# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 11_2 - 167 HTH_IclR PF09339.5 52 0.00028 13.8 0.1 1 1 2e-05 0.00083 12.2 0.1 14 38 17 41 16 44 0.86 # 17 # 517 # 1 # ID=11_2;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 3_5 - 37 HTH_IclR PF09339.5 52 0.00085 12.2 0.0 1 1 2.5e-05 0.001 11.9 0.0 14 34 17 37 15 37 0.90 # 8803 # 8913 # 1 # ID=3_5;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 6_1 - 37 HTH_IclR PF09339.5 52 0.00085 12.2 0.0 1 1 2.5e-05 0.001 11.9 0.0 14 34 17 37 15 37 0.90 # 1 # 111 # -1 # ID=6_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_10 - 198 ABC_tran PF00005.22 137 2.5e-05 17.8 1.4 1 1 4.1e-07 5.2e-05 16.8 1.4 8 125 20 157 15 163 0.59 # 10284 # 10877 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 1_10 - 198 Sigma54_activat PF00158.21 168 1.1e-05 18.2 0.0 1 1 1.2e-07 1.5e-05 17.7 0.0 16 86 17 90 4 107 0.83 # 10284 # 10877 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 11_2 - 167 HTH_38 PF13936.1 44 5.8e-17 54.3 1.9 1 1 3.1e-18 9.7e-17 53.6 1.4 2 44 3 45 2 45 0.98 # 17 # 517 # 1 # ID=11_2;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 3_5 - 37 HTH_38 PF13936.1 44 1.1e-11 37.4 0.2 1 1 3.7e-13 1.2e-11 37.3 0.2 2 36 3 37 2 37 0.97 # 8803 # 8913 # 1 # ID=3_5;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 6_1 - 37 HTH_38 PF13936.1 44 1.1e-11 37.4 0.2 1 1 3.7e-13 1.2e-11 37.3 0.2 2 36 3 37 2 37 0.97 # 1 # 111 # -1 # ID=6_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_6 - 213 HTH_38 PF13936.1 44 0.00077 12.3 0.0 1 1 2.4e-05 0.00077 12.3 0.0 12 42 172 202 166 204 0.92 # 5624 # 6262 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 2_11 - 699 MobB PF03205.9 140 0.0004 13.3 0.1 1 1 1.1e-05 0.0014 11.6 0.1 5 31 520 546 516 587 0.83 # 5704 # 7800 # 1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.386 2_18 - 139 TIGR00873 TIGR00873 467 0.00023 12.9 0.7 1 2 5.6e-06 0.00071 11.3 0.4 47 116 5 70 1 81 0.80 # 13109 # 13525 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.384 2_18 - 139 TIGR00873 TIGR00873 467 0.00023 12.9 0.7 2 2 0.019 2.4 -0.3 0.0 80 114 87 121 67 132 0.72 # 13109 # 13525 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.384 2_11 - 699 AAA_19 PF13245.1 76 1.3e-05 18.1 0.0 1 1 2e-07 2.6e-05 17.2 0.0 12 74 517 572 505 574 0.79 # 5704 # 7800 # 1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.386 1_48 - 290 CbiA PF01656.18 195 2.1e-19 62.9 0.0 1 1 1.1e-20 6.9e-19 61.2 0.0 5 175 36 235 34 251 0.72 # 44318 # 45187 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.411 6_3 - 212 CbiA PF01656.18 195 1.8e-10 33.8 0.1 1 1 4.6e-12 2.9e-10 33.1 0.1 2 146 5 126 4 172 0.76 # 392 # 1027 # 1 # ID=6_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_6 - 213 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 4.2e-05 16.2 0.0 1 1 2.8e-06 9e-05 15.2 0.0 17 43 171 197 170 207 0.89 # 5624 # 6262 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 11_2 - 167 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00013 14.7 0.5 1 1 8.4e-06 0.00027 13.7 0.3 10 49 5 44 4 44 0.95 # 17 # 517 # 1 # ID=11_2;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 3_5 - 37 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00031 