# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 6_9 - 232 ATP-synt_ab PF00006.20 215 0.00055 13.4 0.1 1 1 8.3e-06 0.0017 11.8 0.1 8 35 29 56 23 74 0.86 # 8238 # 8933 # 1 # ID=6_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 3_8 - 228 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 2.7e-05 17.5 0.0 1 2 0.00041 0.085 6.1 0.0 112 146 18 54 8 81 0.66 # 3380 # 4063 # -1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.563 3_8 - 228 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 2.7e-05 17.5 0.0 2 2 4e-05 0.0083 9.4 0.0 41 62 162 183 145 218 0.78 # 3380 # 4063 # -1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.563 6_9 - 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876 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 6.1e-05 15.6 0.0 2 2 0.00022 0.022 7.2 0.0 319 378 711 769 663 771 0.90 # 13025 # 15652 # 1 # ID=1_23;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 11_8 - 139 Ribosomal_S8 PF00410.14 129 0.0027 11.5 1.8 1 2 0.0059 1.2 2.9 0.1 41 73 2 29 1 35 0.56 # 4250 # 4666 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.360 11_8 - 139 Ribosomal_S8 PF00410.14 129 0.0027 11.5 1.8 2 2 0.00012 0.025 8.4 0.1 50 87 90 128 50 135 0.79 # 4250 # 4666 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.360 14_3 - 188 MTS PF05175.9 170 2.2e-07 24.3 0.0 1 1 3e-09 3e-07 23.9 0.0 24 141 45 149 41 166 0.85 # 2712 # 3275 # 1 # ID=14_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.594 2_13 - 519 MTS PF05175.9 170 8.9e-06 19.1 0.8 1 1 2.6e-07 2.7e-05 17.5 0.0 31 140 217 355 201 374 0.82 # 6422 # 7978 # 1 # ID=2_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 7_9 - 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