# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 9_4 - 284 RepC PF06504.6 283 1.2e-158 520.6 0.0 1 1 5e-161 1.3e-158 520.5 0.0 2 282 2 282 1 283 0.99 # 2959 # 3810 # -1 # ID=9_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.661 7_6 - 565 K_oxygenase PF13434.1 341 1.5e-05 18.3 0.0 1 3 0.0039 1.1 2.4 0.0 187 220 94 125 59 130 0.79 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 7_6 - 565 K_oxygenase PF13434.1 341 1.5e-05 18.3 0.0 2 3 3.3e-06 0.00091 12.5 0.0 132 231 218 308 202 332 0.82 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 7_6 - 565 K_oxygenase PF13434.1 341 1.5e-05 18.3 0.0 3 3 0.057 15 -1.4 0.0 132 160 346 369 314 377 0.67 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 6_5 - 208 HTH_IclR PF09339.5 52 0.00042 14.2 0.1 1 1 3.1e-06 0.00083 13.3 0.1 7 48 8 48 7 51 0.91 # 2567 # 3190 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_28 - 351 ABC_tran PF00005.22 137 0.00045 14.8 0.0 1 1 7.6e-06 0.001 13.7 0.0 14 117 99 225 95 229 0.56 # 30687 # 31739 # 1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 3_29 - 488 ABC_tran PF00005.22 137 0.00081 14.0 0.0 1 1 4.9e-05 0.0066 11.1 0.0 13 51 124 162 117 184 0.81 # 20940 # 22403 # 1 # ID=3_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 8_5 - 187 HTH_22 PF13309.1 64 1.5e-05 19.0 0.3 1 2 0.022 6.1 1.1 0.0 23 38 70 85 58 87 0.81 # 4751 # 5311 # -1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 8_5 - 187 HTH_22 PF13309.1 64 1.5e-05 19.0 0.3 2 2 1.3e-06 0.00036 14.6 0.0 47 64 166 183 164 183 0.93 # 4751 # 5311 # -1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_24 - 559 N6_Mtase PF02384.11 311 0.00014 15.3 0.0 1 1 9.6e-07 0.00026 14.4 0.0 76 138 433 493 400 512 0.87 # 21552 # 23228 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 1_23 - 296 rve_3 PF13683.1 67 4.1e-13 43.0 0.1 1 1 7.1e-15 9.7e-13 41.8 0.0 6 67 216 277 211 277 0.92 # 20573 # 21460 # 1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 1_111 - 466 rve_3 PF13683.1 67 1.9e-05 18.5 0.1 1 1 4.5e-07 6.1e-05 16.8 0.0 13 56 249 295 240 296 0.92 # 95337 # 96734 # 1 # ID=1_111;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 2_28 - 351 Sigma54_activat PF00158.21 168 2.9e-05 17.9 0.0 1 1 1.6e-06 0.00043 14.1 0.0 17 115 91 184 77 219 0.60 # 30687 # 31739 # 1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 1_85 - 695 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 2e-06 21.7 0.1 1 2 1.5e-06 0.00041 14.1 0.0 23 80 182 236 168 243 0.82 # 65380 # 67464 # -1 # ID=1_85;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 1_85 - 695 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 2e-06 21.7 0.1 2 2 0.001 0.28 4.9 0.0 170 204 511 542 502 543 0.81 # 65380 # 67464 # -1 # ID=1_85;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 10_3 - 181 Cytidylate_kin2 PF13189.1 179 0.0013 13.0 0.0 1 2 6.6e-05 0.018 9.3 0.0 1 23 2 24 2 46 0.78 # 2033 # 2575 # -1 # ID=10_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 10_3 - 181 Cytidylate_kin2 PF13189.1 179 0.0013 13.0 0.0 2 2 0.015 4 1.6 0.0 112 135 99 122 91 136 0.77 # 2033 # 2575 # -1 # ID=10_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 7_6 - 565 FAD_oxidored PF12831.2 428 7.9e-06 19.4 3.6 1 1 2.9e-08 7.9e-06 19.4 3.6 2 41 100 138 99 167 0.83 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 2_21 - 680 UvrD-helicase PF00580.16 315 4.6e-39 128.8 0.1 1 1 3.9e-40 5.3e-38 125.3 0.1 2 307 6 260 5 266 0.90 # 22215 # 24254 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 2_24 - 595 UvrD-helicase PF00580.16 315 5.4e-30 99.0 7.3 1 3 1.5e-16 2.1e-14 47.8 0.1 2 106 5 92 4 119 0.87 # 26087 # 27871 # 1 # ID=2_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 2_24 - 595 UvrD-helicase PF00580.16 315 5.4e-30 99.0 7.3 2 3 7.8e-18 1.1e-15 52.1 0.7 210 314 147 248 111 249 0.84 # 26087 # 27871 # 1 # ID=2_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 2_24 - 595 UvrD-helicase PF00580.16 315 5.4e-30 99.0 7.3 3 3 0.017 2.3 1.7 0.1 114 190 418 494 367 583 0.74 # 26087 # 27871 # 1 # ID=2_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 11_2 - 63 HTH_34 PF13601.1 80 1.4e-09 32.3 0.0 1 1 1.1e-11 1.4e-09 32.2 0.0 27 79 2 54 1 55 0.93 # 262 # 450 # 1 # ID=11_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.540 6_5 - 208 HTH_34 PF13601.1 80 3.5e-08 27.8 0.4 1 2 8.5e-08 1.1e-05 19.7 0.0 2 49 6 53 5 60 0.91 # 2567 # 3190 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 6_5 - 208 HTH_34 PF13601.1 80 3.5e-08 27.8 0.4 2 2 0.0014 0.2 6.1 0.1 59 74 191 206 184 207 0.90 # 2567 # 3190 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 11_2 - 63 MarR PF01047.17 59 0.00012 16.1 0.0 1 1 1.2e-06 0.00016 15.7 0.0 29 58 1 30 1 31 0.92 # 262 # 450 # 1 # ID=11_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.540 6_5 - 208 MarR PF01047.17 59 0.00046 14.2 0.1 1 1 1.6e-05 0.0022 12.0 0.1 6 48 7 49 4 52 0.88 # 2567 # 3190 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 3_12 - 407 TBPIP PF07106.8 169 0.041 7.7 42.9 1 4 0.003 0.8 3.5 16.3 59 166 131 235 130 238 0.86 # 7706 # 8926 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 3_12 - 407 TBPIP PF07106.8 169 0.041 7.7 42.9 2 4 0.009 2.4 2.0 12.5 82 148 189 253 179 257 0.73 # 7706 # 8926 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 3_12 - 407 TBPIP PF07106.8 169 0.041 7.7 42.9 3 4 0.0002 0.056 7.3 10.4 68 146 252 328 237 343 0.54 # 7706 # 8926 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 3_12 - 407 TBPIP PF07106.8 169 0.041 7.7 42.9 4 4 0.0006 0.16 5.8 1.6 67 110 342 385 336 392 0.89 # 7706 # 8926 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 7_6 - 565 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 3.5e-17 57.4 0.1 1 2 4.4e-14 1.2e-11 39.3 0.1 1 201 101 303 101 305 0.75 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 7_6 - 565 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 3.5e-17 57.4 0.1 2 2 9e-07 0.00024 15.5 0.0 93 147 320 375 309 430 0.76 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 7_6 - 565 NAD_binding_7 PF13241.1 103 9.2e-07 23.4 1.2 1 2 5.4e-05 0.015 9.9 0.2 9 38 99 128 96 184 0.89 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 7_6 - 565 NAD_binding_7 PF13241.1 103 9.2e-07 23.4 1.2 2 2 1.4e-05 0.0038 11.8 0.1 8 41 270 306 264 380 0.74 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 8_5 - 187 HTH_8 PF02954.14 42 0.00028 14.7 0.2 1 2 0.023 6.4 0.8 0.1 2 12 114 124 113 124 0.85 # 4751 # 5311 # -1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 8_5 - 187 HTH_8 PF02954.14 42 0.00028 14.7 0.2 2 2 1.6e-05 0.0043 10.9 0.0 20 37 163 180 159 183 0.86 # 4751 # 5311 # -1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_85 - 695 DUF853 PF05872.7 504 0.00019 14.2 0.0 1 2 1.9e-06 0.00051 12.7 0.0 10 60 187 237 179 240 0.86 # 65380 # 67464 # -1 # ID=1_85;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 1_85 - 695 DUF853 PF05872.7 504 0.00019 14.2 0.0 2 2 0.071 19 -2.4 0.0 257 279 503 525 495 556 0.71 # 65380 # 67464 # -1 # ID=1_85;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 1_109 - 158 tRNA-synt_His PF13393.1 311 0.0013 12.1 0.2 1 1 5.7e-06 0.0016 11.8 0.2 174 260 15 94 6 110 0.78 # 93876 # 94349 # -1 # ID=1_109;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.454 6_4 - 208 TetR_N