# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_92 - 447 KaiC PF06745.8 227 8.5e-11 34.5 0.4 1 3 0.019 1.2 1.4 0.0 120 163 74 120 14 184 0.63 # 79934 # 81274 # 1 # ID=1_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_92 - 447 KaiC PF06745.8 227 8.5e-11 34.5 0.4 2 3 3.7e-11 2.3e-09 29.9 0.0 2 167 191 375 190 392 0.64 # 79934 # 81274 # 1 # ID=1_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_92 - 447 KaiC PF06745.8 227 8.5e-11 34.5 0.4 3 3 0.024 1.5 1.0 0.1 64 127 341 399 330 417 0.60 # 79934 # 81274 # 1 # ID=1_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_114 - 358 KaiC PF06745.8 227 2.1e-05 16.9 0.0 1 1 6.1e-07 3.8e-05 16.1 0.0 3 46 31 78 29 96 0.77 # 103042 # 104115 # 1 # ID=1_114;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.489 1_114 - 358 RecA PF00154.16 323 3.8e-47 154.1 0.0 1 1 4.6e-49 5.8e-47 153.5 0.0 22 281 16 306 5 342 0.81 # 103042 # 104115 # 1 # ID=1_114;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.489 1_109 - 1173 HHH_3 PF12836.2 65 0.00088 12.5 0.0 1 2 0.01 1.3 2.3 0.0 19 40 793 814 790 817 0.90 # 96546 # 100064 # 1 # ID=1_109;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_109 - 1173 HHH_3 PF12836.2 65 0.00088 12.5 0.0 2 2 0.00054 0.067 6.4 0.0 19 48 900 930 895 932 0.81 # 96546 # 100064 # 1 # ID=1_109;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_56 - 222 ABC_tran PF00005.22 137 2e-14 47.3 0.1 1 1 1.5e-13 6e-12 39.2 0.1 1 134 39 152 39 155 0.83 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_3 - 639 ABC_tran PF00005.22 137 2e-06 21.4 6.5 1 1 0.00036 0.015 8.8 6.5 79 125 482 564 40 568 0.86 # 2299 # 4215 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.466 1_12 - 215 ABC_tran PF00005.22 137 0.00011 15.7 0.0 1 1 5.6e-06 0.00023 14.7 0.0 13 35 4 26 2 34 0.90 # 12273 # 12917 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_56 - 222 DUF815 PF05673.8 250 1.6e-05 17.1 0.0 1 1 2e-07 2.5e-05 16.5 0.0 32 103 30 99 9 106 0.83 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_24 - 562 N6_Mtase PF02384.11 311 6.6e-05 15.3 0.0 1 2 0.00061 0.076 5.2 0.0 27 66 400 440 394 449 0.87 # 19666 # 21351 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_24 - 562 N6_Mtase PF02384.11 311 6.6e-05 15.3 0.0 2 2 0.00016 0.02 7.1 0.0 122 142 479 499 459 509 0.79 # 19666 # 21351 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_56 - 222 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00022 13.9 0.1 1 2 1.2e-05 0.0015 11.2 0.0 16 49 43 76 30 92 0.79 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_56 - 222 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00022 13.9 0.1 2 2 0.026 3.2 0.4 0.1 131 150 174 194 155 209 0.67 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_56 - 222 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00028 13.6 0.0 1 2 7.5e-06 0.00094 11.9 0.0 18 58 28 69 16 73 0.81 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_56 - 222 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00028 13.6 0.0 2 2 0.065 8.1 -1.0 0.0 175 200 159 184 95 197 0.72 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_53 - 520 Helicase_C PF00271.26 78 2.4e-14 46.2 0.0 1 1 5.9e-16 7.3e-14 44.7 0.0 2 78 387 463 386 463 0.97 # 41255 # 42814 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 1_12 - 215 Cytidylate_kin2 PF13189.1 179 2e-05 17.7 0.8 1 1 4.6e-07 5.7e-05 16.3 0.8 2 30 5 33 4 206 0.96 # 12273 # 12917 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_116 - 305 TIGR01932 TIGR01932 318 1.6e-09 29.8 2.7 1 1 1.8e-11 2.2e-09 29.4 2.7 144 268 115 240 84 244 0.84 # 104412 # 105326 # 1 # ID=1_116;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 1_116 - 305 TIGR01933 TIGR01933 261 7.2e-06 18.5 1.7 1 1 7.8e-08 9.7e-06 18.0 1.7 84 201 115 234 80 251 0.78 # 104412 # 105326 # 1 # ID=1_116;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 1_56 - 222 MobB PF03205.9 140 4e-06 19.8 0.0 1 1 1.5e-07 9.6e-06 18.6 0.0 2 37 51 86 50 102 0.88 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_12 - 215 MobB PF03205.9 140 0.00072 12.5 0.0 1 1 2.2e-05 0.0013 11.6 0.0 2 20 4 22 3 35 0.90 # 12273 # 12917 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_31 - 108 NinF PF05810.7 58 0.0024 10.9 4.7 1 1 5.6e-05 0.007 9.4 4.7 14 40 59 93 56 101 0.76 # 24692 # 25015 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_12 - 215 AAA_19 PF13245.1 76 0.00061 12.8 0.1 1 1 3.3e-05 0.0014 11.7 0.1 15 35 7 26 4 52 0.78 # 12273 # 12917 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_60 - 419 AAA_19 PF13245.1 76 0.00092 12.2 0.0 1 1 4.5e-05 0.0019 11.2 0.0 22 58 36 70 20 94 0.79 # 46898 # 48154 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_37 - 367 AAA_19 PF13245.1 76 0.0028 10.7 2.0 1 2 0.0003 0.012 8.6 0.3 17 45 112 136 104 