# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 3_4 - 564 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0013 12.3 0.0 1 1 9.7e-06 0.0024 11.5 0.0 105 138 471 502 451 516 0.71 # 1591 # 3282 # -1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 2_29 - 695 KaiC PF06745.8 227 2.3e-05 17.7 0.0 1 2 7e-06 0.0017 11.6 0.0 22 78 201 259 199 342 0.79 # 27199 # 29283 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.426 2_29 - 695 KaiC PF06745.8 227 2.3e-05 17.7 0.0 2 2 0.0019 0.47 3.7 0.0 48 105 357 414 348 425 0.85 # 27199 # 29283 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.426 2_4 - 92 Zn_Tnp_IS1 PF03811.8 36 2e-23 75.8 4.5 1 1 1.6e-25 3.9e-23 74.9 4.5 1 36 1 36 1 36 0.99 # 1178 # 1453 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 1_65 - 156 MADF_DNA_bdg PF10545.4 85 0.00045 14.6 0.0 1 1 4.4e-06 0.0011 13.4 0.0 31 65 27 62 23 86 0.80 # 67928 # 68395 # -1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.496 1_71 - 353 CP_ATPgrasp_1 PF04174.8 330 0.0023 10.7 0.0 1 2 0.072 18 -2.1 0.0 262 305 125 172 113 198 0.68 # 73587 # 74645 # -1 # ID=1_71;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 1_71 - 353 CP_ATPgrasp_1 PF04174.8 330 0.0023 10.7 0.0 2 2 2.5e-05 0.006 9.3 0.0 78 106 276 304 269 342 0.83 # 73587 # 74645 # -1 # ID=1_71;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 2_90 - 254 N6_Mtase PF02384.11 311 9.1e-09 28.9 0.0 1 2 1.1e-05 0.00092 12.5 0.0 55 136 109 176 79 180 0.60 # 71689 # 72450 # 1 # ID=2_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 2_90 - 254 N6_Mtase PF02384.11 311 9.1e-09 28.9 0.0 2 2 6.5e-06 0.00053 13.3 0.0 161 200 179 219 176 245 0.76 # 71689 # 72450 # 1 # ID=2_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 3_4 - 564 N6_Mtase PF02384.11 311 6.2e-06 19.6 0.0 1 1 1.3e-07 1.1e-05 18.8 0.0 89 138 445 492 425 504 0.88 # 1591 # 3282 # -1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 2_60 - 164 N6_Mtase PF02384.11 311 0.002 11.4 0.0 1 1 3.1e-05 0.0025 11.0 0.0 37 78 14 59 5 84 0.72 # 49494 # 49985 # -1 # ID=2_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 2_51 - 284 rve_3 PF13683.1 67 1.5e-17 57.1 0.0 1 1 1.5e-19 3.6e-17 55.9 0.0 1 67 205 271 205 271 0.98 # 44506 # 45357 # -1 # ID=2_51;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.434 1_37 - 353 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.0003 14.4 0.0 1 1 7.9e-06 0.0019 11.8 0.0 20 120 94 189 78 223 0.65 # 41121 # 42179 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.409 2_29 - 695 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 3e-07 24.2 0.0 1 2 5.4e-07 0.00013 15.6 0.0 22 80 181 236 170 243 0.86 # 27199 # 29283 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.426 2_29 - 695 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 3e-07 24.2 0.0 2 2 0.00047 0.11 6.0 0.0 169 204 510 542 500 543 0.81 # 27199 # 29283 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.426 2_90 - 254 N6-adenineMlase PF10237.4 162 1.7e-05 18.7 0.0 1 1 1.1e-07 2.7e-05 18.0 0.0 84 133 163 214 133 225 0.77 # 71689 # 72450 # 1 # ID=2_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 4_4 - 181 Cytidylate_kin2 PF13189.1 179 0.0011 13.0 0.0 1 2 6.6e-05 0.016 9.3 0.0 1 23 2 24 2 46 0.78 # 2203 # 2745 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 4_4 - 181 Cytidylate_kin2 PF13189.1 179 0.0011 13.0 0.0 2 2 0.015 3.6 1.6 0.0 112 135 99 122 91 136 0.77 # 2203 # 2745 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 3_6 - 388 HTH_38 PF13936.1 44 0.00014 15.5 0.1 1 1 1.3e-06 0.00031 14.4 0.1 17 42 178 204 171 204 0.86 # 3530 # 4693 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.470 1_93 - 680 UvrD-helicase PF00580.16 315 9.9e-39 127.6 0.1 1 1 1.1e-39 1.4e-37 123.8 0.1 2 307 6 260 5 268 0.91 # 89369 # 91408 # -1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 1_33 - 595 UvrD-helicase PF00580.16 315 9.2e-31 101.4 2.9 1 3 1.1e-16 1.3e-14 48.4 0.0 2 105 5 91 4 95 0.92 # 36539 # 38323 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_33 - 595 UvrD-helicase PF00580.16 315 9.2e-31 101.4 2.9 2 3 1.1e-17 1.3e-15 51.6 0.3 208 314 145 248 107 249 0.86 # 36539 # 38323 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_33 - 595 UvrD-helicase PF00580.16 315 9.2e-31 101.4 2.9 3 3 0.052 6.4 0.1 0.0 91 128 412 455 373 528 0.74 # 36539 # 38323 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_104 - 402 TBPIP PF07106.8 169 0.049 7.3 30.0 1 3 9.1e-05 0.022 8.4 11.0 59 166 131 235 129 239 0.82 # 98223 # 99428 # 1 # ID=1_104;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_104 - 402 TBPIP PF07106.8 169 0.049 7.3 30.0 2 3 0.0031 0.75 3.5 2.2 71 125 248 300 241 323 0.69 # 98223 # 99428 # 1 # ID=1_104;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_104 - 402 TBPIP PF07106.8 169 0.049 7.3 30.0 3 3 0.0011 0.27 4.9 2.8 71 115 325 369 314 381 0.83 # 98223 # 99428 # 1 # ID=1_104;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_109 - 512 DUF3584 PF12128.3 1201 0.0027 9.2 3.3 1 1 1.6e-05 0.0039 8.6 3.3 304 377 12 86 3 100 0.88 # 101027 # 102562 # 1 # ID=1_109;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.606 2_29 - 695 DUF853 PF05872.7 504 6.9e-05 15.4 0.0 1 1 6.2e-07 0.00015 14.3 0.0 10 60 187 237 179 245 0.87 # 27199 # 29283 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.426 1_50 - 86 TetR_N PF00440.18 47 0.0013 12.5 0.0 1 1 1e-05 0.0026 11.6 0.0 2 26 33 57 32 57 0.93 # 54463 # 54720 # 1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_93 - 680 AAA_19 PF13245.1 76 9.1e-10 32.4 0.1 1 1 3.9e-11 2.4e-09 31.0 0.1 14 75 21 86 11 87 0.88 # 89369 # 91408 # -1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 1_33 - 595 AAA_19 PF13245.1 76 3.6e-09 30.5 0.0 1 1 8.1e-10 