PF00440.18 47 9.1e-18 58.0 0.0 1 2 1.7e-18 2.3e-16 53.5 0.0 2 47 10 55 9 55 0.97 # 1966 # 2589 # 1 # ID=6_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 6_4 - 208 TetR_N PF00440.18 47 9.1e-18 58.0 0.0 2 2 0.016 2.2 2.4 0.0 1 15 169 183 169 185 0.86 # 1966 # 2589 # 1 # ID=6_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 11_4 - 195 TetR_N PF00440.18 47 8.8e-08 26.0 0.0 1 1 1.3e-09 1.7e-07 25.1 0.0 2 46 13 57 12 58 0.95 # 1934 # 2518 # -1 # ID=11_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 2_21 - 680 AAA_19 PF13245.1 76 1.3e-10 35.3 0.1 1 1 3e-12 2.7e-10 34.2 0.1 14 75 21 86 11 87 0.88 # 22215 # 24254 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 2_24 - 595 AAA_19 PF13245.1 76 1.1e-07 25.8 0.0 1 1 3.9e-09 3.5e-07 24.3 0.0 4 74 13 85 9 87 0.76 # 26087 # 27871 # 1 # ID=2_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 10_3 - 181 AAA_19 PF13245.1 76 0.00063 13.8 0.0 1 1 2.5e-05 0.0022 12.1 0.0 15 33 5 22 2 38 0.84 # 2033 # 2575 # -1 # ID=10_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 2_29 - 90 Endonuc-dimeris PF09124.5 54 0.002 12.1 0.0 1 1 1.1e-05 0.003 11.5 0.0 16 45 50 79 46 83 0.88 # 31778 # 32047 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.359 2_2 - 418 CbiA PF01656.18 195 4.2e-20 66.3 0.0 1 1 2.2e-22 5.9e-20 65.8 0.0 1 188 117 358 117 365 0.73 # 541 # 1794 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.431 1_19 - 275 MethyltransfD12 PF02086.10 260 1.4e-53 176.3 0.0 1 1 5.8e-56 1.6e-53 176.1 0.0 1 259 10 255 10 256 0.93 # 17634 # 18458 # -1 # ID=1_19;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 11_2 - 63 PadR PF03551.9 75 2.5e-15 50.4 0.4 1 1 1.1e-17 3e-15 50.1 0.4 29 74 1 45 1 46 0.94 # 262 # 450 # 1 # ID=11_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.540 5_1 - 252 Rep_3 PF01051.16 222 4.8e-50 164.5 0.0 1 1 6e-52 5.4e-50 164.3 0.0 3 222 16 242 14 242 0.91 # 694 # 1449 # 1 # ID=5_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.480 1_14 - 292 Rep_3 PF01051.16 222 1.5e-25 84.4 1.5 1 1 2.7e-27 2.4e-25 83.7 1.5 4 220 24 276 21 280 0.86 # 13107 # 13982 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 1_28 - 294 Rep_3 PF01051.16 222 5.4e-18 59.7 0.0 1 1 1.1e-19 9.8e-18 58.8 0.0 9 211 30 278 23 286 0.82 # 28073 # 28954 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.459 1_23 - 296 rve PF00665.21 120 1.1e-27 90.8 0.0 1 1 4.7e-29 2.6e-27 89.7 0.0 2 119 125 239 124 240 0.97 # 20573 # 21460 # 1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 7_2 - 423 rve PF00665.21 120 2.8e-26 86.3 0.0 1 1 9.6e-28 5.2e-26 85.4 0.0 2 120 173 313 172 313 0.95 # 111 # 1379 # -1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.650 16_1 - 235 rve PF00665.21 120 8.9e-13 42.7 0.1 1 2 0.074 4 1.9 0.0 78 102 27 49 6 54 0.84 # 64 # 768 # 1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 16_1 - 235 rve PF00665.21 120 8.9e-13 42.7 0.1 2 2 3e-13 1.6e-11 38.7 0.0 9 119 75 182 70 183 0.89 # 64 # 768 # 1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_111 - 466 rve PF00665.21 120 8.4e-12 39.6 0.0 1 1 3.2e-13 1.7e-11 38.6 0.0 3 119 141 265 139 266 0.87 # 95337 # 96734 # 1 # ID=1_111;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 3_28 - 707 rve PF00665.21 120 9e-08 26.6 0.0 1 1 5.1e-09 2.8e-07 25.0 0.0 4 119 286 425 283 426 0.80 # 18817 # 20937 # 1 # ID=3_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 1_28 - 294 Fe_dep_repress PF01325.14 60 0.00054 14.2 0.1 1 1 7.7e-06 0.0021 12.3 0.0 26 58 245 277 241 278 0.91 # 28073 # 28954 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.459 10_3 - 181 AAA_24 PF13479.1 213 0.00019 15.3 0.0 1 1 1.4e-06 0.00038 14.4 0.0 6 33 3 34 1 73 0.90 # 2033 # 2575 # -1 # ID=10_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_24 - 559 Methyltransf_26 PF13659.1 117 2e-10 35.1 0.1 1 1 1.7e-12 4.5e-10 33.9 0.1 1 116 421 517 421 518 0.83 # 21552 # 23228 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 10_3 - 181 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00012 15.5 0.0 1 2 4.7e-06 0.0013 12.2 0.0 19 53 3 35 1 120 0.83 # 2033 # 2575 # -1 # ID=10_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 10_3 - 181 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00012 15.5 0.0 2 2 0.024 6.5 0.1 0.0 45 74 106 133 95 150 0.73 # 2033 # 2575 # -1 # ID=10_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 6_6 - 129 ACT_7 PF13840.1 65 0.00018 15.3 0.1 1 1 2e-06 0.00055 13.8 0.0 9 60 65 120 57 123 0.74 # 3261 # 3647 # -1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 2_24 - 595 AAA_30 PF13604.1 196 1.6e-05 18.9 0.0 1 2 2.2e-05 0.003 11.5 0.0 4 66 6 66 4 84 0.76 # 26087 # 27871 # 1 # ID=2_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 2_24 - 595 AAA_30 PF13604.1 196 1.6e-05 18.9 0.0 2 2 0.0062 0.84 3.5 0.0 95 133 191 228 168 287 0.77 # 26087 # 27871 # 1 # ID=2_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 2_21 - 680 AAA_30 PF13604.1 196 0.0009 13.2 0.0 1 2 0.00019 0.026 8.4 0.0 6 43 9 43 4 85 0.70 # 22215 # 24254 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 2_21 - 680 AAA_30 PF13604.1 196 0.0009 13.2 0.0 2 2 0.014 1.8 2.3 0.0 97 133 213 248 196 300 0.84 # 22215 # 24254 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 7_6 - 565 F420_oxidored PF03807.12 96 0.019 9.7 4.1 1 2 0.0023 0.63 4.9 1.2 2 31 100 126 99 131 0.87 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 7_6 - 565 F420_oxidored PF03807.12 96 0.019 9.7 4.1 2 2 0.0075 2 3.3 0.1 1 34 271 300 271 323 0.87 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_22 - 109 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 1.2e-13 45.1 0.9 1 1 5.4e-15 4.9e-13 43.2 0.9 1 74 1 87 1 88 0.86 # 20247 # 20573 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 8_5 - 187 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.00053 14.3 0.1 1 1 1.3e-05 0.0012 13.1 0.1 15 44 154 182 140 186 0.79 # 4751 # 5311 # -1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 16_1 - 235 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.00067 13.9 0.3 1 1 1.6e-05 0.0015 12.9 0.3 4 51 6 58 4 63 0.79 # 64 # 768 # 1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_49 - 792 TIGR02432 TIGR02432 189 0.00061 13.8 0.4 1 1 5.3e-06 0.0014 12.5 0.1 2 40 77 115 76 146 0.72 # 43384 # 45759 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_6 - 171 rRNA_methylase PF06962.7 140 0.00073 13.6 0.0 1 1 3.8e-06 0.001 13.1 0.0 65 113 32 76 28 121 0.73 # 6688 # 7200 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.394 1_85 - 695 TraG-D_C PF12696.2 128 5.3e-11 36.8 0.1 1 1 4.1e-13 1.1e-10 35.8 0.1 2 111 505 616 504 630 0.82 # 65380 # 67464 # -1 # ID=1_85;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 16_1 - 235 DDE_3 PF13358.1 146 0.0019 12.3 0.0 1 1 2.1e-05 0.0056 10.7 0.0 32 90 82 141 59 146 0.87 # 64 # 768 # 1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 10_3 - 181 TIGR03263 TIGR03263 180 0.002 11.8 0.0 1 1 1.6e-05 0.0043 10.7 0.0 3 26 2 25 1 31 0.81 # 2033 # 2575 # -1 # ID=10_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 2_2 - 418 MipZ PF09140.6 261 1.1e-09 32.0 0.1 1 2 8.1e-07 0.00022 14.7 0.1 2 26 116 140 115 161 0.75 # 541 # 1794 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.431 2_2 - 418 MipZ PF09140.6 261 1.1e-09 32.0 0.1 2 