# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_81 - 388 KaiC PF06745.8 227 0.0007 11.5 0.0 1 1 1.4e-05 0.0012 10.7 0.0 11 59 144 191 137 201 0.76 # 60353 # 61516 # 1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_81 - 388 ABC_tran PF00005.22 137 0.0001 15.4 0.0 1 1 2.2e-06 0.0002 14.5 0.0 15 33 156 174 147 217 0.82 # 60353 # 61516 # 1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_81 - 388 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 9.5e-05 14.7 0.0 1 1 2.1e-06 0.00019 13.7 0.0 41 59 155 173 135 184 0.85 # 60353 # 61516 # 1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_32 - 492 2-Hacid_dh_C PF02826.14 178 1.2e-06 20.5 0.0 1 1 2.7e-08 2.4e-06 19.5 0.0 31 105 32 112 7 128 0.80 # 28833 # 30308 # 1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_81 - 388 MobB PF03205.9 140 0.00048 12.6 0.0 1 1 1e-05 0.00093 11.7 0.0 4 25 156 177 154 190 0.85 # 60353 # 61516 # 1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_31 - 301 MarR PF01047.17 59 0.00012 14.6 0.0 1 1 2.7e-06 0.00024 13.6 0.0 24 43 22 41 22 42 0.94 # 27655 # 28557 # -1 # ID=1_31;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 1_32 - 492 IlvN PF07991.7 165 3.6e-63 204.6 0.2 1 1 6.6e-65 5.9e-63 203.9 0.2 2 165 35 204 34 204 0.98 # 28833 # 30308 # 1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_32 - 492 NAD_binding_7 PF13241.1 103 1.6e-05 18.0 0.0 1 1 4.8e-07 4.3e-05 16.5 0.0 5 75 35 113 32 119 0.82 # 28833 # 30308 # 1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_46 - 83 HTH_8 PF02954.14 42 9.1e-06 18.0 0.1 1 1 1.8e-07 1.6e-05 17.2 0.1 18 36 14 32 13 33 0.92 # 40969 # 41217 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_4 - 1017 AAA_19 PF13245.1 76 0.00033 13.2 0.0 1 1 1.2e-05 0.001 11.6 0.0 14 32 492 509 481 523 0.86 # 1592 # 4642 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 1_31 - 301 Fe_dep_repress PF01325.14 60 0.0005 12.8 0.0 1 1 1.3e-05 0.0011 11.6 0.0 29 49 22 42 6 43 0.86 # 27655 # 28557 # -1 # ID=1_31;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 1_81 - 388 AAA_23 PF13476.1 202 2.2e-06 20.9 0.8 1 1 3.9e-08 3.5e-06 20.2 0.2 19 44 152 177 122 198 0.85 # 60353 # 61516 # 1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_19 - 145 eIF-1a PF01176.14 65 0.0004 12.6 0.1 1 1 7.6e-06 0.00069 11.8 0.1 29 63 55 88 52 89 0.85 # 19112 # 19546 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.582 1_32 - 492 F420_oxidored PF03807.12 96 0.00012 15.2 0.1 1 2 4.4e-05 0.0039 10.4 0.0 1 83 39 120 39 126 0.84 # 28833 # 30308 # 1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_32 - 492 F420_oxidored PF03807.12 96 0.00012 15.2 0.1 2 2 0.047 4.3 0.7 0.0 7 21 441 455 439 477 0.83 # 28833 # 30308 # 1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_76 - 122 CPSase_L_D3 PF02787.14 123 0.00073 12.1 0.1 1 1 1.2e-05 0.0011 11.6 0.1 50 96 45 91 21 101 0.79 # 56128 # 56493 # -1 # ID=1_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.415 1_81 - 388 SMC_N PF02463.14 220 0.00091 11.2 0.0 1 1 1.8e-05 0.0016 10.4 0.0 25 50 153 178 146 195 0.81 # 60353 # 61516 # 1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_11 - 696 TraG-D_C PF12696.2 128 0.00012 14.7 0.1 1 1 2.4e-06 0.00021 13.9 0.1 3 94 437 524 435 556 0.78 # 12352 # 14439 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 1_40 - 375 ACT PF01842.20 66 7.8e-05 14.9 0.3 1 2 0.034 3.1 0.3 0.0 13 27 232 246 231 246 0.91 # 36699 # 37823 # -1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.597 1_40 - 375 ACT PF01842.20 66 7.8e-05 14.9 0.3 2 2 1.1e-05 0.00099 11.4 0.0 7 27 319 339 316 339 0.93 # 36699 # 37823 # -1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.597 1_46 - 83 HTH_37 PF13744.1 80 3.9e-05 16.2 0.0 1 1 8.8e-07 7.9e-05 15.2 0.0 24 54 7 37 4 46 0.89 # 40969 # 41217 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_51 - 325 Hydantoinase_A PF01968.13 290 1e-07 24.1 3.6 1 2 5.2e-07 4.7e-05 15.3 0.1 67 96 158 186 140 193 0.83 # 43524 # 44498 # 1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 1_51 - 325 Hydantoinase_A PF01968.13 290 1e-07 24.1 3.6 2 2 3.1e-05 0.0028 9.5 0.1 212 265 248 301 191 322 0.76 # 43524 # 44498 # 1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 1_81 - 388 AAA_16 PF13191.1 185 0.00057 12.6 0.0 1 1 1.2e-05 0.0011 11.7 0.0 25 50 153 178 141 211 0.84 # 60353 # 61516 # 1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_81 - 388 AAA_22 PF13401.1 131 3.8e-06 19.9 0.0 1 1 1.9e-07 8.7e-06 18.7 0.0 4 30 152 178 149 243 0.84 # 60353 # 61516 # 1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_4 - 1017 AAA_22 PF13401.1 131 0.00034 13.5 0.0 1 1 2.4e-05 0.0011 11.9 0.0 8 69 492 557 486 594 0.67 # 1592 # 4642 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 1_62 - 287 Methyltransf_27 PF13708.1 194 5.5e-69 224.3 0.0 1 1 1e-70 9.2e-69 223.6 0.0 2 194 89 282 88 282 0.98 # 49628 # 50488 # 1 # ID=1_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.524 1_81 - 388 AAA_29 PF13555.1 62 7.6e-06 18.2 0.1 1 1 2e-07 1.8e-05 17.0 0.1 25 43 154 172 146 175 0.84 # 60353 # 61516 # 1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_31 - 301 HTH_1 PF00126.22 60 2e-24 77.9 0.5 1 1 4.5e-26 4e-24 77.0 0.5 1 60 3 62 3 62 0.98 # 27655 # 28557 # -1 # ID=1_31;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 1_28 - 398 adh_short_C2 PF13561.1 241 0.00036 13.1 0.0 1 2 2.6e-05 0.0023 10.4 0.0 2 86 49 144 48 169 0.72 # 24488 # 25681 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.536 1_28 - 398 adh_short_C2 PF13561.1 241 0.00036 13.1 0.0 2 2 0.038 3.4 0.1 0.0 122 189 213 281 203 299 0.71 # 24488 # 25681 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.536 1_46 - 83 HTH_3 PF01381.17 55 1.7e-09 30.2 0.1 1 1 9.3e-11 2.8e-09 29.5 0.1 4 45 9 50 6 56 0.86 # 40969 # 41217 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_60 - 89 HTH_3 PF01381.17 55 1e-06 21.4 0.0 1 1 4.2e-08 1.3e-06 21.0 0.0 8 36 41 69 33 78 0.88 # 48433 # 48699 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 1_55 - 160 HTH_3 PF01381.17 55 8.2e-05 15.2 0.2 1 2 0.0022 0.065 5.9 0.0 2 20 15 33 14 37 0.91 # 46134 # 46613 # 1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.548 1_55 - 160 HTH_3 PF01381.17 55 8.2e-05 15.2 0.2 2 2 0.00099 0.03 7.0 0.0 1 23 96 118 96 120 0.89 # 46134 # 46613 # 1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.548 1_60 - 89 HTH_23 PF13384.1 50 6.3e-06 18.6 0.0 1 1 2.1e-07 9.6e-06 18.0 0.0 16 39 38 64 33 68 0.83 # 48433 # 48699 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 1_46 - 83 HTH_23 PF13384.1 50 4e-05 16.0 0.0 1 1 1.7e-06 7.9e-05 15.1 0.0 15 34 10 31 6 40 0.81 # 40969 # 41217 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_32 - 492 GFO_IDH_MocA PF01408.17 120 0.00069 12.9 0.0 1 1 1.5e-05 0.0013 12.0 0.0 2 80 39 116 38 122 0.78 # 28833 # 30308 # 1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_46 - 83 HTH_19 PF12844.2 64 3.6e-08 26.2 0.0 1 