# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_21 - 441 K_oxygenase PF13434.1 341 2.8e-117 384.4 0.0 1 1 3e-119 3.3e-117 384.2 0.0 1 340 2 332 2 333 0.96 # 19278 # 20600 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 1_87 - 242 HTH_IclR PF09339.5 52 2.6e-06 20.0 0.3 1 1 1.6e-07 8.9e-06 18.3 0.3 14 48 43 76 35 78 0.87 # 96382 # 97107 # -1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.665 1_19 - 323 HTH_IclR PF09339.5 52 0.00028 13.5 0.2 1 1 1.5e-05 0.00085 12.0 0.2 9 40 150 181 150 182 0.94 # 15562 # 16530 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.557 1_83 - 240 HTH_41 PF14502.1 48 3.3e-05 16.5 0.0 1 1 8.2e-07 9.2e-05 15.1 0.0 11 38 31 58 25 61 0.91 # 91871 # 92590 # 1 # ID=1_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 1_56 - 253 ABC_tran PF00005.22 137 1.6e-35 115.5 0.0 1 1 1.8e-37 2e-35 115.1 0.0 1 137 18 167 18 167 0.97 # 68569 # 69327 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.623 1_38 - 257 DDR PF08841.5 332 0.00051 11.9 0.0 1 1 6.9e-06 0.00077 11.4 0.0 253 296 77 120 64 132 0.88 # 45629 # 46399 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_19 - 323 HTH_AsnC-type PF13404.1 42 0.00027 13.5 0.5 1 3 3.9e-05 0.0043 9.7 0.1 14 39 156 181 154 183 0.89 # 15562 # 16530 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.557 1_19 - 323 HTH_AsnC-type PF13404.1 42 0.00027 13.5 0.5 2 3 0.073 8.1 -0.8 0.0 28 40 240 252 238 253 0.85 # 15562 # 16530 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.557 1_19 - 323 HTH_AsnC-type PF13404.1 42 0.00027 13.5 0.5 3 3 0.072 8 -0.8 0.1 2 8 307 313 307 318 0.92 # 15562 # 16530 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.557 1_6 - 260 HTH_DeoR PF08220.7 57 3.2e-05 16.5 0.2 1 1 1.1e-06 5.8e-05 15.7 0.2 1 43 34 77 31 86 0.87 # 4118 # 4897 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.562 1_83 - 240 HTH_DeoR PF08220.7 57 5.1e-05 15.9 0.0 1 1 2.3e-06 0.00013 14.6 0.0 19 49 31 61 29 69 0.84 # 91871 # 92590 # 1 # ID=1_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 1_49 - 1054 Helicase_C PF00271.26 78 1.7e-08 27.4 0.0 1 1 4.3e-10 4.7e-08 25.9 0.0 36 77 884 926 866 927 0.85 # 56497 # 59658 # -1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.587 1_28 - 94 HTH_38 PF13936.1 44 0.00054 12.6 0.0 1 1 1.6e-05 0.0009 11.9 0.0 17 36 22 41 16 44 0.92 # 27386 # 27667 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.624 1_19 - 323 HTH_38 PF13936.1 44 0.00071 12.2 1.6 1 1 0.0002 0.011 8.4 1.6 12 34 151 173 124 181 0.87 # 15562 # 16530 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.557 1_48 - 225 TIGR01830 TIGR01830 239 1.9e-15 49.9 0.1 1 1 2.4e-17 2.6e-15 49.5 0.1 2 186 7 184 6 198 0.77 # 55816 # 56490 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.593 1_75 - 135 Ribosomal_S11 PF00411.14 110 0.0011 12.2 0.0 1 1 1.3e-05 0.0014 11.9 0.0 69 107 72 110 40 112 0.80 # 83885 # 84289 # 1 # ID=1_75;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.573 1_7 - 172 HTH_34 PF13601.1 80 4.2e-05 16.6 0.0 1 1 2.1e-06 7.7e-05 15.8 0.0 33 74 50 87 44 89 0.77 # 4845 # 5360 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.605 1_73 - 111 HTH_34 PF13601.1 80 0.00022 14.3 0.0 1 1 8.9e-06 0.00033 13.8 0.0 2 44 17 59 16 66 0.89 # 82138 # 82470 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.601 1_87 - 242 HTH_34 PF13601.1 80 0.00097 12.3 0.1 1 1 0.00064 0.024 7.8 0.0 2 47 34 79 33 88 0.92 # 96382 # 97107 # -1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.665 1_73 - 111 MarR PF01047.17 59 9.3e-05 15.2 0.1 1 1 2.8e-06 0.00016 14.5 0.1 11 48 23 60 15 65 0.89 # 82138 # 82470 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.601 1_87 - 242 MarR PF01047.17 59 0.00054 12.8 0.0 1 1 2.7e-05 0.0015 11.3 0.0 10 47 39 76 32 77 0.84 # 96382 # 97107 # -1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.665 