141 0.81 # 28269 # 29369 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_37 - 367 AAA_19 PF13245.1 76 0.0028 10.7 2.0 2 2 0.09 3.7 0.7 0.1 13 25 216 228 211 251 0.86 # 28269 # 29369 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_37 - 367 CbiA PF01656.18 195 4.6e-20 65.0 0.1 1 1 1.7e-21 7.1e-20 64.4 0.1 1 157 107 275 107 278 0.76 # 28269 # 29369 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_88 - 223 CbiA PF01656.18 195 4.5e-15 48.8 0.2 1 1 1.7e-16 7e-15 48.1 0.2 2 158 6 147 5 185 0.75 # 77130 # 77798 # 1 # ID=1_88;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 1_56 - 222 CbiA PF01656.18 195 0.00055 12.6 0.2 1 1 2e-05 0.00084 12.0 0.2 2 48 52 101 51 201 0.72 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_56 - 222 PRK PF00485.13 194 4.1e-05 16.4 0.1 1 1 1.3e-06 8.3e-05 15.4 0.0 1 39 51 88 51 107 0.78 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_12 - 215 PRK PF00485.13 194 9.5e-05 15.2 0.0 1 1 2.3e-06 0.00014 14.6 0.0 2 33 5 38 4 74 0.79 # 12273 # 12917 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_56 - 222 KTI12 PF08433.5 270 7e-07 21.9 0.1 1 2 1.6e-07 2e-05 17.1 0.0 4 40 52 88 50 102 0.90 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_56 - 222 KTI12 PF08433.5 270 7e-07 21.9 0.1 2 2 0.0037 0.46 2.8 0.0 187 219 149 181 136 217 0.65 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_38 - 700 TIGR00392 TIGR00392 861 1.1e-25 82.8 0.7 1 3 6.8e-16 8.5e-14 43.5 0.1 45 106 37 97 15 114 0.84 # 29461 # 31560 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.522 1_38 - 700 TIGR00392 TIGR00392 861 1.1e-25 82.8 0.7 2 3 0.014 1.8 -0.6 0.0 419 468 208 257 203 268 0.75 # 29461 # 31560 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.522 1_38 - 700 TIGR00392 TIGR00392 861 1.1e-25 82.8 0.7 3 3 1.1e-13 1.4e-11 36.1 0.0 597 792 342 532 323 591 0.76 # 29461 # 31560 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.522 1_38 - 700 TIGR00398 TIGR00398 530 1.5e-211 696.5 0.0 1 1 1.4e-213 1.7e-211 696.3 0.0 1 530 30 558 30 558 0.99 # 29461 # 31560 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.522 1_124 - 405 Rep_3 PF01051.16 222 5.9e-28 91.1 0.5 1 1 9.6e-30 1.2e-27 90.1 0.5 3 215 72 336 70 340 0.85 # 110410 # 111624 # -1 # ID=1_124;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.454 1_3 - 639 AAA_23 PF13476.1 202 8.5e-20 65.1 11.6 1 1 1e-19 1.3e-17 58.0 8.9 1 201 5 266 5 510 0.78 # 2299 # 4215 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.466 1_14 - 186 TIGR00573 TIGR00573 217 2.6e-16 52.6 0.0 1 1 2.6e-18 3.3e-16 52.3 0.0 12 173 8 171 2 176 0.87 # 13408 # 13965 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 1_12 - 215 AAA_24 PF13479.1 213 0.00087 12.1 0.0 1 1 1e-05 0.0013 11.6 0.0 5 25 4 24 2 65 0.86 # 12273 # 12917 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_24 - 562 Methyltransf_26 PF13659.1 117 4.6e-09 29.6 0.0 1 1 7e-11 8.7e-09 28.7 0.0 2 116 422 519 421 520 0.88 # 19666 # 21351 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_56 - 222 Zeta_toxin PF06414.7 201 1.2e-05 17.7 0.1 1 2 2.9e-07 3.6e-05 16.1 0.0 14 52 47 85 37 101 0.81 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_56 - 222 Zeta_toxin PF06414.7 201 1.2e-05 17.7 0.1 2 2 0.064 8 -1.3 0.0 174 185 159 170 126 207 0.61 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_56 - 222 AAA_30 PF13604.1 196 3.4e-05 16.7 0.1 1 2 2.2e-06 0.00028 13.7 0.0 17 50 48 81 42 112 0.91 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_56 - 222 AAA_30 PF13604.1 196 3.4e-05 16.7 0.1 2 2 0.017 2.2 1.0 0.0 36 52 167 183 120 217 0.64 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_3 - 639 SMC_N PF02463.14 220 6.3e-16 51.4 0.6 1 1 1.8e-17 1.1e-15 50.6 0.6 32 199 41 617 4 632 0.91 # 2299 # 4215 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.466 1_56 - 222 SMC_N PF02463.14 220 4.7e-05 15.9 0.6 1 2 0.00086 0.053 5.9 0.1 25 41 50 66 37 73 0.81 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_56 - 222 SMC_N PF02463.14 220 4.7e-05 15.9 0.6 2 2 0.00012 0.0073 8.7 0.0 135 204 117 192 67 208 0.65 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_88 - 223 MipZ PF09140.6 261 3.6e-17 55.5 0.3 1 1 4.2e-17 2.6e-15 49.3 0.3 2 150 4 133 3 145 0.84 # 77130 # 77798 # 1 # ID=1_88;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 1_37 - 367 MipZ PF09140.6 261 1.7e-10 33.6 0.0 1 1 5e-12 3.1e-10 32.7 0.0 2 117 106 232 105 260 0.68 # 28269 # 29369 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_119 - 421 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 9.9e-35 113.2 0.2 1 1 1.7e-36 2.1e-34 112.1 0.0 6 213 128 362 123 362 0.96 # 106760 # 108022 # -1 # ID=1_119;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.340 1_29 - 167 DivIC PF04977.10 80 0.001 11.8 0.0 1 1 