# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 3_32 - 564 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0017 12.3 0.0 1 1 9.7e-06 0.0032 11.5 0.0 105 138 471 502 451 516 0.71 # 28271 # 29962 # -1 # ID=3_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 1_44 - 695 KaiC PF06745.8 227 6.3e-05 16.7 0.0 1 2 1.4e-05 0.0023 11.6 0.0 22 78 201 259 199 342 0.79 # 28650 # 30734 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 1_44 - 695 KaiC PF06745.8 227 6.3e-05 16.7 0.0 2 2 0.0078 1.3 2.6 0.0 48 105 357 414 348 425 0.85 # 28650 # 30734 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 10_2 - 247 KaiC PF06745.8 227 7.9e-05 16.4 0.2 1 2 0.00069 0.11 6.1 0.0 16 56 97 136 81 144 0.81 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 10_2 - 247 KaiC PF06745.8 227 7.9e-05 16.4 0.2 2 2 0.0001 0.017 8.8 0.1 98 153 143 196 134 217 0.83 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 9_4 - 301 TrkA_N PF02254.13 116 0.00011 16.8 0.0 1 1 8e-07 0.00026 15.6 0.0 1 42 7 48 7 79 0.86 # 2105 # 3007 # 1 # ID=9_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 1_66 - 92 Zn_Tnp_IS1 PF03811.8 36 2.6e-23 75.8 4.5 1 1 1.6e-25 5.2e-23 74.9 4.5 1 36 1 36 1 36 0.99 # 54504 # 54779 # 1 # ID=1_66;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 2_15 - 156 MADF_DNA_bdg PF10545.4 85 0.0006 14.6 0.0 1 1 4.4e-06 0.0014 13.4 0.0 31 65 27 62 23 86 0.80 # 12751 # 13218 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.502 4_25 - 562 K_oxygenase PF13434.1 341 1.1e-05 19.0 0.3 1 3 0.0042 1.4 2.3 0.2 187 223 95 129 86 132 0.75 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_25 - 562 K_oxygenase PF13434.1 341 1.1e-05 19.0 0.3 2 3 2.9e-06 0.00094 12.7 0.0 130 231 217 309 200 339 0.79 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_25 - 562 K_oxygenase PF13434.1 341 1.1e-05 19.0 0.3 3 3 0.022 7.1 -0.0 0.0 139 160 345 366 314 376 0.63 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_43 - 186 HTH_IclR PF09339.5 52 4.1e-05 17.7 0.2 1 1 9.2e-07 0.00015 15.9 0.0 15 40 155 180 151 181 0.85 # 32252 # 32809 # -1 # ID=4_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 10_1 - 508 HTH_IclR PF09339.5 52 0.0011 13.1 0.0 1 1 1.7e-05 0.0027 11.9 0.0 14 40 15 41 10 42 0.88 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 2_9 - 353 CP_ATPgrasp_1 PF04174.8 330 0.0029 10.8 0.0 1 2 0.057 19 -1.7 0.0 262 305 125 172 112 198 0.69 # 6501 # 7559 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.501 2_9 - 353 CP_ATPgrasp_1 PF04174.8 330 0.0029 10.8 0.0 2 2 2.7e-05 0.0089 9.2 0.0 78 104 276 302 269 329 0.84 # 6501 # 7559 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.501 4_43 - 186 HTH_22 PF13309.1 64 0.00093 13.6 1.5 1 1 1.2e-05 0.0039 11.6 0.1 35 63 156 179 143 180 0.76 # 32252 # 32809 # -1 # ID=4_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 9_4 - 301 NAD_binding_11 PF14833.1 122 1.6e-37 122.9 0.3 1 2 0.029 9.5 0.9 1.1 8 53 96 141 92 153 0.85 # 2105 # 3007 # 1 # ID=9_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 9_4 - 301 NAD_binding_11 PF14833.1 122 1.6e-37 122.9 0.3 2 2 4.7e-40 1.6e-37 122.9 0.3 1 121 170 289 170 290 0.98 # 2105 # 3007 # 1 # ID=9_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 1_16 - 447 DUF134 PF02001.11 106 0.00051 14.5 0.1 1 1 3.9e-06 0.0013 13.2 0.1 37 83 3 52 1 63 0.81 # 7423 # 8763 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 9_3 - 254 HTH_AsnC-type PF13404.1 42 0.0016 12.6 0.3 1 1 1.4e-05 0.0047 11.1 0.3 7 42 9 44 8 44 0.94 # 1081 # 1842 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 11_2 - 167 HHH_5 PF14520.1 60 1.4e-05 19.8 0.3 1 2 4.1e-07 0.00014 16.7 0.1 11 55 6 51 6 56 0.92 # 882 # 1382 # 1 # ID=11_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.493 11_2 - 167 HHH_5 PF14520.1 60 1.4e-05 19.8 0.3 2 2 0.035 12 0.8 0.0 43 57 87 101 73 103 0.85 # 882 # 1382 # 1 # ID=11_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.493 3_21 - 254 N6_Mtase PF02384.11 311 1.4e-08 28.7 0.0 1 2 1.3e-05 0.0015 12.2 0.0 55 136 109 176 79 179 0.58 # 14905 # 15666 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 3_21 - 254 N6_Mtase PF02384.11 311 1.4e-08 28.7 0.0 2 2 6.1e-06 0.00067 13.3 0.0 161 200 179 219 176 247 0.76 # 14905 # 15666 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 3_32 - 564 N6_Mtase PF02384.11 311 8.2e-06 19.6 0.0 1 1 1.3e-07 1.5e-05 18.8 0.0 89 138 445 492 427 504 0.87 # 28271 # 29962 # -1 # ID=3_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 1_7 - 164 N6_Mtase PF02384.11 311 0.0028 11.3 0.0 1 1 3.2e-05 0.0035 11.0 0.0 37 78 14 59 5 84 0.72 # 3213 # 3704 # 1 # ID=1_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 4_22 - 71 DUF2116 PF09889.4 59 0.0054 11.1 5.7 1 1 0.00073 0.24 5.9 5.7 6 35 14 54 12 60 0.75 # 20389 # 20601 # -1 # ID=4_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.601 1_16 - 447 rve_3 PF13683.1 67 2.7e-10 34.3 0.3 1 2 0.016 1.7 2.9 0.1 16 51 17 52 5 53 0.84 # 7423 # 8763 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_16 - 447 rve_3 PF13683.1 67 2.7e-10 34.3 0.3 2 2 3.2e-10 3.5e-08 27.5 0.0 5 56 238 292 234 292 0.94 # 7423 # 8763 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 10_1 - 508 rve_3 PF13683.1 67 2.8e-06 21.4 0.0 1 1 6.5e-08 7.2e-06 20.1 0.0 2 64 226 288 225 291 0.92 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 1_77 - 468 rve_3 PF13683.1 67 0.00045 14.3 0.0 1 1 9.9e-06 0.0011 13.1 0.0 16 56 252 295 237 295 0.88 # 59377 # 60780 # 1 # ID=1_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 2_45 - 353 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00041 14.4 0.0 1 1 7.9e-06 0.0026 11.8 0.0 20 120 94 189 78 223 0.65 # 38950 # 40008 # -1 # ID=2_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.408 9_3 - 254 HTH_DeoR PF08220.7 57 8.9e-20 64.6 1.0 1 1 7.1e-22 2.3e-19 63.3 1.0 1 55 6 60 6 61 0.97 # 1081 # 1842 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 1_1 - 92 HTH_Tnp_Tc3_2 PF01498.13 72 0.0015 13.2 0.0 1 1 6.5e-06 0.0021 12.7 0.0 14 40 26 52 14 64 0.90 # 1 # 276 # -1 # ID=1_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_44 - 695 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 4.1e-07 24.2 0.0 1 2 5.4e-07 0.00018 15.6 0.0 22 80 181 236 170 243 0.86 # 28650 # 30734 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 1_44 - 695 