1_105 - 204 HTH_Tnp_4 PF13613.1 53 0.00022 13.8 0.5 1 1 4.7e-06 0.00052 12.6 0.1 19 49 38 68 37 72 0.81 # 110531 # 111142 # -1 # ID=1_105;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.541 1_21 - 441 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 1.2e-19 64.2 0.0 1 2 1.6e-18 1.8e-16 53.8 0.0 73 201 87 218 55 220 0.82 # 19278 # 20600 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 1_21 - 441 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 1.2e-19 64.2 0.0 2 2 0.00012 0.014 8.5 0.0 99 144 289 337 229 366 0.73 # 19278 # 20600 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 1_105 - 204 TetR_N PF00440.18 47 2.9e-15 48.8 0.0 1 1 8.9e-17 4.9e-15 48.0 0.0 1 44 23 66 23 68 0.95 # 110531 # 111142 # -1 # ID=1_105;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.541 1_100 - 197 TetR_N PF00440.18 47 7e-14 44.4 0.2 1 1 2.3e-15 1.3e-13 43.5 0.2 1 46 26 71 26 72 0.96 # 106118 # 106708 # -1 # ID=1_100;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.641 1_18 - 390 CbiA PF01656.18 195 2.5e-21 69.0 0.0 1 1 4.7e-23 5.2e-21 67.9 0.0 1 143 111 293 111 324 0.74 # 14357 # 15526 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.550 1_19 - 323 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 3.3e-05 16.4 0.1 1 1 2.9e-06 0.00016 14.2 0.1 26 50 159 183 155 185 0.93 # 15562 # 16530 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.557 1_93 - 248 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00088 11.8 0.0 1 1 4.5e-05 0.0025 10.4 0.0 27 46 4 23 4 26 0.88 # 101256 # 101999 # -1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 1_15 - 338 Rep_3 PF01051.16 222 7.5e-36 116.8 0.4 1 1 8.2e-38 9.1e-36 116.5 0.4 3 215 25 278 23 284 0.94 # 12492 # 13505 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.548 1_82 - 98 zf-ribbon_3 PF13248.1 26 2.4e-08 26.1 1.5 1 1 4.1e-10 4.5e-08 25.2 1.5 2 25 3 26 2 27 0.93 # 91382 # 91675 # 1 # ID=1_82;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.480 1_87 - 242 Fe_dep_repress PF01325.14 60 0.00023 14.2 0.0 1 1 3.8e-06 0.00042 13.3 0.0 24 53 48 77 41 82 0.90 # 96382 # 97107 # -1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.665 1_93 - 248 Terminase_5 PF06056.7 58 3.6e-07 22.8 0.0 1 2 9.5e-08 1.1e-05 18.1 0.0 14 38 4 28 2 30 0.96 # 101256 # 101999 # -1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 1_93 - 248 Terminase_5 PF06056.7 58 3.6e-07 22.8 0.0 2 2 0.013 1.4 1.7 0.0 6 27 182 203 180 206 0.84 # 101256 # 101999 # -1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 1_56 - 253 AAA_23 PF13476.1 202 0.0012 12.2 0.1 1 1 1.9e-05 0.0021 11.5 0.1 25 37 34 46 29 51 0.88 # 68569 # 69327 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.623 1_88 - 133 ACT_7 PF13840.1 65 0.00082 12.0 0.0 1 2 0.0052 0.58 2.9 0.0 19 38 10 29 4 59 0.68 # 97080 # 97478 # -1 # ID=1_88;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.591 1_88 - 133 ACT_7 PF13840.1 65 0.00082 12.0 0.0 2 2 0.00027 0.03 7.0 0.0 21 41 80 100 60 121 0.80 # 97080 # 97478 # -1 # ID=1_88;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.591 1_56 - 253 SMC_N PF02463.14 220 4.6e-06 19.0 0.2 1 1 3.6e-07 4e-05 16.0 0.2 28 186 32 184 14 208 0.69 # 68569 # 69327 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.623 1_93 - 248 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 3.5e-06 20.0 0.3 1 1 2.5e-07 2.8e-05 17.1 0.0 24 52 4 31 2 49 0.80 # 101256 # 101999 # -1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 1_18 - 390 MipZ PF09140.6 261 4.6e-07 22.2 0.2 1 2 2.2e-05 0.0025 9.9 0.0 2 53 110 166 109 190 0.73 # 14357 # 15526 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.550 1_18 - 390 MipZ PF09140.6 261 4.6e-07 22.2 0.2 2 2 2e-05 0.0022 10.1 0.1 90 135 236 281 222 287 0.89 # 14357 # 15526 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.550 1_88 - 133 ACT PF01842.20 