13.5 0.0 1 1 1.1e-05 0.00034 13.4 0.0 10 42 5 37 4 37 0.95 # 8803 # 8913 # 1 # ID=3_5;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 6_1 - 37 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00031 13.5 0.0 1 1 1.1e-05 0.00034 13.4 0.0 10 42 5 37 4 37 0.95 # 1 # 111 # -1 # ID=6_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 12_1 - 169 rve PF00665.21 120 4.6e-15 49.1 0.4 1 1 2.2e-16 6.9e-15 48.5 0.4 4 119 13 122 10 123 0.94 # 3 # 509 # -1 # ID=12_1;partial=11;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.489 5_2 - 68 rve PF00665.21 120 1.6e-07 24.7 0.1 1 1 5.5e-09 1.7e-07 24.6 0.1 11 67 1 54 1 64 0.88 # 3862 # 4065 # -1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.515 7_1 - 104 rve PF00665.21 120 1.9e-05 18.0 0.1 1 1 4.8e-06 0.00015 15.1 0.0 7 33 75 99 68 102 0.87 # 174 # 485 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.545 9_3 - 90 rve PF00665.21 120 0.00029 14.2 0.0 1 1 1.3e-05 0.00041 13.7 0.0 5 51 46 88 42 89 0.87 # 1431 # 1700 # -1 # ID=9_3;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 1_48 - 290 YhjQ PF06564.7 244 5.5e-08 25.6 0.0 1 1 9e-10 1.1e-07 24.6 0.0 10 147 38 175 32 180 0.75 # 44318 # 45187 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.411 1_10 - 198 AAA_23 PF13476.1 202 3.3e-10 33.8 13.8 1 2 7.3e-11 9.3e-09 29.1 0.8 2 35 6 40 5 45 0.91 # 10284 # 10877 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 1_10 - 198 AAA_23 PF13476.1 202 3.3e-10 33.8 13.8 2 2 6e-05 0.0077 9.8 6.1 137 184 71 122 50 142 0.72 # 10284 # 10877 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 2_10 - 691 Zeta_toxin PF06414.7 201 1.9e-05 17.0 0.0 1 1 3.4e-07 4.4e-05 15.9 0.0 10 44 187 223 178 237 0.78 # 3631 # 5703 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.394 2_11 - 699 AAA_30 PF13604.1 196 2.1e-44 144.7 0.0 1 1 6.2e-46 3.9e-44 143.8 0.0 1 190 498 681 498 685 0.96 # 5704 # 7800 # 1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.386 2_12 - 911 AAA_30 PF13604.1 196 4.3e-16 52.3 0.1 1 1 1.5e-17 9.3e-16 51.2 0.1 9 186 362 539 356 547 0.95 # 7942 # 10674 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 1_10 - 198 SMC_N PF02463.14 220 3.4e-11 36.0 4.4 1 1 3.4e-13 4.3e-11 35.7 4.4 2 144 3 148 2 159 0.79 # 10284 # 10877 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 3_1 - 80 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 2.5e-07 23.9 0.0 1 1 2.2e-09 2.8e-07 23.7 0.0 5 67 3 66 1 75 0.85 # 151 # 390 # -1 # ID=3_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.458 2_10 - 691 TraG-D_C PF12696.2 128 2e-18 59.7 0.3 1 1 7.2e-20 9.2e-18 57.6 0.0 1 126 423 544 423 546 0.88 # 3631 # 5703 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.394 6_3 - 212 MipZ PF09140.6 261 6.7e-11 34.9 3.1 1 2 2.7e-06 0.00017 13.9 0.5 4 25 5 26 2 37 0.84 # 392 # 1027 # 1 # ID=6_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 6_3 - 212 MipZ PF09140.6 261 6.7e-11 34.9 3.1 2 2 9.8e-09 6.2e-07 21.9 0.1 83 139 59 115 34 167 0.75 # 392 # 1027 # 1 # ID=6_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_48 - 290 MipZ PF09140.6 261 3.9e-09 29.2 0.1 1 2 1.2e-08 7.3e-07 21.7 0.0 6 41 35 70 31 94 0.86 # 44318 # 45187 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.411 1_48 - 290 MipZ PF09140.6 261 3.9e-09 29.2 0.1 2 2 0.0014 0.088 5.1 0.0 92 114 139 161 112 179 0.75 # 44318 # 45187 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.411 10_1 - 294 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 1e-18 60.9 0.6 1 1 1.3e-20 1.6e-18 60.2 0.6 43 211 33 241 9 242 0.70 # 343 # 1224 # 1 # ID=10_1;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.439 1_10 - 198 AAA_21 PF13304.1 303 1e-05 18.8 6.0 1 1 1.1e-07 1.4e-05 18.4 6.0 1 117 26 128 26 156 0.73 # 10284 # 10877 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 11_2 - 167 Sigma70_r4 PF04545.11 50 4.5e-08 25.6 1.1 1 1 2.1e-09 8.7e-08 24.7 1.1 4 42 5 43 4 45 0.93 # 17 # 517 # 1 # ID=11_2;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 3_5 - 37 Sigma70_r4 PF04545.11 50 1e-07 24.5 0.2 1 1 2.6e-09 1.1e-07 24.3 0.2 4 36 5 37 4 37 0.96 # 8803 # 8913 # 1 # ID=3_5;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 6_1 - 37 Sigma70_r4 PF04545.11 50 1e-07 24.5 0.2 1 1 2.6e-09 1.1e-07 24.3 0.2 4 36 5 37 4 37 0.96 # 1 # 111 # -1 # ID=6_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 2_10 - 691 AAA PF00004.24 132 0.00039 13.9 0.0 1 1 1.1e-05 0.0014 12.1 0.0 1 22 196 217 196 268 0.82 # 3631 # 5703 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.394 1_49 - 464 KorB PF08535.5 93 1.6e-15 50.4 0.0 1 1 5.3e-17 6.8e-15 48.3 0.0 2 82 157 234 156 241 0.91 # 45184 # 46575 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.405 2_3 - 101 HTH_37 PF13744.1 80 4.8e-14 45.2 0.4 1 1 6.1e-16 7.7e-14 44.6 0.4 7 74 25 91 19 95 0.91 # 600 # 902 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.409 2_3 - 101 HTH_25 PF13413.1 62 5.5e-06 19.3 0.3 1 1 1.1e-07 1.4e-05 17.9 0.3 1 33 40 72 40 90 0.88 # 600 # 902 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.409 2_10 - 691 cobW PF02492.14 178 0.00032 13.4 0.0 1 1 6.1e-06 0.00077 12.2 0.0 3 34 196 227 194 235 0.86 # 3631 # 5703 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.394 2_10 - 691 AAA_16 PF13191.1 185 8.2e-06 19.1 0.0 1 1 1.6e-07 2e-05 17.9 0.0 20 47 189 216 182 338 0.89 # 3631 # 5703 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.394 2_10 - 691 AAA_22 PF13401.1 131 9.1e-06 19.1 0.0 1 1 6.1e-07 3.9e-05 17.1 0.0 3 78 192 261 190 330 0.75 # 3631 # 5703 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.394 1_10 - 198 AAA_22 PF13401.1 131 8.7e-05 15.9 0.1 1 1 7.1e-06 0.00045 13.6 0.1 4 37 24 64 20 118 0.70 # 10284 # 10877 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 7_4 - 297 HTH_AraC PF00165.18 42 1e-11 37.7 0.2 1 2 0.029 1.8 1.9 0.0 10 35 22 47 15 53 0.78 # 1661 # 2551 # -1 # ID=7_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 7_4 - 297 HTH_AraC PF00165.18 42 1e-11 37.7 0.2 2 2 3.6e-12 2.3e-10 33.3 0.1 9 42 70 104 65 104 0.91 # 1661 # 2551 # -1 # ID=7_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 1_6 - 213 HTH_AraC PF00165.18 42 0.00085 12.5 0.0 1 1 2.8e-05 0.0018 11.4 0.0 7 31 179 203 175 206 0.90 # 5624 # 6262 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 1_10 - 198 AAA_29 PF13555.1 62 3.2e-05 16.7 0.1 1 1 9.1e-07 5.8e-05 15.9 