1.2e-05 0.0015 11.3 0.0 31 55 62 86 50 102 0.68 # 23797 # 24297 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_3 - 639 AAA_21 PF13304.1 303 1.1e-07 25.3 0.1 1 2 0.00022 0.014 8.5 0.0 8 23 42 57 41 117 0.80 # 2299 # 4215 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.466 1_3 - 639 AAA_21 PF13304.1 303 1.1e-07 25.3 0.1 2 2 3.5e-06 0.00022 14.5 0.1 219 297 500 615 375 616 0.67 # 2299 # 4215 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.466 1_12 - 215 AAA_21 PF13304.1 303 0.00077 12.6 0.0 1 1 1.6e-05 0.001 12.2 0.0 3 22 6 25 5 79 0.88 # 12273 # 12917 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_12 - 215 AAA PF00004.24 132 9.1e-05 15.9 0.1 1 1 1.5e-06 0.00019 14.9 0.0 3 42 7 49 5 72 0.82 # 12273 # 12917 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_105 - 129 HTH_37 PF13744.1 80 0.00026 14.0 0.0 1 1 3.7e-06 0.00046 13.2 0.0 17 56 11 51 2 70 0.80 # 91977 # 92363 # -1 # ID=1_105;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.450 1_58 - 89 LexA_DNA_bind PF01726.11 65 0.00038 13.3 0.3 1 1 1.4e-05 0.0017 11.2 0.3 4 64 3 63 1 64 0.84 # 45804 # 46070 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.464 1_38 - 700 tRNA_bind PF01588.15 95 1.4e-24 79.0 0.0 1 1 2.6e-26 3.2e-24 77.9 0.0 1 94 603 696 603 697 0.98 # 29461 # 31560 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.522 1_58 - 89 HTH_27 PF13463.1 68 0.00051 13.6 0.2 1 2 0.042 5.2 0.8 0.0 19 43 5 30 2 32 0.73 # 45804 # 46070 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.464 1_58 - 89 HTH_27 PF13463.1 68 0.00051 13.6 0.2 2 2 2.8e-05 0.0034 10.9 0.0 29 58 36 63 34 79 0.75 # 45804 # 46070 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.464 1_38 - 700 tRNA-synt_1g PF09334.6 391 3e-158 519.7 0.1 1 1 3e-160 3.8e-158 519.4 0.1 1 390 30 419 30 420 0.98 # 29461 # 31560 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.522 1_31 - 108 TIGR00382 TIGR00382 414 2.9e-12 39.1 2.3 1 1 2.3e-14 2.9e-12 39.1 2.3 8 48 63 103 57 107 0.89 # 24692 # 25015 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_38 - 700 tRNA-synt_1 PF00133.17 601 1.8e-20 65.6 1.9 1 3 3.3e-16 4.1e-14 44.6 0.1 21 103 25 107 11 134 0.82 # 29461 # 31560 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.522 1_38 - 700 tRNA-synt_1 PF00133.17 601 1.8e-20 65.6 1.9 2 3 0.023 2.9 -1.1 0.1 479 498 235 254 219 267 0.63 # 29461 # 31560 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.522 1_38 - 700 tRNA-synt_1 PF00133.17 601 1.8e-20 65.6 1.9 3 3 1.4e-08 1.8e-06 19.4 0.0 546 597 341 392 303 396 0.81 # 29461 # 31560 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.522 1_56 - 222 cobW PF02492.14 178 0.0007 12.3 0.0 1 1 9.8e-06 0.0012 11.5 0.0 2 33 51 83 50 112 0.78 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_56 - 222 AAA_16 PF13191.1 185 1.8e-08 27.7 0.0 1 1 2.1e-10 2.6e-08 27.3 0.0 13 87 39 107 30 182 0.77 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_56 - 222 AAA_22 PF13401.1 131 3.5e-07 23.7 0.0 1 1 2.5e-08 1e-06 22.1 0.0 3 86 48 176 45 194 0.73 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_92 - 447 AAA_22 PF13401.1 131 0.00075 12.9 0.1 1 1 9.9e-05 0.0041 10.5 0.1 3 118 208 361 203 371 0.65 # 79934 # 81274 # 1 # ID=1_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_12 - 215 AAA_22 PF13401.1 131 0.00083 12.7 0.2 1 1 2.7e-05 0.0011 12.3 0.2 9 28 7 26 3 153 0.92 # 12273 # 12917 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_103 - 82 TIGR00365 TIGR00365 99 5.1e-05 16.3 0.0 1 1 4.7e-07 5.9e-05 16.1 0.0 26 81 10 71 2 79 0.80 # 90422 # 90667 # 1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.496 1_24 - 562 Methyltransf_27 PF13708.1 194 3.9e-45 146.9 1.2 1 2 1.3e-46 1.6e-44 144.9 1.3 3 194 87 300 85 300 0.91 # 19666 # 21351 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_24 - 562 Methyltransf_27 PF13708.1 194 3.9e-45 146.9 1.2 2 2 0.084 10 -1.3 0.0 108 135 348 375 334 384 0.78 # 19666 # 21351 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_27 - 214 HTH_9 PF08221.6 62 0.00092 12.3 0.0 1 1 1.7e-05 0.0021 11.2 0.0 3 24 65 86 63 89 0.85 # 22617 # 23258 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_56 - 222 AAA_29 PF13555.1 62 1.1e-07 24.6 0.0 1 1 4.6e-09 2.9e-07 23.2 0.0 8 40 35 66 32 70 0.91 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_3 - 639 AAA_29 PF13555.1 62 7.9e-05 15.4 0.0 1 1 3.7e-06 0.00023 13.9 0.0 31 51 41 61 4 65 0.82 # 2299 # 4215 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.466 1_37 - 367 SRP54 PF00448.17 196 0.0011 11.7 0.1 1 1 1.8e-05 0.0022 10.6 0.1 7 41 111 145 104 153 0.90 # 28269 # 29369 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_12 - 215 AAA_28 PF13521.1 163 2.8e-11 36.8 0.0 1 1 3.4e-13 4.3e-11 36.2 0.0 1 101 4 102 4 158 0.82 # 12273 # 12917 