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 4.1e-07 24.2 0.0 2 2 0.00047 0.15 6.0 0.0 169 204 510 542 500 543 0.81 # 28650 # 30734 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 3_21 - 254 N6-adenineMlase PF10237.4 162 2.4e-05 18.6 0.0 1 1 1.1e-07 3.7e-05 18.0 0.0 84 133 163 214 133 225 0.77 # 14905 # 15666 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 4_43 - 186 HTH_40 PF14493.1 91 0.0022 12.8 0.6 1 1 2.1e-05 0.007 11.2 0.1 7 32 152 177 147 183 0.89 # 32252 # 32809 # -1 # ID=4_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 10_1 - 508 HTH_38 PF13936.1 44 1.3e-06 22.5 0.8 1 3 2e-06 0.00017 15.8 0.1 12 42 9 41 4 43 0.85 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 10_1 - 508 HTH_38 PF13936.1 44 1.3e-06 22.5 0.8 2 3 0.094 7.7 0.8 0.0 20 31 76 87 68 87 0.91 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 10_1 - 508 HTH_38 PF13936.1 44 1.3e-06 22.5 0.8 3 3 0.044 3.6 1.9 0.0 1 10 208 217 208 230 0.93 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 4_43 - 186 HTH_38 PF13936.1 44 1e-05 19.6 1.4 1 1 2.4e-07 1.9e-05 18.7 0.0 9 41 147 179 145 182 0.93 # 32252 # 32809 # -1 # ID=4_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 3_33 - 388 HTH_38 PF13936.1 44 0.00019 15.5 0.1 1 1 5.2e-06 0.00042 14.4 0.1 17 42 178 204 171 204 0.86 # 30210 # 31373 # -1 # ID=3_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 1_1 - 92 HTH_38 PF13936.1 44 0.0024 12.1 0.0 1 1 6.9e-05 0.0057 10.8 0.0 30 43 40 53 38 54 0.90 # 1 # 276 # -1 # ID=1_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 9_4 - 301 2-Hacid_dh_C PF02826.14 178 3.5e-06 20.9 0.1 1 1 1.9e-08 6.3e-06 20.0 0.1 36 146 4 118 2 124 0.86 # 2105 # 3007 # 1 # ID=9_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 4_25 - 562 FAD_oxidored PF12831.2 428 2e-06 21.7 3.8 1 2 5.9e-09 2e-06 21.7 3.8 1 41 100 139 100 159 0.83 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_25 - 562 FAD_oxidored PF12831.2 428 2e-06 21.7 3.8 2 2 0.01 3.3 1.2 0.0 84 120 305 341 261 364 0.71 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 10_2 - 247 MobB PF03205.9 140 0.00053 14.3 0.0 1 1 4.1e-06 0.0013 13.0 0.0 3 32 103 132 101 139 0.94 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 4_4 - 680 UvrD-helicase PF00580.16 315 9.8e-39 128.0 0.2 1 1 7e-40 1.1e-37 124.5 0.2 2 307 6 260 5 266 0.90 # 2958 # 4997 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 2_49 - 595 UvrD-helicase PF00580.16 315 1.4e-30 101.2 2.8 1 3 1.1e-16 1.7e-14 48.4 0.0 2 105 5 91 4 95 0.92 # 42806 # 44590 # -1 # ID=2_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_49 - 595 UvrD-helicase PF00580.16 315 1.4e-30 101.2 2.8 2 3 1.1e-17 1.8e-15 51.6 0.3 208 314 145 248 107 249 0.86 # 42806 # 44590 # -1 # ID=2_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_49 - 595 UvrD-helicase PF00580.16 315 1.4e-30 101.2 2.8 3 3 0.072 12 -0.4 0.0 91 128 412 455 373 525 0.73 # 42806 # 44590 # -1 # ID=2_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 9_3 - 254 MarR PF01047.17 59 1.2e-06 22.8 0.1 1 1 1e-08 3.3e-06 21.4 0.1 7 47 9 49 5 52 0.95 # 1081 # 1842 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 9_4 - 301 TIGR00873 TIGR00873 467 2.1e-08 27.6 0.4 1 1 8.2e-11 2.7e-08 27.3 0.4 2 213 7 209 6 229 0.80 # 2105 # 3007 # 1 # ID=9_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 9_4 - 301 UDPG_MGDP_dh_N PF03721.9 185 2.4e-05 18.4 0.2 1 2 2e-06 0.00065 13.7 0.1 2 39 6 43 5 50 0.92 # 2105 # 3007 # 1 # ID=9_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 9_4 - 301 UDPG_MGDP_dh_N PF03721.9 185 2.4e-05 18.4 0.2 2 2 0.0061 2 2.3 0.0 107 139 86 117 82 126 0.77 # 2105 # 3007 # 1 # ID=9_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 4_25 - 562 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 5.9e-18 60.2 0.1 1 3 1.8e-06 0.0006 14.5 0.1 165 199 96 130 49 137 0.86 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_25 - 562 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 5.9e-18 60.2 0.1 2 3 5.7e-09 1.9e-06 22.7 0.0 115 201 219 304 173 306 0.80 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_25 - 562 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 5.9e-18 60.2 0.1 3 3 5.6e-08 1.8e-05 19.4 0.0 89 147 317 372 309 431 0.82 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_25 - 562 NAD_binding_7 PF13241.1 103 1.3e-05 20.0 1.2 1 2 2e-05 0.0064 11.4 0.2 9 38 100 129 97 164 0.90 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_25 - 562 NAD_binding_7 PF13241.1 103 1.3e-05 20.0 1.2 2 2 0.00049 0.16 6.9 0.1 8 45 271 314 264 382 0.66 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_44 - 695 DUF853 PF05872.7 504 9.4e-05 15.4 0.0 1 1 6.2e-07 0.00021 14.3 0.0 10 60 187 237 179 245 0.87 # 28650 # 30734 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 2_31 - 86 TetR_N PF00440.18 47 0.0018 12.5 0.0 1 1 1e-05 0.0034 11.6 0.0 2 26 33 57 32 57 0.93 # 26417 # 26674 # -1 # ID=2_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 4_4 - 680 AAA_19 PF13245.1 76 1.4e-10 35.4 0.1 1 1 3.6e-12 3e-10 34.4 0.1 14 75 21 86 11 87 0.87 # 2958 # 4997 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 2_49 - 595 AAA_19 PF13245.1 76 4.8e-09 30.5 0.0 1 1 8.1e-10 6.7e-08 26.8 0.0 3 75 12 86 10 87 0.84 # 42806 # 44590 # -1 # ID=2_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 10_2 - 247 AAA_19 PF13245.1 76 0.00032 15.0 0.2 1 1 1.2e-05 0.001 13.4 0.0 10 46 101 132 95 136 0.77 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 3_52 - 418 AAA_19 PF13245.1 76 0.0012 13.2 0.0 1 1 3.6e-05 0.003 11.9 0.0 20 48 125 152 123 182 0.82 # 51589 # 52842 # 1 # ID=3_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 3_52 - 418 CbiA PF01656.18 195 2.5e-22 73.8 0.0 1 1 2.2e-24 3.6e-22 73.3 0.0 1 178 117 348 117 365 0.73 # 51589 # 52842 # 1 # ID=3_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 10_2 - 247 CbiA PF01656.18 195 0.0012 12.8 1.6 1 2 0.057 9.4 0.1 0.1 13 26 17 30 17 33 0.89 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 10_2 - 247 CbiA PF01656.18 195 0.0012 12.8 1.6 2 2 2.9e-05 0.0048 10.9 0.0 9 31 110 132 103 134 0.92 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 10_2 - 247 KTI12 PF08433.5 270 7.6e-05 16.6 0.2 1 1 5.4e-07 0.00018 15.4 0.0 4 94 103 188 102 210 0.77 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 3_19 - 172 Pox_D5 PF03288.11 86 