# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_95 - 323 KaiC PF06745.8 227 0.00019 13.4 0.1 1 1 4.3e-06 0.00042 12.3 0.1 12 43 33 63 27 149 0.80 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_93 - 187 HTH_IclR PF09339.5 52 1.3e-05 17.6 0.0 1 1 1.2e-06 3.7e-05 16.2 0.0 18 40 158 180 144 181 0.92 # 75156 # 75716 # 1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.565 1_96 - 346 HTH_IclR PF09339.5 52 9.8e-05 14.8 2.7 1 2 0.00036 0.012 8.2 0.0 16 37 38 59 27 68 0.84 # 78511 # 79548 # -1 # ID=1_96;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_96 - 346 HTH_IclR PF09339.5 52 9.8e-05 14.8 2.7 2 2 0.0034 0.11 5.1 0.5 30 40 127 137 125 138 0.90 # 78511 # 79548 # -1 # ID=1_96;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_25 - 71 HTH_IclR PF09339.5 52 0.00072 12.1 0.0 1 1 2.6e-05 0.00083 11.8 0.0 18 50 19 56 8 57 0.81 # 14866 # 15078 # -1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 1_95 - 323 ABC_tran PF00005.22 137 6.9e-06 19.3 0.1 1 1 1.4e-07 1.3e-05 18.4 0.1 2 90 31 120 30 159 0.75 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_93 - 187 HTH_22 PF13309.1 64 1.3e-05 17.8 0.1 1 1 4.5e-06 0.00022 13.9 0.0 45 63 161 179 158 180 0.87 # 75156 # 75716 # 1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.565 1_1 - 297 HTH_22 PF13309.1 64 0.00079 12.1 0.2 1 2 0.0044 0.22 4.3 0.0 24 48 5 29 3 32 0.91 # 3 # 893 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.407 1_1 - 297 HTH_22 PF13309.1 64 0.00079 12.1 0.2 2 2 0.003 0.14 4.8 0.1 1 33 103 135 103 139 0.92 # 3 # 893 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.407 1_82 - 425 Cdd1 PF11731.3 93 0.00034 13.4 0.0 1 1 8.1e-06 0.00078 12.3 0.0 10 47 178 215 141 227 0.85 # 65123 # 66397 # 1 # ID=1_82;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_90 - 372 AAA_27 PF13514.1 1111 0.047 4.1 60.6 1 2 0.0083 0.81 0.0 41.6 630 830 68 253 45 256 0.77 # 71690 # 72805 # -1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.582 1_90 - 372 AAA_27 PF13514.1 1111 0.047 4.1 60.6 2 2 0.00053 0.051 4.0 29.1 235 400 200 361 187 369 0.75 # 71690 # 72805 # -1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.582 1_94 - 555 rve_3 PF13683.1 67 0.00027 13.4 1.5 1 1 9.6e-06 0.00093 11.6 1.5 12 58 282 331 278 339 0.84 # 75700 # 77364 # 1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.556 1_60 - 883 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 2.8e-05 16.5 0.1 1 2 2e-06 0.0002 13.7 0.0 39 63 476 504 463 507 0.84 # 49187 # 51835 # -1 # ID=1_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_60 - 883 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 2.8e-05 16.5 0.1 2 2 0.035 3.4 -0.1 0.0 76 166 531 625 529 632 0.78 # 49187 # 51835 # -1 # ID=1_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_96 - 346 HTH_38 PF13936.1 44 3.4e-07 22.7 0.8 1 1 5.7e-08 2.8e-06 19.7 0.0 10 41 30 61 26 62 0.89 # 78511 # 79548 # -1 # ID=1_96;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_93 - 187 HTH_38 PF13936.1 44 8e-05 15.1 0.1 1 1 6.3e-06 0.00031 13.2 0.0 13 41 150 179 147 181 0.88 # 75156 # 75716 # 1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.565 1_95 - 323 MobB PF03205.9 140 0.00031 13.3 0.1 1 1 2.2e-05 0.0011 11.6 0.0 2 31 42 70 41 86 0.78 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_60 - 883 MobB PF03205.9 140 