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_14 - 186 RNase_H_2 PF13482.1 164 6.9e-07 22.4 0.0 1 1 6.5e-08 8.1e-06 18.9 0.0 51 121 77 154 6 161 0.66 # 13408 # 13965 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 1_105 - 129 HTH_3 PF01381.17 55 0.00046 13.3 0.0 1 1 6.4e-06 0.00079 12.5 0.0 10 53 26 70 23 72 0.96 # 91977 # 92363 # -1 # ID=1_105;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.450 1_119 - 421 DDE_Tnp_1_4 PF13701.1 449 4e-27 87.6 3.5 1 2 0.0052 0.64 1.2 0.0 11 42 5 36 3 62 0.72 # 106760 # 108022 # -1 # ID=1_119;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.340 1_119 - 421 DDE_Tnp_1_4 PF13701.1 449 4e-27 87.6 3.5 2 2 1.5e-28 1.8e-26 85.4 2.2 137 438 122 418 41 420 0.82 # 106760 # 108022 # -1 # ID=1_119;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.340 1_37 - 367 Fer4_NifH PF00142.13 273 3.3e-10 32.8 0.0 1 2 5.7e-08 3.6e-06 19.5 0.0 6 51 111 156 105 161 0.83 # 28269 # 29369 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_37 - 367 Fer4_NifH PF00142.13 273 3.3e-10 32.8 0.0 2 2 2.2e-05 0.0014 11.0 0.0 192 256 293 360 241 365 0.86 # 28269 # 29369 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_88 - 223 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.00031 13.2 1.5 1 2 1.2e-05 0.00075 11.9 0.2 8 45 11 49 3 96 0.70 # 77130 # 77798 # 1 # ID=1_88;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 1_88 - 223 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.00031 13.2 1.5 2 2 0.033 2 0.6 0.1 176 228 123 177 79 197 0.69 # 77130 # 77798 # 1 # ID=1_88;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 1_105 - 129 HTH_19 PF12844.2 64 2.4e-07 24.0 0.0 1 1 2.9e-09 3.6e-07 23.4 0.0 9 62 22 76 14 78 0.89 # 91977 # 92363 # -1 # ID=1_105;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.450 1_12 - 215 NB-ARC PF00931.17 287 0.00098 11.2 0.1 1 1 1.3e-05 0.0016 10.5 0.1 22 42 5 25 3 31 0.89 # 12273 # 12917 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_112 - 315 TIGR00593 TIGR00593 890 7.9e-38 123.2 0.0 1 1 7.5e-40 9.3e-38 122.9 0.0 3 278 5 287 3 307 0.82 # 101829 # 102773 # 1 # ID=1_112;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.483 1_53 - 520 TIGR00595 TIGR00595 509 0.00058 11.3 0.0 1 1 1.1e-05 0.0014 10.1 0.0 300 339 403 442 375 452 0.83 # 41255 # 42814 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 1_56 - 222 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.00028 13.8 0.0 1 1 2.8e-06 0.00035 13.5 0.0 18 68 47 97 41 177 0.84 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_60 - 419 PhoH PF02562.11 205 7.6e-05 15.2 0.1 1 2 4.8e-05 0.0059 9.0 0.0 31 136 36 134 13 141 0.63 # 46898 # 48154 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_60 - 419 PhoH PF02562.11 205 7.6e-05 15.2 0.1 2 2 0.0032 0.39 3.1 0.0 62 106 348 392 320 397 0.87 # 46898 # 48154 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_108 - 412 AAA_5 PF07728.9 139 9.2e-18 57.5 0.0 1 1 1.3e-19 1.6e-17 56.7 0.0 4 126 173 293 172 308 0.93 # 95130 # 96365 # 1 # ID=1_108;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.470 1_53 - 520 ResIII PF04851.10 184 8.3e-18 58.0 0.0 1 1 1.4e-19 1.8e-17 57.0 0.0 26 183 112 268 96 269 0.82 # 41255 # 42814 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 1_53 - 520 SNF2_N PF00176.18 299 3e-05 16.1 0.0 1 1 4e-07 5e-05 15.4 0.0 106 182 186 277 155 285 0.84 # 41255 # 42814 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 1_37 - 367 TIGR01968 TIGR01968 261 1e-17 57.2 0.6 1 2 1.9e-14 1.2e-12 40.6 0.2 2 53 105 156 104 158 0.94 # 28269 # 29369 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_37 - 367 TIGR01968 TIGR01968 261 1e-17 57.2 0.6 2 2 2e-06 0.00012 14.3 0.0 98 237 199 347 193 353 0.65 # 28269 # 29369 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_88 - 223 TIGR01968 TIGR01968 261 8.8e-09 27.9 7.3 1 2 8e-07 4.9e-05 15.6 1.6 2 40 3 42 2 46 0.86 # 77130 # 77798 # 1 # ID=1_88;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 1_88 - 223 TIGR01968 TIGR01968 261 8.8e-09 27.9 7.3 2 2 6.5e-07 4e-05 15.9 0.4 99 199 69 173 52 213 0.84 # 77130 # 77798 # 1 # ID=1_88;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 1_12 - 215 AAA_18 PF13238.1 129 7.2e-07 22.8 0.2 1 1 2e-08 1.2e-06 22.1 0.1 1 25 5 29 5 93 0.86 # 12273 # 12917 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_56 - 222 AAA_18 PF13238.1 129 2e-06 21.3 0.0 1 1 6.4e-08 3.9e-06 20.4 0.0 1 40 52 91 52 106 0.82 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_56 - 222 DUF258 PF03193.11 161 1.9e-05 17.1 0.0 1 1 2.7e-07 3.4e-05 16.3 0.0 25 84 38 110 14 119 0.75 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_14 - 186 TIGR01406 TIGR01406 231 3.1e-20 65.6 0.0 1 1 3.1e-22 3.8e-20 65.3 0.0 5 166 8 169 3 178 0.88 # 13408 # 13965 