0.0018 13.1 0.1 1 1 1e-05 0.0033 12.3 0.1 34 67 35 76 32 96 0.87 # 13213 # 13728 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.446 7_9 - 452 DDE_5 PF13546.1 273 0.0017 11.8 0.1 1 1 8.5e-06 0.0028 11.1 0.1 187 243 231 286 213 306 0.84 # 5644 # 6999 # -1 # ID=7_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.636 3_34 - 278 MethyltransfD12 PF02086.10 260 2.3e-47 156.2 0.0 1 1 8e-50 2.6e-47 156.0 0.0 1 256 13 255 13 259 0.91 # 31722 # 32555 # 1 # ID=3_34;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.446 10_1 - 508 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 1.1e-05 19.4 0.1 1 1 3.6e-07 6e-05 17.1 0.0 25 48 18 41 13 42 0.92 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 3_53 - 335 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00047 14.2 0.0 1 1 6.8e-06 0.0011 13.0 0.0 28 51 175 198 173 200 0.94 # 52839 # 53843 # 1 # ID=3_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.374 3_39 - 292 Rep_3 PF01051.16 222 1.7e-27 91.0 1.1 1 1 1.5e-29 2.5e-27 90.5 1.1 2 220 22 276 21 280 0.83 # 36115 # 36990 # 1 # ID=3_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 3_26 - 363 Rep_3 PF01051.16 222 1.1e-15 52.4 1.8 1 1 1.1e-17 1.7e-15 51.7 1.8 6 219 32 285 27 288 0.82 # 21617 # 22705 # -1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.447 1_16 - 447 rve PF00665.21 120 2.9e-13 44.6 0.0 1 1 1.3e-14 8.9e-13 43.0 0.0 4 119 141 262 138 263 0.84 # 7423 # 8763 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 18_1 - 185 rve PF00665.21 120 7e-12 40.1 0.0 1 1 1.6e-13 1.1e-11 39.5 0.0 9 119 25 132 20 133 0.89 # 2 # 556 # 1 # ID=18_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.532 10_1 - 508 rve PF00665.21 120 3e-11 38.1 0.0 1 1 1e-12 6.8e-11 36.9 0.0 22 119 147 253 124 254 0.91 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 1_77 - 468 rve PF00665.21 120 2.8e-09 31.7 0.0 1 1 7.5e-11 5e-09 30.9 0.0 3 119 141 265 139 266 0.82 # 59377 # 60780 # 1 # ID=1_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_1 - 92 rve PF00665.21 120 0.0014 13.3 0.2 1 2 0.013 0.84 4.4 0.0 77 102 26 49 4 55 0.82 # 1 # 276 # -1 # ID=1_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_1 - 92 rve PF00665.21 120 0.0014 13.3 0.2 2 2 0.0015 0.1 7.4 0.0 9 28 75 92 69 92 0.84 # 1 # 276 # -1 # ID=1_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 9_3 - 254 Fe_dep_repress PF01325.14 60 5.2e-06 21.0 0.2 1 1 4.1e-08 1.4e-05 19.6 0.1 13 53 10 50 8 55 0.93 # 1081 # 1842 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 3_52 - 418 YhjQ PF06564.7 244 0.0025 11.8 0.2 1 2 0.00059 0.19 5.6 0.1 6 41 119 157 115 170 0.78 # 51589 # 52842 # 1 # ID=3_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 3_52 - 418 YhjQ PF06564.7 244 0.0025 11.8 0.2 2 2 0.002 0.66 3.8 0.0 115 149 257 291 233 297 0.83 # 51589 # 52842 # 1 # ID=3_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 11_2 - 167 TIGR00575 TIGR00575 652 4.1e-12 39.5 1.5 1 1 1.6e-14 5.3e-12 39.1 1.5 504 643 6 136 4 149 0.82 # 882 # 1382 # 1 # ID=11_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.493 10_2 - 247 AAA_24 PF13479.1 213 0.00099 13.3 0.0 1 1 4.6e-06 0.0015 12.7 0.0 5 77 102 170 98 176 0.77 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 3_21 - 254 Methyltransf_26 PF13659.1 117 3.2e-13 44.4 0.1 1 1 1.2e-14 1.3e-12 42.3 0.0 1 115 101 201 101 207 0.81 # 14905 # 15666 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 3_32 - 564 Methyltransf_26 PF13659.1 117 1.4e-08 29.3 0.0 1 1 2.8e-10 3.1e-08 28.3 0.0 3 116 422 516 416 517 0.80 # 28271 # 29962 # -1 # ID=3_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 9_4 - 301 Methyltransf_26 PF13659.1 117 0.0081 10.8 6.3 1 1 0.00014 0.015 9.9 6.3 13 105 14 155 6 246 0.76 # 2105 # 3007 # 1 # ID=9_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 2_49 - 595 AAA_30 PF13604.1 196 0.00012 16.3 0.3 1 2 4.4e-05 0.0048 11.1 0.0 4 66 6 66 4 90 0.72 # 42806 # 44590 # -1 # ID=2_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_49 - 595 AAA_30 PF13604.1 196 0.00012 16.3 0.3 2 2 0.027 2.9 2.0 0.0 91 132 187 227 162 261 0.83 # 42806 # 44590 # -1 # ID=2_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 10_2 - 247 AAA_30 PF13604.1 196 0.00039 14.6 0.0 1 1 3.1e-05 0.0034 11.6 0.0 18 103 100 171 82 189 0.74 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 4_4 - 680 AAA_30 PF13604.1 196 0.00099 13.3 0.0 1 2 0.00027 0.029 8.5 0.0 7 42 10 42 4 80 0.71 # 2958 # 4997 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 4_4 - 680 AAA_30 PF13604.1 196 0.00099 13.3 0.0 2 2 0.02 2.2 2.3 0.0 97 133 213 248 196 300 0.84 # 2958 # 4997 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 2_9 - 353 ATPgrasp_Ter PF15632.1 330 1.1e-129 426.5 0.0 1 1 3.7e-132 1.2e-129 426.3 0.0 1 329 4 344 4 345 0.98 # 6501 # 7559 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.501 9_4 - 301 F420_oxidored PF03807.12 96 7.1e-06 21.0 0.6 1 1 6.5e-08 2.1e-05 19.5 0.2 2 78 7 79 6 98 0.82 # 2105 # 3007 # 1 # ID=9_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 1_76 - 106 RNA_POL_M_15KD PF02150.11 35 0.0017 12.7 1.3 1 2 0.00012 0.039 8.3 0.1 23 35 13 25 6 25 0.90 # 58846 # 59163 # -1 # ID=1_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.453 1_76 - 106 RNA_POL_M_15KD PF02150.11 35 0.0017 12.7 1.3 2 2 0.0049 1.6 3.1 0.1 22 30 38 46 30 50 0.75 # 58846 # 59163 # -1 # ID=1_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.453 1_1 - 92 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 9.7e-05 16.9 0.3 1 1 6.3e-07 0.00021 15.8 0.3 4 52 6 59 4 64 0.79 # 1 # 276 # -1 # ID=1_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 10_1 - 508 GerE PF00196.14 58 0.002 12.0 0.0 1 1 2.2e-05 0.0072 10.3 0.0 17 40 18 41 17 42 0.92 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 1_44 - 695 TraG-D_C PF12696.2 128 2.3e-11 38.2 0.0 1 1 1.5e-13 4.8e-11 37.2 0.0 2 112 505 617 504 631 0.82 # 28650 # 30734 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 18_1 - 185 DDE_3 PF13358.1 146 0.0026 12.1 0.0 1 1 1.1e-05 0.0037 11.6 0.0 32 90 32 91 11 113 0.89 # 2 # 556 # 1 # ID=18_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.532 10_2 - 247 Bac_DnaA PF00308.13 219 1.7e-11 38.7 0.0 1 1 1e-13 3.4e-11 37.7 0.0 35 139 101 202 94 206 0.88 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 3_52 - 418 MipZ PF09140.6 261 1.6e-11 38.4 