66 3.9e-09 28.9 0.3 1 2 2.2e-05 0.0024 10.5 0.0 5 26 6 27 2 31 0.87 # 97080 # 97478 # -1 # ID=1_88;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.591 1_88 - 133 ACT PF01842.20 66 3.9e-09 28.9 0.3 2 2 4.4e-07 4.8e-05 15.9 0.0 8 30 77 99 71 123 0.77 # 97080 # 97478 # -1 # ID=1_88;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.591 1_19 - 323 Trp_repressor PF01371.14 88 1.7e-05 17.8 0.5 1 1 3.2e-07 3.5e-05 16.8 0.5 15 69 126 179 116 187 0.85 # 15562 # 16530 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.557 1_56 - 253 AAA_21 PF13304.1 303 5e-16 52.5 0.1 1 2 5.8e-10 6.4e-08 25.9 0.1 4 28 33 59 31 80 0.74 # 68569 # 69327 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.623 1_56 - 253 AAA_21 PF13304.1 303 5e-16 52.5 0.1 2 2 1.2e-09 1.3e-07 24.9 0.0 220 285 122 184 84 216 0.76 # 68569 # 69327 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.623 1_28 - 94 Sigma70_r4 PF04545.11 50 7.7e-06 18.3 0.1 1 1 1.4e-07 1.5e-05 17.3 0.1 4 36 9 41 7 48 0.79 # 27386 # 27667 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.624 1_38 - 257 AAA PF00004.24 132 3.3e-07 23.6 0.0 1 1 6.1e-09 6.7e-07 22.6 0.0 2 96 68 161 67 198 0.75 # 45629 # 46399 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_28 - 94 HTH_37 PF13744.1 80 4.1e-08 26.1 0.1 1 1 9.4e-10 5.2e-08 25.7 0.1 25 74 19 67 7 70 0.91 # 27386 # 27667 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.624 1_19 - 323 HTH_37 PF13744.1 80 0.00096 12.1 3.0 1 1 1.5e-05 0.00085 12.2 0.6 27 53 155 181 127 191 0.88 # 15562 # 16530 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.557 1_83 - 240 Rrf2 PF02082.15 83 4.2e-05 16.7 0.0 1 1 7.5e-07 8.3e-05 15.8 0.0 27 66 28 65 11 73 0.85 # 91871 # 92590 # 1 # ID=1_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 1_87 - 242 HTH_27 PF13463.1 68 4.3e-06 20.1 0.1 1 1 3e-07 1.7e-05 18.2 0.0 7 63 36 88 31 89 0.81 # 96382 # 97107 # -1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.665 1_73 - 111 HTH_27 PF13463.1 68 3.4e-05 17.2 0.1 1 1 8.3e-07 4.6e-05 16.8 0.1 23 66 34 74 16 75 0.88 # 82138 # 82470 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.601 1_93 - 248 MerR_1 PF13411.1 69 1.2e-21 69.3 0.0 1 1 1.7e-23 1.9e-21 68.7 0.0 1 68 4 72 4 73 0.98 # 101256 # 101999 # -1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 1_28 - 94 HTH_25 PF13413.1 62 0.00084 12.1 0.1 1 1 1e-05 0.0011 11.7 0.1 6 33 21 48 16 57 0.90 # 27386 # 27667 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.624 1_38 - 257 AAA_16 PF13191.1 185 1.3e-06 21.5 0.1 1 2 3.1e-07 1.7e-05 17.9 0.0 7 51 50 91 45 107 0.76 # 45629 # 46399 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_38 - 257 AAA_16 PF13191.1 185 1.3e-06 21.5 0.1 2 2 0.044 2.4 1.1 0.0 126 166 107 149 96 166 0.68 # 45629 # 46399 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_56 - 253 AAA_16 PF13191.1 185 5.5e-05 16.2 1.5 1 1 3e-06 0.00017 14.7 1.5 24 63 28 67 15 206 0.77 # 68569 # 69327 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.623 1_38 - 257 AAA_22 PF13401.1 131 4.3e-05 16.7 0.0 1 1 1.6e-06 0.00018 14.7 0.0 5 30 65 90 61 161 0.72 # 45629 # 46399 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_56 - 253 AAA_29 PF13555.1 62 4.8e-05 15.9 0.1 1 1 8.4e-07 9.3e-05 15.0 0.1 22 40 27 45 16 54 0.82 # 68569 # 69327 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.623 1_102 - 300 HTH_1 PF00126.22 60 4.8e-22 70.6 0.4 1 1 8.1e-24 8.9e-22 69.7 0.4 1 60 7 66 7 66 0.97 # 107252 # 108151 # 1 # ID=1_102;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 1_48 - 225 adh_short_C2 PF13561.1 241 4.5e-11 36.0 0.1 1 1 4.8e-13 5.4e-11 35.7 0.1 5 183 12 181 9 202 0.82 # 55816 # 56490 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.593 1_48 - 225 adh_short PF00106.20 167 5.5e-19 61.7 3.2 1 1 8.6e-21 9.5e-19 61.0 3.2 2 163 5 160 4 164 0.86 # 55816 # 56490 