5e-08 26.8 0.0 3 75 12 86 10 87 0.84 # 36539 # 38323 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 4_4 - 181 AAA_19 PF13245.1 76 0.00057 13.8 0.0 1 1 3.3e-05 0.002 12.1 0.0 15 33 5 22 2 38 0.84 # 2203 # 2745 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_14 - 418 AAA_19 PF13245.1 76 0.00088 13.2 0.0 1 1 3.6e-05 0.0022 11.9 0.0 20 48 125 152 123 182 0.82 # 15457 # 16710 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 1_14 - 418 CbiA PF01656.18 195 1.8e-22 73.8 0.0 1 1 1.1e-24 2.7e-22 73.3 0.0 1 178 117 348 117 365 0.73 # 15457 # 16710 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 2_88 - 175 Pox_D5 PF03288.11 86 0.00034 15.1 0.6 1 1 2.1e-06 0.00051 14.5 0.1 34 69 38 81 35 102 0.85 # 69999 # 70523 # -1 # ID=2_88;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.434 3_7 - 271 MethyltransfD12 PF02086.10 260 9.4e-49 160.3 0.0 1 1 4.3e-51 1e-48 160.1 0.0 1 257 6 249 6 252 0.91 # 5064 # 5876 # 1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.445 1_15 - 335 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00034 14.2 0.0 1 1 3.4e-06 0.00083 13.0 0.0 28 51 175 198 173 200 0.94 # 16707 # 17711 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 1_1 - 286 Rep_3 PF01051.16 222 6.4e-28 92.0 1.1 1 1 7.4e-30 9.1e-28 91.5 1.1 2 220 16 270 15 274 0.83 # 3 # 860 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.430 2_95 - 363 Rep_3 PF01051.16 222 5.3e-16 53.0 2.2 1 1 7.1e-18 8.7e-16 52.3 2.2 6 219 32 285 27 288 0.82 # 78403 # 79491 # -1 # ID=2_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.445 2_51 - 284 rve PF00665.21 120 6e-30 98.0 0.0 1 1 7.2e-32 8.7e-30 97.5 0.0 2 120 118 234 117 234 0.97 # 44506 # 45357 # -1 # ID=2_51;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.434 7_1 - 235 rve PF00665.21 120 8e-13 42.7 0.1 1 2 0.03 3.6 1.9 0.0 78 102 27 49 6 54 0.84 # 64 # 768 # 1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 7_1 - 235 rve PF00665.21 120 8e-13 42.7 0.1 2 2 1.2e-13 1.5e-11 38.7 0.0 9 119 75 182 70 183 0.89 # 64 # 768 # 1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_14 - 418 YhjQ PF06564.7 244 0.0018 11.8 0.2 1 2 0.00059 0.14 5.6 0.1 6 41 119 157 115 170 0.78 # 15457 # 16710 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 1_14 - 418 YhjQ PF06564.7 244 0.0018 11.8 0.2 2 2 0.002 0.49 3.8 0.0 115 149 257 291 233 297 0.83 # 15457 # 16710 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 4_4 - 181 AAA_24 PF13479.1 213 0.00017 15.3 0.0 1 1 1.4e-06 0.00034 14.4 0.0 6 33 3 34 1 73 0.90 # 2203 # 2745 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 2_90 - 254 Methyltransf_26 PF13659.1 117 3.6e-13 43.8 0.1 1 1 1.2e-14 1.5e-12 41.7 0.0 1 115 101 201 101 207 0.81 # 71689 # 72450 # 1 # ID=2_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 3_4 - 564 Methyltransf_26 PF13659.1 117 1.1e-08 29.3 0.0 1 1 1.9e-10 2.4e-08 28.2 0.0 3 116 422 516 418 517 0.80 # 1591 # 3282 # -1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 4_4 - 181 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00011 15.5 0.0 1 2 4.7e-06 0.0011 12.2 0.0 19 53 3 35 1 120 0.83 # 2203 # 2745 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 4_4 - 181 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00011 15.5 0.0 2 2 0.024 5.8 0.1 0.0 45 74 106 133 95 150 0.73 # 2203 # 2745 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_33 - 595 AAA_30 PF13604.1 196 7.9e-05 16.4 0.3 1 2 2.9e-05 0.0035 11.1 0.0 4 66 6 66 4 90 0.72 # 36539 # 38323 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_33 - 595 AAA_30 PF13604.1 196 7.9e-05 16.4 0.3 2 2 0.018 2.2 2.0 0.0 91 132 187 227 162 261 0.83 # 36539 # 38323 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_93 - 680 AAA_30 PF13604.1 196 0.00068 13.4 0.0 1 2 0.00018 0.022 8.5 0.0 7 40 10 39 4 84 0.71 # 89369 # 91408 # -1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 1_93 - 680 AAA_30 PF13604.1 196 0.00068 13.4 0.0 2 2 0.013 1.6 2.4 0.0 97 133 213 248 195 301 0.82 # 89369 # 91408 # -1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 1_71 - 353 ATPgrasp_Ter PF15632.1 330 6.9e-130 426.7 0.0 1 1 3.2e-132 7.7e-130 426.5 0.0 1 329 4 344 4 345 0.98 # 73587 # 74645 # -1 # ID=1_71;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 1_107 - 128 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 3.6e-17 56.3 0.1 1 1 5.6e-19 4.5e-17 56.0 0.1 4 52 9 58 6 81 0.86 # 100250 # 100633 # 1 # ID=1_107;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 2_52 - 174 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 5.5e-07 23.7 0.2 1 2 2.6e-07 2.1e-05 18.6 0.0 5 49 4 49 1 63 0.87 # 45354 # 45875 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 2_52 - 174 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 5.5e-07 23.7 0.2 2 2 0.022 1.8 2.8 0.1 9 53 65 114 63 140 0.70 # 45354 # 45875 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 7_1 - 235 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.0006 13.9 0.3 1 1 1.6e-05 0.0013 12.9 0.3 4 51 6 58 4 63 0.79 # 64 # 768 # 1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 2_69 - 795 TIGR02432 TIGR02432 189 0.00055 13.8 0.0 1 1 4.4e-06 0.0011 12.8 0.0 2 41 77 116 76 148 0.70 # 54137 # 56521 # -1 # ID=2_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.510 2_29 - 695 TraG-D_C PF12696.2 128 1.7e-11 38.2 0.0 1 1 1.5e-13 3.5e-11 37.2 0.0 2 112 505 617 504 631 0.82 # 27199 # 29283 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.426 7_1 - 235 DDE_3 PF13358.1 146 0.0017 12.3 0.0 1 1 2.1e-05 0.0051 10.7 0.0 32 90 82 141 59 146 0.87 # 64 # 768 # 1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 4_4 - 181 TIGR03263 TIGR03263 180 0.0018 11.8 0.0 1 1 1.6e-05 0.0039 10.7 0.0 3 26 2 25 1 31 0.81 # 