2 9.4e-07 0.00026 14.4 0.0 71 126 230 287 215 297 0.75 # 541 # 1794 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.431 5_9 - 327 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 7.5e-35 114.7 0.1 1 1 2.4e-36 1.3e-34 113.9 0.1 5 212 138 312 135 313 0.90 # 7240 # 8220 # 1 # ID=5_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 17_1 - 268 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 3.2e-23 76.7 0.0 1 1 8.4e-25 4.5e-23 76.2 0.0 4 185 59 268 56 268 0.94 # 1 # 804 # 1 # ID=17_1;partial=11;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.440 15_1 - 248 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 7.8e-20 65.6 0.4 1 1 6.4e-21 3.5e-19 63.5 0.2 4 119 115 230 112 246 0.90 # 235 # 978 # -1 # ID=15_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.542 6_11 - 63 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 4.1e-10 33.9 0.0 1 1 8.3e-12 4.5e-10 33.7 0.0 150 199 3 58 1 61 0.82 # 6214 # 6402 # -1 # ID=6_11;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.455 19_1 - 48 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 1.4e-08 28.8 0.0 1 1 2.6e-10 1.4e-08 28.8 0.0 150 185 3 41 1 46 0.93 # 109 # 252 # -1 # ID=19_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.431 6_6 - 129 ACT PF01842.20 66 2.6e-07 24.4 0.2 1 2 0.011 2.9 1.9 0.0 6 26 7 27 3 47 0.85 # 3261 # 3647 # -1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 6_6 - 129 ACT PF01842.20 66 2.6e-07 24.4 0.2 2 2 1.6e-08 4.4e-06 20.5 0.0 9 29 78 98 74 115 0.91 # 3261 # 3647 # -1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 15_1 - 248 DDE_Tnp_1_2 PF13586.1 88 0.00051 14.5 0.6 1 1 4.6e-06 0.0013 13.3 0.6 2 46 191 237 190 244 0.81 # 235 # 978 # -1 # ID=15_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.542 2_24 - 595 AAA_12 PF13087.1 200 1.2e-08 28.9 0.1 1 3 0.00013 0.035 7.8 0.0 99 152 34 86 15 95 0.84 # 26087 # 27871 # 1 # ID=2_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 2_24 - 595 AAA_12 PF13087.1 200 1.2e-08 28.9 0.1 2 3 0.0048 1.3 2.6 0.0 5 38 240 273 237 377 0.81 # 26087 # 27871 # 1 # ID=2_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 2_24 - 595 AAA_12 PF13087.1 200 1.2e-08 28.9 0.1 3 3 1.4e-06 0.00039 14.1 0.0 143 195 499 562 415 567 0.82 # 26087 # 27871 # 1 # ID=2_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 11_2 - 63 Replic_Relax PF13814.1 191 0.0002 15.6 0.1 1 1 7.6e-07 0.00021 15.5 0.1 28 77 5 51 1 57 0.87 # 262 # 450 # 1 # ID=11_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.540 2_3 - 336 Phage_CI_repr PF07022.8 66 0.00083 13.8 0.0 1 1 5.9e-06 0.0016 12.9 0.0 5 45 166 239 165 318 0.80 # 1791 # 2798 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.398 3_29 - 488 AAA PF00004.24 132 3.6e-05 18.3 0.1 1 1 1.3e-06 0.00018 16.0 0.1 4 126 128 280 125 286 0.70 # 20940 # 22403 # 1 # ID=3_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 2_28 - 351 AAA PF00004.24 132 0.00012 16.6 0.0 1 1 2e-06 0.00028 15.4 0.0 1 73 99 177 99 215 0.69 # 30687 # 31739 # 1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 1_72 - 402 KorB PF08535.5 93 1.9e-05 19.1 0.0 1 2 0.013 3.6 2.2 0.0 45 66 65 86 60 105 0.84 # 56435 # 57640 # 1 # ID=1_72;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 1_72 - 402 KorB PF08535.5 93 1.9e-05 19.1 0.0 2 2 2.7e-06 0.00074 14.0 0.0 5 47 170 212 166 246 0.86 # 56435 # 57640 # 1 # ID=1_72;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 11_2 - 63 DUF4364 PF14277.1 163 0.0025 11.7 0.0 1 1 1e-05 0.0027 11.6 0.0 39 80 9 53 5 60 0.76 # 262 # 450 # 1 # ID=11_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.540 2_21 - 680 Herpes_ori_bp PF02399.10 824 0.00078 11.7 0.0 1 1 4.5e-06 0.0012 11.1 0.0 52 108 20 82 9 217 0.86 # 22215 # 24254 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 6_5 - 208 HTH_27 PF13463.1 68 0.00014 16.5 0.3 1 1 2.3e-06 0.00061 14.4 0.0 8 48 9 48 5 61 0.85 # 2567 # 3190 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_28 - 351 TIGR00382 TIGR00382 414 0.0017 11.4 0.0 1 1 9.4e-06 0.0026 10.8 0.0 120 194 99 174 59 181 0.71 # 30687 # 31739 # 1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 1_23 - 296 rve_2 PF13333.1 52 5.2e-08 27.2 0.0 1 1 4e-10 1.1e-07 26.2 0.0 1 44 230 276 230 283 0.88 # 20573 # 21460 # 1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 2_9 - 345 Hydantoinase_A PF01968.13 290 1.7e-07 24.9 0.5 1 2 1.9e-06 0.00051 13.5 0.1 73 101 187 214 177 221 0.82 # 6045 # 7079 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.421 2_9 - 345 Hydantoinase_A PF01968.13 290 1.7e-07 24.9 0.5 2 2 3.8e-05 0.01 9.2 0.0 209 275 272 332 235 342 0.79 # 6045 # 7079 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.421 7_10 - 145 MerR_1 PF13411.1 69 2.4e-19 63.2 0.0 1 1 3e-21 4e-19 62.5 0.0 2 67 9 75 8 77 0.96 # 5686 # 6120 # 1 # ID=7_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.595 7_5 - 121 MerR_1 PF13411.1 69 1.5e-13 44.7 0.0 1 1 1.8e-15 2.4e-13 44.0 0.0 1 68 4 72 4 73 0.97 # 2391 # 2753 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 10_3 - 181 cobW PF02492.14 178 0.0023 11.7 0.0 1 1 1.3e-05 0.0036 11.1 0.0 2 22 2 22 1 30 0.79 # 2033 # 2575 # -1 # ID=10_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 3_29 - 488 AAA_16 PF13191.1 185 9.5e-06 20.0 0.2 1 1 1.8e-07 5e-05 17.7 0.0 20 183 118 257 108 259 0.69 # 20940 # 22403 # 1 # ID=3_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 3_29 - 488 AAA_22 PF13401.1 131 4.2e-22 73.0 0.0 1 1 1.9e-23 1e-21 71.8 0.0 4 130 122 267 118 268 0.89 # 20940 # 22403 # 1 # ID=3_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 10_3 - 181 AAA_22 PF13401.1 131 4.6e-05 17.9 0.0 1 1 1.7e-06 9e-05 17.0 0.0 6 37 2 34 1 177 0.84 # 2033 # 2575 # -1 # ID=10_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 2_21 - 680 AAA_22 PF13401.1 131 4.7e-05 17.9 0.2 1 2 0.00019 0.01 10.3 0.0 4 66 17 76 13 107 0.80 # 22215 # 24254 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 2_21 - 680 AAA_22 PF13401.1 131 4.7e-05 17.9 0.2 2 2 0.0082 0.45 5.0 0.0 42 108 154 232 111 246 0.60 # 22215 # 24254 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_85 - 695 AAA_22 PF13401.1 131 0.00016 16.1 0.1 1 2 0.00019 0.01 10.3 0.0 5 24 199 218 198 296 0.70 # 65380 # 67464 # -1 # ID=1_85;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 1_85 - 695 AAA_22 PF13401.1 131 0.00016 16.1 0.1 2 2 0.034 1.9 3.0 0.0 87 124 503 537 458 545 0.76 # 65380 # 67464 # -1 # ID=1_85;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 2_28 - 351 AAA_22 PF13401.1 131 0.0013 13.2 0.3 1 1 0.00014 0.0077 10.7 0.0 6 30 98 122 96 159 0.81 # 30687 # 31739 # 1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 7_5 - 121 DUF977 PF06163.6 127 0.00081 13.5 0.1 1 1 5.9e-06 0.0016 12.5 0.0 27 70 4 47 2 65 0.90 # 2391 # 2753 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 2_24 - 595 TIGR01074 TIGR01074 668 9.4e-54 176.7 1.9 1 1 1.5e-54 2.1e-52 172.2 1.9 5 610 7 563 5 586 0.79 # 26087 # 27871 # 1 # ID=2_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 2_21 - 680 TIGR01074 TIGR01074 668 3.2e-51 168.3 0.0 1 2 2.4e-38 3.3e-36 118.7 0.0 2 304 5 308 4 404 0.85 # 22215 # 24254 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 2_21 - 680 TIGR01074 TIGR01074 668 3.2e-51 168.3 0.0 2 2 9e-17 1.2e-14 47.4 0.0 533 610 517 607 502 613 