 0.87 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 AAA_21 PF13304.1 303 1.6e-18 60.3 5.1 2 4 0.00027 0.022 7.2 0.0 237 303 100 160 91 160 0.84 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 AAA_21 PF13304.1 303 1.6e-18 60.3 5.1 3 4 4.9e-07 4e-05 16.2 0.0 3 43 326 361 325 384 0.76 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 AAA_21 PF13304.1 303 1.6e-18 60.3 5.1 4 4 6.8e-08 5.6e-06 19.1 0.0 233 301 405 467 386 469 0.89 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 1_43 - 342 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.00025 13.0 0.6 1 1 7.7e-06 0.00064 11.7 0.6 18 40 15 37 3 40 0.82 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_42 - 260 AAA PF00004.24 132 1.7e-08 27.3 0.0 1 1 8.2e-10 3.4e-08 26.4 0.0 1 70 104 175 104 207 0.82 # 33962 # 34741 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 4_4 - 492 AAA PF00004.24 132 3.3e-05 16.7 0.1 1 2 0.011 0.47 3.3 0.0 3 22 35 54 33 124 0.77 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 AAA PF00004.24 132 3.3e-05 16.7 0.1 2 2 6.4e-05 0.0026 10.6 0.0 3 23 327 347 325 437 0.75 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 1_30 - 774 zf-C4_Topoisom PF01396.14 39 8.3e-11 33.9 16.0 1 3 0.024 2 0.7 0.0 9 22 560 574 558 575 0.87 # 21875 # 24196 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.476 1_30 - 774 zf-C4_Topoisom PF01396.14 39 8.3e-11 33.9 16.0 2 3 4.3e-11 3.5e-09 28.7 7.3 4 37 636 670 633 672 0.92 # 21875 # 24196 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.476 1_30 - 774 zf-C4_Topoisom PF01396.14 39 8.3e-11 33.9 16.0 3 3 0.00022 0.018 7.2 1.6 3 21 691 707 689 718 0.78 # 21875 # 24196 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.476 4_2 - 204 rve_2 PF13333.1 52 2.3e-11 36.3 0.0 1 1 5.4e-13 4.4e-11 35.4 0.0 1 46 137 187 137 190 0.90 # 768 # 1379 # 1 # ID=4_2;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 1_29 - 132 tRNA-synt_1 PF00133.17 601 0.00031 11.4 0.1 1 1 4.1e-06 0.00034 11.3 0.1 462 492 80 110 28 122 0.79 # 21470 # 21865 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.346 4_4 - 492 cobW PF02492.14 178 0.00022 13.3 1.3 1 2 0.0051 0.42 2.6 0.0 3 19 33 49 31 59 0.87 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 cobW PF02492.14 178 0.00022 13.3 1.3 2 2 6.1e-05 0.005 8.9 0.3 3 28 325 349 323 352 0.80 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 AAA_16 PF13191.1 185 7.9e-06 18.6 0.1 1 2 0.00079 0.032 6.8 0.0 29 44 35 50 22 151 0.89 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 AAA_16 PF13191.1 185 7.9e-06 18.6 0.1 2 2 0.00014 0.0059 9.2 0.0 27 49 325 347 320 410 0.84 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 1_42 - 260 AAA_16 PF13191.1 185 1.2e-05 18.0 2.4 1 2 2.4e-06 9.8e-05 15.0 0.1 23 51 100 128 86 149 0.80 # 33962 # 34741 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_42 - 260 AAA_16 PF13191.1 185 1.2e-05 18.0 2.4 2 2 0.071 2.9 0.4 0.0 124 162 143 175 125 192 0.74 # 33962 # 34741 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 4_4 - 492 AAA_22 PF13401.1 131 1.4e-08 27.6 0.8 1 2 0.005 0.21 4.4 0.0 9 25 35 51 30 144 0.78 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 AAA_22 PF13401.1 131 1.4e-08 27.6 0.8 2 2 4.1e-08 1.7e-06 20.9 0.0 7 125 325 464 322 471 0.86 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 1_42 - 260 AAA_22 PF13401.1 131 1e-06 21.6 0.0 1 2 8.3e-06 0.00034 13.4 0.1 4 28 101 125 98 148 0.75 # 33962 # 34741 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_42 - 260 AAA_22 PF13401.1 131 1e-06 21.6 0.0 2 2 0.0016 0.067 6.0 0.0 77 101 151 178 124 201 0.64 # 33962 # 34741 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_42 - 260 TIGR00362 TIGR00362 437 1.9e-10 32.6 0.0 1 1 3.3e-12 2.7e-10 32.1 0.0 140 240 104 202 94 210 0.89 # 33962 # 34741 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_43 - 342 NUMOD1 PF07453.8 37 1.6e-05 17.3 0.1 1 1 1.4e-06 5.6e-05 15.6 0.0 17 37 18 38 15 38 0.95 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 3_7 - 216 NUMOD1 PF07453.8 37 5.4e-05 15.7 0.0 1 1 2.3e-06 9.3e-05 14.9 0.0 6 35 174 203 174 205 0.96 # 4265 # 4912 # 1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.508 4_4 - 492 AAA_29 PF13555.1 62 3.6e-08 25.5 0.5 1 2 9.5e-06 0.00078 11.6 0.0 25 40 32 47 20 52 0.78 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 AAA_29 PF13555.1 62 3.6e-08 25.5 0.5 2 2 1.1e-05 0.0009 11.4 0.1 14 40 314 339 310 343 0.77 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_1 - 104 HTH_1 PF00126.22 60 3.2e-05 16.3 0.2 1 2 3.9e-07 3.2e-05 16.3 0.2 4 40 15 52 14 54 0.89 # 202 # 513 # 1 # ID=4_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.506 4_1 - 104 HTH_1 PF00126.22 60 3.2e-05 16.3 0.2 2 2 0.07 5.7 -0.5 0.4 33 41 69 77 67 83 0.62 # 202 # 513 # 1 # ID=4_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.506 4_1 - 104 LZ_Tnp_IS481 PF13011.1 85 0.00027 13.9 0.5 1 1 4.9e-06 0.00041 13.4 0.5 21 53 21 53 15 85 0.85 # 202 # 513 # 1 # ID=4_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.506 1_43 - 342 HTH_Tnp_Tc3_1 PF11427.3 50 1.2e-06 20.8 0.0 1 1 2.8e-08 2.3e-06 19.9 0.0 13 45 10 42 3 46 0.90 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 7_1 - 106 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 3.3e-05 16.2 0.0 1 1 1.3e-06 5.4e-05 15.5 0.0 8 44 68 104 63 105 0.91 # 202 # 519 # -1 # ID=7_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 1_43 - 342 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 0.00048 12.4 0.0 1 1 3.3e-05 0.0014 11.0 0.0 16 57 15 56 8 76 0.77 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 3_6 - 221 SRP54 PF00448.17 196 0.00027 13.1 0.0 1 1 1.1e-05 0.00086 11.4 0.0 10 94 12 90 3 104 0.70 # 3269 # 3931 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 4_4 - 492 AAA_28 PF13521.1 163 3.2e-05 16.6 4.3 1 2 0.046 1.9 1.0 0.0 2 20 33 51 32 66 0.84 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 AAA_28 PF13521.1 163 3.2e-05 16.6 4.3 2 2 1.1e-06 4.6e-05 16.0 0.1 1 34 324 359 324 391 0.79 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 1_42 - 260 AAA_28 PF13521.1 163 0.00021 13.9 0.0 1 1 1e-05 0.00041 13.0 0.0 1 49 103 156 103 171 0.73 # 33962 # 34741 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 2_11 - 425 DDE_Tnp_1_3 PF13612.1 155 0.00049 12.5 0.1 1 2 7.5e-05 0.0061 8.9 0.0 60 110 165 216 158 232 0.72 # 6498 # 7772 # 1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.503 2_11 - 425 DDE_Tnp_1_3 PF13612.1 155 0.00049 12.5 0.1 2 2 0.024 2 0.8 0.0 126 149 299 322 289 328 0.80 # 6498 # 7772 # 1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.503 8_1 - 172 HTH_32 PF13565.1 77 4e-07 23.5 0.1 1 1 4.4e-08 1.8e-06 21.3 0.0 26 76 9 54 2 55 0.83 # 2 # 517 # -1 # ID=8_1;partial=11;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.552 2_2 - 177 HTH_32 PF13565.1 77 0.00095 12.6 2.6 1 1 4.5e-05 0.0018 11.7 0.7 7 43 118 156 113 174 0.61 # 162 # 692 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.571 1_43 - 342 GntR PF00392.16 64 0.0002 13.5 0.0 1 1 1.2e-05 0.00094 11.3 0.0 26 45 19 38 15 40 0.88 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 2_3 - 99 HTH_3 PF01381.17 55 2.4e-09 29.6 0.0 1 1 1.2e-10 3.1e-09 29.2 0.0 6 55 19 68 15 68 0.93 # 1310 # 1606 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 1_43 - 342 HTH_3 PF01381.17 55 9.6e-05 14.9 0.0 1 1 7.3e-06 0.0002 13.9 0.0 7 32 15 40 9 57 0.83 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_4 - 80 HTH_3 PF01381.17 55 0.00019 13.9 0.0 1 1 1.3e-05 0.00036 13.0 0.0 1 22 10 31 10 36 0.86 # 2757 # 2996 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 4_1 - 104 HTH_23 PF13384.1 50 3.9e-10 31.8 0.0 1 1 1.3e-10 2.1e-09 29.5 0.0 7 