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 1_92 - 447 DnaB_C PF03796.10 259 6.2e-12 38.1 0.3 1 1 7.2e-14 9e-12 37.6 0.3 2 216 190 403 189 441 0.75 # 79934 # 81274 # 1 # ID=1_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_56 - 222 DUF2791 PF10923.3 417 0.00023 13.0 0.1 1 1 3.4e-06 0.00042 12.1 0.0 26 84 27 84 23 105 0.85 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_38 - 700 tRNA-synt_1e PF01406.14 301 3.6e-16 52.3 0.5 1 2 1.1e-09 1.3e-07 24.2 0.0 10 120 30 141 22 154 0.87 # 29461 # 31560 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.522 1_38 - 700 tRNA-synt_1e PF01406.14 301 3.6e-16 52.3 0.5 2 2 3.1e-10 3.8e-08 25.9 0.0 213 283 316 385 310 405 0.82 # 29461 # 31560 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.522 1_37 - 367 AAA_26 PF13500.1 199 0.00024 13.9 0.6 1 2 0.0011 0.13 5.0 0.1 3 33 107 137 105 144 0.88 # 28269 # 29369 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_37 - 367 AAA_26 PF13500.1 199 0.00024 13.9 0.6 2 2 0.00029 0.036 6.8 0.0 117 196 224 317 217 319 0.69 # 28269 # 29369 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_56 - 222 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 3.1e-05 17.3 0.0 1 1 4.3e-07 5.3e-05 16.5 0.0 10 95 38 143 34 192 0.70 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_60 - 419 Terminase_GpA PF05876.7 557 2.9e-05 15.8 0.1 1 1 3.8e-07 4.7e-05 15.0 0.1 35 149 26 132 11 136 0.79 # 46898 # 48154 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_14 - 186 TIGR01298 TIGR01298 200 9.3e-07 21.7 0.0 1 2 5.4e-05 0.0067 9.1 0.0 13 75 8 66 3 108 0.86 # 13408 # 13965 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 1_14 - 186 TIGR01298 TIGR01298 200 9.3e-07 21.7 0.0 2 2 1.5e-05 0.0018 10.9 0.0 163 192 146 175 120 179 0.88 # 13408 # 13965 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 1_12 - 215 HTH_33 PF13592.1 60 0.00023 13.9 0.0 1 1 3.7e-06 0.00046 13.0 0.0 10 36 18 44 16 49 0.94 # 12273 # 12917 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_114 - 358 Rad51 PF08423.6 256 5.1e-05 15.4 0.0 1 2 5.8e-06 0.00072 11.7 0.0 31 85 44 92 18 136 0.80 # 103042 # 104115 # 1 # ID=1_114;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.489 1_114 - 358 Rad51 PF08423.6 256 5.1e-05 15.4 0.0 2 2 0.0074 0.92 1.5 0.0 169 207 195 230 159 263 0.78 # 103042 # 104115 # 1 # ID=1_114;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.489 1_53 - 520 DEAD PF00270.24 169 4.2e-14 45.6 0.1 1 2 3.2e-13 2e-11 36.9 0.0 2 163 99 268 98 275 0.66 # 41255 # 42814 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 1_53 - 520 DEAD PF00270.24 169 4.2e-14 45.6 0.1 2 2 0.0018 0.11 5.1 0.0 64 102 384 425 371 428 0.80 # 41255 # 42814 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 1_60 - 419 DEAD PF00270.24 169 0.00019 14.2 0.0 1 1 1.1e-05 0.00068 12.4 0.0 25 133 35 131 15 154 0.77 # 46898 # 48154 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_56 - 222 DUF2075 PF09848.4 352 8.3e-05 14.8 0.1 1 2 1.8e-06 0.00023 13.4 0.0 3 28 51 76 49 105 0.82 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_56 - 222 DUF2075 PF09848.4 352 8.3e-05 14.8 0.1 2 2 0.056 6.9 -1.4 0.0 207 245 166 203 147 212 0.70 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_24 - 562 TIGR00755 TIGR00755 256 1.6e-05 17.1 0.0 1 1 2.8e-07 3.4e-05 16.1 0.0 15 106 406 494 393 498 0.83 # 19666 # 21351 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_114 - 358 TIP49 PF06068.8 398 0.0054 8.6 2.2 1 3 0.0064 0.79 1.5 0.1 61 77 3 19 1 26 0.85 # 103042 # 104115 # 1 # ID=1_114;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.489 1_114 - 358 TIP49 PF06068.8 398 0.0054 8.6 2.2 2 3 0.0015 0.18 3.6 0.0 49 69 50 70 47 83 0.87 # 103042 # 104115 # 1 # ID=1_114;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.489 1_114 - 358 TIP49 PF06068.8 398 0.0054 8.6 2.2 3 3 0.0064 0.8 1.5 0.0 246 286 305 344 285 349 0.74 # 103042 # 104115 # 1 # ID=1_114;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.489 1_124 - 405 HTH_36 PF13730.1 55 5.1e-06 19.8 0.0 1 2 0.0068 0.85 3.1 0.0 20 47 159 186 148 187 0.79 # 110410 # 111624 # -1 # ID=1_124;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.454 1_124 - 405 HTH_36 PF13730.1 55 5.1e-06 19.8 0.0 2 2 3.9e-06 0.00048 13.5 0.0 6 55 271 325 269 325 0.86 # 110410 # 111624 # -1 # ID=1_124;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.454 1_60 - 419 Terminase_6 PF03237.10 384 1.8e-21 69.5 0.0 1 1 1.7e-23 2.1e-21 69.3 0.0 4 382 31 403 28 405 0.89 # 46898 # 48154 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_56 - 222 T2SE PF00437.15 272 0.00022 13.4 0.1 1 1 3.2e-06 0.0004 12.5 0.1 117 164 38 85 5 109 0.79 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_56 - 222 NACHT PF05729.7 166 4.8e-05 16.3 0.0 1 1 1.8e-06 0.00011 15.1 0.0 