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.593 1_83 - 240 GntR PF00392.16 64 2.5e-15 48.8 0.0 1 1 8.9e-17 4.9e-15 47.8 0.0 2 62 4 64 3 66 0.94 # 91871 # 92590 # 1 # ID=1_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 1_70 - 445 GntR PF00392.16 64 1e-13 43.6 0.1 1 2 1.8e-15 1e-13 43.6 0.1 2 64 5 67 4 67 0.95 # 78829 # 80163 # -1 # ID=1_70;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.635 1_70 - 445 GntR PF00392.16 64 1e-13 43.6 0.1 2 2 0.046 2.6 0.7 0.3 41 54 104 117 100 122 0.81 # 78829 # 80163 # -1 # ID=1_70;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.635 1_28 - 94 HTH_3 PF01381.17 55 2.1e-15 49.5 0.0 1 1 2.8e-17 3.1e-15 48.9 0.0 5 53 21 69 20 70 0.95 # 27386 # 27667 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.624 1_48 - 225 Epimerase PF01370.16 236 5.7e-08 25.5 0.5 1 2 9.5e-10 1.1e-07 24.6 0.4 1 121 6 135 6 166 0.66 # 55816 # 56490 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.593 1_48 - 225 Epimerase PF01370.16 236 5.7e-08 25.5 0.5 2 2 0.083 9.2 -1.4 0.0 63 63 167 167 135 215 0.51 # 55816 # 56490 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.593 1_93 - 248 HTH_23 PF13384.1 50 1.2e-05 18.0 1.5 1 1 1.7e-06 3.2e-05 16.6 0.0 18 41 4 27 4 39 0.86 # 101256 # 101999 # -1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 1_28 - 94 HTH_23 PF13384.1 50 1.3e-05 17.8 0.0 1 1 9.2e-07 1.7e-05 17.5 0.0 15 37 23 45 13 65 0.88 # 27386 # 27667 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.624 1_105 - 204 HTH_23 PF13384.1 50 2.2e-05 17.1 0.0 1 1 3.2e-06 5.9e-05 15.8 0.0 9 42 27 63 20 69 0.80 # 110531 # 111142 # -1 # ID=1_105;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.541 1_19 - 323 HTH_23 PF13384.1 50 0.00036 13.3 0.0 1 1 6.1e-05 0.0011 11.7 0.0 13 40 153 182 150 187 0.82 # 15562 # 16530 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.557 1_83 - 240 HTH_23 PF13384.1 50 0.00042 13.1 0.0 1 2 0.0015 0.028 7.3 0.0 21 41 30 50 24 58 0.84 # 91871 # 92590 # 1 # ID=1_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 1_83 - 240 HTH_23 PF13384.1 50 0.00042 13.1 0.0 2 2 0.039 0.71 2.8 0.0 5 29 87 110 85 115 0.84 # 91871 # 92590 # 1 # ID=1_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 1_6 - 260 HTH_23 PF13384.1 50 0.0009 12.0 1.1 1 1 0.00037 0.0069 9.2 0.2 4 36 32 67 28 74 0.84 # 4118 # 4897 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.562 1_18 - 390 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.001 11.3 0.0 1 1 1.7e-05 0.0019 10.4 0.0 8 74 117 188 110 197 0.77 # 14357 # 15526 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.550 1_6 - 260 HTH_7 PF02796.10 45 0.00072 12.5 0.1 1 1 1.9e-05 0.0021 11.0 0.1 19 40 46 67 28 70 0.84 # 4118 # 4897 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.562 1_28 - 94 HTH_19 PF12844.2 64 8.6e-09 28.5 0.0 1 1 1.1e-10 1.2e-08 28.0 0.0 7 53 20 66 19 69 0.93 # 27386 # 27667 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.624 1_44 - 267 zinc_ribbon_4 PF13717.1 36 0.0013 11.6 0.9 1 1 2.7e-05 0.0029 10.4 0.9 1 17 1 17 1 28 0.85 # 51881 # 52681 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 1_48 - 225 NAD_binding_10 PF13460.1 183 4.7e-10 32.8 1.0 1 1 5.9e-12 6.6e-10 32.3 1.0 1 79 6 89 6 207 0.66 # 55816 # 56490 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.593 1_73 - 111 HTH_29 PF13551.1 112 1.5e-06 21.5 0.3 1 1 1.7e-08 1.9e-06 21.1 0.3 3 90 20 98 19 107 0.87 # 82138 # 82470 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.601 1_21 - 441 NAD_binding_9 PF13454.1 156 6.8e-07 22.2 3.9 1 4 2.2e-05 0.0025 10.7 0.1 61 154 63 149 39 151 0.65 # 19278 # 20600 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 1_21 - 441 NAD_binding_9 PF13454.1 156 6.8e-07 22.2 3.9 2 4 0.018 2 1.2 0.1 2 24 185 206 184 222 0.79 # 19278 # 20600 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 1_21 - 441 