46 14 56 10 60 0.86 # 202 # 513 # 1 # ID=4_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.506 1_43 - 342 HTH_23 PF13384.1 50 2.1e-09 29.5 0.4 1 1 1.3e-10 2.1e-09 29.5 0.4 13 39 13 39 8 44 0.91 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 8_1 - 172 HTH_23 PF13384.1 50 3.6e-06 19.2 0.8 1 2 0.051 0.83 2.2 0.0 7 27 15 39 11 40 0.70 # 2 # 517 # -1 # ID=8_1;partial=11;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.552 8_1 - 172 HTH_23 PF13384.1 50 3.6e-06 19.2 0.8 2 2 6.1e-06 0.0001 14.6 0.1 28 42 45 59 44 67 0.87 # 2 # 517 # -1 # ID=8_1;partial=11;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.552 3_7 - 216 HTH_23 PF13384.1 50 3.9e-06 19.1 0.9 1 1 5.5e-07 9.1e-06 17.9 0.1 10 42 177 208 167 215 0.77 # 4265 # 4912 # 1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.508 7_1 - 106 HTH_23 PF13384.1 50 7.2e-06 18.3 2.1 1 1 7e-07 1.1e-05 17.6 0.2 5 39 66 100 62 104 0.87 # 202 # 519 # -1 # ID=7_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 3_6 - 221 Fer4_NifH PF00142.13 273 3e-07 22.5 0.2 1 1 8.8e-09 7.2e-07 21.2 0.0 6 41 9 44 5 48 0.90 # 3269 # 3931 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 7_1 - 106 HTH_7 PF02796.10 45 6e-14 44.4 0.6 1 1 6.9e-15 1.4e-13 43.2 0.1 1 44 61 101 61 102 0.97 # 202 # 519 # -1 # ID=7_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 1_43 - 342 HTH_7 PF02796.10 45 9.1e-09 27.8 0.1 1 1 9.1e-10 1.9e-08 26.8 0.1 12 44 8 40 2 41 0.89 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 3_7 - 216 HTH_7 PF02796.10 45 1e-05 18.0 0.5 1 2 0.02 0.4 3.3 0.0 5 24 83 103 80 106 0.74 # 4265 # 4912 # 1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.508 3_7 - 216 HTH_7 PF02796.10 45 1e-05 18.0 0.5 2 2 3.7e-05 0.00076 12.0 0.0 1 38 166 201 166 201 0.91 # 4265 # 4912 # 1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.508 2_2 - 177 HTH_7 PF02796.10 45 0.00055 12.5 0.0 1 1 6.5e-05 0.0013 11.2 0.0 1 32 139 171 139 171 0.97 # 162 # 692 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.571 1_4 - 80 HTH_19 PF12844.2 64 0.00043 13.0 0.0 1 1 7.2e-06 0.00059 12.6 0.0 3 25 9 31 7 65 0.77 # 2757 # 2996 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 1_43 - 342 HTH_29 PF13551.1 112 3e-06 20.0 1.1 1 1 3.6e-07 9.9e-06 18.4 0.0 7 35 13 40 8 72 0.86 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 4_1 - 104 HTH_29 PF13551.1 112 1.6e-05 17.7 0.3 1 1 9.3e-07 2.5e-05 17.0 0.3 5 46 18 58 14 87 0.69 # 202 # 513 # 1 # ID=4_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.506 7_1 - 106 HTH_29 PF13551.1 112 2.8e-05 16.9 0.9 1 2 0.038 1 2.2 0.3 24 54 34 63 18 70 0.64 # 202 # 519 # -1 # ID=7_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 7_1 - 106 HTH_29 PF13551.1 112 2.8e-05 16.9 0.9 2 2 1e-05 0.00028 13.7 0.0 4 35 71 101 68 105 0.90 # 202 # 519 # -1 # ID=7_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 4_4 - 492 ABC_tran_2 PF12848.2 85 5.2e-14 44.6 16.1 1 1 2e-14 1.6e-12 39.8 16.1 1 85 167 283 167 283 0.93 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 8_1 - 172 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 9.5e-13 40.5 0.3 1 1 1.3e-14 1.1e-12 40.4 0.3 5 132 14 148 10 163 0.87 # 2 # 517 # -1 # ID=8_1;partial=11;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.552 4_4 - 492 Arch_ATPase PF01637.13 234 8.6e-05 14.9 3.0 1 3 0.02 1.6 0.9 0.0 25 40 35 50 24 85 0.87 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 Arch_ATPase PF01637.13 234 8.6e-05 14.9 3.0 2 3 0.0083 0.68 2.1 0.7 53 104 181 237 166 267 0.65 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 Arch_ATPase PF01637.13 234 8.6e-05 14.9 3.0 3 3 3.2e-05 0.0027 10.0 0.0 24 68 326 374 323 473 0.69 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 1_42 - 260 PhoH PF02562.11 205 2.6e-07 22.7 0.1 1 1 5e-09 4.1e-07 22.0 0.1 14 56 96 138 84 163 0.80 # 33962 # 34741 