2 30 51 79 50 106 0.84 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_12 - 215 NACHT PF05729.7 166 0.00096 12.0 0.1 1 1 2.8e-05 0.0017 11.2 0.1 4 20 6 22 3 27 0.87 # 12273 # 12917 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_94 - 382 AP_endonuc_2 PF01261.19 213 0.00021 13.8 0.1 1 2 0.01 1.3 1.4 0.0 60 119 55 107 22 118 0.72 # 82529 # 83674 # -1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.415 1_94 - 382 AP_endonuc_2 PF01261.19 213 0.00021 13.8 0.1 2 2 2.1e-05 0.0026 10.3 0.0 62 133 201 265 138 270 0.81 # 82529 # 83674 # -1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.415 1_56 - 222 UPF0079 PF02367.12 123 4.6e-06 19.5 0.0 1 1 8e-08 1e-05 18.4 0.0 9 47 43 82 36 93 0.87 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_77 - 197 Lambda_tail_I PF06805.7 82 0.00014 14.9 0.0 1 1 3.4e-06 0.00042 13.4 0.0 5 81 7 95 4 96 0.75 # 63186 # 63776 # 1 # ID=1_77;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_12 - 215 AAA_17 PF13207.1 121 1.9e-13 44.6 0.1 1 1 3.9e-15 2.4e-13 44.2 0.1 1 95 4 103 4 192 0.76 # 12273 # 12917 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_56 - 222 AAA_17 PF13207.1 121 5.7e-07 23.6 0.0 1 1 1.6e-08 1e-06 22.8 0.0 1 33 51 86 51 183 0.81 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_56 - 222 TIGR02211 TIGR02211 221 4.5e-16 51.9 0.2 1 2 2.7e-09 1.7e-07 23.9 0.0 15 51 33 69 22 81 0.90 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_56 - 222 TIGR02211 TIGR02211 221 4.5e-16 51.9 0.2 2 2 4.7e-10 2.9e-08 26.3 0.0 119 215 102 200 83 204 0.86 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_3 - 639 TIGR02211 TIGR02211 221 3.2e-05 16.4 0.2 1 2 0.045 2.8 0.2 0.1 39 51 41 53 31 70 0.84 # 2299 # 4215 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.466 1_3 - 639 TIGR02211 TIGR02211 221 3.2e-05 16.4 0.2 2 2 5.2e-06 0.00032 13.1 0.0 137 218 543 634 520 636 0.79 # 2299 # 4215 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.466 1_92 - 447 AAA_25 PF13481.1 194 2.4e-13 43.1 0.1 1 2 0.09 2.8 0.5 0.0 120 176 44 103 12 114 0.63 # 79934 # 81274 # 1 # ID=1_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_92 - 447 AAA_25 PF13481.1 194 2.4e-13 43.1 0.1 2 2 6.6e-14 2.1e-12 40.1 0.0 14 193 189 372 175 373 0.75 # 79934 # 81274 # 1 # ID=1_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_114 - 358 AAA_25 PF13481.1 194 2.1e-07 23.7 0.0 1 1 3e-08 9.4e-07 21.6 0.0 11 157 25 157 18 216 0.68 # 103042 # 104115 # 1 # ID=1_114;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.489 1_56 - 222 AAA_25 PF13481.1 194 0.00028 13.5 0.1 1 2 0.00011 0.0035 9.9 0.0 19 50 31 66 15 88 0.76 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_56 - 222 AAA_25 PF13481.1 194 0.00028 13.5 0.1 2 2 0.049 1.5 1.3 0.1 165 185 162 182 144 186 0.80 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_37 - 367 AAA_25 PF13481.1 194 0.00036 13.2 0.1 1 1 2.1e-05 0.00065 12.3 0.1 36 60 108 133 99 191 0.84 # 28269 # 29369 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_56 - 222 AAA_15 PF13175.1 415 0.00013 14.3 0.0 1 1 1.2e-06 0.00015 14.1 0.0 14 54 41 95 6 142 0.77 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_12 - 215 AAA_14 PF13173.1 128 0.00021 14.4 0.1 1 1 1.1e-05 0.00069 12.8 0.1 5 35 5 31 2 41 0.80 # 12273 # 12917 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_56 - 222 AAA_14 PF13173.1 128 0.0004 13.5 0.0 1 1 1.9e-05 0.0012 12.0 0.0 2 44 49 90 48 122 0.72 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_37 - 367 VirC1 PF07015.6 231 4.1e-05 15.9 0.0 1 1 5.9e-07 7.3e-05 15.1 0.0 2 40 105 143 104 149 0.93 # 28269 # 29369 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_84 - 231 MerR PF00376.18 38 8.7e-05 15.3 0.1 1 1 2.6e-06 0.00032 13.5 0.0 2 26 87 111 86 124 0.85 # 74492 # 75184 # 1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 1_12 - 215 AAA_33 PF13671.1 143 0.00039 13.5 0.0 1 1 1.1e-05 0.00068 12.7 0.0 5 78 8 81 5 119 0.63 # 12273 # 12917 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_56 - 222 AAA_33 PF13671.1 143 0.00039 13.5 0.1 1 1 1.1e-05 0.00069 12.7 0.1 1 33 51 94 51 213 0.69 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_56 - 222 ArgK PF03308.11 267 1.9e-05 16.8 0.0 1 1 5.3e-07 3.3e-05 15.9 0.0 25 63 45 83 5 86 0.88 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_37 - 367 ArgK PF03308.11 267 0.00078 11.4 0.4 1 1 2e-05 0.0013 10.7 0.4 35 66 111 142 89 155 0.82 # 28269 # 29369 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_3 - 639 SbcCD_C PF13558.1 90 4e-08 26.4 0.1 1 1 7.6e-10 9.4e-08 25.2 0.1 7 89 529 601 520 602 0.84 # 2299 # 4215 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.466 1_109 - 1173 HHH_6 PF14579.1 90 1.3e-16 53.6 0.0 1 1 3.2e-18 4e-16 52.1 0.0 1 84 866 956 866 959 0.93 # 96546 # 100064 # 