NAD_binding_9 PF13454.1 156 6.8e-07 22.2 3.9 3 4 0.00025 0.027 7.3 0.0 122 155 293 331 270 332 0.77 # 19278 # 20600 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 1_21 - 441 NAD_binding_9 PF13454.1 156 6.8e-07 22.2 3.9 4 4 0.029 3.2 0.6 0.0 40 78 392 425 369 440 0.72 # 19278 # 20600 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 1_93 - 248 MerR_2 PF13591.1 84 2e-05 17.2 0.0 1 1 3.4e-07 3.7e-05 16.4 0.0 2 51 5 56 4 58 0.88 # 101256 # 101999 # -1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 1_20 - 717 Plug PF07715.10 108 2.1e-22 72.6 1.9 1 1 5.5e-24 6.1e-22 71.1 1.9 3 107 28 129 26 130 0.95 # 17060 # 19210 # -1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.547 1_49 - 1054 ResIII PF04851.10 184 5.5e-06 19.4 0.1 1 2 7e-07 7.8e-05 15.6 0.0 4 86 15 106 5 136 0.77 # 56497 # 59658 # -1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.587 1_49 - 1054 ResIII PF04851.10 184 5.5e-06 19.4 0.1 2 2 0.017 1.8 1.3 0.0 148 183 261 304 236 305 0.77 # 56497 # 59658 # -1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.587 1_49 - 1054 SNF2_N PF00176.18 299 1.1e-08 27.2 0.0 1 2 1.5e-05 0.0016 10.2 0.0 1 56 18 68 18 88 0.71 # 56497 # 59658 # -1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.587 1_49 - 1054 SNF2_N PF00176.18 299 1.1e-08 27.2 0.0 2 2 6.7e-07 7.4e-05 14.6 0.0 128 227 253 372 236 400 0.75 # 56497 # 59658 # -1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.587 1_18 - 390 TIGR01968 TIGR01968 261 0.00039 12.5 0.0 1 2 0.0015 0.17 3.9 0.0 4 27 111 134 108 153 0.79 # 14357 # 15526 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.550 1_18 - 390 TIGR01968 TIGR01968 261 0.00039 12.5 0.0 2 2 0.00033 0.037 6.1 0.0 102 136 235 269 229 280 0.88 # 14357 # 15526 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.550 1_56 - 253 TIGR00611 TIGR00611 365 6.5e-05 14.9 0.0 1 2 1.6e-05 0.0018 10.2 0.0 12 55 16 60 10 109 0.69 # 68569 # 69327 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.623 1_56 - 253 TIGR00611 TIGR00611 365 6.5e-05 14.9 0.0 2 2 0.003 0.33 2.7 0.0 306 337 160 191 146 210 0.77 # 68569 # 69327 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.623 1_56 - 253 DUF258 PF03193.11 161 0.00024 13.3 0.0 1 1 3.4e-06 0.00037 12.7 0.0 19 59 11 52 2 96 0.79 # 68569 # 69327 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.623 1_93 - 248 HTH_28 PF13518.1 52 2.8e-05 17.1 1.1 1 1 1.8e-06 5.1e-05 16.3 0.0 14 36 5 27 3 36 0.94 # 101256 # 101999 # -1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 1_105 - 204 HTH_28 PF13518.1 52 0.00021 14.4 0.0 1 1 1.6e-05 0.00045 13.3 0.0 6 40 32 66 26 72 0.78 # 110531 # 111142 # -1 # ID=1_105;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.541 1_83 - 240 HTH_28 PF13518.1 52 0.00072 12.7 0.1 1 1 0.00011 0.003 10.7 0.0 16 36 30 50 30 63 0.87 # 91871 # 92590 # 1 # ID=1_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 1_6 - 260 HTH_28 PF13518.1 52 0.00094 12.3 0.6 1 2 0.0012 0.034 7.3 0.1 17 31 51 67 36 67 0.79 # 4118 # 4897 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.562 1_6 - 260 HTH_28 PF13518.1 52 0.00094 12.3 0.6 2 2 0.065 1.8 1.8 0.0 11 28 209 228 206 232 0.79 # 4118 # 4897 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.562 1_105 - 204 HTH_Tnp_1_2 PF13022.1 142 0.001 11.9 0.3 1 1 1.9e-05 0.0021 10.9 0.1 8 56 4 60 2 85 0.75 # 110531 # 111142 # -1 # ID=1_105;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.541 1_19 - 323 HTH_24 PF13412.1 48 5.1e-08 25.3 0.5 1 1 6.5e-09 1.8e-07 23.6 0.1 14 39 156 181 152 183 0.93 # 15562 # 16530 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.557 1_73 - 111 HTH_24 PF13412.1 48 0.00024 13.6 0.1 1 1 1.3e-05 0.00036 13.0 0.1 12 47 24 59 13 60 0.78 # 82138 # 82470 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.601 1_28 - 94 HTH_24 PF13412.1 48 0.00024 13.6 0.0 1 1 1.4e-05 