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_42 - 260 AAA_5 PF07728.9 139 1.5e-05 17.4 0.0 1 1 4.6e-07 3.7e-05 16.1 0.0 1 74 103 172 103 177 0.80 # 33962 # 34741 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_22 - 612 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 5.1e-22 70.5 0.0 1 1 1.1e-23 9.2e-22 69.7 0.0 165 380 331 548 294 552 0.86 # 16983 # 18818 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.419 3_6 - 221 TIGR01968 TIGR01968 261 5.5e-11 34.6 0.3 1 2 1.6e-10 1.3e-08 26.7 0.1 2 48 3 46 2 53 0.87 # 3269 # 3931 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 3_6 - 221 TIGR01968 TIGR01968 261 5.5e-11 34.6 0.3 2 2 0.00037 0.03 5.9 0.0 101 141 69 109 64 164 0.81 # 3269 # 3931 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 3_6 - 221 AAA_18 PF13238.1 129 0.00062 12.7 0.1 1 1 2.9e-05 0.0012 11.8 0.0 8 79 13 86 11 108 0.79 # 3269 # 3931 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 4_4 - 492 AAA_18 PF13238.1 129 0.0008 12.4 8.3 1 2 0.0031 0.13 5.3 0.0 1 21 33 53 33 89 0.81 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 AAA_18 PF13238.1 129 0.0008 12.4 8.3 2 2 6.9e-05 0.0028 10.6 0.6 1 23 325 354 325 475 0.80 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 TIGR00611 TIGR00611 365 0.00053 11.4 2.8 1 3 0.0032 0.27 2.6 0.0 27 41 34 48 20 55 0.82 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 TIGR00611 TIGR00611 365 0.00053 11.4 2.8 2 3 0.01 0.85 0.9 0.2 81 124 230 273 204 274 0.81 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 TIGR00611 TIGR00611 365 0.00053 11.4 2.8 3 3 0.0004 0.033 5.6 0.0 27 43 326 342 318 348 0.86 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 1_39 - 440 DDE_Tnp_1_6 PF13751.1 125 3.2e-19 61.8 0.2 1 1 4e-21 3.2e-19 61.8 0.2 52 125 364 437 356 437 0.92 # 31125 # 32444 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.615 1_43 - 342 HTH_Tnp_IS1 PF12759.2 46 1.6e-05 17.0 0.1 1 1 3.6e-07 2.9e-05 16.1 0.1 17 43 13 39 3 41 0.83 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 4_4 - 492 DUF258 PF03193.11 161 6.4e-09 27.8 0.1 1 2 4e-07 1.6e-05 16.7 0.0 39 95 34 126 15 136 0.87 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 DUF258 PF03193.11 161 6.4e-09 27.8 0.1 2 2 0.00013 0.0053 8.6 0.0 38 67 325 352 302 391 0.77 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 1_42 - 260 DUF258 PF03193.11 161 0.00017 13.4 0.0 1 1 7.3e-06 0.0003 12.6 0.0 26 59 92 125 80 153 0.82 # 33962 # 34741 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 4_4 - 492 DUF87 PF01935.12 229 0.011 8.1 11.6 1 4 0.0013 0.1 4.9 0.0 25 48 32 55 20 62 0.86 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 DUF87 PF01935.12 229 0.011 8.1 11.6 2 4 0.063 5.2 -0.6 1.7 115 174 205 266 179 295 0.51 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 DUF87 PF01935.12 229 0.011 8.1 11.6 3 4 0.00099 0.081 5.3 0.3 25 46 324 345 321 357 0.88 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 DUF87 PF01935.12 229 0.011 8.1 11.6 4 4 0.0088 0.72 2.2 0.1 40 196 415 472 368 486 0.56 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_1 - 104 HTH_28 PF13518.1 52 1.7e-10 33.4 0.0 1 1 1.8e-11 3e-10 32.6 0.0 1 45 13 57 13 61 0.87 # 202 # 513 # 1 # ID=4_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.506 1_43 - 342 HTH_28 PF13518.1 52 1.1e-06 21.3 1.6 1 1 9.6e-08 1.6e-06 20.7 0.3 9 34 14 39 10 40 0.89 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 3_7 - 216 HTH_28 PF13518.1 52 2.4e-05 17.0 0.3 1 1 5.3e-06 8.7e-05 15.2 0.1 2 38 173 210 172 213 0.89 # 4265 # 4912 # 1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.508 8_1 - 172 HTH_28 PF13518.1 52 3.1e-05 16.6 1.3 1 1 8.5e-06 0.00014 14.5 1.3 22 36 44 58 17 59 0.75 # 2 # 517 # -1 # ID=8_1;partial=11;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.552 7_1 - 106 HTH_28 PF13518.1 52 