1 # ID=1_109;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_24 - 562 MTS PF05175.9 170 0.00097 11.7 0.0 1 1 1.9e-05 0.0024 10.5 0.0 97 140 481 518 408 530 0.79 # 19666 # 21351 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_56 - 222 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00012 15.5 0.1 1 1 5.5e-06 0.00068 13.1 0.1 1 26 52 77 52 109 0.80 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_99 - 72 HTH_45 PF14947.1 77 0.00068 12.7 0.0 1 1 9.6e-06 0.0012 11.9 0.0 43 71 33 66 29 70 0.75 # 87076 # 87291 # 1 # ID=1_99;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 1_56 - 222 APS_kinase PF01583.15 157 4.3e-07 22.9 0.0 1 1 6.6e-09 8.2e-07 22.0 0.0 1 38 48 85 48 105 0.86 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_56 - 222 NTPase_1 PF03266.10 168 3.6e-05 16.7 0.0 1 2 5.6e-06 0.00035 13.5 0.0 2 31 52 81 51 85 0.94 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_56 - 222 NTPase_1 PF03266.10 168 3.6e-05 16.7 0.0 2 2 0.055 3.4 0.5 0.0 94 140 143 193 124 216 0.57 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_12 - 215 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00043 13.2 0.1 1 1 1.3e-05 0.00078 12.4 0.1 1 19 4 22 4 28 0.88 # 12273 # 12917 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_18 - 197 RNase_H PF00075.19 132 3.8e-34 111.1 0.0 1 1 4e-36 5e-34 110.7 0.0 3 131 40 178 38 179 0.90 # 16710 # 17300 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.462 1_38 - 700 TIGR00422 TIGR00422 863 1.2e-22 72.6 6.6 1 3 1.2e-13 1.5e-11 35.8 0.2 30 89 25 84 11 106 0.85 # 29461 # 31560 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.522 1_38 - 700 TIGR00422 TIGR00422 863 1.2e-22 72.6 6.6 2 3 0.0042 0.53 1.0 0.1 385 414 235 266 210 272 0.80 # 29461 # 31560 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.522 1_38 - 700 TIGR00422 TIGR00422 863 1.2e-22 72.6 6.6 3 3 4.4e-14 5.4e-12 37.3 0.0 512 696 342 526 315 565 0.79 # 29461 # 31560 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.522 1_59 - 211 HTH_26 PF13443.1 63 0.00069 13.1 0.0 1 2 4e-05 0.005 10.3 0.0 11 34 29 52 25 55 0.90 # 46266 # 46898 # 1 # ID=1_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 1_59 - 211 HTH_26 PF13443.1 63 0.00069 13.1 0.0 2 2 0.081 10 -0.3 0.0 22 44 164 188 161 190 0.74 # 46266 # 46898 # 1 # ID=1_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 1_56 - 222 KAP_NTPase PF07693.9 325 3.6e-07 22.6 0.0 1 1 3.5e-09 4.3e-07 22.4 0.0 17 115 46 142 37 203 0.69 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_116 - 305 ATP-synt_B PF00430.13 132 0.0011 11.9 7.4 1 1 1.8e-05 0.0022 11.0 7.4 45 93 187 233 179 263 0.80 # 104412 # 105326 # 1 # ID=1_116;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 1_9 - 368 TIGR03284 TIGR03284 296 3.7e-68 222.7 0.5 1 4 6.4e-22 8e-20 64.0 0.0 2 84 18 101 17 103 0.95 # 10282 # 11385 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_9 - 368 TIGR03284 TIGR03284 296 3.7e-68 222.7 0.5 2 4 1.5e-08 1.9e-06 20.1 0.1 116 137 100 121 100 138 0.82 # 10282 # 11385 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_9 - 368 TIGR03284 TIGR03284 296 3.7e-68 222.7 0.5 3 4 4.1e-16 5.1e-14 45.0 0.0 139 188 157 206 149 221 0.90 # 10282 # 11385 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_9 - 368 TIGR03284 TIGR03284 296 3.7e-68 222.7 0.5 4 4 5e-30 6.2e-28 90.6 0.0 191 296 260 367 255 367 0.93 # 10282 # 11385 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_19 - 165 PdxJ PF03740.8 239 0.00093 11.5 0.0 1 1 9.4e-06 0.0012 11.2 0.0 149 226 22 99 11 103 0.86 # 17449 # 17943 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_58 - 89 MarR_2 PF12802.2 62 0.00038 13.4 0.1 1 1 5.9e-06 0.00073 12.5 0.1 34 54 38 58 36 72 0.75 # 45804 # 46070 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.464 1_56 - 222 PIF1 PF05970.9 364 5.1e-05 15.5 0.0 1 1 6.8e-07 8.4e-05 14.8 0.0 18 55 45 82 31 85 0.86 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_37 - 367 ParA PF10609.4 81 2.9e-38 122.9 0.4 1 1 4.2e-40 5.3e-38 122.1 0.4 1 81 213 293 213 293 0.99 # 28269 # 29369 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_38 - 700 tRNA-synt_1f PF01921.13 360 2.2e-09 29.6 0.0 1 2 8.5e-05 0.011 7.6 0.0 34 69 40 75 18 79 0.90 # 29461 # 31560 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.522 1_38 - 700 tRNA-synt_1f PF01921.13 360 2.2e-09 29.6 0.0 2 2 2.3e-08 2.8e-06 19.4 0.0 265 323 338 396 332 408 0.74 # 29461 # 31560 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.522 1_12 - 215 CoaE PF01121.15 180 1.6e-06 20.9 0.1 1 1 2.5e-08 3.1e-06 19.9 0.1 2 31 4 34 3 50 0.92 # 12273 # 12917 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_14 - 186 RNase_T PF00929.19 164 6.5e-21 68.5 0.0 1 1 6e-23 7.4e-21 68.3 0.0 3 164 8 168 6 168 0.93 # 13408 # 13965 