0.1 1 2 1.4e-08 4.6e-06 20.4 0.1 2 39 116 156 115 170 0.78 # 51589 # 52842 # 1 # ID=3_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 3_52 - 418 MipZ PF09140.6 261 1.6e-11 38.4 0.1 2 2 5.4e-07 0.00018 15.2 0.0 77 126 236 287 213 297 0.75 # 51589 # 52842 # 1 # ID=3_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 3_21 - 254 UPF0020 PF01170.13 180 0.00015 16.0 0.0 1 1 1.8e-06 0.0006 14.0 0.0 15 126 87 185 76 221 0.72 # 14905 # 15666 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 1_70 - 251 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 7.6e-35 114.9 0.1 1 1 1.3e-36 1.1e-34 114.4 0.1 5 212 62 236 59 237 0.90 # 55651 # 56403 # 1 # ID=1_70;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 7_9 - 452 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 4.9e-33 109.0 0.0 1 1 7.9e-35 6.5e-33 108.6 0.0 3 213 153 381 151 381 0.95 # 5644 # 6999 # -1 # ID=7_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.636 15_1 - 246 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 4.2e-24 79.8 0.8 1 1 6.3e-26 5.1e-24 79.5 0.8 4 205 53 224 50 231 0.88 # 3 # 740 # 1 # ID=15_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.549 4_17 - 308 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 3.3e-22 73.6 0.6 1 1 5.7e-24 4.7e-22 73.1 0.6 4 201 115 282 112 293 0.84 # 14892 # 15815 # -1 # ID=4_17;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.541 5_12 - 402 DivIC PF04977.10 80 0.097 6.8 32.9 1 5 0.063 21 -0.7 6.4 35 50 141 156 119 200 0.62 # 6643 # 7848 # -1 # ID=5_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 5_12 - 402 DivIC PF04977.10 80 0.097 6.8 32.9 2 5 0.018 6 1.1 0.5 18 47 208 237 202 239 0.70 # 6643 # 7848 # -1 # ID=5_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 5_12 - 402 DivIC PF04977.10 80 0.097 6.8 32.9 3 5 3e-05 0.0098 10.0 1.0 19 57 244 282 236 290 0.86 # 6643 # 7848 # -1 # ID=5_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 5_12 - 402 DivIC PF04977.10 80 0.097 6.8 32.9 4 5 0.002 0.67 4.1 0.1 21 49 302 330 296 338 0.76 # 6643 # 7848 # -1 # ID=5_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 5_12 - 402 DivIC PF04977.10 80 0.097 6.8 32.9 5 5 0.00036 0.12 6.5 1.0 23 49 339 365 333 374 0.89 # 6643 # 7848 # -1 # ID=5_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_16 - 447 Trp_repressor PF01371.14 88 0.0029 12.1 0.3 1 1 1.9e-05 0.0062 11.1 0.3 37 69 14 46 6 57 0.90 # 7423 # 8763 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 2_49 - 595 AAA_12 PF13087.1 200 2.2e-08 28.3 0.1 1 3 0.00079 0.26 5.2 0.0 98 153 33 84 13 94 0.78 # 42806 # 44590 # -1 # ID=2_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_49 - 595 AAA_12 PF13087.1 200 2.2e-08 28.3 0.1 2 3 0.0026 0.86 3.5 0.0 5 52 240 287 237 400 0.74 # 42806 # 44590 # -1 # ID=2_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_49 - 595 AAA_12 PF13087.1 200 2.2e-08 28.3 0.1 3 3 5.1e-07 0.00017 15.6 0.0 136 196 497 563 409 567 0.81 # 42806 # 44590 # -1 # ID=2_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 4_11 - 99 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.00011 16.1 0.0 1 1 1.5e-06 0.00016 15.5 0.0 3 42 9 48 8 49 0.84 # 11099 # 11395 # 1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_16 - 447 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.0026 11.7 1.3 1 1 6.2e-05 0.0068 10.4 1.3 12 43 18 49 15 52 0.90 # 7423 # 8763 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 9_3 - 254 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.014 9.4 4.2 1 1 3.9e-05 0.0043 11.0 0.4 7 39 5 38 5 43 0.90 # 1081 # 1842 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 3_53 - 335 Phage_CI_repr PF07022.8 66 2.3e-06 22.2 0.0 1 1 1.4e-08 4.8e-06 21.2 0.0 7 50 168 244 164 256 0.92 # 52839 # 53843 # 1 # ID=3_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.374 4_25 - 562 Thi4 PF01946.12 230 0.00088 13.0 0.4 1 1 6.4e-06 0.0021 11.7 0.4 19 70 100 150 95 158 0.88 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 3_30 - 152 Ribosomal_L28 PF00830.14 61 0.0014 13.1 0.7 1 1 9.1e-06 0.003 12.0 0.3 35 58 114 135 111 138 0.82 # 27594 # 28049 # -1 # ID=3_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.410 10_2 - 247 AAA PF00004.24 132 6.9e-09 30.6 0.1 1 1 1.1e-10 1.8e-08 29.3 0.0 1 109 103 200 103 207 0.73 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 2_45 - 353 AAA PF00004.24 132 0.00071 14.4 0.0 1 1 9.4e-06 0.0016 13.3 0.0 1 74 99 178 99 237 0.73 # 38950 # 40008 # -1 # ID=2_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.408 1_29 - 395 KorB PF08535.5 93 4.2e-05 18.3 0.3 1 1 8.3e-07 0.00027 15.7 0.1 5 48 170 213 166 252 0.76 # 18230 # 19414 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 4_11 - 99 HTH_37 PF13744.1 80 4.7e-08 27.4 0.0 1 1 2.1e-10 6.8e-08 26.9 0.0 23 76 18 70 10 73 0.92 # 11099 # 11395 # 1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 9_3 - 254 Rrf2 PF02082.15 83 6.2e-06 20.9 0.3 1 1 4.9e-08 1.6e-05 19.6 0.2 17 60 11 54 9 70 0.84 # 1081 # 1842 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 4_4 - 680 Herpes_ori_bp PF02399.10 824 0.0012 11.4 0.0 1 1 7.3e-06 0.0024 10.4 0.0 52 109 20 83 9 102 0.80 # 2958 # 4997 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 9_3 - 254 HTH_27 PF13463.1 68 0.00024 16.0 0.1 1 1 3e-06 0.00049 15.0 0.1 5 49 7 50 5 70 0.88 # 1081 # 1842 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 2_15 - 156 HTH_27 PF13463.1 68 0.0011 13.8 0.3 1 2 7.3e-05 0.012 10.6 0.0 1 44 3 48 3 49 0.87 # 12751 # 13218 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.502 2_15 - 156 HTH_27 PF13463.1 68 0.0011 13.8 0.3 2 2 0.074 12 0.9 0.1 17 42 112 138 106 149 0.81 # 12751 # 13218 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.502 3_6 - 417 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 6.7e-22 72.6 0.0 1 1 3.1e-24 1e-21 72.1 0.0 1 227 128 389 128 393 0.81 # 2927 # 4177 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 10_1 - 508 rve_2 PF13333.1 52 0.0011 13.6 0.1 1 2 7.1e-05 0.023 9.4 0.0 7 43 250 286 248 290 0.85 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 10_1 - 508 rve_2 PF13333.1 52 0.0011 13.6 0.1 2 2 0.035 12 0.8 0.0 6 28 377 399 376 400 0.89 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 3_58 - 346 Hydantoinase_A PF01968.13 290 7.5e-08 26.3 0.8 1 2 1.2e-06 0.00038 14.2 0.2 72 101 186 214 177 