0.1 10 60 12 57 3 59 0.72 # 10284 # 10877 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 2_10 - 691 AAA_29 PF13555.1 62 0.001 11.9 0.0 1 1 4.8e-05 0.0031 10.4 0.0 24 40 194 210 180 214 0.82 # 3631 # 5703 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.394 2_3 - 101 HTH_3 PF01381.17 55 5.3e-16 51.5 0.0 1 1 2.7e-17 8.6e-16 50.9 0.0 1 52 41 92 41 94 0.96 # 600 # 902 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.409 1_18 - 70 HTH_3 PF01381.17 55 7.3e-09 28.7 0.0 1 1 5.4e-10 1.7e-08 27.5 0.0 10 55 1 50 1 50 0.91 # 16692 # 16901 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 1_6 - 213 HTH_3 PF01381.17 55 0.00012 15.2 2.8 1 2 0.072 2.3 1.5 0.7 2 16 142 156 142 163 0.81 # 5624 # 6262 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 1_6 - 213 HTH_3 PF01381.17 55 0.00012 15.2 2.8 2 2 1.5e-05 0.00049 13.2 0.1 1 32 172 203 172 210 0.89 # 5624 # 6262 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 11_2 - 167 HTH_3 PF01381.17 55 0.00018 14.6 0.3 1 2 8.2e-05 0.0026 10.9 0.1 3 28 15 40 14 40 0.92 # 17 # 517 # 1 # ID=11_2;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 11_2 - 167 HTH_3 PF01381.17 55 0.00018 14.6 0.3 2 2 0.086 2.7 1.2 0.0 19 38 108 129 104 135 0.74 # 17 # 517 # 1 # ID=11_2;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 11_2 - 167 HTH_23 PF13384.1 50 1.1e-09 31.0 0.1 1 2 1e-09 2.6e-08 26.6 0.1 2 42 6 45 5 54 0.89 # 17 # 517 # 1 # ID=11_2;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 11_2 - 167 HTH_23 PF13384.1 50 1.1e-09 31.0 0.1 2 2 0.051 1.3 2.1 0.0 27 40 110 123 110 131 0.82 # 17 # 517 # 1 # ID=11_2;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 1_6 - 213 HTH_23 PF13384.1 50 5e-07 22.5 0.9 1 1 5e-08 1.3e-06 21.3 0.1 8 40 170 203 163 209 0.87 # 5624 # 6262 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 3_5 - 37 HTH_23 PF13384.1 50 6.1e-06 19.1 0.1 1 1 2.5e-07 6.4e-06 19.0 0.1 2 33 6 37 5 37 0.95 # 8803 # 8913 # 1 # ID=3_5;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 6_1 - 37 HTH_23 PF13384.1 50 6.1e-06 19.1 0.1 1 1 2.5e-07 6.4e-06 19.0 0.1 2 33 6 37 5 37 0.95 # 1 # 111 # -1 # ID=6_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_44 - 460 HTH_23 PF13384.1 50 0.00033 13.6 1.0 1 1 0.00097 0.025 7.6 0.0 23 41 433 451 406 454 0.87 # 40640 # 42019 # 1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.436 11_2 - 167 HTH_7 PF02796.10 45 0.0002 14.5 1.6 1 2 0.00011 0.0072 9.5 0.1 14 40 14 40 5 45 0.87 # 17 # 517 # 1 # ID=11_2;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 11_2 - 167 HTH_7 PF02796.10 45 0.0002 14.5 1.6 2 2 0.0061 0.39 4.0 0.0 32 42 111 121 109 124 0.86 # 17 # 517 # 1 # ID=11_2;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 1_6 - 213 HTH_7 PF02796.10 45 0.0031 10.7 2.1 1 1 0.00028 0.018 8.2 0.1 14 41 172 200 161 204 0.81 # 5624 # 6262 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 2_3 - 101 HTH_19 PF12844.2 64 7.1e-14 44.9 0.0 1 1 1.9e-15 1.2e-13 44.2 0.0 3 54 40 91 39 97 0.94 # 600 # 902 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.409 1_18 - 70 HTH_19 PF12844.2 64 8.9e-06 19.0 0.0 1 1 1.5e-07 9.8e-06 18.9 0.0 13 59 1 51 1 56 0.83 # 16692 # 16901 