2203 # 2745 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_14 - 418 MipZ PF09140.6 261 1.1e-11 38.4 0.1 1 2 1.4e-08 3.4e-06 20.4 0.1 2 39 116 156 115 170 0.78 # 15457 # 16710 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 1_14 - 418 MipZ PF09140.6 261 1.1e-11 38.4 0.1 2 2 5.4e-07 0.00013 15.2 0.0 77 126 236 287 213 297 0.75 # 15457 # 16710 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 2_90 - 254 UPF0020 PF01170.13 180 0.00027 14.7 0.0 1 1 5.2e-06 0.0013 12.5 0.0 16 126 88 185 76 221 0.68 # 71689 # 72450 # 1 # ID=2_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 6_1 - 421 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 1.9e-34 113.2 0.2 1 1 3.4e-36 4.2e-34 112.1 0.0 6 213 128 362 123 362 0.96 # 187 # 1449 # 1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.340 2_49 - 371 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 2.1e-31 103.3 0.0 1 1 2.2e-33 2.7e-31 102.9 0.0 2 213 107 348 106 348 0.96 # 43058 # 44170 # -1 # ID=2_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.520 1_109 - 512 DivIC PF04977.10 80 0.01 9.5 5.3 1 2 0.0024 0.29 4.9 2.4 19 51 16 48 8 52 0.68 # 101027 # 102562 # 1 # ID=1_109;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.606 1_109 - 512 DivIC PF04977.10 80 0.01 9.5 5.3 2 2 0.0027 0.33 4.7 0.0 21 49 58 86 54 88 0.81 # 101027 # 102562 # 1 # ID=1_109;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.606 1_104 - 402 DivIC PF04977.10 80 0.026 8.2 33.9 1 6 0.0041 0.5 4.1 1.6 26 50 132 156 119 164 0.81 # 98223 # 99428 # 1 # ID=1_104;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_104 - 402 DivIC PF04977.10 80 0.026 8.2 33.9 2 6 0.017 2.1 2.1 1.1 22 48 156 182 153 199 0.71 # 98223 # 99428 # 1 # ID=1_104;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_104 - 402 DivIC PF04977.10 80 0.026 8.2 33.9 3 6 0.033 4.1 1.2 0.5 17 47 207 237 200 240 0.71 # 98223 # 99428 # 1 # ID=1_104;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_104 - 402 DivIC PF04977.10 80 0.026 8.2 33.9 4 6 5.8e-05 0.0071 10.0 0.8 19 57 244 282 237 286 0.87 # 98223 # 99428 # 1 # ID=1_104;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_104 - 402 DivIC PF04977.10 80 0.026 8.2 33.9 5 6 0.0068 0.83 3.4 0.1 22 49 303 330 296 335 0.72 # 98223 # 99428 # 1 # ID=1_104;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_104 - 402 DivIC PF04977.10 80 0.026 8.2 33.9 6 6 0.00025 0.031 8.0 1.7 23 49 339 365 333 374 0.89 # 98223 # 99428 # 1 # ID=1_104;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 2_51 - 284 DDE_Tnp_1_2 PF13586.1 88 0.0013 13.2 0.1 1 1 2.6e-05 0.0064 10.9 0.1 3 58 187 231 185 235 0.82 # 44506 # 45357 # -1 # ID=2_51;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.434 1_33 - 595 AAA_12 PF13087.1 200 1.6e-08 28.3 0.1 1 3 0.00079 0.19 5.2 0.0 98 153 33 84 13 94 0.78 # 36539 # 38323 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_33 - 595 AAA_12 PF13087.1 200 1.6e-08 28.3 0.1 2 3 0.0026 0.64 3.5 0.0 5 52 240 287 237 400 0.74 # 36539 # 38323 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_33 - 595 AAA_12 PF13087.1 200 1.6e-08 28.3 0.1 3 3 5.1e-07 0.00012 15.6 0.0 136 196 497 563 409 567 0.81 # 36539 # 38323 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_84 - 99 Sigma70_r4 PF04545.11 50 8.1e-05 16.1 0.0 1 1 4.9e-07 0.00012 15.5 0.0 3 42 9 48 8 49 0.84 # 84099 # 84395 # 1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 1_15 - 335 Phage_CI_repr PF07022.8 66 1.6e-06 22.3 0.0 1 1 1.4e-08 3.5e-06 21.2 0.0 7 50 168 244 164 256 0.92 # 16707 # 17711 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 1_37 - 353 AAA PF00004.24 132 0.00053 14.4 0.0 1 1 4.7e-06 0.0012 13.3 0.0 1 74 99 178 99 237 0.73 # 41121 # 42179 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.409 2_43 - 395 KorB PF08535.5 93 3.1e-05 18.3 0.3 1 1 1.7e-06 0.0002 15.7 0.1 5 48 170 213 166 252 0.76 # 37894 # 39078 # -1 # ID=2_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 2_48 - 68 KorB PF08535.5 93 9e-05 16.8 0.3 1 1 8.1e-07 9.9e-05 16.7 0.3 44 90 20 66 6 67 0.87 # 42279 # 42482 # 1 # ID=2_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.520 1_84 - 99 HTH_37 PF13744.1 80 3.6e-08 27.3 0.0 1 1 2.1e-10 5e-08 26.9 0.0 23 76 18 70 10 73 0.92 # 84099 # 84395 # 1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 1_93 - 680 Herpes_ori_bp PF02399.10 824 0.0012 10.9 0.0 1 1 8.6e-06 0.0021 10.2 0.0 52 108 20 82 9 218 0.83 # 89369 # 91408 # -1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 1_65 - 156 HTH_27 PF13463.1 68 0.00085 13.8 0.3 1 2 3.7e-05 0.0089 10.6 0.0 1 44 3 48 3 49 0.87 # 67928 # 68395 # -1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.496 1_65 - 156 HTH_27 PF13463.1 68 0.00085 13.8 0.3 2 2 0.037 9 0.9 0.1 17 42 112 138 106 149 0.81 # 67928 # 68395 # -1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.496 2_75 - 417 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 1.3e-22 74.6 0.0 1 1 7.8e-25 1.9e-22 74.0 0.0 1 227 128 389 128 393 0.81 # 59705 # 60955 # -1 # ID=2_75;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 2_51 - 284 rve_2 PF13333.1 52 4.6e-23 75.3 1.1 1 1 4.6e-25 1.1e-22 74.0 1.1 1 51 224 278 224 279 0.96 # 44506 # 45357 # -1 # ID=2_51;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.434 1_20 - 346 Hydantoinase_A PF01968.13 290 5.6e-08 26.3 0.8 1 2 1.2e-06 0.00028 14.2 0.2 72 101 186 214 177 222 0.82 # 20817 # 21854 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.384 1_20 - 346 Hydantoinase_A PF01968.13 290 5.6e-08 26.3 0.8 2 2 1.4e-05 0.0034 10.6 0.0 195 275 258 332 231 344 0.78 # 20817 # 21854 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.384 4_4 - 181 cobW PF02492.14 178 0.002 11.7 0.0 1 1 1.3e-05 0.0032 11.1 0.0 2 22 2 22 