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 1_12 - 215 SKI PF01202.17 158 0.00094 12.3 0.0 1 1 1.4e-05 0.0017 11.4 0.0 2 23 12 33 11 68 0.89 # 12273 # 12917 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_56 - 222 AAA_10 PF12846.2 304 3.4e-06 19.8 0.4 1 2 3.5e-06 0.00015 14.5 0.0 6 42 54 92 51 107 0.81 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_56 - 222 AAA_10 PF12846.2 304 3.4e-06 19.8 0.4 2 2 0.0063 0.26 3.8 0.1 216 260 140 184 94 191 0.78 # 44242 # 44907 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_3 - 639 AAA_10 PF12846.2 304 5.5e-06 19.2 3.7 1 2 0.00031 0.013 8.1 0.1 10 29 42 64 39 100 0.70 # 2299 # 4215 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.466 1_3 - 639 AAA_10 PF12846.2 304 5.5e-06 19.2 3.7 2 2 3e-05 0.0012 11.5 0.4 62 262 434 617 351 628 0.86 # 2299 # 4215 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.466 1_37 - 367 AAA_10 PF12846.2 304 0.00015 14.4 0.0 1 1 5.7e-06 0.00023 13.8 0.0 7 67 111 172 106 216 0.73 # 28269 # 29369 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_59 - 211 HTH_20 PF12840.2 61 0.00048 13.2 0.0 1 1 2.1e-05 0.0026 10.8 0.0 21 47 25 51 11 58 0.89 # 46266 # 46898 # 1 # ID=1_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 1_12 - 215 CPT PF07931.7 174 0.00064 12.6 0.0 1 2 2.2e-05 0.0027 10.5 0.0 7 45 8 46 5 84 0.81 # 12273 # 12917 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_12 - 215 CPT PF07931.7 174 0.00064 12.6 0.0 2 2 0.077 9.5 -1.0 0.0 61 86 170 195 142 206 0.58 # 12273 # 12917 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_24 - 562 RrnaAD PF00398.15 262 0.0004 12.7 0.0 1 1 5.9e-06 0.00073 11.8 0.0 11 108 401 493 394 502 0.81 # 19666 # 21351 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_116 - 305 TIGR01144 TIGR01144 147 0.062 6.1 9.9 1 2 0.036 4.5 0.1 0.1 109 145 117 153 111 155 0.76 # 104412 # 105326 # 1 # ID=1_116;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 1_116 - 305 TIGR01144 TIGR01144 147 0.062 6.1 9.9 2 2 0.00026 0.032 7.0 6.2 41 89 187 235 179 251 0.84 # 104412 # 105326 # 1 # ID=1_116;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 1_38 - 700 TIGR00435 TIGR00435 466 9e-18 57.4 0.2 1 2 2.7e-09 3.3e-07 22.5 0.1 31 132 39 141 15 151 0.85 # 29461 # 31560 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.522 1_38 - 700 TIGR00435 TIGR00435 466 9e-18 57.4 0.2 2 2 2.1e-12 2.6e-10 32.8 0.0 223 375 314 475 309 510 0.61 # 29461 # 31560 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.522 1_37 - 367 ArsA_ATPase PF02374.10 305 5e-06 18.9 2.7 1 2 1.6e-07 9.8e-06 17.9 0.6 6 38 110 142 105 144 0.88 # 28269 # 29369 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_37 - 367 ArsA_ATPase PF02374.10 305 5e-06 18.9 2.7 2 2 0.083 5.1 -0.8 0.0 114 138 200 225 194 234 0.79 # 28269 # 29369 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_88 - 223 ArsA_ATPase PF02374.10 305 0.0012 11.1 0.8 1 1 3.4e-05 0.0021 10.3 0.8 2 35 3 37 2 45 0.81 # 77130 # 77798 # 1 # ID=1_88;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 1_37 - 367 AAA_31 PF13614.1 157 9.3e-13 41.6 0.0 1 1 2e-13 1.2e-11 37.9 0.0 1 53 105 157 105 235 0.79 # 28269 # 29369 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_88 - 223 AAA_31 PF13614.1 157 5.2e-07 22.9 0.0 1 2 7.6e-06 0.00047 13.3 0.0 1 41 3 44 3 68 0.84 # 77130 # 77798 # 1 # ID=1_88;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 1_88 - 223 AAA_31 PF13614.1 157 5.2e-07 22.9 0.0 2 2 0.00042 0.026 7.6 0.0 109 151 70 114 51 120 0.74 # 77130 # 77798 # 1 # ID=1_88;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 1_114 - 358 TIGR02012 TIGR02012 321 4.6e-47 153.7 0.0 1 1 6.4e-49 7.9e-47 152.9 0.0 35 285 28 308 13 340 0.78 # 103042 # 104115 # 1 # ID=1_114;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.489 1_60 - 419 Terminase_3 PF04466.8 387 2.3e-08 26.7 0.0 1 2 6.8e-10 8.5e-08 24.8 0.0 2 123 24 143 23 159 0.92 # 46898 # 48154 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_60 - 419 Terminase_3 PF04466.8 387 2.3e-08 26.7 0.0 2 2 0.042 5.2 -0.8 0.0 342 385 357 402 322 404 0.70 # 46898 # 48154 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_114 - 358 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.00024 13.8 0.0 1 1 4e-06 0.0005 12.7 0.0 52 81 56 85 51 100 0.84 # 103042 # 104115 # 1 # ID=1_114;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.489 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/52ef42f0-91f9-4527-8075-86a96554121c # Target file: checkm_output/bins/pm1140/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm1140/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/52ef42f0-91f9-4527-8075-86a96554121c checkm_output/bins/pm1140/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 09:35:49 2017 # [ok]