222 0.82 # 56949 # 57986 # 1 # ID=3_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.384 3_58 - 346 Hydantoinase_A PF01968.13 290 7.5e-08 26.3 0.8 2 2 1.4e-05 0.0046 10.6 0.0 195 275 258 332 231 344 0.78 # 56949 # 57986 # 1 # ID=3_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.384 4_19 - 145 MerR_1 PF13411.1 69 4.5e-22 72.3 0.0 1 1 7.3e-24 8.1e-22 71.4 0.0 2 66 4 69 3 71 0.91 # 16382 # 16816 # -1 # ID=4_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 4_29 - 152 MerR_1 PF13411.1 69 1.1e-19 64.5 0.0 1 1 1.9e-21 2.1e-19 63.7 0.0 2 67 9 75 8 77 0.96 # 24188 # 24643 # 1 # ID=4_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.610 4_24 - 122 MerR_1 PF13411.1 69 1.7e-12 41.6 0.0 1 1 2.2e-14 2.5e-12 41.1 0.0 1 68 4 72 4 73 0.97 # 20900 # 21265 # -1 # ID=4_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.672 10_2 - 247 AAA_16 PF13191.1 185 1.5e-05 19.6 0.3 1 3 0.045 15 0.1 0.3 102 140 19 59 4 81 0.58 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 10_2 - 247 AAA_16 PF13191.1 185 1.5e-05 19.6 0.3 2 3 6e-07 0.0002 16.0 0.0 10 41 86 117 75 133 0.88 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 10_2 - 247 AAA_16 PF13191.1 185 1.5e-05 19.6 0.3 3 3 0.088 29 -0.9 0.0 75 119 133 173 119 200 0.46 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_41 - 394 Mt_ATP-synt_B PF05405.9 163 0.0016 12.5 0.0 1 1 9.5e-06 0.0031 11.5 0.0 105 146 248 289 234 299 0.84 # 25700 # 26881 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.476 2_9 - 353 ATP-grasp_3 PF02655.9 161 0.00042 14.8 0.0 1 2 0.03 10 0.6 0.0 109 146 75 115 31 120 0.74 # 6501 # 7559 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.501 2_9 - 353 ATP-grasp_3 PF02655.9 161 0.00042 14.8 0.0 2 2 9.6e-06 0.0032 11.9 0.0 2 87 115 232 114 244 0.84 # 6501 # 7559 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.501 10_2 - 247 AAA_22 PF13401.1 131 2.6e-07 25.5 0.3 1 1 3.7e-06 0.0004 15.1 0.3 4 113 100 192 97 204 0.68 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 4_4 - 680 AAA_22 PF13401.1 131 4e-05 18.4 0.2 1 2 0.00019 0.021 9.6 0.0 4 65 17 75 13 106 0.77 # 2958 # 4997 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 4_4 - 680 AAA_22 PF13401.1 131 4e-05 18.4 0.2 2 2 0.002 0.22 6.2 0.0 41 108 152 232 112 246 0.62 # 2958 # 4997 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 1_44 - 695 AAA_22 PF13401.1 131 0.00055 14.7 0.1 1 2 0.00011 0.013 10.3 0.1 5 24 199 218 198 295 0.71 # 28650 # 30734 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 1_44 - 695 AAA_22 PF13401.1 131 0.00055 14.7 0.1 2 2 0.065 7.1 1.4 0.0 89 121 505 534 458 544 0.72 # 28650 # 30734 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 9_3 - 254 DUF977 PF06163.6 127 0.00059 14.2 0.3 1 1 4.9e-06 0.0016 12.8 0.3 15 57 8 50 4 65 0.87 # 1081 # 1842 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 10_2 - 247 TIGR00362 TIGR00362 437 1.4e-13 45.0 0.1 1 1 5e-16 1.6e-13 44.7 0.1 138 241 101 201 13 205 0.91 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 2_49 - 595 TIGR01074 TIGR01074 668 1.3e-54 179.8 1.3 1 2 2.2e-33 3.6e-31 102.3 0.4 5 404 7 377 4 381 0.83 # 42806 # 44590 # -1 # ID=2_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_49 - 595 TIGR01074 TIGR01074 668 1.3e-54 179.8 1.3 2 2 5.8e-25 9.5e-23 74.5 0.0 498 610 451 563 413 575 0.77 # 42806 # 44590 # -1 # ID=2_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 4_4 - 680 TIGR01074 TIGR01074 668 4e-51 168.3 0.0 1 2 2.5e-38 4.2e-36 118.6 0.0 2 304 5 308 4 404 0.84 # 2958 # 4997 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 4_4 - 680 TIGR01074 TIGR01074 668 4e-51 168.3 0.0 2 2 9e-17 1.5e-14 47.4 0.0 533 610 517 607 502 613 0.80 # 2958 # 4997 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 3_32 - 564 Methyltransf_27 PF13708.1 194 1.2e-56 185.9 0.1 1 1 1.5e-58 2.5e-56 184.9 0.0 2 194 93 296 92 296 0.95 # 28271 # 29962 # -1 # ID=3_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 5_13 - 273 Methyltransf_27 PF13708.1 194 1.6e-46 152.8 0.0 1 1 1.2e-48 1.9e-46 152.6 0.0 3 194 72 266 70 266 0.95 # 7845 # 8663 # -1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 10_1 - 508 NUMOD1 PF07453.8 37 0.0002 15.8 0.1 1 1 2.9e-06 0.00048 14.6 0.1 18 37 21 40 17 40 0.95 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 1_56 - 180 NUMOD1 PF07453.8 37 0.0013 13.2 0.0 1 1 6.7e-05 0.011 10.2 0.0 18 30 22 34 21 37 0.89 # 46649 # 47188 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.450 4_25 - 562 Pyr_redox PF00070.22 80 3.1e-19 63.8 5.4 1 2 1.2e-06 0.00041 15.4 1.5 2 31 101 130 100 132 0.95 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_25 - 562 Pyr_redox PF00070.22 80 3.1e-19 63.8 5.4 2 2 3.2e-17 1e-14 49.3 0.1 1 72 272 342 272 351 0.91 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_16 - 447 LZ_Tnp_IS481 PF13011.1 85 3e-06 22.1 0.5 1 1 8.6e-08 1.4e-05 20.0 0.2 15 66 16 69 9 80 0.82 # 7423 # 8763 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_77 - 468 LZ_Tnp_IS481 PF13011.1 85 4.4e-06 21.6 0.1 1 1 7.7e-08 1.3e-05 20.1 0.1 13 61 15 63 4 78 0.89 # 59377 # 60780 # 1 # ID=1_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 4_43 - 186 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 0.00031 15.0 0.0 1 1 1.9e-06 0.00064 14.0 0.0 8 44 148 184 145 185 0.90 # 32252 # 32809 # -1 # ID=4_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 10_2 - 247 AAA_28 PF13521.1 163 0.00047 14.7 1.2 1 2 0.089 29 -0.9 0.2 51 70 36 55 8 70 0.60 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 10_2 - 247 AAA_28 PF13521.1 163 0.00047 14.7 1.2 2 2 3.1e-06 0.001 13.6 0.0 2 48 103 154 102 216 0.84 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_70 - 251 DDE_Tnp_1_3 PF13612.1 155 3.2e-10 34.5 0.1 1 1 1.6e-12 5.1e-10 33.9 0.1 5 151 61 216 58 220 0.72 # 55651 # 56403 # 1 # ID=1_70;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 4_25 - 562 HI0933_like PF03486.9 409 1.4e-08 28.1 5.0 1 2 4.3e-07 0.00014 15.0 2.8 2 33 100 131 99 139 0.91 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_25 - 562 HI0933_like PF03486.9 409 1.4e-08 28.1 5.0 2 2 1.7e-06 0.00056 13.0 0.0 83 163 286 362 281 379 0.85 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_16 - 447 HTH_32 PF13565.1 77 5.3e-11 37.8 0.1 1 1 2.7e-12 2.2e-10 35.8 0.1 2 77 43 116 42 116 0.85 # 7423 # 8763 