0.00078 12.0 0.1 1 1 5.4e-05 0.0026 10.3 0.0 4 37 483 515 481 523 0.79 # 49187 # 51835 # -1 # ID=1_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_94 - 555 HTH_Tnp_4 PF13613.1 53 0.00032 13.1 0.4 1 1 1.1e-05 0.0011 11.4 0.0 26 44 38 56 35 57 0.90 # 75700 # 77364 # 1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.556 1_93 - 187 HTH_8 PF02954.14 42 0.00022 13.7 0.1 1 1 5.9e-06 0.00057 12.3 0.1 24 42 164 182 161 182 0.89 # 75156 # 75716 # 1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.565 1_93 - 187 TetR_N PF00440.18 47 0.00043 12.8 0.9 1 2 0.027 2.6 0.7 0.0 11 21 3 13 1 13 0.83 # 75156 # 75716 # 1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.565 1_93 - 187 TetR_N PF00440.18 47 0.00043 12.8 0.9 2 2 3.7e-05 0.0036 9.9 0.2 16 35 158 177 149 178 0.88 # 75156 # 75716 # 1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.565 1_43 - 1754 AAA_19 PF13245.1 76 3.8e-07 22.7 2.3 1 1 2.5e-08 8e-07 21.7 0.5 7 76 980 1046 973 1046 0.77 # 28066 # 33327 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.615 1_95 - 323 AAA_19 PF13245.1 76 6.2e-05 15.6 0.2 1 1 9.8e-06 0.00032 13.3 0.1 6 37 36 67 32 119 0.75 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_65 - 113 AAA_19 PF13245.1 76 0.0003 13.4 0.0 1 1 1.4e-05 0.00044 12.9 0.0 15 42 83 109 69 112 0.78 # 53559 # 53897 # -1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_84 - 402 CbiA PF01656.18 195 2.2e-18 59.2 0.0 1 1 4.6e-20 4.5e-18 58.2 0.0 1 141 111 291 111 328 0.75 # 67453 # 68658 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 1_95 - 323 PRK PF00485.13 194 0.00033 13.1 0.0 1 1 7e-06 0.00068 12.1 0.0 1 38 42 81 42 132 0.66 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_83 - 325 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00052 12.4 0.0 1 1 1.6e-05 0.0016 10.8 0.0 24 50 158 184 153 185 0.89 # 66479 # 67453 # -1 # ID=1_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.448 1_94 - 555 rve PF00665.21 120 1.2e-12 40.9 0.0 1 1 7.7e-14 3.7e-12 39.3 0.0 2 118 157 298 156 300 0.89 # 75700 # 77364 # 1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.556 1_96 - 346 rve PF00665.21 120 1.8e-10 33.9 0.0 1 1 8.1e-12 3.9e-10 32.8 0.0 18 118 206 305 190 307 0.91 # 78511 # 79548 # -1 # ID=1_96;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_96 - 346 Terminase_5 PF06056.7 58 0.00015 14.2 0.0 1 1 6.1e-06 0.00059 12.3 0.0 3 35 30 62 28 85 0.86 # 78511 # 79548 # -1 # ID=1_96;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_78 - 158 Methyltransf_26 PF13659.1 117 4.2e-06 19.7 0.0 1 1 6.6e-08 6.4e-06 19.1 0.0 60 114 10 71 3 74 0.70 # 62516 # 62989 # -1 # ID=1_78;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.582 1_43 - 1754 AAA_30 PF13604.1 196 7.1e-42 136.0 23.4 1 3 0.038 1.8 0.9 0.0 41 86 223 269 218 282 0.84 # 28066 # 33327 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.615 1_43 - 1754 AAA_30 PF13604.1 196 7.1e-42 136.0 23.4 2 3 1.2e-05 0.0006 12.3 2.0 9 133 421 539 419 559 0.79 # 28066 # 33327 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.615 1_43 - 1754 AAA_30 PF13604.1 196 7.1e-42 136.0 23.4 3 3 1.7e-43 8e-42 135.9 1.7 1 185 967 1154 967 1159 0.95 # 28066 # 33327 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.615 1_95 - 323 AAA_30 PF13604.1 196 0.00016 14.2 0.3 1 1 9.7e-06 0.00047 12.6 0.3 15 128 