0.80 # 22215 # 24254 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_24 - 559 Methyltransf_27 PF13708.1 194 5e-58 190.1 0.1 1 1 8.6e-60 7.8e-58 189.5 0.1 2 194 93 296 92 296 0.95 # 21552 # 23228 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 3_14 - 152 Methyltransf_27 PF13708.1 194 2.3e-17 57.4 0.0 1 1 3.3e-19 3e-17 57.1 0.0 3 82 72 150 70 151 0.97 # 9286 # 9741 # -1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 3_13 - 63 Methyltransf_27 PF13708.1 194 2.1e-08 28.2 0.0 1 1 2.4e-10 2.2e-08 28.2 0.0 152 194 16 58 4 58 0.88 # 8929 # 9117 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 8_5 - 187 NUMOD1 PF07453.8 37 0.0014 12.8 0.0 1 1 1.1e-05 0.0029 11.8 0.0 19 37 164 182 164 182 0.94 # 4751 # 5311 # -1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 11_2 - 63 DUF3116 PF11313.3 85 0.00042 14.3 0.1 1 1 2e-06 0.00053 13.9 0.1 49 84 11 50 5 51 0.73 # 262 # 450 # 1 # ID=11_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.540 3_29 - 488 AAA_29 PF13555.1 62 0.0004 14.3 0.1 1 1 3.9e-06 0.0011 12.9 0.1 21 40 121 139 114 143 0.83 # 20940 # 22403 # 1 # ID=3_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 7_6 - 565 Pyr_redox PF00070.22 80 9.8e-20 65.1 6.0 1 2 1.4e-06 0.00039 15.2 1.5 1 31 99 129 99 131 0.96 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 7_6 - 565 Pyr_redox PF00070.22 80 9.8e-20 65.1 6.0 2 2 6.2e-18 1.7e-15 51.6 0.2 1 74 271 345 271 354 0.90 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 6_10 - 42 HTH_1 PF00126.22 60 7.1e-15 48.9 0.1 1 1 5.5e-17 7.5e-15 48.8 0.1 1 38 3 40 3 41 0.96 # 5840 # 5965 # 1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.421 1_111 - 466 HTH_1 PF00126.22 60 0.00096 13.2 0.0 1 1 1.8e-05 0.0024 11.9 0.0 1 39 14 53 14 60 0.92 # 95337 # 96734 # 1 # ID=1_111;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 8_5 - 187 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 9e-05 16.5 0.0 1 1 6.4e-07 0.00017 15.6 0.0 10 42 157 185 151 186 0.86 # 4751 # 5311 # -1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 10_3 - 181 AAA_28 PF13521.1 163 0.00037 14.8 0.0 1 1 2.9e-06 0.00079 13.7 0.0 2 30 3 34 2 165 0.89 # 2033 # 2575 # -1 # ID=10_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 5_9 - 327 DDE_Tnp_1_3 PF13612.1 155 4.2e-10 33.9 0.1 1 1 3.2e-12 8.7e-10 32.9 0.1 5 151 137 292 134 296 0.73 # 7240 # 8220 # 1 # ID=5_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 7_6 - 565 HI0933_like PF03486.9 409 6e-08 25.8 3.7 1 2 1.2e-06 0.00032 13.5 2.5 2 33 99 130 98 138 0.91 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 7_6 - 565 HI0933_like PF03486.9 409 6e-08 25.8 3.7 2 2 7.2e-06 0.002 10.9 0.0 82 164 284 366 276 385 0.83 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_111 - 466 HTH_32 PF13565.1 77 1.4e-07 26.5 3.4 1 1 2.9e-09 2.6e-07 25.7 0.2 3 77 45 117 43 117 0.76 # 95337 # 96734 # 1 # ID=1_111;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 16_1 - 235 HTH_32 PF13565.1 77 3.5e-06 22.1 0.2 1 1 1.7e-07 1.5e-05 20.0 0.0 26 76 5 50 2 51 0.83 # 64 # 768 # 1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 8_5 - 187 HTH_32 PF13565.1 77 0.0019 13.3 5.4 1 1 7.9e-05 0.0072 11.5 3.5 7 77 124 182 119 182 0.68 # 4751 # 5311 # -1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 2_21 - 680 TIGR00609 TIGR00609 1175 8.4e-17 54.5 0.0 1 3 0.0027 0.37 2.7 0.1 10 62 18 68 11 77 0.85 # 22215 # 24254 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 2_21 - 680 TIGR00609 TIGR00609 1175 8.4e-17 54.5 0.0 2 3 4.7e-11 6.4e-09 28.4 0.0 332 419 180 255 97 259 0.79 # 22215 # 24254 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 2_21 - 680 TIGR00609 TIGR00609 1175 8.4e-17 54.5 0.0 3 3 2.7e-08 3.6e-06 19.3 0.0 731 813 539 609 529 627 0.81 # 22215 # 24254 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 2_24 - 595 TIGR00609 TIGR00609 1175 8e-16 51.2 5.9 1 3 2.2e-06 0.00029 12.9 0.0 11 67 18 71 12 81 0.86 # 26087 # 27871 # 1 # ID=2_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 2_24 - 595 TIGR00609 TIGR00609 1175 8e-16 51.2 5.9 2 3 3.9e-11 5.3e-09 28.6 0.1 376 458 194 276 190 284 0.87 # 26087 # 27871 # 1 # ID=2_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 2_24 - 595 TIGR00609 TIGR00609 1175 8e-16 51.2 5.9 3 3 4.4e-05 0.006 8.6 0.9 781 812 533 564 340 570 0.92 # 26087 # 27871 # 1 # ID=2_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 4_8 - 332 HTH_3 PF01381.17 55 4.9e-05 17.5 0.0 1 1 1.1e-06 0.00015 15.9 0.0 11 47 3 39 3 40 0.92 # 9014 # 10009 # 1 # ID=4_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 8_5 - 187 HTH_3 PF01381.17 55 0.0011 13.1 0.4 1 1 2.3e-05 0.0031 11.7 0.4 2 31 152 183 151 184 0.86 # 4751 # 5311 # -1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_111 - 466 HTH_23 PF13384.1 50 3.1e-10 33.8 0.2 1 1 4.6e-11 2.1e-09 31.2 0.0 3 47 12 57 10 59 0.94 # 95337 # 96734 # 1 # ID=1_111;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 7_2 - 423 HTH_23 PF13384.1 50 9.8e-07 22.7 0.9 1 1 6.5e-08 2.9e-06 21.2 0.9 3 45 23 71 21 76 0.87 # 111 # 1379 # -1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.650 16_1 - 235 HTH_23 PF13384.1 50 1.6e-05 18.8 0.7 1 2 0.095 4.3 1.6 0.0 7 27 11 35 7 36 0.69 # 64 # 768 # 1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 16_1 - 235 HTH_23 PF13384.1 50 1.6e-05 18.8 0.7 2 2 1.1e-05 0.0005 14.0 0.1 28 42 41 55 40 62 0.87 # 64 # 768 # 1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_22 - 109 HTH_23 PF13384.1 50 2.3e-05 18.3 1.1 1 1 1e-06 4.6e-05 17.3 0.2 5 43 10 56 8 66 0.84 # 20247 # 20573 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 8_5 - 187 HTH_23 PF13384.1 50 6.3e-05 16.9 1.3 1 1 1.8e-06 7.9e-05 16.6 0.1 10 39 151 183 148 184 0.82 # 4751 # 5311 # -1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 6_4 - 208 HTH_23 PF13384.1 50 0.00067 13.6 0.0 1 1 3.9e-05 0.0018 12.3 0.0 10 39 13 47 11 56 0.81 # 1966 # 2589 # 1 # ID=6_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 2_2 - 418 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.001 12.6 0.1 1 1 8.1e-06 0.0022 11.5 0.0 7 59 122 177 116 207 0.77 # 541 # 1794 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.431 8_5 - 187 HTH_7 PF02796.10 45 3.3e-16 53.3 0.3 1 1 4.7e-18 6.4e-16 52.3 0.3 1 44 141 184 141 185 0.98 # 4751 # 5311 # -1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 4_8 - 332 HTH_7 PF02796.10 45 0.00032 14.9 0.0 1 1 2.2e-05 0.003 11.8 0.0 24 44 4 24 2 25 0.92 # 9014 # 10009 # 1 # ID=4_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 2_28 - 351 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.00016 15.1 0.1 1 2 0.00099 0.27 4.6 0.0 24 47 98 121 88 140 0.84 # 30687 # 31739 # 1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 2_28 - 351 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.00016 15.1 0.1 2 2 6.4e-05 0.017 8.5 0.0 88 143 142 199 134 239 0.77 # 30687 # 31739 # 1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 1_111 - 466 HTH_29 PF13551.1 112 4e-14 47.1 0.5 1 1 1.1e-15 1e-13 45.7 0.5 1 112 16 121 16 121 0.89 # 95337 # 96734 # 1 # ID=1_111;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 7_2 - 423 HTH_29 PF13551.1 112 4.8e-06 21.0 2.2 1 1 6.5e-08 5.9e-06 20.8 0.3 13 77 39 109 27 133 0.79 # 111 # 1379 # -1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.650 