1 30 0.79 # 2203 # 2745 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 2_32 - 394 Mt_ATP-synt_B PF05405.9 163 0.0012 12.5 0.0 1 1 9.5e-06 0.0023 11.5 0.0 105 146 248 289 234 299 0.84 # 31052 # 32233 # 1 # ID=2_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.477 1_71 - 353 ATP-grasp_3 PF02655.9 161 0.00016 15.7 0.0 1 2 0.044 11 0.0 0.0 110 144 76 112 40 118 0.76 # 73587 # 74645 # -1 # ID=1_71;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 1_71 - 353 ATP-grasp_3 PF02655.9 161 0.00016 15.7 0.0 2 2 5.8e-06 0.0014 12.7 0.0 2 86 115 231 114 239 0.84 # 73587 # 74645 # -1 # ID=1_71;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 1_93 - 680 AAA_22 PF13401.1 131 1.9e-05 19.0 0.1 1 2 0.00021 0.017 9.4 0.0 4 65 17 75 13 100 0.79 # 89369 # 91408 # -1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 1_93 - 680 AAA_22 PF13401.1 131 1.9e-05 19.0 0.1 2 2 0.0014 0.12 6.7 0.0 41 108 152 232 117 246 0.67 # 89369 # 91408 # -1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 4_4 - 181 AAA_22 PF13401.1 131 4.1e-05 17.9 0.0 1 1 9.9e-07 8.1e-05 17.0 0.0 6 37 2 34 1 177 0.84 # 2203 # 2745 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 2_29 - 695 AAA_22 PF13401.1 131 0.00041 14.7 0.1 1 2 0.00011 0.0093 10.3 0.1 5 24 199 218 198 295 0.71 # 27199 # 29283 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.426 2_29 - 695 AAA_22 PF13401.1 131 0.00041 14.7 0.1 2 2 0.065 5.3 1.4 0.0 89 121 505 534 458 544 0.72 # 27199 # 29283 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.426 1_33 - 595 TIGR01074 TIGR01074 668 9.3e-55 179.8 1.3 1 2 2.2e-33 2.7e-31 102.3 0.4 5 404 7 377 4 381 0.83 # 36539 # 38323 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_33 - 595 TIGR01074 TIGR01074 668 9.3e-55 179.8 1.3 2 2 5.4e-25 6.5e-23 74.6 0.0 497 610 450 563 412 575 0.76 # 36539 # 38323 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_93 - 680 TIGR01074 TIGR01074 668 1.8e-51 169.0 0.0 1 2 9.3e-39 1.1e-36 120.1 0.0 2 304 5 308 4 404 0.84 # 89369 # 91408 # -1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 1_93 - 680 TIGR01074 TIGR01074 668 1.8e-51 169.0 0.0 2 2 1.5e-16 1.8e-14 46.7 0.0 532 610 516 607 494 613 0.79 # 89369 # 91408 # -1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 3_4 - 564 Methyltransf_27 PF13708.1 194 9e-57 185.9 0.1 1 1 1.5e-58 1.8e-56 184.9 0.0 2 194 93 296 92 296 0.95 # 1591 # 3282 # -1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_103 - 273 Methyltransf_27 PF13708.1 194 1.4e-46 152.7 0.0 1 1 1.4e-48 1.6e-46 152.4 0.0 3 194 72 266 70 266 0.95 # 97408 # 98226 # 1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 1_10 - 286 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 0.0026 11.6 0.0 1 1 2.4e-05 0.0058 10.5 0.0 65 106 26 67 20 71 0.84 # 7113 # 7970 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 4_4 - 181 AAA_28 PF13521.1 163 0.00033 14.8 0.0 1 1 2.9e-06 0.00071 13.7 0.0 2 30 3 34 2 165 0.89 # 2203 # 2745 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_92 - 107 RNA_pol_Rpb6 PF01192.17 57 0.001 13.0 0.0 1 1 6.8e-06 0.0017 12.3 0.0 17 37 77 97 75 104 0.87 # 89046 # 89366 # 1 # ID=1_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.517 2_52 - 174 HTH_32 PF13565.1 77 1.1e-09 33.2 0.3 1 2 2.1e-06 0.00026 15.9 0.0 2 57 39 88 38 92 0.82 # 45354 # 45875 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 2_52 - 174 HTH_32 PF13565.1 77 1.1e-09 33.2 0.3 2 2 3.4e-06 0.00041 15.3 0.3 1 44 96 140 96 166 0.73 # 45354 # 45875 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 7_1 - 235 HTH_32 PF13565.1 77 3.2e-06 22.1 0.2 1 1 1.1e-07 1.4e-05 20.0 0.0 26 76 5 50 2 51 0.83 # 64 # 768 # 1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_33 - 595 TIGR00609 TIGR00609 1175 4.7e-17 55.2 7.7 1 4 6.8e-07 8.3e-05 14.6 0.0 12 67 19 71 11 80 0.87 # 36539 # 38323 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_33 - 595 TIGR00609 TIGR00609 1175 4.7e-17 55.2 7.7 2 4 4.7e-10 5.7e-08 25.1 0.0 376 457 194 275 190 285 0.83 # 36539 # 38323 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_33 - 595 TIGR00609 TIGR00609 1175 4.7e-17 55.2 7.7 3 4 0.039 4.8 -1.2 0.2 241 287 419 468 405 484 0.72 # 36539 # 38323 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_33 - 595 TIGR00609 TIGR00609 1175 4.7e-17 55.2 7.7 4 4 3.8e-07 4.6e-05 15.4 0.2 781 812 533 564 494 568 0.80 # 36539 # 38323 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_93 - 680 TIGR00609 TIGR00609 1175 1.3e-15 50.4 0.0 1 3 0.0088 1.1 1.0 0.1 10 63 18 69 12 83 0.85 # 89369 # 91408 # -1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 1_93 - 680 TIGR00609 TIGR00609 1175 1.3e-15 50.4 0.0 2 3 6e-11 7.3e-09 28.0 0.0 342 419 186 255 147 298 0.80 # 89369 # 91408 # -1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 1_93 - 680 TIGR00609 TIGR00609 1175 1.3e-15 50.4 0.0 3 3 1e-07 1.3e-05 17.3 0.0 731 813 539 609 530 628 0.81 # 89369 # 91408 # -1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 1_84 - 99 HTH_3 PF01381.17 55 1.7e-16 54.0 0.0 1 1 1.1e-18 2.8e-16 53.3 0.0 5 53 22 70 21 71 0.97 # 84099 # 84395 # 1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 6_1 - 421 DDE_Tnp_1_4 PF13701.1 449 7.9e-27 87.6 3.5 1 2 0.0052 1.3 1.2 0.0 11 42 5 36 3 62 0.72 # 187 # 1449 # 1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.340 6_1 - 421 DDE_Tnp_1_4 PF13701.1 449 7.9e-27 87.6 3.5 2 2 1.5e-28 3.6e-26 85.4 2.2 137 438 122 418 41 420 0.82 # 187 # 1449 # 1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.340 2_52 - 174 HTH_23 PF13384.1 50 1e-12 41.5 0.6 1 2 1.9e-09 7.8e-08 26.0 0.0 5 49 9 54 6 55 0.89 # 45354 # 45875 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 2_52 - 174 HTH_23 PF13384.1 50 1e-12 41.5 0.6 2 2 2.8e-05 