0.00038 12.9 0.0 14 36 22 44 17 45 0.89 # 27386 # 27667 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.624 1_87 - 242 HTH_24 PF13412.1 48 0.00045 12.7 0.0 1 1 2.6e-05 0.00073 12.0 0.0 19 47 48 76 38 77 0.94 # 96382 # 97107 # -1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.665 1_102 - 300 HTH_30 PF13556.1 59 0.00032 13.4 0.4 1 1 5.5e-06 0.00061 12.5 0.4 13 54 20 62 12 64 0.81 # 107252 # 108151 # 1 # ID=1_102;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 1_49 - 1054 DEAD PF00270.24 169 5.5e-09 28.8 0.0 1 2 2.8e-06 0.00031 13.3 0.0 15 112 37 135 17 147 0.75 # 56497 # 59658 # -1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.587 1_49 - 1054 DEAD PF00270.24 169 5.5e-09 28.8 0.0 2 2 3.7e-06 0.00041 12.9 0.0 118 163 258 304 239 309 0.86 # 56497 # 59658 # -1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.587 1_28 - 94 HTH_31 PF13560.1 64 4.7e-10 32.7 0.1 1 1 1.1e-11 6.3e-10 32.2 0.1 4 57 15 67 12 78 0.85 # 27386 # 27667 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.624 1_19 - 323 HTH_31 PF13560.1 64 0.0018 11.5 3.8 1 1 4.5e-05 0.0025 11.1 2.7 8 39 154 184 103 191 0.82 # 15562 # 16530 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.557 1_15 - 338 HTH_36 PF13730.1 55 0.00056 13.1 0.0 1 1 2.3e-05 0.0025 11.0 0.0 6 55 214 267 207 267 0.84 # 12492 # 13505 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.548 1_38 - 257 NACHT PF05729.7 166 1.1e-05 18.2 0.0 1 2 7.3e-05 0.0081 8.9 0.0 3 26 67 90 65 107 0.85 # 45629 # 46399 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_38 - 257 NACHT PF05729.7 166 1.1e-05 18.2 0.0 2 2 0.00021 0.023 7.4 0.0 72 163 120 211 105 214 0.74 # 45629 # 46399 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_82 - 98 DZR PF12773.2 50 2.6e-07 23.5 1.4 1 1 4.5e-09 5e-07 22.6 1.4 1 23 6 28 3 38 0.82 # 91382 # 91675 # 1 # ID=1_82;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.480 1_56 - 253 TIGR02211 TIGR02211 221 3.2e-32 104.5 0.0 1 1 4.4e-34 4.9e-32 103.9 0.0 17 219 14 213 4 215 0.81 # 68569 # 69327 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.623 1_38 - 257 TIGR03346 TIGR03346 853 5.2e-11 34.2 0.0 1 1 5.9e-13 6.6e-11 33.9 0.0 159 332 29 194 13 208 0.84 # 45629 # 46399 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_56 - 253 AAA_25 PF13481.1 194 0.00028 13.4 0.0 1 1 5.1e-06 0.00056 12.4 0.0 30 110 25 98 6 134 0.71 # 68569 # 69327 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.623 1_56 - 253 AAA_15 PF13175.1 415 0.00058 12.0 0.3 1 2 0.00066 0.074 5.0 0.0 27 42 33 48 13 90 0.83 # 68569 # 69327 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.623 1_56 - 253 AAA_15 PF13175.1 415 0.00058 12.0 0.3 2 2 0.00066 0.074 5.0 0.2 373 397 160 184 151 191 0.92 # 68569 # 69327 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.623 1_19 - 323 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.00043 12.6 0.2 1 1 1.7e-05 0.0019 10.5 0.0 22 50 153 182 150 184 0.88 # 15562 # 16530 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.557 1_93 - 248 MerR PF00376.18 38 8.7e-15 47.1 0.0 1 1 1.5e-16 1.6e-14 46.3 0.0 1 38 5 42 5 42 0.97 # 101256 # 101999 # -1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 1_56 - 253 AAA_33 PF13671.1 143 0.00015 14.7 0.0 1 1 7.5e-06 0.00084 12.3 0.0 4 98 33 187 31 198 0.71 # 68569 # 69327 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.623 1_87 - 242 PaaX PF07848.7 70 0.0011 12.1 0.6 1 1 2.5e-05 0.0028 10.8 0.1 32 68 55 91 45 93 0.86 # 96382 # 97107 # -1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.665 1_56 - 253 SbcCD_C PF13558.1 90 0.00027 13.9 0.0 1 1 3.8e-05 0.0042 10.1 0.0 28 89 134 182 117 183 0.73 # 68569 # 69327 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.623 1_38 - 257 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00087 12.6 0.0 1 1 1.6e-05 0.0017 11.6 0.0 2 24 68 