1_22 - 109 HTH_29 PF13551.1 112 0.00014 16.3 1.1 1 2 0.0088 0.8 4.2 0.0 56 81 5 30 2 32 0.79 # 20247 # 20573 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_22 - 109 HTH_29 PF13551.1 112 0.00014 16.3 1.1 2 2 1.9e-05 0.0017 12.8 0.5 9 59 27 77 16 107 0.65 # 20247 # 20573 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 7_6 - 565 Glyco_trans_4_4 PF13579.1 160 0.00053 14.5 1.7 1 1 4.2e-06 0.0011 13.4 0.1 2 26 276 306 276 340 0.70 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 7_6 - 565 NAD_binding_9 PF13454.1 156 7.7e-05 16.8 2.8 1 3 0.0081 2.2 2.3 0.1 1 41 101 135 101 162 0.81 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 7_6 - 565 NAD_binding_9 PF13454.1 156 7.7e-05 16.8 2.8 2 3 0.034 9.1 0.3 0.0 134 155 218 241 202 242 0.72 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 7_6 - 565 NAD_binding_9 PF13454.1 156 7.7e-05 16.8 2.8 3 3 6.6e-06 0.0018 12.4 0.1 112 155 321 366 311 367 0.85 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 7_6 - 565 GIDA PF01134.17 392 7e-08 26.0 6.6 1 3 3.5e-10 9.4e-08 25.5 3.3 2 187 100 279 99 302 0.72 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 7_6 - 565 GIDA PF01134.17 392 7e-08 26.0 6.6 2 3 0.038 10 -0.9 0.0 3 31 273 301 271 315 0.84 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 7_6 - 565 GIDA PF01134.17 392 7e-08 26.0 6.6 3 3 0.018 5 0.1 0.1 349 385 393 429 387 433 0.77 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 7_6 - 565 NAD_binding_8 PF13450.1 68 9.5e-05 16.7 1.2 1 2 3.5e-07 9.5e-05 16.7 1.2 1 35 102 135 102 155 0.90 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 7_6 - 565 NAD_binding_8 PF13450.1 68 9.5e-05 16.7 1.2 2 2 0.041 11 0.5 0.2 1 25 274 298 274 303 0.81 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 16_1 - 235 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 6.3e-12 39.5 0.3 1 1 3e-14 8.1e-12 39.2 0.3 5 132 10 144 6 174 0.87 # 64 # 768 # 1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 3_23 - 164 TIGR01062 TIGR01062 735 0.00078 11.5 0.1 1 1 3.4e-06 0.00091 11.3 0.1 642 708 40 103 14 112 0.77 # 15144 # 15635 # -1 # ID=3_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 3_29 - 488 Arch_ATPase PF01637.13 234 1e-06 22.9 0.0 1 1 8.2e-09 2.2e-06 21.8 0.0 25 150 127 251 119 261 0.84 # 20940 # 22403 # 1 # ID=3_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 2_24 - 595 PhoH PF02562.11 205 5.6e-05 16.7 0.1 1 2 5.4e-05 0.015 8.9 0.0 6 61 5 61 2 78 0.77 # 26087 # 27871 # 1 # ID=2_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 2_24 - 595 PhoH PF02562.11 205 5.6e-05 16.7 0.1 2 2 0.0006 0.16 5.4 0.0 118 173 188 242 155 258 0.74 # 26087 # 27871 # 1 # ID=2_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 2_28 - 351 AAA_5 PF07728.9 139 1.3e-38 126.2 0.0 1 1 7e-41 1.9e-38 125.6 0.0 1 139 98 238 98 238 0.97 # 30687 # 31739 # 1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 2_24 - 595 ResIII PF04851.10 184 0.00032 14.9 0.4 1 1 8.6e-06 0.0012 13.0 0.0 19 77 12 77 5 97 0.74 # 26087 # 27871 # 1 # ID=2_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 2_21 - 680 ResIII PF04851.10 184 0.0023 12.1 0.2 1 1 4.2e-05 0.0057 10.8 0.2 21 60 14 58 4 218 0.85 # 22215 # 24254 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_49 - 792 PAPS_reduct PF01507.14 174 1.7e-08 28.7 0.0 1 1 1.3e-10 3.4e-08 27.8 0.0 3 149 78 263 76 267 0.73 # 43384 # 45759 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_85 - 695 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 2.3e-15 50.4 0.1 1 2 7.8e-07 0.00021 14.3 0.0 16 53 199 236 189 341 0.85 # 65380 # 67464 # -1 # ID=1_85;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 1_85 - 695 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 2.3e-15 50.4 0.1 2 2 1e-12 2.7e-10 33.7 0.0 183 375 433 640 403 647 0.70 # 65380 # 67464 # -1 # ID=1_85;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 2_2 - 418 TIGR01968 TIGR01968 261 2.9e-05 17.5 0.1 1 2 3e-05 0.008 9.5 0.2 3 39 116 155 114 184 0.83 # 541 # 1794 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.431 2_2 - 418 TIGR01968 TIGR01968 261 2.9e-05 17.5 0.1 2 2 0.0005 0.13 5.5 0.0 103 143 251 291 222 320 0.77 # 541 # 1794 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.431 5_9 - 327 DDE_Tnp_4 PF13359.1 158 5.7e-07 23.6 0.1 1 1 4.4e-09 1.2e-06 22.5 0.1 6 153 147 306 142 311 0.65 # 7240 # 8220 # 1 # ID=5_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 10_3 - 181 AAA_18 PF13238.1 129 1.8e-10 35.5 0.0 1 1 1.2e-12 3.2e-10 34.7 0.0 1 126 3 134 3 137 0.71 # 2033 # 2575 # -1 # ID=10_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 2_9 - 345 MutL PF13941.1 457 0.00096 11.8 0.1 1 2 9.2e-06 0.0025 10.4 0.0 234 271 177 214 158 220 0.78 # 6045 # 7079 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.421 2_9 - 345 MutL PF13941.1 457 0.00096 11.8 0.1 2 2 0.058 16 -2.1 0.0 39 58 270 289 258 306 0.70 # 6045 # 7079 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.421 1_101 - 418 IMS_HHH PF11798.3 32 1.3e-06 22.6 0.2 1 2 0.056 15 0.3 0.0 17 30 133 146 123 146 0.87 # 85671 # 86924 # -1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 1_101 - 418 IMS_HHH PF11798.3 32 1.3e-06 22.6 0.2 2 2 5.7e-08 1.5e-05 19.2 0.1 14 32 179 197 168 197 0.85 # 85671 # 86924 # -1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 5_9 - 327 DDE_Tnp_1_6 PF13751.1 125 1.1e-08 29.4 0.2 1 1 1.1e-10 3e-08 28.1 0.2 62 123 256 314 244 316 0.81 # 7240 # 8220 # 1 # ID=5_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 8_5 - 187 HTH_psq PF05225.11 45 0.00034 14.5 0.0 1 1 2.5e-06 0.00068 13.5 0.0 21 39 166 184 165 186 0.91 # 4751 # 5311 # -1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 2_3 - 336 DsrH PF04077.7 88 0.0012 12.9 0.0 1 2 0.012 3.4 1.8 0.0 53 62 88 97 71 104 0.76 # 1791 # 2798 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.398 2_3 - 336 DsrH PF04077.7 88 0.0012 12.9 0.0 2 2 0.0001 0.028 8.5 0.0 26 65 105 145 97 152 0.78 # 1791 # 2798 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.398 3_29 - 488 DUF258 PF03193.11 161 0.00097 12.7 0.0 1 1 7.3e-06 0.002 11.6 0.0 37 59 124 146 109 167 0.86 # 20940 # 22403 # 1 # ID=3_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 1_85 - 695 DUF87 PF01935.12 229 0.00031 14.9 0.0 1 1 2.5e-06 0.00068 13.8 0.0 25 68 200 242 185 281 0.87 # 65380 # 67464 # -1 # ID=1_85;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 1_111 - 466 HTH_28 PF13518.1 52 8.9e-11 36.0 0.1 1 1 6e-12 3.3e-10 34.2 0.1 2 51 16 66 15 67 0.92 # 95337 # 96734 # 1 # ID=1_111;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 7_2 - 423 HTH_28 PF13518.1 52 6.3e-08 26.9 0.1 1 1 1.2e-09 6.3e-08 26.9 0.1 1 46 26 78 26 87 0.76 # 111 # 1379 # -1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.650 8_5 - 187 HTH_28 PF13518.1 52 0.00013 16.3 0.1 1 1 2.4e-06 0.00013 16.3 0.1 9 34 158 183 147 184 0.84 # 4751 # 5311 # -1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 16_1 - 235 HTH_28 PF13518.1 52 0.00016 16.0 1.2 1 1 1.3e-05 0.00069 14.0 1.2 22 36 40 54 13 55 0.76 # 64 # 768 # 1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_22 - 109 HTH_28 PF13518.1 52 0.00026 15.3 0.2 1 1 9.3e-06 0.0005 14.4 0.2 2 38 12 56 11 72 0.76 # 20247 # 20573 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 