5.2e-05 15.9 0.0 1 1 8e-06 0.00013 14.6 0.0 8 33 74 99 68 104 0.82 # 202 # 519 # -1 # ID=7_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 1_43 - 342 DUF2089 PF09862.4 113 0.00011 14.7 0.0 1 1 2.3e-06 0.00019 13.9 0.0 34 70 2 38 1 45 0.94 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_43 - 342 HTH_24 PF13412.1 48 4e-05 15.6 0.1 1 1 1.8e-06 7.4e-05 14.8 0.1 11 39 12 39 10 40 0.87 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 2_3 - 99 HTH_24 PF13412.1 48 0.00068 11.7 0.0 1 1 2.5e-05 0.001 11.1 0.0 17 37 22 42 20 44 0.90 # 1310 # 1606 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 1_42 - 260 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 0.00032 13.4 0.0 1 1 6.3e-06 0.00051 12.7 0.0 9 64 87 144 84 229 0.70 # 33962 # 34741 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_43 - 342 HTH_30 PF13556.1 59 1.4e-05 17.3 0.4 1 1 4.1e-07 3.4e-05 16.1 0.4 6 34 11 39 10 40 0.90 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_43 - 342 HTH_10 PF04967.7 53 0.00052 12.3 0.0 1 1 1.5e-05 0.0013 11.0 0.0 25 45 19 39 16 41 0.92 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 4_4 - 492 MMR_HSR1 PF01926.18 116 1.5e-06 20.8 4.1 1 2 2.2e-05 0.0018 10.9 0.1 1 27 32 92 32 178 0.52 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 MMR_HSR1 PF01926.18 116 1.5e-06 20.8 4.1 2 2 4.9e-05 0.004 9.8 0.7 1 99 324 473 324 488 0.56 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 1_21 - 348 DEAD PF00270.24 169 0.00025 13.2 0.0 1 1 5.4e-06 0.00044 12.4 0.0 7 39 159 191 156 246 0.79 # 15937 # 16980 # 1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.431 4_4 - 492 Miro PF08477.8 119 3.1e-09 30.0 1.0 1 2 5.7e-06 0.00046 13.3 0.0 1 21 32 52 32 82 0.89 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 Miro PF08477.8 119 3.1e-09 30.0 1.0 2 2 3.4e-06 0.00028 14.0 0.0 1 25 324 348 324 392 0.72 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 2_3 - 99 HTH_31 PF13560.1 64 7.3e-08 25.2 0.1 1 1 2.3e-09 9.5e-08 24.9 0.1 14 59 22 66 3 85 0.88 # 1310 # 1606 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 1_4 - 80 HTH_31 PF13560.1 64 8.2e-06 18.6 0.0 1 1 2.4e-07 1e-05 18.4 0.0 5 37 9 42 6 61 0.83 # 2757 # 2996 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 1_23 - 132 DUF3897 PF13036.1 180 0.00073 11.8 0.0 1 1 1.1e-05 0.00091 11.5 0.0 1 56 5 61 5 74 0.74 # 18815 # 19210 # 1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.391 1_20 - 404 DLIC PF05783.6 472 0.033 5.4 7.5 1 1 0.00064 0.052 4.7 7.5 377 458 117 204 76 210 0.63 # 14714 # 15925 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_43 - 342 HTH_36 PF13730.1 55 5.7e-05 15.9 0.0 1 1 1.4e-06 0.00012 14.9 0.0 27 47 19 39 11 40 0.93 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_21 - 348 T2SE PF00437.15 272 7.7e-47 152.0 0.0 1 1 1.1e-48 9.1e-47 151.8 0.0 12 246 29 289 18 320 0.88 # 15937 # 16980 # 1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.431 4_4 - 492 NACHT PF05729.7 166 1.2e-06 20.9 0.1 1 2 0.00093 0.038 6.3 0.0 3 20 33 50 31 63 0.86 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 NACHT PF05729.7 166 1.2e-06 20.9 0.1 2 2 1.4e-05 0.00058 12.2 0.0 3 24 325 346 323 394 0.84 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 1_42 - 260 NACHT PF05729.7 166 0.0001 14.6 0.0 1 1 4.1e-06 0.00017 13.9 0.0 3 49 104 151 102 200 0.81 # 33962 # 34741 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 4_4 - 492 UPF0079 PF02367.12 123 0.00033 12.9 0.1 1 2 0.0017 0.14 4.4 0.0 18 36 33 51 26 60 0.85 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 UPF0079 PF02367.12 123 0.00033 12.9 0.1 2 2 0.00063 0.052 5.8 0.0 14 39 321 346 312 357 0.83 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 AAA_17 PF13207.1 121 7.4e-07 22.7 3.7 1 2 0.0046 0.19 5.2 0.4 1 20 32 51 32 195 0.85 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 