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 2_10 - 691 NB-ARC PF00931.17 287 0.00039 12.6 0.0 1 1 6.8e-06 0.00087 11.4 0.0 17 81 191 256 184 275 0.74 # 3631 # 5703 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.394 11_2 - 167 HTH_29 PF13551.1 112 3.8e-06 20.3 0.5 1 1 7.1e-08 9e-06 19.1 0.3 6 110 16 123 11 125 0.69 # 17 # 517 # 1 # ID=11_2;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 7_1 - 104 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 1.8e-10 33.7 0.3 1 1 6.4e-12 2e-10 33.5 0.3 8 95 17 98 11 102 0.90 # 174 # 485 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.545 2_21 - 105 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 2.3e-09 30.0 0.1 1 1 7.8e-11 2.5e-09 29.9 0.1 7 85 16 88 10 100 0.87 # 17017 # 17331 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 4_8 - 63 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 7.5e-07 21.8 0.0 1 1 2.4e-08 7.5e-07 21.8 0.0 8 49 17 58 10 62 0.91 # 8315 # 8503 # 1 # ID=4_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.508 7_5 - 63 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 7.5e-07 21.8 0.0 1 1 2.4e-08 7.5e-07 21.8 0.0 8 49 17 58 10 62 0.91 # 2691 # 2879 # 1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.513 2_10 - 691 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 6.2e-108 354.0 0.0 1 1 1.3e-109 8.5e-108 353.5 0.0 2 386 180 565 179 565 0.99 # 3631 # 5703 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.394 1_32 - 858 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 0.00047 12.0 0.1 1 1 1.6e-05 0.001 10.9 0.0 6 55 458 508 454 534 0.86 # 31359 # 33932 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.413 1_48 - 290 TIGR01968 TIGR01968 261 8.1e-13 41.2 0.1 1 2 6.3e-10 8e-08 24.8 0.1 9 40 37 68 31 74 0.92 # 44318 # 45187 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.411 1_48 - 290 TIGR01968 TIGR01968 261 8.1e-13 41.2 0.1 2 2 9.3e-07 0.00012 14.4 0.0 105 228 139 272 108 283 0.77 # 44318 # 45187 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.411 2_10 - 691 AAA_18 PF13238.1 129 2.6e-06 21.0 1.4 1 1 8.7e-08 5.5e-06 20.0 0.0 1 106 196 326 196 336 0.64 # 3631 # 5703 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.394 1_10 - 198 AAA_18 PF13238.1 129 1.6e-05 18.4 0.2 1 1 4.7e-07 3e-05 17.6 0.2 2 77 28 116 28 175 0.75 # 10284 # 10877 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 1_10 - 198 TIGR00611 TIGR00611 365 1.5e-05 17.2 0.6 1 1 2.1e-07 2.7e-05 16.4 0.2 1 61 1 62 1 111 0.79 # 10284 # 10877 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 1_6 - 213 HTH_Tnp_IS1 PF12759.2 46 1.6e-05 17.6 0.1 1 1 2.2e-07 2.8e-05 16.8 0.1 10 45 168 204 163 205 0.90 # 5624 # 6262 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 1_10 - 198 DUF258 PF03193.11 161 0.00021 13.7 0.1 1 1 4.5e-06 0.00057 12.3 0.0 33 67 22 56 3 61 0.75 # 10284 # 10877 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 1_32 - 858 DUF87 PF01935.12 229 3.3e-08 26.8 0.0 1 1 6.6e-10 8.4e-08 25.5 0.0 14 218 457 667 448 675 0.73 # 31359 # 33932 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.413 11_2 - 167 HTH_28 PF13518.1 52 2.3e-06 20.8 0.7 1 2 2e-05 0.00083 12.7 0.1 10 35 19 44 11 59 0.88 # 17 # 517 # 1 # ID=11_2;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 11_2 - 167 HTH_28 PF13518.1 52 2.3e-06 20.8 0.7 2 2 0.0016 0.069 6.5 0.1 22 41 108 130 93 141 0.74 # 17 # 517 # 1 # ID=11_2;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 1_6 - 213 HTH_28 PF13518.1 52 2.1e-05 17.7 0.9 1 1 9e-07 3.8e-05 16.9 0.1 4 37 171 205 171 208 0.88 # 5624 # 6262 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 3_1 - 80 HTH_28 PF13518.1 52 0.00037 13.8 0.0 1 1 1.1e-05 0.00045 13.5 0.0 1 37 9 44 9 57 0.84 # 151 # 390 # -1 # ID=3_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.458 7_4 - 297 HTH_18 PF12833.2 81 7.4e-20 64.2 0.4 1 1 1.4e-21 1.8e-19 62.9 0.4 2 80 27 104 26 105 0.96 # 1661 # 2551 # -1 # ID=7_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 2_10 - 691 MMR_HSR1 PF01926.18 116 3.8e-05 16.9 0.0 1 1 1.5e-06 0.00019 14.6 0.0 2 35 196 234 195 266 0.72 # 3631 # 5703 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.394 2_2 - 111 SAP PF02037.22 35 0.00044 13.0 0.1 1 1 7e-06 0.00089 12.1 0.1 10 33 8 31 7 33 0.88 # 275 # 607 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.390 2_3 - 101 HTH_31 PF13560.1 64 4.5e-13 42.5 0.0 1 1 9.4e-15 6e-13 42.1 0.0 5 55 40 89 36 95 0.95 # 600 # 902 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.409 1_18 - 70 HTH_31 PF13560.1 64 2.6e-06 20.9 0.0 1 1 5.6e-08 3.6e-06 20.4 0.0 15 58 1 47 1 55 0.90 # 16692 # 16901 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 2_12 - 911 UvrD_C_2 PF13538.1 104 1.9e-12 40.5 0.5 1 2 6.9e-11 8.8e-09 28.8 0.0 3 99 81 180 79 183 0.74 # 7942 # 10674 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 2_12 - 911 UvrD_C_2 PF13538.1 104 1.9e-12 40.5 0.5 2 2 0.0001 0.013 8.9 0.1 49 104 757 812 716 812 0.77 # 7942 # 10674 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 1_28 - 240 PcrB PF01884.12 231 0.00016 14.2 0.0 1 1 2.5e-06 0.00031 13.2 0.0 12 79 76 139 65 151 0.85 # 25100 # 25819 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.411 1_6 - 213 HTH_36 PF13730.1 55 0.00027 14.3 0.1 1 1 4e-06 0.00051 13.5 0.1 22 50 180 205 164 208 0.81 # 5624 # 6262 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 1_10 - 198 AAA_17 PF13207.1 121 2.4e-06 21.6 0.0 1 1 5e-08 3.2e-06 21.3 0.0 3 77 28 118 26 163 0.63 # 10284 # 10877 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 2_10 - 691 AAA_17 PF13207.1 121 0.00064 13.8 0.0 1 1 2.8e-05 0.0018 12.4 0.0 2 32 196 223 195 336 0.74 # 3631 # 5703 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.394 2_10 - 691 AAA_25 PF13481.1 194 0.00089 11.9 0.0 1 1 2.8e-05 0.0035 10.0 0.0 28 53 186 213 159 216 0.66 # 3631 # 5703 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.394 2_10 - 691 Viral_helicase1 PF01443.13 234 0.00012 14.9 0.0 1 1 2.3e-06 0.00029 13.6 0.0 2 35 197 227 196 257 0.73 # 3631 # 5703 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.394 1_12 - 340 Transposase_20 PF02371.11 87 1.5e-29 95.2 0.1 1 1 2.4e-31 3e-29 94.3 0.1 1 77 211 287 211 299 0.94 # 11289 # 12308 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_6 - 213 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 1.5e-05 17.4 0.0 1 1 2.2e-07 2.8e-05 16.5 0.0 