0.0011 12.8 0.4 3 50 64 113 62 113 0.90 # 45354 # 45875 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 7_1 - 235 HTH_23 PF13384.1 50 1.5e-05 18.8 0.7 1 2 0.095 3.8 1.6 0.0 7 27 11 35 7 36 0.69 # 64 # 768 # 1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 7_1 - 235 HTH_23 PF13384.1 50 1.5e-05 18.8 0.7 2 2 1.1e-05 0.00045 14.0 0.1 28 42 41 55 40 62 0.87 # 64 # 768 # 1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 2_4 - 92 HTH_23 PF13384.1 50 5.5e-05 17.0 0.0 1 1 2.2e-06 8.8e-05 16.3 0.0 7 40 53 86 51 90 0.93 # 1178 # 1453 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 1_84 - 99 HTH_23 PF13384.1 50 0.00017 15.4 0.0 1 1 6.1e-06 0.00025 14.9 0.0 15 37 24 46 17 58 0.87 # 84099 # 84395 # 1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 1_107 - 128 HTH_23 PF13384.1 50 0.00028 14.7 0.0 1 1 1.1e-05 0.00043 14.1 0.0 6 45 16 56 11 60 0.88 # 100250 # 100633 # 1 # ID=1_107;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 3_6 - 388 HTH_23 PF13384.1 50 0.0011 12.8 0.4 1 1 8.3e-05 0.0034 11.3 0.1 13 39 179 204 173 208 0.84 # 3530 # 4693 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.470 1_14 - 418 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.00022 14.6 0.0 1 2 2.7e-06 0.00065 13.1 0.0 7 58 122 176 116 201 0.79 # 15457 # 16710 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 1_14 - 418 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.00022 14.6 0.0 2 2 0.1 24 -1.9 0.0 30 65 324 358 321 391 0.61 # 15457 # 16710 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 1_84 - 99 HTH_19 PF12844.2 64 1.8e-11 38.1 0.0 1 1 1.1e-13 2.7e-11 37.6 0.0 7 55 21 69 20 71 0.95 # 84099 # 84395 # 1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 2_4 - 92 zinc_ribbon_4 PF13717.1 36 0.00014 15.7 4.1 1 1 1.6e-06 0.00038 14.3 4.1 3 35 6 39 5 40 0.86 # 1178 # 1453 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 2_52 - 174 HTH_29 PF13551.1 112 1.2e-12 42.1 0.3 1 2 5.6e-08 6.8e-06 20.4 0.0 16 75 26 80 11 86 0.82 # 45354 # 45875 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 2_52 - 174 HTH_29 PF13551.1 112 1.2e-12 42.1 0.3 2 2 7.1e-09 8.6e-07 23.3 0.3 1 76 68 145 68 167 0.79 # 45354 # 45875 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 1_107 - 128 HTH_29 PF13551.1 112 0.00012 16.4 0.1 1 1 1.9e-06 0.00023 15.5 0.1 3 54 19 69 17 82 0.78 # 100250 # 100633 # 1 # ID=1_107;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 3_1 - 214 TIGR03413 TIGR03413 248 3.5e-06 20.4 0.0 1 1 1.8e-08 4.3e-06 20.1 0.0 41 146 56 173 16 183 0.73 # 160 # 801 # 1 # ID=3_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.410 1_109 - 512 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 3.8e-101 332.0 0.0 1 1 3.1e-103 3.8e-101 332.0 0.0 1 271 175 462 175 462 0.98 # 101027 # 102562 # 1 # ID=1_109;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.606 7_1 - 235 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 5.7e-12 39.5 0.3 1 1 6e-14 7.3e-12 39.2 0.3 5 132 10 144 6 174 0.87 # 64 # 768 # 1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 2_90 - 254 Methyltransf_31 PF13847.1 152 0.00096 12.9 0.0 1 1 9.3e-06 0.0023 11.7 0.0 8 106 105 197 99 230 0.77 # 71689 # 72450 # 1 # ID=2_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_33 - 595 PhoH PF02562.11 205 7.5e-07 22.7 0.5 1 1 8.8e-08 2.1e-05 17.9 0.5 6 177 5 246 2 258 0.76 # 36539 # 38323 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_37 - 353 AAA_5 PF07728.9 139 5.9e-34 110.9 0.0 1 1 3.9e-36 9.6e-34 110.3 0.0 1 139 98 238 98 238 0.96 # 41121 # 42179 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.409 2_69 - 795 PAPS_reduct PF01507.14 174 4e-08 27.4 0.0 1 1 4.2e-10 1e-07 26.1 0.0 3 150 78 264 76 269 0.70 # 54137 # 56521 # -1 # ID=2_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.510 2_29 - 695 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.2e-16 54.5 0.1 1 2 6.1e-07 0.00015 14.6 0.0 16 52 199 235 190 345 0.87 # 27199 # 29283 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.426 2_29 - 695 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.2e-16 54.5 0.1 2 2 8.1e-14 2e-11 37.3 0.0 164 345 412 604 390 646 0.77 # 27199 # 29283 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.426 1_14 - 418 TIGR01968 TIGR01968 261 2.4e-06 20.9 0.1 1 2 3.9e-06 0.00095 12.4 0.1 2 39 115 155 114 185 0.85 # 15457 # 16710 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 1_14 - 418 TIGR01968 TIGR01968 261 2.4e-06 20.9 0.1 2 2 0.00024 0.059 6.5 0.0 103 143 251 291 226 382 0.85 # 15457 # 16710 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 4_4 - 181 AAA_18 PF13238.1 129 1.6e-10 35.5 0.0 1 1 1.2e-12 2.9e-10 34.7 0.0 1 126 3 134 3 137 0.71 # 2203 # 2745 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 2_10 - 418 IMS_HHH PF11798.3 32 1.4e-05 19.2 0.2 1 1 2.4e-07 5.8e-05 17.2 0.2 6 32 171 197 167 197 0.82 # 6323 # 7576 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.485 2_52 - 174 HTH_psq PF05225.11 45 0.0011 12.8 0.2 1 2 0.018 4.5 1.1 0.0 23 31 29 37 28 37 0.87 # 45354 # 45875 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 2_52 - 174 HTH_psq PF05225.11 45 0.0011 12.8 0.2 2 2 7e-05 0.017 8.9 0.1 10 26 73 89 72 89 0.85 # 45354 # 45875 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 2_4 - 92 HTH_Tnp_IS1 PF12759.2 46 5e-31 100.1 0.2 1 1 3.2e-33 7.8e-31 99.5 0.2 1 46 43 88 43 88 0.99 # 1178 # 1453 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 2_29 - 695 DUF87 PF01935.12 229 0.00042 14.3 0.0 1 1 4e-06 0.00098 13.1 0.0 25 68 200 242 189 279 0.89 # 27199 # 29283 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.426 2_52 - 174 HTH_28 PF13518.1 52 1e-24 80.4 0.3 1 2 2.3e-13 1.4e-11 38.4 0.0 1 50 10 60 10 61 0.93 # 45354 # 45875 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 2_52 - 174 HTH_28 PF13518.1 52 1e-24 80.4 0.3 2 2 8.3e-14 5.1e-12 39.8 0.2 2 47 68 115 67 121 0.93 # 45354 # 45875 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 1_107 - 128 HTH_28 PF13518.1 52 1.7e-07 25.3 0.1 1 1 4e-09 2.4e-07 24.8 0.1 1 41 16 57 16 65 0.90 # 100250 # 100633 # 1 # ID=1_107;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 7_1 - 235 HTH_28 PF13518.1 52 0.00014 16.0 1.2 1 1 1e-05 0.00062 14.0 1.2 22 36 40 54 13 55 0.76 # 64 # 768 # 1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 2_4 - 92 HTH_28 PF13518.1 52 0.00022 15.4 0.0 1 1 5.4e-06 0.00033 14.8 0.0 4 35 55 86 53 90 0.90 # 1178 # 1453 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 1_84 - 99 HTH_24 PF13412.1 48 3.3e-05 17.4 0.0 1 1 6.8e-07 5.6e-05 16.7 0.0 14 36 23 45 17 46 0.86 # 84099 # 84395 # 1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 1_15 - 335 HTH_24 PF13412.1 48 0.0012 12.4 0.7 1 1 0.00019 0.016 8.8 0.2 14 39 170 195 165 197 0.87 # 16707 # 17711 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 1_1 - 286 HTH_24 PF13412.1 48 0.0027 11.3 0.7 1 1 0.00019 0.016 8.8 0.0 18 39 107 128 102 129 0.91 # 3 # 860 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.430 2_90 - 254 TIGR03533 TIGR03533 284 3.6e-05 17.1 0.0 1 1 2e-07 4.9e-05 16.6 0.0 119 208 98 184 69 192 0.80 # 71689 # 72450 # 1 # ID=2_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 2_90 - 254 TIGR03534 TIGR03534 253 3.6e-10 33.5 0.0 1 1 6.4e-12 5.2e-10 33.0 0.0 74 177 86 186 71 191 0.88 # 71689 # 72450 # 1 # ID=2_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_20 - 346 TIGR03534 TIGR03534 253 0.00085 12.7 0.0 1 1 1.9e-05 0.0015 11.8 0.0 80 128 290 337 280 341 0.85 # 20817 # 21854 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.384 3_4 - 564 TIGR03534 TIGR03534 253 0.0014 11.9 0.0 1 1 3e-05 0.0024 11.2 0.0 135 175 456 498 444 505 0.74 # 1591 # 3282 # -1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_33 - 595 DEAD PF00270.24 169 7.3e-05 16.5 0.7 1 1 3.8e-06 0.00092 12.9 0.7 4 105 8 107 5 222 0.77 # 36539 # 38323 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_84 - 99 HTH_31 PF13560.1 64 1.1e-08 29.4 0.0 1 1 5.2e-11 1.3e-08 29.2 0.0 5 56 17 67 13 81 0.86 # 84099 # 84395 # 1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 1_33 - 595 UvrD_C_2 PF13538.1 104 2.1e-12 41.3 0.0 1 1 4e-14 4.9e-12 40.1 0.0 47 103 496 562 450 563 0.79 # 36539 # 38323 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_93 - 680 UvrD_C_2 PF13538.1 104 6.4e-11 36.5 0.0 1 1 1.7e-12 2.1e-10 34.9 0.0 40 104 520 607 486 607 0.81 # 89369 # 91408 # -1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 2_76 - 203 TIGR00755 TIGR00755 256 0.00013 15.2 0.2 1 1 9.5e-07 0.00023 14.3 0.2 32 87 83 140 60 151 0.86 # 61124 # 61732 # -1 # ID=2_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.498 1_14 - 418 HTH_OrfB_IS605 PF12323.3 46 0.00061 13.3 0.0 1 2 0.00072 0.18 5.4 0.1 24 38 40 54 40 55 0.89 # 15457 # 16710 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 1_14 - 418 HTH_OrfB_IS605 PF12323.3 46 0.00061 13.3 0.0 2 2 0.00036 0.087 6.4 0.0 17 37 53 73 52 76 0.85 # 15457 # 16710 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 1_14 - 418 HTH_36 PF13730.1 55 0.0019 12.5 0.1 1 1 5.1e-05 0.0062 10.9 0.0 28 52 52 76 31 79 0.91 # 15457 # 16710 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 2_95 - 363 HTH_36 PF13730.1 55 0.0072 10.7 2.0 1 1 0.00019 0.023 9.1 0.8 6 55 220 273 217 273 0.83 # 78403 # 79491 # -1 # ID=2_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.445 1_20 - 346 StbA PF06406.6 318 2.2e-132 434.9 0.7 1 1 1e-134 2.5e-132 434.7 0.7 1 317 22 340 22 341 0.98 # 20817 # 21854 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.384 4_4 - 181 NACHT PF05729.7 166 3.7e-05 17.6 0.0 1 2 7.7e-07 0.00019 15.3 0.0 2 22 2 22 1 37 0.89 # 2203 # 2745 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 4_4 - 181 NACHT PF05729.7 166 3.7e-05 17.6 0.0 2 2 0.045 11 -0.2 0.0 77 91 151 177 95 179 0.61 # 2203 # 2745 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 4_4 - 181 UPF0079 PF02367.12 123 0.0005 13.9 0.0 1 1 3.3e-06 0.00081 13.2 0.0 17 36 2 21 1 30 0.88 # 2203 # 2745 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 4_4 - 181 AAA_17 PF13207.1 121 1.5e-06 23.2 0.1 1 1 1.2e-08 2.8e-06 22.3 0.1 1 77 2 94 2 173 0.54 # 2203 # 2745 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_63 - 214 Bd3614-deam PF14439.1 136 0.00027 15.0 0.1 1 1 1.6e-06 0.0004 14.4 0.1 3 68 47 112 45 122 0.77 # 66163 # 66804 # -1 # ID=1_63;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.481 1_33 - 595 AAA_25 PF13481.1 194 0.00084 12.9 0.0 1 1 1.8e-05 0.0043 10.6 0.0 17 63 3 46 1 62 0.78 # 36539 # 38323 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_93 - 680 Viral_helicase1 PF01443.13 234 1.6e-11 38.3 0.1 1 3 7.8e-07 9.5e-05 16.1 0.0 2 59 21 77 20 88 0.79 # 89369 # 91408 # -1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 1_93 - 680 Viral_helicase1 PF01443.13 234 1.6e-11 38.3 0.1 2 3 0.00024 0.03 8.0 0.0 61 118 208 263 179 348 0.74 # 89369 # 91408 # -1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 1_93 - 680 Viral_helicase1 PF01443.13 234 1.6e-11 38.3 0.1 3 3 0.0006 0.073 6.7 0.0 187 232 540 606 528 608 0.61 # 89369 # 91408 # -1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 1_33 - 595 Viral_helicase1 PF01443.13 234 5.5e-08 26.7 0.1 1 3 0.0057 0.69 3.5 0.0 2 21 20 39 19 91 0.63 # 36539 # 38323 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_33 - 595 Viral_helicase1 PF01443.13 234 5.5e-08 26.7 0.1 2 3 0.0086 1.1 2.9 0.0 40 135 167 261 132 297 0.74 # 36539 # 38323 