AAA_17 PF13207.1 121 7.4e-07 22.7 3.7 2 2 6e-07 2.5e-05 17.8 0.1 1 52 324 379 324 486 0.80 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 1_42 - 260 AAA_17 PF13207.1 121 0.00032 14.2 0.0 1 1 1.3e-05 0.00054 13.4 0.0 2 26 104 131 103 216 0.74 # 33962 # 34741 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 4_4 - 492 TIGR02211 TIGR02211 221 1.6e-30 98.6 2.1 1 4 3.1e-07 2.6e-05 16.1 0.0 18 53 17 52 4 67 0.83 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 TIGR02211 TIGR02211 221 1.6e-30 98.6 2.1 2 4 2e-14 1.6e-12 39.7 0.0 124 220 85 175 68 176 0.81 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 TIGR02211 TIGR02211 221 1.6e-30 98.6 2.1 3 4 1.1e-05 0.00089 11.1 0.0 19 52 310 343 305 358 0.90 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 TIGR02211 TIGR02211 221 1.6e-30 98.6 2.1 4 4 5.5e-11 4.5e-09 28.4 0.0 124 219 390 483 373 485 0.82 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 1_42 - 260 AAA_25 PF13481.1 194 5.9e-07 21.7 0.1 1 1 6.7e-08 1.8e-06 20.1 0.1 9 60 72 128 68 201 0.77 # 33962 # 34741 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 4_4 - 492 AAA_25 PF13481.1 194 1.6e-05 17.0 0.0 1 2 0.022 0.6 2.1 0.0 37 54 34 51 30 72 0.81 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 AAA_25 PF13481.1 194 1.6e-05 17.0 0.0 2 2 4.2e-05 0.0012 10.9 0.0 29 54 318 343 294 423 0.76 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 1_21 - 348 AAA_25 PF13481.1 194 0.00029 12.9 0.0 1 1 1.6e-05 0.00044 12.3 0.0 20 52 154 186 138 218 0.87 # 15937 # 16980 # 1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.431 4_4 - 492 AAA_15 PF13175.1 415 3e-10 32.2 1.2 1 3 6e-05 0.005 8.5 0.0 26 54 34 58 5 119 0.80 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 AAA_15 PF13175.1 415 3e-10 32.2 1.2 2 3 6.4e-06 0.00053 11.7 0.0 26 90 326 383 300 417 0.60 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 AAA_15 PF13175.1 415 3e-10 32.2 1.2 3 3 3.8e-05 0.0032 9.1 0.1 352 414 415 467 393 476 0.75 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 1_42 - 260 AAA_14 PF13173.1 128 2.9e-07 23.1 0.0 1 2 1.7e-08 1.4e-06 20.9 0.0 3 97 102 203 100 219 0.64 # 33962 # 34741 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_42 - 260 AAA_14 PF13173.1 128 2.9e-07 23.1 0.0 2 2 0.048 4 0.0 0.0 14 46 215 247 212 257 0.80 # 33962 # 34741 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 3_6 - 221 VirC1 PF07015.6 231 7.4e-08 24.3 0.0 1 1 1.7e-09 1.4e-07 23.4 0.0 3 54 4 55 2 66 0.91 # 3269 # 3931 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 1_43 - 342 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 2.4e-05 16.1 0.3 1 1 7e-07 5.8e-05 14.9 0.3 23 50 13 40 9 40 0.87 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 4_4 - 492 AAA_33 PF13671.1 143 0.00054 12.5 0.1 1 2 0.0085 0.7 2.4 0.0 4 19 35 50 33 121 0.83 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 AAA_33 PF13671.1 143 0.00054 12.5 0.1 2 2 0.00025 0.021 7.3 0.0 3 33 326 356 325 398 0.77 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 7_1 - 106 CENP-B_N PF04218.8 53 0.0003 12.8 0.1 1 1 2.3e-05 0.0019 10.3 0.1 26 47 82 103 67 104 0.86 # 202 # 519 # -1 # ID=7_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 1_22 - 612 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 1.2e-149 491.5 0.0 1 1 1.7e-151 1.4e-149 491.2 0.0 2 460 102 569 101 581 0.98 # 16983 # 18818 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.419 4_4 - 492 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00055 12.8 0.2 1 2 0.0033 0.27 4.1 0.0 3 22 35 54 33 65 0.83 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00055 12.8 0.2 2 2 0.00092 0.075 5.9 0.0 2 22 326 346 325 380 0.79 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 NTPase_1 PF03266.10 168 6.8e-05 15.2 2.1 1 2 0.087 3.6 -0.1 0.0 1 19 32 50 32 62 0.83 