28 50 181 203 168 205 0.86 # 5624 # 6262 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 1_10 - 198 AAA_33 PF13671.1 143 0.00018 14.7 0.0 1 1 4.3e-06 0.00028 14.0 0.0 3 33 28 74 26 138 0.59 # 10284 # 10877 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 2_10 - 691 AAA_33 PF13671.1 143 0.00049 13.3 0.0 1 1 2.9e-05 0.0019 11.4 0.0 2 23 196 217 196 275 0.83 # 3631 # 5703 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.394 11_2 - 167 CENP-B_N PF04218.8 53 2e-05 17.3 0.3 1 1 1e-06 4.3e-05 16.2 0.3 7 41 6 40 4 47 0.92 # 17 # 517 # 1 # ID=11_2;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 3_5 - 37 CENP-B_N PF04218.8 53 4.9e-05 16.0 0.1 1 1 1.3e-06 5.4e-05 15.9 0.1 6 38 5 37 3 37 0.96 # 8803 # 8913 # 1 # ID=3_5;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 6_1 - 37 CENP-B_N PF04218.8 53 4.9e-05 16.0 0.1 1 1 1.3e-06 5.4e-05 15.9 0.1 6 38 5 37 3 37 0.96 # 1 # 111 # -1 # ID=6_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 2_10 - 691 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 1.7e-13 43.2 0.0 1 1 3.9e-15 4.9e-13 41.6 0.0 221 431 337 551 147 600 0.82 # 3631 # 5703 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.394 2_10 - 691 NTPase_1 PF03266.10 168 0.0005 13.1 0.0 1 1 1.5e-05 0.00097 12.1 0.0 2 24 196 218 195 342 0.83 # 3631 # 5703 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.394 2_11 - 699 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00055 12.9 0.1 1 1 3e-05 0.0019 11.1 0.1 4 34 520 550 517 592 0.91 # 5704 # 7800 # 1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.386 12_1 - 169 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 2.9e-58 189.0 0.6 1 1 1.2e-59 3.7e-58 188.7 0.6 1 139 15 152 15 153 0.98 # 3 # 509 # -1 # ID=12_1;partial=11;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.489 5_2 - 68 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 1.1e-26 86.7 0.1 1 1 3.8e-28 1.2e-26 86.6 0.1 6 56 1 51 1 61 0.95 # 3862 # 4065 # -1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.515 7_1 - 104 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 1.1e-13 44.7 1.1 1 1 6.8e-15 2.2e-13 43.6 0.4 2 26 75 99 74 102 0.94 # 174 # 485 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.545 2_21 - 105 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 6e-09 29.2 0.3 1 1 4.3e-10 1.4e-08 28.1 0.1 2 19 75 92 74 98 0.93 # 17017 # 17331 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 2_3 - 101 HTH_26 PF13443.1 63 6.7e-05 16.3 0.0 1 1 7.4e-07 9.4e-05 15.9 0.0 10 51 49 89 34 92 0.86 # 600 # 902 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.409 1_10 - 198 TIGR00634 TIGR00634 563 0.00046 12.1 1.4 1 2 0.0067 0.85 1.3 0.0 2 36 3 38 2 42 0.81 # 10284 # 10877 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 1_10 - 198 TIGR00634 TIGR00634 563 0.00046 12.1 1.4 2 2 1.7e-05 0.0021 9.9 0.3 177 230 78 132 64 160 0.79 # 10284 # 10877 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 11_2 - 167 HTH_17 PF12728.2 51 0.00076 13.0 0.1 1 2 0.0049 0.63 3.7 0.0 8 24 28 44 25 58 0.83 # 17 # 517 # 1 # ID=11_2;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 11_2 - 167 HTH_17 PF12728.2 51 0.00076 13.0 0.1 2 2 0.00043 