90 67 115 0.84 # 45629 # 46399 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_48 - 225 Eno-Rase_NADH_b PF12242.3 78 4.5e-05 16.3 0.4 1 1 1.1e-06 0.00012 14.9 0.3 40 74 4 37 2 41 0.83 # 55816 # 56490 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.593 1_44 - 267 zinc_ribbon_5 PF13719.1 37 0.00063 12.4 1.0 1 1 1.3e-05 0.0015 11.2 1.0 1 18 1 18 1 28 0.86 # 51881 # 52681 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 1_2 - 231 Trans_reg_C PF00486.23 77 2.1e-20 65.6 0.2 1 1 4.4e-22 4.9e-20 64.4 0.2 4 77 156 227 152 227 0.94 # 986 # 1678 # -1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.603 1_88 - 133 ACT_4 PF13291.1 80 0.0003 14.2 0.0 1 2 0.00035 0.039 7.4 0.0 8 35 3 30 1 48 0.86 # 97080 # 97478 # -1 # ID=1_88;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.591 1_88 - 133 ACT_4 PF13291.1 80 0.0003 14.2 0.0 2 2 0.0023 0.26 4.8 0.0 14 35 77 98 72 112 0.84 # 97080 # 97478 # -1 # ID=1_88;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.591 1_57 - 82 Glyco_transf_4 PF13439.1 177 0.00084 12.1 0.0 1 1 1.9e-05 0.0021 10.8 0.0 146 171 49 75 48 77 0.93 # 69403 # 69648 # -1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.524 1_28 - 94 HTH_26 PF13443.1 63 0.00034 13.9 0.0 1 1 5e-06 0.00056 13.2 0.0 7 53 22 67 19 74 0.89 # 27386 # 27667 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.624 1_93 - 248 HTH_17 PF12728.2 51 1.7e-07 24.5 0.1 1 1 1.9e-08 1e-06 22.0 0.0 1 45 3 49 3 52 0.93 # 101256 # 101999 # -1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 1_105 - 204 HTH_17 PF12728.2 51 0.00016 15.0 0.0 1 1 2.8e-05 0.0015 11.8 0.0 3 24 40 61 39 85 0.75 # 110531 # 111142 # -1 # ID=1_105;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.541 1_6 - 260 HTH_11 PF08279.7 55 6.8e-20 63.6 0.4 1 1 3.8e-21 1.4e-19 62.6 0.4 1 54 34 87 34 88 0.98 # 4118 # 4897 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.562 1_83 - 240 HTH_11 PF08279.7 55 9.5e-06 18.3 0.0 1 1 5.1e-07 1.9e-05 17.4 0.0 20 47 31 59 28 64 0.89 # 91871 # 92590 # 1 # ID=1_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 1_15 - 338 HTH_11 PF08279.7 55 0.00072 12.3 0.3 1 1 0.00062 0.023 7.5 0.3 13 43 229 265 218 276 0.71 # 12492 # 13505 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.548 1_87 - 242 MarR_2 PF12802.2 62 6.7e-08 25.2 0.4 1 1 1.1e-08 2e-07 23.7 0.2 5 52 32 77 27 86 0.85 # 96382 # 97107 # -1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.665 1_70 - 445 MarR_2 PF12802.2 62 0.00017 14.3 4.5 1 1 1.6e-05 0.0003 13.5 0.1 23 56 29 62 19 65 0.89 # 78829 # 80163 # -1 # ID=1_70;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.635 1_2 - 231 MarR_2 PF12802.2 62 0.00034 13.4 0.1 1 1 5.5e-05 0.001 11.8 0.1 2 31 157 186 156 199 0.85 # 986 # 1678 # -1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.603 1_73 - 111 MarR_2 PF12802.2 62 0.00034 13.3 0.5 1 1 3.2e-05 0.00059 12.6 0.5 13 55 23 63 14 66 0.79 # 82138 # 82470 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.601 1_28 - 94 MarR_2 PF12802.2 62 0.00042 13.1 0.0 1 1 3.3e-05 0.00061 12.5 0.0 11 39 16 43 5 45 0.75 # 27386 # 27667 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.624 1_19 - 323 MarR_2 PF12802.2 62 0.00043 13.0 0.1 1 1 0.00011 0.002 10.9 0.1 11 44 152 182 151 186 0.89 # 15562 # 16530 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.557 1_82 - 98 zinc_ribbon_2 PF13240.1 23 8.7e-07 21.4 3.8 1 1 1.5e-08 1.7e-06 20.5 3.8 1 21 5 25 5 27 0.94 # 91382 # 91675 # 1 # ID=1_82;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.480 1_73 - 111 HTH_5 PF01022.15 47 1.2e-17 56.5 1.6 1 1 4.4e-19 1.6e-17 56.0 1.6 1 46 14 60 14 61 0.97 # 82138 # 82470 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.601 1_87 - 242 HTH_5 PF01022.15 47 1.8e-10 33.4 0.0 1 1 8.5e-12 3.1e-10 32.7 0.0 1 45 31 76 31 77 0.95 # 96382 # 97107 # -1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.665 1_105 - 204 HTH_5 PF01022.15 47 0.00083 12.1 0.0 1 1 4.8e-05 0.0018 11.1 0.0 18 37 41 60 30 61 0.90 # 110531 # 111142 # -1 # ID=1_105;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.541 1_83 - 240 TrmB PF01978.14 68 1.7e-06 20.8 0.0 1 1 1.1e-07 4.2e-06 19.5 0.0 26 63 30 78 25 83 0.86 # 91871 # 92590 # 1 # ID=1_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 1_73 - 111 TrmB PF01978.14 68 1.3e-05 17.9 0.0 1 1 4.5e-07 1.7e-05 17.6 0.0 15 62 20 70 6 76 0.80 # 82138 # 82470 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.601 1_87 - 242 TrmB PF01978.14 68 0.00014 14.6 0.0 1 1 7e-06 0.00026 13.8 0.0 16 63 40 88 35 91 0.83 # 96382 # 97107 # -1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.665 1_48 - 225 RmlD_sub_bind PF04321.12 287 2.2e-06 19.7 0.1 1 1 3e-08 3.3e-06 19.2 0.1 2 88 5 113 4 134 0.80 # 55816 # 56490 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.593 1_87 - 242 HTH_20 PF12840.2 61 1.3e-14 46.8 1.3 1 1 9.5e-16 2.6e-14 45.9 0.5 3 55 25 77 23 83 0.94 # 96382 # 97107 # -1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.665 1_73 - 111 HTH_20 PF12840.2 61 3.8e-12 39.0 2.1 1 1 2e-13 5.4e-12 38.5 2.1 2 61 7 66 6 66 0.97 # 82138 # 82470 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.601 1_7 - 172 HTH_20 PF12840.2 61 0.00015 14.7 0.1 1 1 1e-05 0.00028 13.8 0.1 10 61 15 68 13 68 0.75 # 4845 # 5360 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.605 1_15 - 338 HTH_20 PF12840.2 61 0.00047 13.0 0.1 1 1 5.1e-05 0.0014 11.5 0.0 19 58 225 271 203 274 0.82 # 12492 # 13505 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.548 1_82 - 98 UPF0547 PF10571.4 26 7.5e-05 15.5 4.3 1 1 1.3e-06 0.00015 14.6 4.3 3 21 6 24 5 25 0.94 # 91382 # 91675 # 1 # ID=1_82;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.480 1_18 - 390 AAA_31 PF13614.1 157 4.5e-06 19.7 0.0 1 2 0.0018 0.2 4.6 0.0 8 53 116 166 109 209 0.79 # 14357 # 15526 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.550 1_18 - 390 AAA_31 PF13614.1 157 4.5e-06 19.7 0.0 2 2 5.6e-06 0.00062 12.8 0.0 109 148 236 274 234 279 0.88 # 14357 # 15526 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.550 1_48 - 225 NmrA PF05368.8 233 3.8e-05 16.1 0.3 1 1 4.4e-07 4.9e-05 15.7 0.3 1 74 6 104 6 151 0.70 # 55816 # 56490 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.593 1_21 - 441 FMO-like PF00743.14 532 7.3e-07 20.7 0.0 1 2 3.9e-07 4.3e-05 14.9 0.0 85 202 97 199 80 216 0.76 # 19278 # 20600 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 1_21 - 441 FMO-like PF00743.14 532 7.3e-07 20.7 0.0 2 2 0.0009 0.1 3.7 0.0 316 337 317 338 307 348 0.78 # 19278 # 20600 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 1_48 - 225 KR PF08659.5 181 1.5e-05 17.8 3.6 1 1 5.1e-07 5.6e-05 15.9 3.6 3 162 6 158 5 164 0.80 # 55816 # 56490 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.593 1_72 - 296 DHDPS PF00701.17 289 1.8e-40 131.3 0.0 1 1 1.8e-42 2e-40 131.2 0.0 1 288 1 292 1 293 0.94 # 81158 # 82045 # 1 # ID=1_72;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.633 1_44 - 267 GATA PF00320.22 36 0.00018 13.9 0.1 1 1 3.9e-06 0.00044 12.7 0.1 21 31 3 13 1 17 0.87 # 51881 # 52681 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 1_105 - 204 Phage_AlpA PF05930.7 51 0.00013 14.8 0.0 1 1 2.2e-06 0.00024 13.9 0.0 4 25 39 60 36 68 0.89 # 110531 # 111142 # -1 # ID=1_105;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.541 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/155247c7-2a5e-4ba9-ac88-3982a06ebd55 # Target file: checkm_output/bins/pm1154/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm1154/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/155247c7-2a5e-4ba9-ac88-3982a06ebd55 checkm_output/bins/pm1154/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 09:36:05 2017 # [ok]