1 1.2e-09 5.2e-08 25.7 0.0 8 45 10 47 8 56 0.86 # 40969 # 41217 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_60 - 89 HTH_19 PF12844.2 64 7.6e-05 15.5 0.0 1 1 2.3e-06 0.0001 15.1 0.0 4 39 33 69 30 73 0.85 # 48433 # 48699 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 1_32 - 492 IlvC PF01450.14 145 1.7e-58 189.5 0.5 1 2 3.4e-21 3.1e-19 62.1 0.0 1 128 210 337 210 345 0.91 # 28833 # 30308 # 1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_32 - 492 IlvC PF01450.14 145 1.7e-58 189.5 0.5 2 2 1.1e-40 9.8e-39 125.3 0.2 15 145 359 485 349 485 0.93 # 28833 # 30308 # 1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_32 - 492 ApbA PF02558.11 151 9.4e-05 14.6 0.0 1 1 1.8e-06 0.00016 13.9 0.0 1 95 40 126 40 153 0.81 # 28833 # 30308 # 1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_32 - 492 AdoHcyase_NAD PF00670.16 162 0.00014 14.5 0.0 1 1 3.5e-06 0.00032 13.3 0.0 21 120 35 141 26 165 0.69 # 28833 # 30308 # 1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_11 - 696 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.7e-06 19.6 0.9 1 3 1.7e-05 0.0015 9.8 0.0 16 36 134 154 125 158 0.88 # 12352 # 14439 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 1_11 - 696 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.7e-06 19.6 0.9 2 3 9.3e-05 0.0084 7.4 0.1 93 140 235 281 229 303 0.80 # 12352 # 14439 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 1_11 - 696 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.7e-06 19.6 0.9 3 3 0.083 7.4 -2.3 0.0 293 323 482 512 405 546 0.58 # 12352 # 14439 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 1_4 - 1017 AAA_18 PF13238.1 129 4.9e-05 16.4 0.1 1 1 4.2e-06 0.00037 13.6 0.0 2 19 492 509 492 562 0.79 # 1592 # 4642 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 1_20 - 435 IMS_HHH PF11798.3 32 0.0003 13.6 0.1 1 1 1e-05 0.00091 12.1 0.1 14 32 194 212 183 212 0.85 # 19495 # 20799 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 1_28 - 398 Eno-Rase_FAD_bd PF07055.7 65 1.8e-33 107.1 1.5 1 1 3.4e-35 3.1e-33 106.4 1.5 2 65 323 386 322 386 0.98 # 24488 # 25681 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.536 1_81 - 388 DUF87 PF01935.12 229 8.4e-05 15.2 0.0 1 1 1.8e-06 0.00016 14.2 0.0 28 45 157 174 155 188 0.89 # 60353 # 61516 # 1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_60 - 89 HTH_28 PF13518.1 52 5.6e-05 15.9 0.0 1 1 1.7e-06 7.8e-05 15.4 0.0 7 34 34 64 33 68 0.82 # 48433 # 48699 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 1_46 - 83 HTH_28 PF13518.1 52 0.00038 13.3 0.1 1 1 1.8e-05 0.00082 12.2 0.1 8 29 8 31 6 35 0.78 # 40969 # 41217 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_31 - 301 HTH_24 PF13412.1 48 0.00055 12.1 0.0 1 1 1.7e-05 0.0015 10.7 0.0 24 44 22 42 22 42 0.91 # 27655 # 28557 # -1 # ID=1_31;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 1_31 - 301 HTH_30 PF13556.1 59 2.7e-06 19.7 0.1 1 1 5.8e-08 5.2e-06 18.8 0.1 9 46 12 49 3 58 0.82 # 27655 # 28557 # -1 # ID=1_31;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 1_81 - 388 Miro PF08477.8 119 0.00085 12.6 0.0 1 1 2.1e-05 0.0019 11.5 0.0 4 28 157 186 156 220 0.72 # 60353 # 61516 # 1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_46 - 83 HTH_31 PF13560.1 64 1.7e-09 30.6 0.9 1 1 7.4e-11 2.2e-09 30.2 0.9 9 56 9 55 6 72 0.90 # 40969 # 41217 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_55 - 160 HTH_31 PF13560.1 64 1.3e-07 24.5 1.6 1 2 0.0036 0.11 5.6 0.1 