38 164 27 170 0.55 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_83 - 325 CPSase_L_D3 PF02787.14 123 0.00022 13.9 0.5 1 1 7.1e-06 0.00069 12.3 0.1 49 98 134 186 125 191 0.83 # 66479 # 67453 # -1 # ID=1_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.448 1_44 - 673 TraG-D_C PF12696.2 128 6.9e-21 67.3 0.0 1 2 0.088 8.5 -0.9 0.0 12 60 195 242 191 246 0.85 # 33422 # 35440 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 1_44 - 673 TraG-D_C PF12696.2 128 6.9e-21 67.3 0.0 2 2 3.8e-22 3.7e-20 65.0 0.0 1 127 418 540 418 541 0.87 # 33422 # 35440 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 1_96 - 346 DDE_3 PF13358.1 146 1.9e-29 95.2 0.1 1 1 4.1e-31 4e-29 94.1 0.0 2 138 177 310 176 317 0.96 # 78511 # 79548 # -1 # ID=1_96;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_84 - 402 MipZ PF09140.6 261 5.5e-06 18.4 0.0 1 2 0.0025 0.24 3.2 0.0 3 50 111 163 109 201 0.73 # 67453 # 68658 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 1_84 - 402 MipZ PF09140.6 261 5.5e-06 18.4 0.0 2 2 2.8e-06 0.00027 12.9 0.0 87 136 233 282 220 305 0.87 # 67453 # 68658 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 1_63 - 74 zf-dskA_traR PF01258.12 36 2.5e-15 48.9 2.2 1 1 3.5e-17 3.4e-15 48.4 2.2 5 35 36 66 29 72 0.86 # 52691 # 52912 # -1 # ID=1_63;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 1_90 - 372 DUF2316 PF10078.4 89 0.016 8.2 9.4 1 2 0.00018 0.018 8.0 2.7 5 45 198 238 193 249 0.88 # 71690 # 72805 # -1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.582 1_90 - 372 DUF2316 PF10078.4 89 0.016 8.2 9.4 2 2 0.008 0.77 2.7 0.6 5 42 251 288 246 300 0.86 # 71690 # 72805 # -1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.582 1_95 - 323 AAA PF00004.24 132 1.5e-06 21.3 0.0 1 1 3.5e-08 3.4e-06 20.2 0.0 3 97 45 152 43 181 0.68 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_83 - 325 HTH_37 PF13744.1 80 0.00012 14.7 1.2 1 2 0.0091 0.88 2.4 0.1 27 55 9 37 6 43 0.82 # 66479 # 67453 # -1 # ID=1_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.448 1_83 - 325 HTH_37 PF13744.1 80 0.00012 14.7 1.2 2 2 3.6e-05 0.0035 10.1 0.1 27 53 156 182 139 186 0.92 # 66479 # 67453 # -1 # ID=1_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.448 1_95 - 323 TIGR00064 TIGR00064 279 6.9e-05 14.7 0.2 1 1 1.4e-06 0.00014 13.7 0.0 72 111 33 72 4 76 0.73 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_78 - 158 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 1.1e-13 44.1 0.0 1 1 1.2e-15 1.2e-13 43.9 0.0 1 115 21 125 21 153 0.86 # 62516 # 62989 # -1 # ID=1_78;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.582 1_65 - 113 cobW PF02492.14 178 0.0003 13.1 0.0 1 1 5.1e-06 0.0005 12.4 0.0 5 24 83 106 80 111 0.76 # 53559 # 53897 # -1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_95 - 323 AAA_16 PF13191.1 185 3.5e-11 36.3 1.2 1 1 1.8e-11 4.4e-10 32.7 0.3 22 179 38 153 24 162 0.76 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_44 - 673 AAA_16 PF13191.1 185 0.00014 14.7 0.0 1 1 2.3e-05 0.00056 12.8 0.0 21 55 181 215 178 246 0.85 # 33422 # 35440 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 1_65 - 113 AAA_16 PF13191.1 185 0.00045 13.1 0.0 1 1 2.6e-05 0.00062 12.6 0.0 26 51 80 105 57 111 0.83 # 53559 # 53897 # -1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_43 - 1754 AAA_16 