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 NTPase_1 PF03266.10 168 6.8e-05 15.2 2.1 2 2 3.4e-05 0.0014 11.0 1.0 1 26 324 349 324 490 0.62 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 1_42 - 260 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00019 13.8 0.1 1 2 0.003 0.12 4.6 0.1 2 30 104 132 103 143 0.82 # 33962 # 34741 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_42 - 260 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00019 13.8 0.1 2 2 0.0006 0.025 6.9 0.0 87 108 155 176 141 202 0.77 # 33962 # 34741 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 8_1 - 172 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 2.9e-36 117.2 0.0 1 1 2.1e-37 4.2e-36 116.6 0.0 4 94 79 171 77 172 0.98 # 2 # 517 # -1 # ID=8_1;partial=11;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.552 1_48 - 109 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 1.1e-24 79.7 0.0 1 1 5.7e-26 1.2e-24 79.5 0.0 57 139 4 86 1 87 0.97 # 44347 # 44673 # -1 # ID=1_48;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.514 4_3 - 65 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 1.1e-10 34.2 0.0 1 1 6.2e-12 1.3e-10 34.1 0.0 98 139 1 42 1 43 0.97 # 1396 # 1590 # 1 # ID=4_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.482 4_2 - 204 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 4.8e-10 32.2 0.0 1 1 3.1e-11 6.3e-10 31.8 0.0 2 131 36 168 35 178 0.84 # 768 # 1379 # 1 # ID=4_2;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 2_3 - 99 HTH_26 PF13443.1 63 1.5e-05 17.8 0.0 1 1 7.3e-07 3e-05 16.9 0.0 5 42 17 53 15 72 0.81 # 1310 # 1606 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 7_1 - 106 HTH_26 PF13443.1 63 0.00052 12.9 0.0 1 1 2.1e-05 0.00087 12.2 0.0 6 34 74 102 70 105 0.90 # 202 # 519 # -1 # ID=7_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 4_4 - 492 PduV-EutP PF10662.4 143 2.1e-06 19.9 1.2 1 3 8e-05 0.0065 8.6 0.0 3 31 32 60 30 100 0.90 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 PduV-EutP PF10662.4 143 2.1e-06 19.9 1.2 2 3 0.00051 0.042 6.0 0.1 3 23 324 344 322 352 0.89 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 PduV-EutP PF10662.4 143 2.1e-06 19.9 1.2 3 3 0.0082 0.67 2.1 0.0 40 72 431 463 420 484 0.69 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 1_30 - 774 Toprim_Crpt PF13342.1 62 3.3e-22 70.6 6.7 1 1 7.8e-24 6.4e-22 69.7 5.8 1 61 709 771 709 772 0.96 # 21875 # 24196 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.476 4_4 - 492 KAP_NTPase PF07693.9 325 0.00017 13.2 1.8 1 2 0.00056 0.046 5.3 0.0 23 47 33 57 26 143 0.77 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 KAP_NTPase PF07693.9 325 0.00017 13.2 1.8 2 2 0.00018 0.015 6.9 0.0 23 42 325 344 319 398 0.87 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_1 - 104 HTH_17 PF12728.2 51 3.7e-05 16.6 0.1 1 1 2e-06 5.6e-05 16.0 0.1 2 24 26 48 25 84 0.86 # 202 # 513 # 1 # ID=4_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.506 1_43 - 342 HTH_17 PF12728.2 51 0.00012 14.9 0.0 1 1 1.3e-05 0.00036 13.4 0.0 4 24 20 40 19 50 0.88 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 7_1 - 106 HTH_17 PF12728.2 51 0.00064 12.6 1.0 1 2 0.041 1.1 2.3 0.1 25 43 53 71 39 74 0.80 # 202 # 519 # -1 # ID=7_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 7_1 - 106 HTH_17 PF12728.2 51 0.00064 12.6 1.0 2 2 0.00032 0.0088 9.0 0.1 6 23 83 100 81 103 0.87 # 202 # 519 # -1 # ID=7_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 1_10 - 164 TIGR00922 TIGR00922 172 4.9e-08 25.3 0.0 1 2 0.08 6.5 -1.1 0.0 1 20 3 22 3 27 0.81 # 6329 # 6820 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_10 - 164 TIGR00922 TIGR00922 172 4.9e-08 25.3 0.0 2 2 1.6e-09 1.3e-07 23.9 0.0 56 110 52 106 30 145 0.90 # 6329 # 6820 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_43 - 342 HTH_11 PF08279.7 55 