6_4 - 208 HTH_Tnp_1_2 PF13022.1 142 0.00027 15.1 0.0 1 1 1.7e-06 0.00045 14.3 0.0 26 77 15 64 2 68 0.78 # 1966 # 2589 # 1 # ID=6_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 7_10 - 145 MerR-DNA-bind PF09278.6 65 5.7e-21 69.1 0.6 1 1 9.7e-23 1.3e-20 67.9 0.5 1 65 51 113 51 113 0.95 # 5686 # 6120 # 1 # ID=7_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.595 7_5 - 121 MerR-DNA-bind PF09278.6 65 0.0021 12.8 7.4 1 1 2.5e-05 0.0034 12.1 7.4 1 64 47 108 47 109 0.85 # 2391 # 2753 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 6_5 - 208 HTH_24 PF13412.1 48 1.7e-06 21.7 0.1 1 1 1.3e-08 3.5e-06 20.7 0.1 3 48 4 49 2 49 0.90 # 2567 # 3190 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_28 - 351 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 0.00075 13.9 0.0 1 1 6e-06 0.0016 12.8 0.0 21 95 96 188 79 219 0.73 # 30687 # 31739 # 1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 8_5 - 187 HTH_10 PF04967.7 53 3.2e-05 17.8 0.2 1 1 1.7e-06 0.00023 15.0 0.0 27 45 165 183 162 185 0.93 # 4751 # 5311 # -1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 6_5 - 208 HTH_10 PF04967.7 53 0.002 12.0 0.2 1 1 4.8e-05 0.0065 10.4 0.0 22 46 17 41 15 44 0.92 # 2567 # 3190 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 7_6 - 565 TIGR01292 TIGR01292 300 4.5e-19 62.3 2.9 1 2 3.8e-05 0.01 8.6 1.1 3 39 100 136 98 142 0.89 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 7_6 - 565 TIGR01292 TIGR01292 300 4.5e-19 62.3 2.9 2 2 1.1e-18 2.9e-16 53.1 0.0 142 296 270 428 213 430 0.81 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 3_29 - 488 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.0009 13.5 0.0 1 1 1.2e-05 0.0032 11.8 0.0 2 104 125 245 124 267 0.71 # 20940 # 22403 # 1 # ID=3_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 2_24 - 595 DEAD PF00270.24 169 0.00029 14.7 0.2 1 1 4.9e-06 0.0013 12.5 0.2 5 78 9 80 5 218 0.62 # 26087 # 27871 # 1 # ID=2_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 4_8 - 332 HTH_31 PF13560.1 64 1.9e-05 19.1 0.7 1 2 3.2e-06 0.00088 13.8 0.0 16 51 3 37 2 41 0.92 # 9014 # 10009 # 1 # ID=4_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 4_8 - 332 HTH_31 PF13560.1 64 1.9e-05 19.1 0.7 2 2 0.018 4.9 1.8 0.4 5 18 189 202 188 214 0.88 # 9014 # 10009 # 1 # ID=4_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 2_24 - 595 UvrD_C_2 PF13538.1 104 6.4e-12 39.9 0.0 1 1 1.2e-13 1.6e-11 38.7 0.0 47 103 496 562 454 563 0.79 # 26087 # 27871 # 1 # ID=2_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 2_21 - 680 UvrD_C_2 PF13538.1 104 5.4e-11 36.9 0.0 1 1 1.4e-12 2e-10 35.1 0.0 23 104 505 607 490 607 0.83 # 22215 # 24254 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 2_28 - 351 TIP49 PF06068.8 398 0.00096 12.2 0.0 1 2 9.1e-06 0.0025 10.8 0.0 40 82 87 128 80 144 0.79 # 30687 # 31739 # 1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 2_28 - 351 TIP49 PF06068.8 398 0.00096 12.2 0.0 2 2 0.088 24 -2.3 0.0 336 363 234 261 223 278 0.84 # 30687 # 31739 # 1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 2_2 - 418 HTH_OrfB_IS605 PF12323.3 46 0.0003 14.4 0.1 1 2 0.00067 0.18 5.5 0.1 24 38 40 54 40 56 0.90 # 541 # 1794 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.431 2_2 - 418 HTH_OrfB_IS605 PF12323.3 46 0.0003 14.4 0.1 2 2 0.00015 0.041 7.6 0.0 17 38 53 74 52 76 0.86 # 541 # 1794 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.431 1_28 - 294 HTH_36 PF13730.1 55 5.4e-05 17.6 0.0 1 2 0.0046 0.63 4.6 0.0 28 48 119 139 96 139 0.87 # 28073 # 28954 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.459 1_28 - 294 HTH_36 PF13730.1 55 5.4e-05 17.6 0.0 2 2 7e-05 0.0095 10.4 0.0 6 55 218 271 216 271 0.75 # 28073 # 28954 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.459 2_2 - 418 HTH_36 PF13730.1 55 0.00036 15.0 0.1 1 1 1.2e-05 0.0016 12.9 0.0 28 54 52 78 34 79 0.91 # 541 # 1794 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.431 7_2 - 423 HTH_Tnp_Mu_2 PF09039.6 108 2e-05 18.6 0.0 1 1 1.8e-07 5e-05 17.4 0.0 37 101 100 163 83 166 0.91 # 111 # 1379 # -1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.650 2_9 - 345 StbA PF06406.6 318 7.7e-123 403.7 0.7 1 1 3.3e-125 8.9e-123 403.5 0.7 1 317 22 340 22 341 0.98 # 6045 # 7079 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.421 10_3 - 181 NACHT PF05729.7 166 4.2e-05 17.6 0.0 1 2 7.7e-07 0.00021 15.3 0.0 2 22 2 22 1 37 0.89 # 2033 # 2575 # -1 # ID=10_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 10_3 - 181 NACHT PF05729.7 166 4.2e-05 17.6 0.0 2 2 0.045 12 -0.2 0.0 77 91 151 177 95 179 0.61 # 2033 # 2575 # -1 # ID=10_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 10_3 - 181 UPF0079 PF02367.12 123 0.00055 13.9 0.0 1 1 3.3e-06 0.0009 13.2 0.0 17 36 2 21 1 30 0.88 # 2033 # 2575 # -1 # ID=10_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 10_3 - 181 AAA_17 PF13207.1 121 1.7e-06 23.2 0.1 1 1 3.5e-08 3.1e-06 22.3 0.1 1 77 2 94 2 173 0.54 # 2033 # 2575 # -1 # ID=10_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 3_29 - 488 AAA_17 PF13207.1 121 0.00078 14.6 0.1 1 1 3.9e-05 0.0035 12.5 0.1 4 22 127 145 125 279 0.83 # 20940 # 22403 # 1 # ID=3_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 2_28 - 351 AAA_17 PF13207.1 121 0.0011 14.2 0.0 1 1 3.5e-05 0.0032 12.6 0.0 2 46 99 141 98 195 0.74 # 30687 # 31739 # 1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 7_6 - 565 FAD_binding_2 PF00890.19 417 1.2e-05 18.6 4.7 1 3 4.3e-08 1.2e-05 18.6 4.7 2 32 100 130 99 137 0.90 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 7_6 - 565 FAD_binding_2 PF00890.19 417 1.2e-05 18.6 4.7 2 3 0.034 9.3 -0.8 0.1 143 204 311 369 297 388 0.72 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 7_6 - 565 FAD_binding_2 PF00890.19 417 1.2e-05 18.6 4.7 3 3 0.074 20 -1.9 0.0 376 402 388 408 377 424 0.82 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 9_5 - 236 AAA_25 PF13481.1 194 1.4e-24 80.8 0.0 1 1 1.4e-26 1.9e-24 80.4 0.0 48 193 1 140 1 141 0.86 # 3797 # 4504 # -1 # ID=9_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.679 3_29 - 488 AAA_25 PF13481.1 194 2.8e-06 21.1 0.0 1 1 5.8e-08 7.9e-06 19.7 0.0 30 187 119 260 112 263 0.80 # 20940 # 22403 # 1 # ID=3_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 2_21 - 680 Viral_helicase1 PF01443.13 234 9.4e-11 35.9 0.0 1 3 1.4e-06 0.00019 15.3 0.0 2 59 21 77 20 88 0.79 # 22215 # 24254 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 2_21 - 680 Viral_helicase1 PF01443.13 234 9.4e-11 35.9 0.0 2 3 0.00023 0.031 8.0 0.0 62 118 209 263 191 344 0.72 # 22215 # 24254 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 2_21 - 680 Viral_helicase1 PF01443.13 234 9.4e-11 35.9 0.0 3 3 0.0011 0.14 5.9 0.0 213 232 572 606 528 608 0.62 # 22215 # 24254 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 2_24 - 595 Viral_helicase1 PF01443.13 234 5e-07 23.7 0.1 1 3 0.0084 1.1 2.9 0.0 2 21 20 39 19 79 0.77 # 26087 # 27871 # 1 # ID=2_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 2_24 - 595 Viral_helicase1 PF01443.13 234 5e-07 23.7 0.1 2 3 0.044 5.9 0.6 0.0 40 135 167 261 142 290 0.69 # 26087 # 27871 # 1 # ID=2_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 2_24 - 595 Viral_helicase1 PF01443.13 234 5e-07 23.7 0.1 3 3 7.3e-07 9.8e-05 16.2 0.0 181 233 