PF13191.1 185 0.00063 12.6 2.5 1 2 0.0057 0.14 5.0 0.0 25 47 985 1007 964 1018 0.84 # 28066 # 33327 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.615 1_43 - 1754 AAA_16 PF13191.1 185 0.00063 12.6 2.5 2 2 0.0043 0.1 5.4 0.1 48 148 1086 1218 1036 1239 0.75 # 28066 # 33327 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.615 1_95 - 323 AAA_22 PF13401.1 131 4.8e-16 52.0 0.3 1 1 1.1e-17 1.1e-15 50.8 0.3 3 129 39 170 36 172 0.77 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_1 - 297 HTH_1 PF00126.22 60 1.1e-15 50.1 0.0 1 1 3.3e-17 3.2e-15 48.6 0.0 2 60 6 64 5 64 0.96 # 3 # 893 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.407 1_96 - 346 LZ_Tnp_IS481 PF13011.1 85 4.6e-06 19.8 0.2 1 1 1.1e-07 1.1e-05 18.6 0.2 12 69 27 82 15 89 0.91 # 78511 # 79548 # -1 # ID=1_96;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_63 - 74 Tnp_zf-ribbon_2 PF13842.1 32 0.0003 14.1 0.8 1 1 5.1e-06 0.00049 13.4 0.8 15 32 33 61 21 61 0.82 # 52691 # 52912 # -1 # ID=1_63;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 1_20 - 146 Limkain-b1 PF11608.3 91 0.00055 12.6 0.0 1 1 7.9e-06 0.00076 12.1 0.0 41 74 13 46 7 67 0.89 # 12553 # 12990 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.621 1_96 - 346 HTH_32 PF13565.1 77 1.7e-12 40.9 3.6 1 2 0.0027 0.13 6.0 0.1 32 77 24 61 9 61 0.80 # 78511 # 79548 # -1 # ID=1_96;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_96 - 346 HTH_32 PF13565.1 77 1.7e-12 40.9 3.6 2 2 9.8e-14 4.7e-12 39.5 0.3 1 77 56 136 56 136 0.82 # 78511 # 79548 # -1 # ID=1_96;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_94 - 555 HTH_32 PF13565.1 77 5.3e-05 16.9 7.1 1 3 0.0033 0.16 5.7 0.1 33 77 11 52 2 52 0.67 # 75700 # 77364 # 1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.556 1_94 - 555 HTH_32 PF13565.1 77 5.3e-05 16.9 7.1 2 3 0.0011 0.055 7.2 0.1 21 63 61 113 54 120 0.69 # 75700 # 77364 # 1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.556 1_94 - 555 HTH_32 PF13565.1 77 5.3e-05 16.9 7.1 3 3 0.0055 0.27 5.0 0.1 1 18 131 148 131 160 0.79 # 75700 # 77364 # 1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.556 1_96 - 346 HTH_23 PF13384.1 50 1.7e-11 36.3 2.8 1 1 1.2e-12 3.9e-11 35.2 0.0 3 50 26 73 24 73 0.94 # 78511 # 79548 # -1 # ID=1_96;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_93 - 187 HTH_23 PF13384.1 50 1.2e-05 17.8 0.0 1 1 9.4e-07 3e-05 16.5 0.0 12 42 152 183 148 186 0.81 # 75156 # 75716 # 1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.565 1_94 - 555 HTH_23 PF13384.1 50 0.0034 10.0 0.1 1 2 0.00011 0.0034 10.0 0.1 20 39 34 53 29 57 0.88 # 75700 # 77364 # 1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.556 1_94 - 555 HTH_23 PF13384.1 50 0.0034 10.0 0.1 2 2 0.0017 0.056 6.1 0.5 32 42 130 140 128 147 0.84 # 75700 # 77364 # 1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.556 1_93 - 187 HTH_7 PF02796.10 45 7.3e-10 31.5 0.1 1 1 4.8e-11 1.6e-09 30.4 0.1 1 42 140 179 140 181 0.93 # 75156 # 75716 # 1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.565 1_94 - 555 HTH_7 PF02796.10 45 2.6e-05 16.9 0.2 1 1 3e-06 9.8e-05 15.1 0.2 23 43 33 53 30 54 0.93 # 75700 # 77364 # 1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.556 1_96 - 346 HTH_7 PF02796.10 45 0.0004 13.2 0.2 1 2 0.00021 0.0067 9.2 0.0 15 38 34 57 16 61 0.84 # 78511 # 79548 # -1 # ID=1_96;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_96 - 346 HTH_7 PF02796.10 45 0.0004 13.2 0.2 2 2 0.066 2.1 1.2 0.1 35 43 129 137 119 139 0.79 # 78511 # 79548 # -1 # ID=1_96;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_95 - 323 NB-ARC PF00931.17 287 0.00039 12.2 0.3 1 1 5.9e-06 0.00058 11.6 0.3 8 104 29 126 22 144 0.74 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_96 - 346 HTH_29 PF13551.1 112 2.7e-19 62.3 0.2 1 1 2e-20 6.5e-19 61.0 0.2 1 111 30 139 30 140 0.92 # 78511 # 79548 # -1 # ID=1_96;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_94 - 555 HTH_29 PF13551.1 112 8e-06 18.9 0.5 1 2 3.4e-05 0.0011 12.0 0.1 14 91 33 109 25 121 0.65 # 75700 # 77364 # 1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.556 1_94 - 555 HTH_29 PF13551.1 112 8e-06 18.9 0.5 2 2 0.011 0.36 3.9 0.0 25 44 128 147 125 155 0.80 # 75700 # 77364 # 1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.556 1_93 - 187 HTH_29 PF13551.1 112 1.3e-05 18.2 1.2 1 2 0.067 2.2 1.4 0.1 32 62 120 149 104 156 0.71 # 75156 # 75716 # 1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.565 1_93 - 187 HTH_29 PF13551.1 112 1.3e-05 18.2 1.2 2 2 5.5e-06 0.00018 14.5 0.0 10 38 157 184 152 185 0.90 # 75156 # 75716 # 1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.565 1_95 - 323 Arch_ATPase PF01637.13 234 3.5e-05 16.4 0.2 1 1 8.6e-07 8.3e-05 15.2 0.2 8 135 30 142 27 164 0.68 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_43 - 1754 PhoH PF02562.11 205 0.00026 13.1 0.0 1 1 1e-05 0.00099 11.2 0.1 3 59 966 1026 964 1042 0.84 # 28066 # 33327 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.615 1_95 - 323 AAA_5 PF07728.9 139 7.8e-05 15.3 0.1 1 1 7e-06 0.00068 12.2 0.2 5 90 46 149 43 152 0.85 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_95 - 323 ResIII PF04851.10 184 9.5e-06 18.4 0.2 1 2 1.7e-05 0.0017 11.1 0.3 29 101 44 110 20 121 0.72 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_95 - 323 ResIII PF04851.10 184 9.5e-06 18.4 0.2 2 2 0.00058 0.056 6.1 0.0 131 162 109 140 96 153 0.63 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_44 - 673 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.3e-145 477.6 0.0 1 1 5e-147 1.6e-145 477.3 0.0 2 386 171 560 170 560 0.99 # 33422 # 35440 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 1_60 - 883 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 5.3e-07 21.4 0.2 1 2 6.9e-08 2.2e-06 19.3 0.0 15 53 479 517 470 552 0.81 # 49187 # 51835 # -1 # ID=1_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_60 - 883 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 5.3e-07 21.4 0.2 2 2 0.095 3.1 -0.9 0.0 261 317 713 769 707 772 0.92 # 49187 # 51835 # -1 # ID=1_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_95 - 323 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 0.00014 13.4 0.5 1 2 5e-05 0.0016 9.9 0.0 14 44 39 69 35 76 0.83 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_95 - 323 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 0.00014 13.4 0.5 2 2 0.063 2 -0.3 0.0 234 275 115 158 112 169 0.78 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_95 - 323 AAA_18 PF13238.1 129 8.9e-05 15.7 0.0 1 1 1.7e-06 0.00016 14.8 0.0 1 23 43 90 43 138 0.67 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_82 - 425 IMS_HHH PF11798.3 32 3.3e-08 