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_33 - 595 Viral_helicase1 PF01443.13 234 5.5e-08 26.7 0.1 3 3 5.6e-07 6.8e-05 16.6 0.0 174 232 485 562 400 563 0.67 # 36539 # 38323 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 4_4 - 181 AAA_14 PF13173.1 128 0.0014 12.7 0.0 1 1 1.1e-05 0.0028 11.7 0.0 4 27 2 25 1 54 0.79 # 2203 # 2745 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 2_52 - 174 DUF1153 PF06627.6 90 1.5e-07 25.4 0.1 1 2 0.00077 0.19 5.9 0.0 58 81 31 54 20 57 0.87 # 45354 # 45875 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 2_52 - 174 DUF1153 PF06627.6 90 1.5e-07 25.4 0.1 2 2 2e-07 4.8e-05 17.4 0.2 39 86 69 117 66 121 0.89 # 45354 # 45875 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 4_4 - 181 AAA_33 PF13671.1 143 1.4e-10 35.4 0.0 1 1 7.3e-13 1.8e-10 35.0 0.0 2 127 3 130 2 151 0.75 # 2203 # 2745 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_103 - 273 ThiS-like PF14453.1 57 0.0018 12.3 0.0 1 1 1.7e-05 0.0041 11.2 0.0 25 54 165 194 146 196 0.94 # 97408 # 98226 # 1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 2_90 - 254 MTS PF05175.9 170 2.8e-08 27.5 0.0 1 1 3.7e-10 4.5e-08 26.8 0.0 35 144 104 205 89 224 0.72 # 71689 # 72450 # 1 # ID=2_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 3_4 - 564 MTS PF05175.9 170 7.7e-07 22.8 0.0 1 1 1.1e-08 1.3e-06 22.0 0.0 94 156 475 532 447 543 0.80 # 1591 # 3282 # -1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 4_4 - 181 RNA_helicase PF00910.17 107 0.0014 13.0 0.0 1 1 9.1e-06 0.0022 12.3 0.0 1 26 3 28 3 47 0.84 # 2203 # 2745 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_37 - 353 AAA_2 PF07724.9 171 1.2e-05 19.5 0.0 1 1 1.1e-07 2.7e-05 18.3 0.0 5 83 98 177 95 184 0.74 # 41121 # 42179 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.409 4_4 - 181 APS_kinase PF01583.15 157 3.4e-05 17.7 0.0 1 2 7.3e-06 0.0018 12.1 0.0 4 24 2 22 1 35 0.87 # 2203 # 2745 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 4_4 - 181 APS_kinase PF01583.15 157 3.4e-05 17.7 0.0 2 2 0.0032 0.79 3.5 0.1 34 73 107 148 95 160 0.86 # 2203 # 2745 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_112 - 476 DNA_methylase PF00145.12 335 7.9e-76 249.4 0.0 1 1 4.2e-78 1e-75 249.0 0.0 1 333 92 455 92 457 0.87 # 103723 # 105150 # -1 # ID=1_112;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 2_22 - 171 Auto_anti-p27 PF06677.7 41 0.00072 13.5 1.6 1 1 5.5e-06 0.0013 12.6 1.6 19 40 131 152 130 153 0.95 # 20752 # 21264 # -1 # ID=2_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.390 2_4 - 92 zinc_ribbon_5 PF13719.1 37 2.8e-05 17.9 2.9 1 1 3.2e-07 7.9e-05 16.4 2.9 3 36 6 40 5 41 0.83 # 1178 # 1453 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 7_1 - 235 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 1.9e-52 171.2 0.0 1 1 2.1e-54 2.6e-52 170.7 0.0 4 139 75 212 73 213 0.99 # 64 # 768 # 1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 2_51 - 284 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 1.5e-11 38.6 0.0 1 1 2e-13 2.4e-11 37.9 0.0 2 137 123 261 122 264 0.92 # 44506 # 45357 # -1 # ID=2_51;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.434 1_84 - 99 HTH_26 PF13443.1 63 6.2e-06 20.6 0.0 1 1 4.4e-08 1.1e-05 19.8 0.0 7 55 23 70 20 70 0.92 # 84099 # 84395 # 1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 1_1 - 286 TrfA PF07042.6 282 1.8e-06 21.1 0.0 1 1 8.9e-09 2.2e-06 20.8 0.0 84 173 71 164 28 226 0.79 # 3 # 860 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.430 2_4 - 92 Zn_Tnp_IS1595 PF12760.2 46 0.00042 14.3 2.3 1 1 3.4e-06 0.00083 13.4 2.3 21 46 8 38 5 38 0.74 # 1178 # 1453 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 1_65 - 156 HTH_11 PF08279.7 55 7.5e-06 19.7 0.0 1 1 6.5e-08 1.6e-05 18.7 0.0 4 42 9 49 6 62 0.82 # 67928 # 68395 # -1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.496 1_84 - 99 MarR_2 PF12802.2 62 9.1e-05 16.3 0.0 1 1 1.1e-06 0.00014 15.7 0.0 15 41 22 46 7 46 0.83 # 84099 # 84395 # 1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 1_65 - 156 MarR_2 PF12802.2 62 0.00059 13.7 0.1 1 1 1.3e-05 0.0016 12.3 0.1 11 47 13 48 5 49 0.84 # 67928 # 68395 # -1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.496 1_71 - 353 ATP-grasp_4 PF13535.1 184 1.6e-26 87.3 0.0 1 2 0.065 16 -0.7 0.0 101 154 40 76 21 95 0.57 # 73587 # 74645 # -1 # ID=1_71;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 1_71 - 353 ATP-grasp_4 PF13535.1 184 1.6e-26 87.3 0.0 2 2 3.2e-28 7.7e-26 85.1 0.0 2 182 114 293 113 296 0.93 # 73587 # 74645 # -1 # ID=1_71;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 1_14 - 418 HTH_Crp_2 PF13545.1 76 0.0004 14.4 0.0 1 1 8.1e-06 0.00099 13.1 0.0 21 57 42 78 28 88 0.88 # 15457 # 16710 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 1_84 - 99 HTH_Crp_2 PF13545.1 76 0.00069 13.6 0.0 1 1 1e-05 0.0012 12.8 0.0 28 48 26 46 20 47 0.93 # 84099 # 84395 # 1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 2_5 - 466 Seryl_tRNA_N PF02403.17 108 0.0011 13.2 8.8 1 3 0.0031 0.77 4.0 0.1 39 104 167 233 146 237 0.90 # 2000 # 3397 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 2_5 - 466 Seryl_tRNA_N PF02403.17 108 0.0011 13.2 8.8 2 3 0.001 0.25 5.6 0.1 27 59 264 296 252 317 0.85 # 2000 # 3397 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 2_5 - 466 Seryl_tRNA_N PF02403.17 108 0.0011 13.2 8.8 3 3 0.00071 0.17 6.1 1.7 17 107 336 425 330 426 0.75 # 2000 # 3397 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 2_12 - 204 LptE PF04390.7 155 1.6e-05 18.9 0.0 1 1 1.1e-07 2.7e-05 18.1 0.0 2 80 8 88 7 126 0.79 # 8538 # 9149 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 1_12 - 894 AAA_10 PF12846.2 304 2e-65 215.3 0.0 1 1 3.7e-67 3e-65 214.7 0.0 1 303 456 812 456 813 0.93 # 8939 # 11620 