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_77 - 468 HTH_32 PF13565.1 77 7.5e-07 24.5 0.1 1 1 9.1e-09 7.5e-07 24.5 0.1 3 77 45 117 43 117 0.74 # 59377 # 60780 # 1 # ID=1_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 10_1 - 508 HTH_32 PF13565.1 77 1.2e-06 23.9 1.4 1 2 8e-06 0.00066 15.1 0.2 2 76 36 103 33 104 0.69 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 10_1 - 508 HTH_32 PF13565.1 77 1.2e-06 23.9 1.4 2 2 0.0095 0.78 5.2 0.0 33 60 439 465 404 472 0.79 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 1_1 - 92 HTH_32 PF13565.1 77 1.7e-06 23.4 0.0 1 1 3.3e-08 2.8e-06 22.7 0.0 26 76 5 50 2 51 0.83 # 1 # 276 # -1 # ID=1_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 2_49 - 595 TIGR00609 TIGR00609 1175 6e-17 55.2 7.9 1 4 6.8e-07 0.00011 14.6 0.0 12 67 19 71 11 80 0.87 # 42806 # 44590 # -1 # ID=2_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_49 - 595 TIGR00609 TIGR00609 1175 6e-17 55.2 7.9 2 4 4.7e-10 7.7e-08 25.1 0.0 376 457 194 275 190 285 0.83 # 42806 # 44590 # -1 # ID=2_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_49 - 595 TIGR00609 TIGR00609 1175 6e-17 55.2 7.9 3 4 0.025 4.1 -0.5 0.3 240 287 418 468 405 505 0.76 # 42806 # 44590 # -1 # ID=2_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_49 - 595 TIGR00609 TIGR00609 1175 6e-17 55.2 7.9 4 4 3.5e-07 5.8e-05 15.5 0.2 781 812 533 564 494 570 0.80 # 42806 # 44590 # -1 # ID=2_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 4_4 - 680 TIGR00609 TIGR00609 1175 1.2e-16 54.2 0.0 1 3 0.0035 0.57 2.3 0.1 10 55 18 61 12 83 0.86 # 2958 # 4997 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 4_4 - 680 TIGR00609 TIGR00609 1175 1.2e-16 54.2 0.0 2 3 4.2e-11 7e-09 28.5 0.0 331 419 179 255 96 258 0.77 # 2958 # 4997 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 4_4 - 680 TIGR00609 TIGR00609 1175 1.2e-16 54.2 0.0 3 3 2.7e-08 4.4e-06 19.3 0.0 731 813 539 609 529 627 0.81 # 2958 # 4997 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 9_3 - 254 GntR PF00392.16 64 1.1e-06 22.6 0.5 1 1 8.1e-09 2.7e-06 21.4 0.5 26 59 21 54 9 59 0.92 # 1081 # 1842 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 4_11 - 99 HTH_3 PF01381.17 55 2.4e-16 54.0 0.0 1 1 3.4e-18 3.8e-16 53.3 0.0 5 53 22 70 21 71 0.97 # 11099 # 11395 # 1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 10_1 - 508 HTH_3 PF01381.17 55 0.00035 15.0 0.4 1 1 1.7e-05 0.0019 12.7 0.1 8 32 18 42 16 52 0.86 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 1_16 - 447 HTH_3 PF01381.17 55 0.00048 14.6 0.1 1 1 1.4e-05 0.0015 13.0 0.1 8 30 25 47 21 52 0.87 # 7423 # 8763 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 7_9 - 452 DDE_Tnp_1_4 PF13701.1 449 7.9e-77 252.8 0.0 1 1 3.9e-79 1.3e-76 252.1 0.0 8 441 20 440 17 447 0.90 # 5644 # 6999 # -1 # ID=7_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.636 1_16 - 447 HTH_23 PF13384.1 50 5e-12 39.7 0.4 1 1 6.6e-13 2.2e-11 37.7 0.3 2 49 10 58 9 59 0.95 # 7423 # 8763 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_77 - 468 HTH_23 PF13384.1 50 4e-11 36.9 0.9 1 1 4.2e-12 1.4e-10 35.2 0.9 2 48 11 58 10 60 0.94 # 59377 # 60780 # 1 # ID=1_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 10_1 - 508 HTH_23 PF13384.1 50 8.6e-09 29.5 1.5 1 1 6.2e-09 2.1e-07 25.1 0.1 7 40 3 42 1 45 0.81 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 1_1 - 92 HTH_23 PF13384.1 50 6e-06 20.4 1.5 1 2 0.036 1.2 3.6 0.1 7 27 11 35 7 36 0.70 # 1 # 276 # -1 # ID=1_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_1 - 92 HTH_23 PF13384.1 50 6e-06 20.4 1.5 2 2 5.2e-06 0.00017 15.8 0.3 28 42 41 55 40 64 0.87 # 1 # 276 # -1 # ID=1_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 8_8 - 246 HTH_23 PF13384.1 50 4e-05 17.8 0.4 1 1 1.2e-06 4e-05 17.8 0.4 2 37 171 206 170 216 0.90 # 4946 # 5683 # -1 # ID=8_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.673 1_66 - 92 HTH_23 PF13384.1 50 7.4e-05 17.0 0.0 1 1 3.6e-06 0.00012 16.3 0.0 7 40 53 86 51 90 0.93 # 54504 # 54779 # 1 # ID=1_66;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 9_3 - 254 HTH_23 PF13384.1 50 8e-05 16.8 0.1 1 1 6.3e-06 0.00021 15.5 0.1 4 45 4 47 1 50 0.86 # 1081 # 1842 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 4_43 - 186 HTH_23 PF13384.1 50 0.00015 16.0 0.3 1 1 4.4e-06 0.00015 16.0 0.3 5 39 146 180 142 184 0.87 # 32252 # 32809 # -1 # ID=4_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 4_11 - 99 HTH_23 PF13384.1 50 0.00024 15.4 0.0 1 1 1e-05 0.00034 14.9 0.0 15 37 24 46 17 58 0.87 # 11099 # 11395 # 1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 3_33 - 388 HTH_23 PF13384.1 50 0.0015 12.8 0.4 1 1 0.00014 0.0045 11.3 0.1 13 39 179 204 173 208 0.84 # 30210 # 31373 # -1 # ID=3_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 3_52 - 418 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.0003 14.6 0.0 1 2 2.7e-06 0.00087 13.1 0.0 7 58 122 176 116 201 0.79 # 51589 # 52842 # 1 # ID=3_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 3_52 - 418 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.0003 14.6 0.0 2 2 0.1 33 -1.9 0.0 30 65 324 358 321 391 0.61 # 51589 # 52842 # 1 # ID=3_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 4_43 - 186 HTH_7 PF02796.10 45 7.6e-13 42.7 1.1 1 1 1.5e-14 1.7e-12 41.6 0.1 1 44 141 181 141 182 0.97 # 32252 # 32809 # -1 # ID=4_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 8_8 - 246 HTH_7 PF02796.10 45 2.7e-07 25.0 0.1 1 1 5.7e-09 6.2e-07 23.8 0.1 8 44 173 209 168 210 0.87 # 4946 # 5683 # -1 # ID=8_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.673 10_1 - 508 HTH_7 PF02796.10 45 5.1e-05 17.7 0.0 1 1 1.1e-06 0.00013 16.4 0.0 11 43 7 41 4 43 0.90 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 4_11 - 99 HTH_19 PF12844.2 64 2.4e-11 38.1 0.0 1 1 2.2e-13 3.6e-11 37.6 0.0 7 55 21 69 20 71 0.95 # 11099 # 11395 # 1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 10_1 - 508 HTH_19 PF12844.2 64 0.0015 13.2 0.0 1 1 1.9e-05 0.0031 12.2 0.0 11 44 18 51 16 89 0.84 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 1_66 - 92 zinc_ribbon_4 PF13717.1 36 0.00019 15.7 4.1 1 1 1.6e-06 0.00051 14.3 4.1 3 35 6 39 5 40 0.86 # 54504 # 54779 # 1 # ID=1_66;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 10_2 - 247 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.0015 12.3 0.3 1 2 0.063 21 -1.2 0.1 36 70 