26.2 0.1 1 1 7.8e-10 7.6e-08 25.0 0.1 5 32 174 201 169 201 0.89 # 65123 # 66397 # 1 # ID=1_82;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_89 - 170 TIGR01406 TIGR01406 231 0.00032 12.9 0.0 1 1 5e-06 0.00049 12.3 0.0 3 59 106 156 105 159 0.81 # 71188 # 71697 # -1 # ID=1_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.594 1_60 - 883 DUF87 PF01935.12 229 3e-07 23.3 0.0 1 1 1.1e-08 5.4e-07 22.5 0.0 26 221 482 668 468 676 0.75 # 49187 # 51835 # -1 # ID=1_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_95 - 323 DUF87 PF01935.12 229 0.00057 12.6 0.2 1 1 0.0001 0.0051 9.5 0.0 26 52 43 69 40 73 0.85 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_96 - 346 HTH_28 PF13518.1 52 9.5e-10 31.3 0.1 1 1 2.1e-10 6.9e-09 28.5 0.0 1 50 29 79 29 82 0.91 # 78511 # 79548 # -1 # ID=1_96;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_93 - 187 HTH_28 PF13518.1 52 1.6e-06 20.9 1.1 1 1 7.1e-08 2.3e-06 20.4 0.1 4 38 149 184 148 185 0.92 # 75156 # 75716 # 1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.565 1_94 - 555 HTH_28 PF13518.1 52 0.0017 11.2 0.0 1 2 5.4e-05 0.0017 11.2 0.0 15 35 34 54 32 64 0.90 # 75700 # 77364 # 1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.556 1_94 - 555 HTH_28 PF13518.1 52 0.0017 11.2 0.0 2 2 0.037 1.2 2.2 0.4 26 37 129 140 125 145 0.87 # 75700 # 77364 # 1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.556 1_95 - 323 TIGR00041 TIGR00041 196 0.00032 13.0 0.0 1 1 5.7e-06 0.00055 12.2 0.0 2 54 38 96 37 122 0.74 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_83 - 325 HTH_24 PF13412.1 48 2.8e-05 16.4 0.5 1 1 2.5e-06 0.00012 14.3 0.0 13 39 157 182 153 184 0.84 # 66479 # 67453 # -1 # ID=1_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.448 1_25 - 71 HTH_24 PF13412.1 48 0.00061 12.1 0.1 1 2 0.017 0.83 2.0 0.0 7 19 8 22 7 24 0.84 # 14866 # 15078 # -1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 1_25 - 71 HTH_24 PF13412.1 48 0.00061 12.1 0.1 2 2 0.00021 0.01 8.2 0.0 21 48 28 55 25 55 0.95 # 14866 # 15078 # -1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 1_78 - 158 TIGR03534 TIGR03534 253 0.0013 10.8 0.0 1 1 0.00012 0.011 7.7 0.0 146 238 11 91 3 105 0.70 # 62516 # 62989 # -1 # ID=1_78;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.582 1_96 - 346 HTH_33 PF13592.1 60 1.3e-09 30.4 0.2 1 1 5.2e-11 5.1e-09 28.5 0.2 3 46 108 151 107 155 0.94 # 78511 # 79548 # -1 # ID=1_96;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_95 - 323 DUF2075 PF09848.4 352 1.7e-06 20.0 0.1 1 1 5.2e-08 2.5e-06 19.5 0.1 2 97 41 138 40 165 0.71 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_65 - 113 DUF2075 PF09848.4 352 5.1e-05 15.2 0.0 1 1 1.3e-06 6.4e-05 14.8 0.0 4 30 81 107 78 112 0.78 # 53559 # 53897 # -1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_43 - 1754 UvrD_C_2 PF13538.1 104 3.1e-07 23.4 0.4 1 1 3.5e-08 3.4e-06 20.1 0.1 3 102 1337 1440 1335 1442 0.78 # 28066 # 33327 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.615 1_9 - 117 HTH_OrfB_IS605 PF12323.3 46 7.9e-19 59.7 0.0 1 1 1.3e-20 1.3e-18 59.0 0.0 1 45 1 45 1 46 0.98 # 6652 # 7002 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 1_95 - 323 T2SE PF00437.15 272 2.6e-06 19.3 0.7 1 1 1.3e-07 1.3e-05 17.1 0.7 110 161 22 72 6 137 0.81 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_95 - 323 NACHT PF05729.7 166 0.00047 12.7 0.2 1 1 1.1e-05 0.0011 11.5 0.2 1 28 41 68 41 140 0.77 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_95 - 323 UPF0079 PF02367.12 123 0.00011 14.7 0.0 1 1 2.2e-06 0.00021 13.8 0.0 3 45 28 70 26 114 0.84 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_95 - 323 AAA_17 PF13207.1 121 0.00014 15.5 0.1 1 1 3.4e-06 0.00033 14.4 0.0 1 40 42 89 42 186 0.63 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_95 - 323 TIGR02211 TIGR02211 221 0.00044 12.3 0.0 1 1 7.3e-06 0.00071 11.7 0.0 11 51 20 60 12 86 0.88 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_65 - 113 Pox_A32 PF04665.7 241 0.00056 12.1 0.0 1 1 8.3e-06 0.00081 11.6 0.0 7 40 72 105 67 108 0.90 # 53559 # 53897 # -1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_95 - 323 AAA_14 PF13173.1 128 4e-06 19.6 0.0 1 1 1.7e-07 1.7e-05 17.6 0.0 2 96 40 164 39 193 0.62 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_96 - 346 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.00023 13.2 0.4 1 1 2.3e-05 0.0011 11.0 0.4 18 49 30 62 26 62 0.79 # 78511 # 79548 # -1 # ID=1_96;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_94 - 555 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.00036 12.6 0.0 1 1 2.7e-05 0.0013 10.8 0.0 30 49 34 53 32 55 0.90 # 75700 # 77364 # 1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.556 1_95 - 323 AAA_33 PF13671.1 143 0.00016 14.5 0.0 1 1 3.7e-06 0.00035 13.3 0.0 1 45 42 100 42 132 0.60 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_65 - 113 ArgK PF03308.11 267 7.9e-05 14.3 0.0 1 1 9.5e-07 9.3e-05 14.1 0.0 22 59 71 108 56 111 0.85 # 53559 # 53897 # -1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_44 - 673 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 4.1e-12 38.2 0.0 1 1 1.7e-13 8.4e-12 37.2 0.0 276 392 393 505 363 541 0.81 # 33422 # 35440 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 1_60 - 883 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 0.00019 12.9 0.0 1 2 0.0019 0.093 4.0 0.0 105 185 533 607 470 622 0.85 # 49187 # 51835 # -1 # ID=1_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_60 - 883 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 0.00019 12.9 0.0 2 2 0.00033 0.016 6.6 0.0 321 378 713 769 665 771 0.93 # 49187 # 51835 # -1 # ID=1_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_90 - 372 TIGR00422 TIGR00422 863 0.013 5.9 17.3 1 1 0.00016 0.016 5.7 16.6 719 856 133 270 77 276 0.83 # 71690 # 72805 # -1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.582 1_96 - 346 HTH_17 PF12728.2 51 0.00012 15.2 0.3 1 2 4.3e-05 0.0042 10.3 0.0 2 45 41 90 40 92 0.87 # 78511 # 79548 # -1 # ID=1_96;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_96 - 346 HTH_17 PF12728.2 51 0.00012 15.2 0.3 2 2 0.031 3 1.1 0.0 13 25 127 139 122 153 0.86 # 78511 # 79548 # -1 # ID=1_96;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_63 - 74 Zn-ribbon_8 PF09723.5 42 5.2e-05 16.1 0.6 1 1 1e-06 9.8e-05 15.2 0.6 6 39 35 67 34 69 0.78 # 52691 # 52912 # -1 # ID=1_63;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 1_95 - 323 PIF1 PF05970.9 364 2.8e-05 16.0 0.0 1 1 6.3e-07 6.1e-05 14.9 0.0 7 127 27 149 23 167 0.68 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_93 - 187 TrmB PF01978.14 68 8.7e-05 15.1 0.0 1 1 1.8e-06 0.00017 