4.5e-06 18.9 0.4 1 1 1.1e-07 9.4e-06 17.9 0.4 4 37 6 39 3 40 0.81 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_43 - 342 Sigma70_ECF PF07638.6 185 0.00033 13.0 0.0 1 1 8.2e-06 0.00067 12.0 0.0 140 172 4 38 2 46 0.82 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 7_1 - 106 TrmB PF01978.14 68 2.1e-05 16.9 0.0 1 1 4.3e-07 3.5e-05 16.1 0.0 19 44 75 100 69 101 0.89 # 202 # 519 # -1 # ID=7_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 1_43 - 342 LacI PF00356.16 46 2.8e-05 16.4 0.2 1 1 1.2e-06 9.6e-05 14.6 0.0 2 25 20 43 19 50 0.86 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 2_3 - 99 HTH_Crp_2 PF13545.1 76 1.6e-05 17.4 0.0 1 1 2.9e-07 2.4e-05 16.8 0.0 25 50 19 44 10 45 0.89 # 1310 # 1606 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 1_14 - 920 AAA_10 PF12846.2 304 1.6e-33 109.0 0.0 1 1 1.7e-34 4.6e-33 107.5 0.0 3 292 539 823 538 832 0.89 # 7984 # 10743 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 1_42 - 260 AAA_10 PF12846.2 304 3e-05 16.1 0.2 1 2 0.043 1.2 1.1 0.0 106 155 28 69 4 89 0.61 # 33962 # 34741 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_42 - 260 AAA_10 PF12846.2 304 3e-05 16.1 0.2 2 2 1.3e-05 0.00036 12.6 0.1 3 35 103 135 101 172 0.84 # 33962 # 34741 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 4_4 - 492 AAA_10 PF12846.2 304 3.6e-05 15.9 4.7 1 2 0.002 0.056 5.4 0.0 6 22 35 51 33 67 0.80 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 AAA_10 PF12846.2 304 3.6e-05 15.9 4.7 2 2 5.1e-05 0.0014 10.7 0.5 4 118 325 478 322 489 0.76 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 7_1 - 106 HTH_20 PF12840.2 61 1.5e-05 17.4 0.1 1 1 4.1e-06 0.00017 14.0 0.1 2 43 29 97 28 101 0.93 # 202 # 519 # -1 # ID=7_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 1_43 - 342 HTH_20 PF12840.2 61 6.2e-05 15.4 0.0 1 1 4e-06 0.00016 14.1 0.0 18 46 12 39 10 40 0.91 # 34738 # 35763 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 4_4 - 492 Dynamin_N PF00350.18 168 0.0087 8.5 17.3 1 2 0.0077 0.63 2.4 11.6 1 86 33 234 33 305 0.68 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 4_4 - 492 Dynamin_N PF00350.18 168 0.0087 8.5 17.3 2 2 0.00049 0.04 6.3 0.3 1 111 325 437 325 487 0.51 # 2040 # 3515 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 3_6 - 221 ArsA_ATPase PF02374.10 305 3.5e-11 35.2 0.3 1 2 7.4e-12 6.1e-10 31.2 0.2 4 39 6 41 3 51 0.91 # 3269 # 3931 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 3_6 - 221 ArsA_ATPase PF02374.10 305 3.5e-11 35.2 0.3 2 2 0.0055 0.45 2.0 0.0 103 165 54 116 42 141 0.73 # 3269 # 3931 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 3_6 - 221 AAA_31 PF13614.1 157 1.1e-08 27.8 0.1 1 2 5.4e-09 4.4e-07 22.6 0.0 1 41 3 43 3 60 0.90 # 3269 # 3931 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 3_6 - 221 AAA_31 PF13614.1 157 1.1e-08 27.8 0.1 2 2 0.0053 0.43 3.1 0.0 111 151 73 112 62 115 0.87 # 3269 # 3931 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 1_37 - 280 Pterin_bind PF00809.17 210 2.1e-58 189.7 0.0 1 1 3e-60 2.5e-58 189.5 0.0 1 210 7 216 7 216 0.98 # 28842 # 29681 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.617 1_42 - 260 IstB_IS21 PF01695.12 178 7.1e-66 213.6 0.0 1 1 2.2e-67 1.8e-65 212.3 0.0 2 177 56 233 55 234 0.96 # 33962 # 34741 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 3_6 - 221 GTP_EFTU PF00009.22 188 1.6e-07 23.5 0.0 1 1 2.3e-09 1.9e-07 23.3 0.0 15 115 15 123 4 210 0.70 # 3269 # 3931 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/34f4ca2a-8539-42ca-a3f9-ccb97aa37e3c # Target file: checkm_output/bins/pm1271/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm1271/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/34f4ca2a-8539-42ca-a3f9-ccb97aa37e3c checkm_output/bins/pm1271/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 09:39:02 2017 # [ok]