6 33 14 41 12 47 0.88 # 46134 # 46613 # 1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.548 1_55 - 160 HTH_31 PF13560.1 64 1.3e-07 24.5 1.6 2 2 4.5e-07 1.3e-05 18.1 0.3 4 39 94 129 91 135 0.88 # 46134 # 46613 # 1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.548 1_60 - 89 HTH_31 PF13560.1 64 1.8e-06 20.9 0.0 1 1 8.4e-08 2.5e-06 20.4 0.0 2 42 29 69 28 80 0.84 # 48433 # 48699 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 1_4 - 1017 DUF2075 PF09848.4 352 0.00033 12.4 0.0 1 1 1e-05 0.00094 10.9 0.0 5 22 492 509 489 526 0.84 # 1592 # 4642 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 1_81 - 388 T2SE PF00437.15 272 1.9e-23 75.4 0.0 1 1 3.4e-25 3e-23 74.8 0.0 11 269 24 303 15 306 0.78 # 60353 # 61516 # 1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_51 - 325 StbA PF06406.6 318 2.9e-157 515.2 0.2 1 1 3.7e-159 3.3e-157 515.1 0.2 1 318 1 322 1 322 0.99 # 43524 # 44498 # 1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 1_81 - 388 NACHT PF05729.7 166 0.00031 13.2 0.0 1 1 6.6e-06 0.0006 12.3 0.0 4 29 156 181 154 188 0.83 # 60353 # 61516 # 1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_4 - 1017 AAA_17 PF13207.1 121 4.1e-05 17.2 0.0 1 1 2.9e-06 0.00026 14.6 0.0 3 28 492 523 492 587 0.67 # 1592 # 4642 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 1_81 - 388 AAA_25 PF13481.1 194 5.1e-06 18.8 0.0 1 1 1.1e-07 1e-05 17.8 0.0 25 53 144 172 122 178 0.89 # 60353 # 61516 # 1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_69 - 147 RepA_N PF06970.6 76 0.00076 12.1 0.0 1 1 1.7e-05 0.0015 11.1 0.0 15 44 56 85 54 90 0.92 # 52941 # 53381 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 1_51 - 325 Hydant_A_N PF05378.8 176 0.0009 11.5 3.9 1 4 0.08 7.2 -1.2 0.0 1 19 2 20 2 48 0.82 # 43524 # 44498 # 1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 1_51 - 325 Hydant_A_N PF05378.8 176 0.0009 11.5 3.9 2 4 0.049 4.5 -0.5 0.0 108 154 38 86 15 103 0.67 # 43524 # 44498 # 1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 1_51 - 325 Hydant_A_N PF05378.8 176 0.0009 11.5 3.9 3 4 0.057 5.1 -0.7 0.0 95 129 113 147 89 153 0.76 # 43524 # 44498 # 1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 1_51 - 325 Hydant_A_N PF05378.8 176 0.0009 11.5 3.9 4 4 3.6e-05 0.0033 9.7 0.2 2 51 170 217 169 226 0.82 # 43524 # 44498 # 1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 1_60 - 89 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.00033 12.6 0.0 1 1 5e-06 0.00045 12.2 0.0 19 49 35 64 33 65 0.91 # 48433 # 48699 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 1_60 - 89 CENP-B_N PF04218.8 53 0.0013 11.0 0.0 1 1 1.9e-05 0.0017 10.6 0.0 24 49 44 69 34 72 0.88 # 48433 # 48699 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 1_81 - 388 Ribosomal_S5 PF00333.15 67 2.8e-05 16.6 0.1 1 2 0.00093 0.083 5.5 0.0 26 45 84 103 77 114 0.83 # 60353 # 61516 # 1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_81 - 388 Ribosomal_S5 PF00333.15 67 2.8e-05 16.6 0.1 2 2 0.00012 0.01 8.4 0.0 21 54 242 274 230 278 0.91 # 60353 # 61516 # 1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_81 - 388 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00099 12.1 0.0 1 1 2.5e-05 0.0022 10.9 0.0 3 26 157 180 156 197 0.81 # 60353 # 61516 # 1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_28 - 398 Eno-Rase_NADH_b PF12242.3 78 9.2e-41 130.4 0.7 1 1 2.4e-42 2.2e-40 129.2 0.7 1 77 2 79 2 80 0.98 # 24488 # 25681 