14.1 0.0 21 45 157 181 148 184 0.88 # 75156 # 75716 # 1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.565 1_25 - 71 HTH_Crp_2 PF13545.1 76 0.00028 13.6 0.0 1 1 3.2e-06 0.00031 13.4 0.0 18 59 14 55 4 69 0.84 # 14866 # 15078 # -1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 1_89 - 170 RNase_T PF00929.19 164 4.3e-07 23.2 0.0 1 1 6.3e-09 6.1e-07 22.7 0.0 1 55 106 152 106 158 0.89 # 71188 # 71697 # -1 # ID=1_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.594 1_60 - 883 AAA_10 PF12846.2 304 1.3e-49 162.0 0.0 1 1 6.9e-51 2.2e-49 161.3 0.0 1 294 479 768 479 774 0.87 # 49187 # 51835 # -1 # ID=1_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_44 - 673 AAA_10 PF12846.2 304 4.8e-07 22.3 0.0 1 1 8.6e-07 2.8e-05 16.5 0.0 4 295 187 492 185 497 0.53 # 33422 # 35440 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 1_95 - 323 AAA_10 PF12846.2 304 9.8e-07 21.3 0.1 1 2 1.3e-05 0.00041 12.7 0.0 3 34 42 73 40 106 0.73 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_95 - 323 AAA_10 PF12846.2 304 9.8e-07 21.3 0.1 2 2 0.0019 0.062 5.5 0.0 216 245 120 150 79 207 0.83 # 77354 # 78322 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_90 - 372 AAA_13 PF13166.1 712 0.079 4.1 35.7 1 2 0.00079 0.076 4.2 28.7 273 455 74 262 53 280 0.68 # 71690 # 72805 # -1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.582 1_90 - 372 AAA_13 PF13166.1 712 0.079 4.1 35.7 2 2 0.0041 0.39 1.8 25.3 278 478 158 356 152 365 0.56 # 71690 # 72805 # -1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.582 1_84 - 402 AAA_31 PF13614.1 157 0.00044 13.1 0.1 1 2 0.071 6.9 -0.6 0.0 12 61 120 174 110 209 0.55 # 67453 # 68658 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 1_84 - 402 AAA_31 PF13614.1 157 0.00044 13.1 0.1 2 2 3.1e-05 0.003 10.3 0.0 108 147 235 273 231 279 0.86 # 67453 # 68658 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 1_25 - 71 FaeA PF04703.7 62 1.1e-22 72.9 0.0 1 1 1.4e-24 1.4e-22 72.6 0.0 3 60 7 69 5 70 0.92 # 14866 # 15078 # -1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 1_82 - 425 DNA_pol_lambd_f PF10391.4 52 0.00031 13.2 0.0 1 1 1e-05 0.001 11.5 0.0 5 29 183 207 179 218 0.85 # 65123 # 66397 # 1 # ID=1_82;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_43 - 1754 AAA_11 PF13086.1 236 0.00011 14.6 0.0 1 1 5.1e-06 0.00049 12.5 0.0 2 75 968 1038 967 1059 0.80 # 28066 # 33327 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.615 1_71 - 173 SSB PF00436.20 104 1.1e-42 137.1 0.4 1 1 1.5e-44 1.4e-42 136.7 0.4 1 103 6 112 6 113 0.96 # 57585 # 58103 # -1 # ID=1_71;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 1_86 - 314 Glyco_trans_4_3 PF12000.3 171 1.3e-05 17.7 0.1 1 2 0.00077 0.075 5.5 0.0 14 84 112 182 97 188 0.79 # 69073 # 70014 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 1_86 - 314 Glyco_trans_4_3 PF12000.3 171 1.3e-05 17.7 0.1 2 2 3.4e-05 0.0033 9.9 0.0 19 65 209 256 201 261 0.90 # 69073 # 70014 # 1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/dd3361b4-5290-495d-91d4-df9b059f7cba # Target file: checkm_output/bins/pm1253/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm1253/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/dd3361b4-5290-495d-91d4-df9b059f7cba checkm_output/bins/pm1253/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 09:38:36 2017 # [ok]