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.422 2_29 - 695 AAA_10 PF12846.2 304 7.7e-17 55.8 0.0 1 1 1.9e-18 1.6e-16 54.8 0.0 2 296 199 578 198 585 0.73 # 27199 # 29283 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.426 1_33 - 595 AAA_10 PF12846.2 304 0.00063 13.4 0.2 1 1 3.5e-05 0.0029 11.2 0.0 1 25 16 40 16 49 0.80 # 36539 # 38323 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_65 - 156 HTH_20 PF12840.2 61 0.00014 15.8 0.4 1 2 4.3e-05 0.0053 10.8 0.0 19 50 17 48 7 49 0.91 # 67928 # 68395 # -1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.496 1_65 - 156 HTH_20 PF12840.2 61 0.00014 15.8 0.4 2 2 0.018 2.2 2.4 0.1 7 20 108 121 103 142 0.72 # 67928 # 68395 # -1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.496 2_51 - 284 HTH_20 PF12840.2 61 0.0003 14.8 0.0 1 1 4.8e-06 0.00058 13.8 0.0 27 50 13 36 1 40 0.79 # 44506 # 45357 # -1 # ID=2_51;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.434 2_76 - 203 RrnaAD PF00398.15 262 0.00051 13.3 0.0 1 1 2.7e-06 0.00065 12.9 0.0 52 92 104 144 81 170 0.84 # 61124 # 61732 # -1 # ID=2_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.498 2_90 - 254 Methyltransf_18 PF12847.2 112 3.6e-05 18.5 0.0 1 1 2.7e-07 6.6e-05 17.7 0.0 3 107 102 198 100 203 0.77 # 71689 # 72450 # 1 # ID=2_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 2_82 - 157 DnaJ_CXXCXGXG PF00684.14 66 5.9e-06 20.5 0.2 1 1 9.8e-08 1.2e-05 19.5 0.2 1 32 35 66 20 76 0.75 # 65056 # 65526 # -1 # ID=2_82;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.454 3_9 - 234 DnaJ_CXXCXGXG PF00684.14 66 9.5e-06 19.8 1.4 1 1 1.2e-07 1.5e-05 19.2 1.4 36 64 27 54 17 56 0.85 # 6990 # 7691 # -1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.373 1_33 - 595 UvrD_C PF13361.1 351 3.7e-42 139.1 0.0 1 1 5.7e-44 6.9e-42 138.2 0.0 2 348 254 564 253 567 0.86 # 36539 # 38323 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_93 - 680 UvrD_C PF13361.1 351 3.7e-22 73.3 0.0 1 2 0.0039 0.47 3.9 0.0 74 118 332 377 287 388 0.79 # 89369 # 91408 # -1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 1_93 - 680 UvrD_C PF13361.1 351 3.7e-22 73.3 0.0 2 2 5.1e-22 6.2e-20 66.0 0.0 290 347 538 607 517 611 0.91 # 89369 # 91408 # -1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 2_90 - 254 Methyltransf_11 PF08241.7 95 0.001 13.8 0.0 1 1 9.2e-06 0.0022 12.6 0.0 5 86 109 191 105 198 0.78 # 71689 # 72450 # 1 # ID=2_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_109 - 512 AAA_13 PF13166.1 712 0.0011 11.6 0.2 1 1 1.4e-05 0.0017 11.0 0.2 360 440 4 84 2 102 0.90 # 101027 # 102562 # 1 # ID=1_109;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.606 2_5 - 466 AAA_13 PF13166.1 712 0.0043 9.6 17.5 1 2 3.3e-05 0.004 9.8 2.7 365 467 191 295 141 311 0.52 # 2000 # 3397 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 2_5 - 466 AAA_13 PF13166.1 712 0.0043 9.6 17.5 2 2 0.001 0.12 4.8 8.4 321 439 331 459 289 465 0.75 # 2000 # 3397 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 1_14 - 418 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.5e-09 31.4 0.8 1 2 0.0076 1.9 1.6 0.0 214 274 14 76 6 87 0.78 # 15457 # 16710 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 1_14 - 418 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.5e-09 31.4 0.8 2 2 2.4e-10 5.9e-08 26.2 0.1 8 136 122 269 115 274 0.80 # 15457 # 16710 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 2_4 - 92 DUF2387 PF09526.5 71 0.00043 14.4 0.2 1 1 2.3e-06 0.00055 14.0 0.2 10 47 7 47 5 72 0.76 # 1178 # 1453 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 1_14 - 418 AAA_31 PF13614.1 157 4.4e-08 27.4 0.2 1 2 9.4e-08 2.3e-05 18.5 0.0 9 128 123 270 121 292 0.83 # 15457 # 16710 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 1_14 - 418 AAA_31 PF13614.1 157 4.4e-08 27.4 0.2 2 2 0.00088 0.21 5.6 0.1 14 89 299 381 284 410 0.72 # 15457 # 16710 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 2_75 - 417 FaeA PF04703.7 62 0.0013 13.1 0.1 1 1 1.2e-05 0.003 11.9 0.1 31 54 59 82 52 86 0.90 # 59705 # 60955 # -1 # ID=2_75;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_35 - 126 SSB PF00436.20 104 0.0012 12.8 0.1 1 2 3.3e-05 0.0081 10.2 0.1 2 83 8 87 7 94 0.74 # 39648 # 40025 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.370 1_35 - 126 SSB PF00436.20 104 0.0012 12.8 0.1 2 2 0.033 8.1 0.6 0.0 43 60 92 109 88 112 0.83 # 39648 # 40025 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.370 2_90 - 254 MetW PF07021.7 193 0.00029 14.4 0.0 1 1 3.5e-06 0.00043 13.8 0.0 13 102 100 192 90 202 0.76 # 71689 # 72450 # 1 # ID=2_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 3_4 - 564 MetW PF07021.7 193 0.0016 12.0 0.0 1 1 2.1e-05 0.0026 11.3 0.0 17 83 423 487 409 499 0.84 # 1591 # 3282 # -1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 2_52 - 174 BrkDBD PF09607.5 58 0.002 11.9 0.0 1 1 3.6e-05 0.0087 9.8 0.0 11 47 11 44 2 51 0.80 # 45354 # 45875 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 2_51 - 284 HTH_21 PF13276.1 60 8.3e-16 52.0 5.2 1 2 3.4e-18 8.3e-16 52.0 5.2 6 60 43 96 38 97 0.90 # 44506 # 45357 # -1 # ID=2_51;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.434 2_51 - 284 HTH_21 PF13276.1 60 8.3e-16 52.0 5.2 2 2 0.041 9.9 0.5 0.1 44 56 199 211 185 215 0.73 # 44506 # 45357 # -1 # ID=2_51;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.434 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/042c30d3-9fec-4aab-bf42-e4dc7c1f1b40 # Target file: checkm_output/bins/pm113/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm113/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/042c30d3-9fec-4aab-bf42-e4dc7c1f1b40 checkm_output/bins/pm113/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 09:35:32 2017 # [ok]