504 563 417 564 0.88 # 26087 # 27871 # 1 # ID=2_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 3_29 - 488 AAA_14 PF13173.1 128 5.7e-06 20.6 0.1 1 1 1.9e-06 0.00026 15.2 0.0 6 115 126 279 122 293 0.55 # 20940 # 22403 # 1 # ID=3_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 10_3 - 181 AAA_14 PF13173.1 128 0.0016 12.7 0.0 1 1 2.3e-05 0.0031 11.7 0.0 4 27 2 25 1 54 0.79 # 2033 # 2575 # -1 # ID=10_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 7_10 - 145 MerR PF00376.18 38 2.2e-13 43.9 0.2 1 1 3e-15 4e-13 43.1 0.2 1 38 9 46 9 46 0.99 # 5686 # 6120 # 1 # ID=7_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.595 7_5 - 121 MerR PF00376.18 38 3.4e-06 20.9 0.0 1 1 3.9e-08 5.3e-06 20.3 0.0 1 38 5 42 5 42 0.95 # 2391 # 2753 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 10_3 - 181 AAA_33 PF13671.1 143 1.6e-10 35.4 0.0 1 1 7.3e-13 2e-10 35.0 0.0 2 127 3 130 2 151 0.75 # 2033 # 2575 # -1 # ID=10_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 8_5 - 187 CENP-B_N PF04218.8 53 7.9e-06 19.6 0.0 1 1 1.1e-07 1.5e-05 18.7 0.0 17 43 156 182 152 186 0.92 # 4751 # 5311 # -1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 6_4 - 208 CENP-B_N PF04218.8 53 0.0014 12.4 0.0 1 1 2e-05 0.0027 11.5 0.0 26 51 28 53 23 55 0.90 # 1966 # 2589 # 1 # ID=6_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 3_29 - 488 ArgK PF03308.11 267 0.0028 10.7 0.1 1 1 1.8e-05 0.005 9.9 0.1 28 51 121 144 118 149 0.84 # 20940 # 22403 # 1 # ID=3_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 1_24 - 559 MTS PF05175.9 170 8.1e-07 22.9 0.0 1 1 5.2e-09 1.4e-06 22.1 0.0 60 144 444 520 433 543 0.70 # 21552 # 23228 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 1_35 - 60 UvrB PF12344.3 44 0.00094 13.0 0.1 1 1 4.2e-06 0.0011 12.8 0.1 9 31 10 32 5 40 0.87 # 34824 # 35003 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.483 10_3 - 181 RNA_helicase PF00910.17 107 0.0016 13.0 0.0 1 1 9.1e-06 0.0025 12.3 0.0 1 26 3 28 3 47 0.84 # 2033 # 2575 # -1 # ID=10_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 6_5 - 208 HTH_45 PF14947.1 77 0.00018 15.6 0.2 1 2 1.8e-05 0.0024 12.0 0.0 10 53 8 55 5 76 0.75 # 2567 # 3190 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 6_5 - 208 HTH_45 PF14947.1 77 0.00018 15.6 0.2 2 2 0.09 12 0.2 0.0 55 65 190 200 177 204 0.79 # 2567 # 3190 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_18 - 274 HTH_45 PF14947.1 77 0.00027 15.1 0.1 1 1 8e-06 0.0011 13.1 0.0 1 51 183 235 183 248 0.85 # 16798 # 17619 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.450 2_28 - 351 AAA_2 PF07724.9 171 7.6e-07 23.5 0.0 1 1 5.8e-09 1.6e-06 22.5 0.0 5 83 98 177 96 184 0.71 # 30687 # 31739 # 1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 10_3 - 181 APS_kinase PF01583.15 157 3.8e-05 17.7 0.0 1 2 7.3e-06 0.002 12.1 0.0 4 24 2 22 1 35 0.87 # 2033 # 2575 # -1 # ID=10_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 10_3 - 181 APS_kinase PF01583.15 157 3.8e-05 17.7 0.0 2 2 0.0032 0.87 3.5 0.1 34 73 107 148 95 160 0.86 # 2033 # 2575 # -1 # ID=10_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 3_29 - 488 NTPase_1 PF03266.10 168 0.0031 11.5 0.2 1 1 2.9e-05 0.0079 10.2 0.1 2 20 125 143 124 149 0.88 # 20940 # 22403 # 1 # ID=3_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 7_6 - 565 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 6.4e-05 16.9 3.1 1 2 0.00051 0.14 6.0 0.8 15 50 92 127 89 130 0.90 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 7_6 - 565 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 6.4e-05 16.9 3.1 2 2 2.1e-05 0.0057 10.5 0.1 16 58 265 307 257 339 0.84 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 3_8 - 476 DNA_methylase PF00145.12 335 1.2e-74 245.7 0.0 1 1 6.9e-77 1.9e-74 245.0 0.0 1 331 92 453 92 456 0.88 # 4364 # 5791 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.489 18_1 - 162 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 9.9e-80 259.4 1.0 1 1 8.5e-82 1.2e-79 259.2 1.0 1 131 31 161 31 161 0.99 # 16 # 501 # -1 # ID=18_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.549 5_3 - 98 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 2e-50 164.6 0.3 1 1 1.6e-52 2.2e-50 164.4 0.3 35 131 1 97 1 97 0.99 # 2231 # 2524 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 1_90 - 171 Auto_anti-p27 PF06677.7 41 0.00059 13.9 2.1 1 1 3.5e-06 0.00095 13.3 2.1 18 40 130 152 129 153 0.95 # 73275 # 73787 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 7_6 - 565 3HCDH_N PF02737.13 180 0.0086 10.0 6.4 1 2 0.0047 1.3 2.9 2.4 1 30 99 128 99 134 0.93 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 7_6 - 565 3HCDH_N PF02737.13 180 0.0086 10.0 6.4 2 2 9e-05 0.024 8.6 0.1 2 39 272 309 271 348 0.73 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_49 - 792 ATP_bind_3 PF01171.15 182 0.0021 11.9 0.3 1 2 2.8e-05 0.0076 10.0 0.1 2 40 77 115 76 145 0.78 # 43384 # 45759 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_49 - 792 ATP_bind_3 PF01171.15 182 0.0021 11.9 0.3 2 2 0.095 26 -1.5 0.0 122 146 758 784 748 787 0.58 # 43384 # 45759 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 7_6 - 565 Glyco_transf_4 PF13439.1 177 1.6e-05 19.0 0.1 1 1 1.3e-07 3.6e-05 17.8 0.1 13 40 276 303 272 356 0.82 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 16_1 - 235 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 2.1e-52 171.2 0.0 1 1 2.1e-54 2.9e-52 170.7 0.0 4 139 75 212 73 213 0.99 # 64 # 768 # 1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_23 - 296 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 1.3e-07 25.9 0.0 1 1 1.5e-09 2e-07 25.4 0.0 2 137 130 267 129 269 0.92 # 20573 # 21460 # 1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 8_5 - 187 HTH_11 PF08279.7 55 0.00033 14.6 0.1 1 1 2.5e-05 0.0034 11.4 0.0 20 37 166 183 162 184 0.91 # 4751 # 5311 # -1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 6_5 - 208 HTH_11 PF08279.7 55 0.0029 11.6 0.1 1 1 6.9e-05 0.0094 10.0 0.0 4 43 8 46 6 60 0.82 # 2567 # 3190 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 15_1 - 248 DDE_Tnp_1_5 PF13737.1 112 2.6e-44 144.3 0.0 1 1 1.5e-46 4.1e-44 143.7 0.0 1 112 19 130 19 130 0.95 # 235 # 978 # -1 # ID=15_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.542 6_5 - 208 MarR_2 PF12802.2 62 0.00023 15.2 0.1 1 1 4.2e-06 0.00056 13.9 0.1 10 55 9 52 2 57 0.83 # 2567 # 3190 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 6_10 - 42 MarR_2 PF12802.2 62 0.00026 15.0 0.0 1 1 2e-06 0.00027 14.9 0.0 5 46 3 40 1 41 0.85 # 5840 # 5965 # 1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.421 6_5 - 208 HTH_5 PF01022.15 47 1.9e-10 34.6 0.1 1 1 1.5e-12 4.1e-10 33.5 0.1 3 46 5 49 3 50 0.92 # 2567 # 3190 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 6_5 - 208 TrmB PF01978.14 68 2.6e-07 24.6 0.0 1 1 4.3e-09 5.8e-07 23.5 0.0 11 62 7 58 6 62 0.93 # 2567 # 3190 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 11_2 - 63 TrmB PF01978.14 68 0.00036 14.5 0.1 1 1 9.8e-06 0.0013 12.7 0.1 36 62 3 34 1 39 0.84 # 262 # 450 # 1 # ID=11_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.540 12_2 - 302 LYTB PF02401.13 281 0.0019 11.5 0.0 1 1 2e-05 0.0054 9.9 0.0 236 272 81 117 70 124 0.91 # 1181 # 2086 # -1 # ID=12_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.657 