0.055 7.1 0.0 11 26 110 125 109 142 0.79 # 17 # 517 # 1 # ID=11_2;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 11_2 - 167 MarR_2 PF12802.2 62 2e-06 20.7 0.1 1 1 8.6e-08 3.6e-06 19.9 0.1 17 44 18 44 12 48 0.84 # 17 # 517 # 1 # ID=11_2;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 3_5 - 37 MarR_2 PF12802.2 62 0.00027 13.9 0.0 1 1 7.8e-06 0.00033 13.6 0.0 17 37 17 37 12 37 0.79 # 8803 # 8913 # 1 # ID=3_5;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 6_1 - 37 MarR_2 PF12802.2 62 0.00027 13.9 0.0 1 1 7.8e-06 0.00033 13.6 0.0 17 37 17 37 12 37 0.79 # 1 # 111 # -1 # ID=6_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_53 - 147 TrmB PF01978.14 68 0.00099 12.1 0.0 1 1 1.7e-05 0.0021 11.0 0.0 13 48 85 120 74 121 0.90 # 48230 # 48670 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.286 1_6 - 213 LacI PF00356.16 46 0.00027 13.8 0.4 1 1 4.5e-06 0.00057 12.8 0.4 1 24 182 205 182 211 0.88 # 5624 # 6262 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 1_48 - 290 ParA PF10609.4 81 0.0002 14.5 0.0 1 1 2.9e-06 0.00037 13.6 0.0 2 50 147 193 146 218 0.81 # 44318 # 45187 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.411 2_3 - 101 HTH_Crp_2 PF13545.1 76 0.00029 13.9 0.0 1 1 4.2e-06 0.00053 13.1 0.0 26 48 47 69 31 72 0.86 # 600 # 902 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.409 1_32 - 858 AAA_10 PF12846.2 304 1.8e-37 122.6 0.2 1 1 4.5e-39 2.9e-37 121.9 0.2 2 267 469 744 468 753 0.88 # 31359 # 33932 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.413 2_10 - 691 AAA_10 PF12846.2 304 4.1e-12 39.3 0.0 1 1 2.6e-13 1.6e-11 37.3 0.0 3 302 195 504 194 506 0.74 # 3631 # 5703 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.394 1_9 - 490 AAA_13 PF13166.1 712 3.8e-112 369.2 32.9 1 1 6.7e-114 4.2e-112 369.0 32.9 233 712 2 473 1 473 0.94 # 8724 # 10193 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.305 1_10 - 198 AAA_13 PF13166.1 712 4e-31 101.4 7.9 1 1 7.1e-33 4.5e-31 101.2 7.9 1 191 10 188 10 196 0.79 # 10284 # 10877 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 1_48 - 290 ArsA_ATPase PF02374.10 305 2.4e-09 29.9 0.0 1 2 4.2e-09 5.3e-07 22.1 0.0 9 38 38 67 34 91 0.94 # 44318 # 45187 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.411 1_48 - 290 ArsA_ATPase PF02374.10 305 2.4e-09 29.9 0.0 2 2 0.00053 0.067 5.4 0.0 115 136 134 155 114 160 0.77 # 44318 # 45187 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.411 1_48 - 290 AAA_31 PF13614.1 157 3.3e-08 26.8 0.0 1 2 4.8e-05 0.0061 9.7 0.0 9 39 38 68 36 102 0.88 # 44318 # 45187 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.411 1_48 - 290 AAA_31 PF13614.1 157 3.3e-08 26.8 0.0 2 2 1.7e-06 0.00022 14.4 0.0 111 150 139 177 138 182 0.86 # 44318 # 45187 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.411 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/7bd14396-151e-4f28-858b-58696798cc37 # Target file: checkm_output/bins/pm11/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm11/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/7bd14396-151e-4f28-858b-58696798cc37 checkm_output/bins/pm11/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 09:34:41 2017 # [ok]