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.536 1_39 - 236 Mor PF08765.6 108 1e-07 24.5 0.0 1 2 0.01 0.93 2.1 0.0 28 56 109 137 97 148 0.82 # 35910 # 36617 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 1_39 - 236 Mor PF08765.6 108 1e-07 24.5 0.0 2 2 3e-08 2.7e-06 19.9 0.0 32 98 151 226 142 231 0.88 # 35910 # 36617 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 1_60 - 89 Phage_CII PF05269.6 91 0.00065 12.5 0.0 1 1 9.2e-06 0.00083 12.2 0.0 17 45 36 64 32 81 0.83 # 48433 # 48699 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 1_81 - 388 ATP_bind_1 PF03029.12 238 0.00073 11.8 0.0 1 1 1.3e-05 0.0012 11.2 0.0 1 25 157 181 157 191 0.84 # 60353 # 61516 # 1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_85 - 66 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 0.00024 13.9 0.0 1 1 2.8e-06 0.00025 13.8 0.0 29 64 18 52 5 58 0.83 # 65575 # 65772 # -1 # ID=1_85;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.449 1_60 - 89 HTH_26 PF13443.1 63 0.00024 14.1 0.0 1 1 3.6e-06 0.00032 13.7 0.0 11 47 43 78 33 82 0.90 # 48433 # 48699 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 1_31 - 301 MarR_2 PF12802.2 62 9.3e-05 14.9 0.1 1 1 2.9e-06 0.00026 13.4 0.1 28 47 22 41 22 42 0.95 # 27655 # 28557 # -1 # ID=1_31;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 1_60 - 89 HTH_Crp_2 PF13545.1 76 0.00041 12.9 0.0 1 1 6.6e-06 0.00059 12.4 0.0 26 50 40 64 32 65 0.88 # 48433 # 48699 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 1_4 - 1017 AAA_10 PF12846.2 304 6.8e-42 136.6 0.0 1 1 4.6e-43 1.4e-41 135.6 0.0 5 297 492 884 489 889 0.94 # 1592 # 4642 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 1_11 - 696 AAA_10 PF12846.2 304 5.7e-10 31.8 0.0 1 1 2.8e-11 8.4e-10 31.2 0.0 2 292 134 503 133 514 0.76 # 12352 # 14439 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 1_81 - 388 AAA_10 PF12846.2 304 1.1e-06 21.0 0.0 1 1 2.1e-07 6.3e-06 18.5 0.0 2 27 153 178 152 196 0.74 # 60353 # 61516 # 1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_31 - 301 HTH_20 PF12840.2 61 0.00015 14.3 1.0 1 3 0.00012 0.011 8.4 0.2 19 50 10 41 3 44 0.85 # 27655 # 28557 # -1 # ID=1_31;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 1_31 - 301 HTH_20 PF12840.2 61 0.00015 14.3 1.0 2 3 0.08 7.2 -0.7 0.0 21 40 51 71 46 84 0.72 # 27655 # 28557 # -1 # ID=1_31;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 1_31 - 301 HTH_20 PF12840.2 61 0.00015 14.3 1.0 3 3 0.0072 0.65 2.7 0.0 10 22 200 211 195 231 0.77 # 27655 # 28557 # -1 # ID=1_31;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 1_28 - 398 Enoyl_reductase PF12241.3 237 2.1e-117 382.9 0.1 1 1 2.9e-119 2.6e-117 382.6 0.1 2 237 82 317 81 317 0.99 # 24488 # 25681 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.536 1_72 - 145 SSB PF00436.20 104 6.6e-32 102.3 0.2 1 1 8.4e-34 7.6e-32 102.1 0.2 2 103 7 111 6 112 0.96 # 54157 # 54591 # 1 # ID=1_72;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_81 - 388 GTP_EFTU PF00009.22 188 0.00098 11.3 0.0 1 1 2e-05 0.0018 10.5 0.0 8 34 157 183 155 195 0.87 # 60353 # 61516 # 1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/ee5797b5-b170-4f9a-9470-a4650fda0449 # Target file: checkm_output/bins/pm1180/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm1180/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/ee5797b5-b170-4f9a-9470-a4650fda0449 checkm_output/bins/pm1180/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 09:36:41 2017 # [ok]