4_8 - 332 LacI PF00356.16 46 2.5e-20 66.2 0.2 1 1 1.6e-22 4.2e-20 65.5 0.2 1 46 3 48 3 48 0.98 # 9014 # 10009 # 1 # ID=4_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 7_6 - 565 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 2.1e-43 142.8 0.0 1 1 3.2e-45 8.8e-43 140.8 0.0 2 199 100 410 99 412 0.96 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 7_6 - 565 DFP PF04127.10 185 0.0021 12.0 2.4 1 2 0.00039 0.11 6.4 0.4 28 51 105 128 99 156 0.83 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 7_6 - 565 DFP PF04127.10 185 0.0021 12.0 2.4 2 2 0.0014 0.37 4.7 0.1 32 53 281 302 276 336 0.77 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 2_2 - 418 HTH_Crp_2 PF13545.1 76 0.00048 14.2 0.0 1 1 8.2e-06 0.0011 13.1 0.0 21 58 42 79 27 89 0.88 # 541 # 1794 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.431 1_111 - 466 HTH_Crp_2 PF13545.1 76 0.0016 12.6 0.0 1 1 3.7e-05 0.005 11.0 0.0 25 56 24 55 9 66 0.81 # 95337 # 96734 # 1 # ID=1_111;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 7_6 - 565 DAO PF01266.19 358 1.1e-08 28.6 11.7 1 3 1.4e-08 3.7e-06 20.3 0.7 1 38 99 134 99 190 0.84 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 7_6 - 565 DAO PF01266.19 358 1.1e-08 28.6 11.7 2 3 0.032 8.6 -0.6 0.1 3 31 273 301 271 307 0.75 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 7_6 - 565 DAO PF01266.19 358 1.1e-08 28.6 11.7 3 3 9.4e-07 0.00026 14.3 0.5 152 208 314 372 307 433 0.74 # 2771 # 4465 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_99 - 204 LptE PF04390.7 155 9.5e-05 16.5 0.0 1 1 6.7e-07 0.00018 15.6 0.0 1 79 7 87 7 134 0.82 # 84092 # 84703 # -1 # ID=1_99;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.489 1_3 - 894 AAA_10 PF12846.2 304 2.2e-67 221.9 0.1 1 1 3.8e-69 3.4e-67 221.3 0.1 1 304 456 813 456 813 0.95 # 2180 # 4861 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.419 1_85 - 695 AAA_10 PF12846.2 304 1.9e-17 57.9 0.0 1 1 5.2e-19 4.7e-17 56.6 0.0 2 300 199 582 198 586 0.82 # 65380 # 67464 # -1 # ID=1_85;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 2_24 - 595 AAA_10 PF12846.2 304 0.00076 13.3 0.0 1 1 2.3e-05 0.0021 11.8 0.0 1 22 16 37 16 47 0.84 # 26087 # 27871 # 1 # ID=2_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 6_5 - 208 HTH_20 PF12840.2 61 4e-11 36.9 0.3 1 1 7.6e-13 1e-10 35.6 0.0 11 61 5 55 1 55 0.94 # 2567 # 3190 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 6_4 - 208 HTH_20 PF12840.2 61 0.0016 12.6 0.0 1 1 2.7e-05 0.0037 11.4 0.0 21 46 21 46 12 61 0.84 # 1966 # 2589 # 1 # ID=6_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 10_5 - 74 Dimerisation PF08100.6 51 0.00025 15.2 0.5 1 1 4.2e-06 0.00038 14.6 0.1 15 47 28 65 26 66 0.81 # 3591 # 3812 # 1 # ID=10_5;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.437 3_1 - 74 Dimerisation PF08100.6 51 0.00025 15.2 0.5 1 1 4.2e-06 0.00038 14.6 0.1 15 47 28 65 26 66 0.81 # 2 # 223 # -1 # ID=3_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.437 17_1 - 268 Dimerisation PF08100.6 51 0.0014 12.8 0.1 1 1 0.00015 0.014 9.6 0.0 21 47 5 33 3 34 0.88 # 1 # 804 # 1 # ID=17_1;partial=11;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.440 1_17 - 236 DnaJ_CXXCXGXG PF00684.14 66 2e-05 18.9 1.3 1 1 2.4e-07 3.3e-05 18.2 1.3 36 66 28 57 21 57 0.86 # 15808 # 16515 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.421 1_42 - 156 DnaJ_CXXCXGXG PF00684.14 66 0.00012 16.5 5.9 1 1 3.3e-06 0.00045 14.6 5.9 16 52 33 60 8 72 0.57 # 38511 # 38978 # 1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 2_24 - 595 UvrD_C PF13361.1 351 6.1e-42 138.6 0.0 1 1 1.7e-43 2.3e-41 136.6 0.0 2 348 254 564 253 567 0.89 # 26087 # 27871 # 1 # ID=2_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 2_21 - 680 UvrD_C PF13361.1 351 1.8e-22 74.5 0.0 1 2 0.0044 0.6 3.7 0.0 74 118 332 377 289 388 0.79 # 22215 # 24254 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 2_21 - 680 UvrD_C PF13361.1 351 1.8e-22 74.5 0.0 2 2 2e-22 2.7e-20 67.4 0.0 290 347 538 607 519 611 0.91 # 22215 # 24254 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 3_12 - 407 AAA_13 PF13166.1 712 0.087 5.5 36.8 1 2 1.1e-05 0.0029 10.3 27.3 291 493 107 313 81 324 0.73 # 7706 # 8926 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 3_12 - 407 AAA_13 PF13166.1 712 0.087 5.5 36.8 2 2 0.02 5.5 -0.5 2.9 406 453 339 383 315 391 0.55 # 7706 # 8926 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 3_29 - 488 TIGR00436 TIGR00436 270 0.00094 12.6 0.0 1 2 0.00012 0.032 7.6 0.0 3 28 125 150 123 167 0.88 # 20940 # 22403 # 1 # ID=3_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 3_29 - 488 TIGR00436 TIGR00436 270 0.00094 12.6 0.0 2 2 0.0036 0.98 2.7 0.0 66 160 209 301 203 315 0.80 # 20940 # 22403 # 1 # ID=3_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 2_2 - 418 ArsA_ATPase PF02374.10 305 2.5e-06 21.0 0.7 1 2 0.026 7.1 -0.2 0.0 214 274 14 76 6 84 0.76 # 541 # 1794 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.431 2_2 - 418 ArsA_ATPase PF02374.10 305 2.5e-06 21.0 0.7 2 2 3.9e-07 0.00011 15.7 0.2 7 136 121 269 115 274 0.63 # 541 # 1794 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.431 2_2 - 418 AAA_31 PF13614.1 157 6.4e-06 20.5 0.2 1 2 5.5e-06 0.0015 12.8 0.0 9 128 123 270 121 295 0.81 # 541 # 1794 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.431 2_2 - 418 AAA_31 PF13614.1 157 6.4e-06 20.5 0.2 2 2 0.0022 0.59 4.4 0.1 14 116 299 408 284 411 0.82 # 541 # 1794 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.431 9_3 - 272 Pterin_bind PF00809.17 210 3.1e-60 197.4 0.0 1 1 1.4e-62 3.7e-60 197.2 0.0 1 209 10 216 10 217 0.98 # 1836 # 2651 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.608 2_21 - 680 AAA_11 PF13086.1 236 0.00024 15.0 0.2 1 2 6e-06 0.0016 12.3 0.0 17 75 17 70 4 141 0.75 # 22215 # 24254 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 2_21 - 680 AAA_11 PF13086.1 236 0.00024 15.0 0.2 2 2 0.069 19 -1.0 0.0 25 75 308 359 289 377 0.69 # 22215 # 24254 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 2_26 - 126 SSB PF00436.20 104 0.00039 14.6 0.1 1 2 8.1e-06 0.0022 12.2 0.1 2 84 8 88 7 94 0.79 # 29203 # 29580 # 1 # ID=2_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.376 2_26 - 126 SSB PF00436.20 104 0.00039 14.6 0.1 2 2 0.027 7.3 0.9 0.0 42 60 91 109 85 112 0.83 # 29203 # 29580 # 1 # ID=2_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.376 1_24 - 559 MetW PF07021.7 193 5.8e-05 16.8 0.0 1 1 4.2e-07 0.00011 15.9 0.0 7 90 412 495 409 506 0.84 # 21552 # 23228 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 1_23 - 296 HTH_21 PF13276.1 60 9.4e-18 58.4 3.6 1 1 7e-20 9.4e-18 58.4 3.6 3 60 47 103 44 103 0.92 # 20573 # 21460 # 1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 1_111 - 466 HTH_21 PF13276.1 60 0.0011 13.4 0.1 1 1 2.3e-05 0.0031 11.9 0.1 28 59 98 129 75 130 0.77 # 95337 # 96734 # 1 # ID=1_111;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/f8cc000d-ab1e-443b-ab42-1e1b596b00c0 # Target file: checkm_output/bins/pm1109/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm1109/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/f8cc000d-ab1e-443b-ab42-1e1b596b00c0 checkm_output/bins/pm1109/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 09:34:55 2017 # [ok]