17 51 16 69 0.65 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 10_2 - 247 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.0015 12.3 0.3 2 2 1.7e-05 0.0055 10.4 0.0 23 39 101 117 97 125 0.89 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_16 - 447 HTH_29 PF13551.1 112 3.1e-18 60.6 0.4 1 1 8.4e-20 6.9e-18 59.5 0.4 1 111 15 119 15 120 0.93 # 7423 # 8763 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_77 - 468 HTH_29 PF13551.1 112 2.7e-15 51.1 1.2 1 1 8.3e-17 6.8e-15 49.8 1.2 1 112 16 121 16 121 0.89 # 59377 # 60780 # 1 # ID=1_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 10_1 - 508 HTH_29 PF13551.1 112 1.2e-05 20.0 0.1 1 1 5.3e-07 4.4e-05 18.2 0.1 7 109 13 105 8 108 0.82 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 4_43 - 186 HTH_29 PF13551.1 112 0.00035 15.3 0.6 1 2 0.098 8.1 1.3 0.2 24 46 114 136 88 153 0.67 # 32252 # 32809 # -1 # ID=4_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 4_43 - 186 HTH_29 PF13551.1 112 0.00035 15.3 0.6 2 2 4.1e-05 0.0034 12.2 0.0 4 35 151 181 148 184 0.90 # 32252 # 32809 # -1 # ID=4_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 10_1 - 508 TIGR03413 TIGR03413 248 0.002 11.7 0.3 1 1 1.1e-05 0.0036 11.0 0.3 16 71 349 402 338 417 0.80 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 4_25 - 562 GIDA PF01134.17 392 8.6e-06 19.4 5.3 1 2 5.2e-08 8.6e-06 19.4 5.3 1 53 100 154 100 290 0.87 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_25 - 562 GIDA PF01134.17 392 8.6e-06 19.4 5.3 2 2 0.02 3.3 1.0 0.3 349 385 390 426 376 430 0.79 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 9_4 - 301 GIDA PF01134.17 392 0.016 8.6 3.4 1 1 0.00014 0.023 8.1 3.4 2 72 7 78 6 90 0.89 # 2105 # 3007 # 1 # ID=9_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 4_25 - 562 XdhC_C PF13478.1 136 0.0027 12.6 1.0 1 2 0.08 26 -0.3 0.1 1 29 101 129 101 163 0.86 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_25 - 562 XdhC_C PF13478.1 136 0.0027 12.6 1.0 2 2 6.9e-05 0.023 9.6 0.1 1 66 273 351 273 371 0.64 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_25 - 562 NAD_binding_8 PF13450.1 68 0.00023 15.8 1.2 1 1 6.9e-07 0.00023 15.8 1.2 1 35 103 136 103 155 0.91 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_1 - 92 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 5.4e-09 30.2 0.0 1 1 3.4e-11 5.5e-09 30.2 0.0 5 89 10 90 6 92 0.90 # 1 # 276 # -1 # ID=1_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 18_1 - 185 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 0.00042 14.2 0.0 1 1 3.7e-06 0.00061 13.6 0.0 71 132 26 94 20 126 0.84 # 2 # 556 # 1 # ID=18_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.532 3_21 - 254 Methyltransf_31 PF13847.1 152 0.00046 14.4 0.0 1 1 2.6e-06 0.00086 13.5 0.0 7 106 104 197 99 240 0.78 # 14905 # 15666 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 10_2 - 247 Arch_ATPase PF01637.13 234 1.2e-05 19.7 0.1 1 1 2.2e-07 7.3e-05 17.1 0.1 18 94 99 167 85 198 0.70 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 3_7 - 203 Spermine_synth PF01564.12 246 0.0012 12.4 0.0 1 1 5e-06 0.0016 11.9 0.0 79 143 83 141 65 156 0.84 # 4348 # 4956 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.499 10_2 - 247 PhoH PF02562.11 205 5.8e-07 23.5 0.0 1 1 1.4e-08 2.3e-06 21.6 0.0 13 78 94 158 82 162 0.80 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 2_49 - 595 PhoH PF02562.11 205 1e-06 22.7 0.5 1 1 1.8e-07 2.9e-05 17.9 0.5 6 177 5 246 2 258 0.76 # 42806 # 44590 # -1 # ID=2_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_45 - 353 AAA_5 PF07728.9 139 8e-34 110.9 0.0 1 1 7.9e-36 1.3e-33 110.3 0.0 1 139 98 238 98 238 0.96 # 38950 # 40008 # -1 # ID=2_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.408 10_2 - 247 AAA_5 PF07728.9 139 0.0017 12.7 1.0 1 1 1.6e-05 0.0026 12.1 0.1 1 16 102 117 102 235 0.94 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 10_2 - 247 TIGR00763 TIGR00763 795 0.00035 13.3 0.0 1 1 1.5e-06 0.00051 12.8 0.0 356 390 103 141 97 159 0.69 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 10_2 - 247 ResIII PF04851.10 184 0.00018 15.9 0.2 1 2 2.1e-06 0.00068 14.1 0.1 22 55 80 133 43 163 0.69 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 10_2 - 247 ResIII PF04851.10 184 0.00018 15.9 0.2 2 2 0.032 10 0.4 0.0 137 154 152 169 128 197 0.69 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 4_25 - 562 Trp_halogenase PF04820.9 454 0.015 8.5 3.3 1 1 8.1e-05 0.027 7.6 3.3 1 47 100 143 100 151 0.76 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_44 - 695 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.6e-16 54.5 0.0 1 2 6.5e-07 0.00021 14.5 0.0 16 52 199 235 191 341 0.88 # 28650 # 30734 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 1_44 - 695 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.6e-16 54.5 0.0 2 2 8.1e-14 2.7e-11 37.2 0.0 164 345 412 604 391 646 0.77 # 28650 # 30734 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 3_52 - 418 TIGR01968 TIGR01968 261 3.2e-06 20.9 0.1 1 2 3.9e-06 0.0013 12.4 0.1 2 39 115 155 114 185 0.85 # 51589 # 52842 # 1 # ID=3_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 3_52 - 418 TIGR01968 TIGR01968 261 3.2e-06 20.9 0.1 2 2 0.00024 0.08 6.5 0.0 103 143 251 291 226 382 0.85 # 51589 # 52842 # 1 # ID=3_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 1_70 - 251 DDE_Tnp_4 PF13359.1 158 3.7e-07 24.5 0.1 1 1 2e-09 6.7e-07 23.6 0.1 6 153 71 230 66 235 0.65 # 55651 # 56403 # 1 # ID=1_70;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 10_2 - 247 AAA_18 PF13238.1 129 0.00069 14.5 1.6 1 2 0.03 10 1.1 0.0 99 121 43 65 20 78 0.76 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 10_2 - 247 AAA_18 PF13238.1 129 0.00069 14.5 1.6 2 2 3.2e-05 0.011 10.7 0.6 1 21 103 123 103 207 0.70 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_62 - 418 IMS_HHH PF11798.3 32 5.1e-06 21.0 0.1 1 1 6.3e-08 2.1e-05 19.0 0.1 8 32 173 197 167 197 0.82 # 50591 # 51844 # -1 # ID=1_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.482 1_70 - 251 DDE_Tnp_1_6 PF13751.1 125 1.1e-08 29.7 0.1 1 1 7.1e-11 2.3e-08 28.7 0.1 62 123 180 238 168 240 0.80 # 55651 # 56403 # 1 # ID=1_70;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 1_66 - 92 HTH_Tnp_IS1 PF12759.2 46 6.7e-31 100.1 0.2 1 1 3.2e-33 1e-30 99.5 0.2 1 46 43 88 43 88 0.99 # 54504 # 54779 # 1 # ID=1_66;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 1_44 - 695 DUF87 PF01935.12 229 0.00057 14.3 0.0 1 1 4e-06 0.0013 13.1 0.0 25 68 200 242 189 278 0.89 # 28650 # 30734 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 1_16 - 447 HTH_28 PF13518.1 52 7.4e-14 46.1 2.0 1 1 1.8e-15 7.4e-14 46.1 2.0 1 52 14 66 14 67 0.96 # 7423 # 8763 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_77 - 468 HTH_28 PF13518.1 52 8.6e-12 39.5 2.6 1 1 3.5e-13 1.4e-11 38.8 1.6 2 48 16 63 15 70 0.93 # 59377 # 60780 # 1 # ID=1_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 10_1 - 508 HTH_28 PF13518.1 52 9.2e-06 20.2 0.2 1 1 1.5e-06 6.2e-05 17.6 0.1 10 35 15 42 7 42 0.83 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 1_1 - 92 HTH_28 PF13518.1 52 5.5e-05 17.7 1.7 1 1 5.7e-06 0.00023 15.7 1.7 22 36 40 54 12 55 0.72 # 1 # 276 # -1 # ID=1_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 9_3 - 254 HTH_28 PF13518.1 52 0.00013 16.5 0.0 1 1 7.5e-06 0.00031 15.3 0.0 4 41 9 48 6 53 0.89 # 1081 # 1842 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 1_66 - 92 HTH_28 PF13518.1 52 0.00029 15.4 0.0 1 1 1.1e-05 0.00044 14.8 0.0 4 35 55 86 53 90 0.90 # 54504 # 54779 # 1 # ID=1_66;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 4_43 - 186 HTH_28 PF13518.1 52 0.00044 14.8 0.0 1 1 3.4e-05 0.0014 13.2 0.0 8 33 154 179 148 184 0.82 # 32252 # 32809 # -1 # ID=4_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 8_8 - 246 HTH_28 PF13518.1 52 0.001 13.7 0.7 1 1 2.5e-05 0.001 13.7 0.7 1 33 175 207 175 209 0.95 # 4946 # 5683 # -1 # ID=8_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.673 10_1 - 508 HTH_12 PF08461.5 66 0.0019 12.6 0.3 1 1 2.5e-05 0.0083 10.5 0.0 14 53 77 118 67 126 0.85 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 10_2 - 247 DnaB_C PF03796.10 259 0.012 9.0 2.5 1 2 0.0002 0.064 6.6 0.0 20 48 101 129 92 143 0.77 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 10_2 - 247 DnaB_C PF03796.10 259 0.012 9.0 2.5 2 2 0.0048 1.6 2.1 0.1 111 144 142 175 138 188 0.79 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 4_29 - 152 MerR-DNA-bind PF09278.6 65 1.1e-20 68.4 1.4 1 1 1.8e-22 2e-20 67.6 1.1 1 65 51 113 51 113 0.95 # 24188 # 24643 # 1 # ID=4_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.610 4_19 - 145 MerR-DNA-bind PF09278.6 65 2.9e-20 67.1 3.1 1 1 3.4e-22 3.7e-20 66.7 3.1 1 65 46 110 46 110 0.98 # 16382 # 16816 # -1 # ID=4_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 4_24 - 122 MerR-DNA-bind PF09278.6 65 0.00062 14.8 6.6 1 1 1e-05 0.0011 14.0 6.6 1 64 47 108 47 109 0.80 # 20900 # 21265 # -1 # ID=4_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.672 10_1 - 508 HTH_24 PF13412.1 48 6e-07 23.4 1.5 1 2 9.3e-07 4.4e-05 17.4 0.1 11 39 12 41 10 42 0.91 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 10_1 - 508 HTH_24 PF13412.1 48 6e-07 23.4 1.5 2 2 0.032 1.5 2.9 0.0 8 43 67 109 60 110 0.77 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 9_3 - 254 HTH_24 PF13412.1 48 1.2e-06 22.5 0.4 1 1 6.6e-08 3.1e-06 21.1 0.2 5 47 7 49 5 50 0.95 # 1081 # 1842 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 4_11 - 99 HTH_24 PF13412.1 48 4.5e-05 17.4 0.0 1 1 1.6e-06 7.5e-05 16.7 0.0 14 36 23 45 17 46 0.86 # 11099 # 11395 # 1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_16 - 447 HTH_24 PF13412.1 48 9.2e-05 16.4 0.2 1 1 3.9e-06 0.00018 15.5 0.2 9 45 16 54 16 54 0.93 # 7423 # 8763 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_77 - 468 HTH_24 PF13412.1 48 0.00088 13.3 0.2 1 1 0.00011 0.0054 10.7 0.1 15 43 25 53 17 55 0.82 # 59377 # 60780 # 1 # ID=1_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 3_53 - 335 HTH_24 PF13412.1 48 0.0016 12.4 0.7 1 1 0.00045 0.021 8.8 0.2 14 39 170 195 165 197 0.87 # 52839 # 53843 # 1 # ID=3_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.374 3_39 - 292 HTH_24 PF13412.1 48 0.003 11.6 0.8 1 1 0.00036 0.017 9.2 0.0 17 39 112 134 108 135 0.91 # 36115 # 36990 # 1 # ID=3_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 10_2 - 247 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 0.0037 11.9 1.9 1 3 0.0075 2.5 2.8 0.2 85 121 19 55 15 57 0.89 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 10_2 - 247 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 0.0037 11.9 1.9 2 3 0.0044 1.4 3.5 0.0 20 38 99 117 85 126 0.85 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 10_2 - 247 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 0.0037 11.9 1.9 3 3 0.0047 1.6 3.4 0.0 98 132 126 160 120 164 0.89 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_16 - 447 HTH_18 PF12833.2 81 0.00071 14.3 0.1 1 2 2.1e-05 0.0069 11.1 0.1 2 33 33 64 32 82 0.91 # 7423 # 8763 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_16 - 447 HTH_18 PF12833.2 81 0.00071 14.3 0.1 2 2 0.091 30 -0.5 0.0 61 76 283 298 251 299 0.79 # 7423 # 8763 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 10_1 - 508 HTH_30 PF13556.1 59 7.2e-05 17.0 0.1 1 1 5.5e-07 0.00018 15.7 0.1 12 48 19 55 17 62 0.91 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 3_21 - 254 TIGR03533 TIGR03533 284 6.7e-06 19.9 0.0 1 1 2.8e-08 9.3e-06 19.4 0.0 119 208 98 184 69 192 0.81 # 14905 # 15666 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 3_21 - 254 TIGR03534 TIGR03534 253 1.6e-10 35.1 0.0 1 1 2.2e-12 2.4e-10 34.6 0.0 74 177 86 186 71 191 0.88 # 14905 # 15666 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 3_58 - 346 TIGR03534 TIGR03534 253 0.0012 12.6 0.0 1 1 1.9e-05 0.002 11.8 0.0 80 128 290 337 280 341 0.85 # 56949 # 57986 # 1 # ID=3_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.384 3_32 - 564 TIGR03534 TIGR03534 253 0.0019 11.9 0.0 1 1 3e-05 0.0033 11.2 0.0 135 175 456 498 444 505 0.74 # 28271 # 29962 # -1 # ID=3_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 10_1 - 508 HTH_10 PF04967.7 53 0.00049 14.3 0.9 1 1 2.5e-06 0.00082 13.6 0.0 22 48 18 44 14 49 0.86 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 4_25 - 562 TIGR01292 TIGR01292 300 4.3e-19 62.7 3.5 1 2 4.9e-06 0.0016 11.5 1.2 2 39 100 137 99 143 0.91 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_25 - 562 TIGR01292 TIGR01292 300 4.3e-19 62.7 3.5 2 2 3.9e-18 1.3e-15 51.2 0.0 143 296 272 425 214 427 0.82 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 11_2 - 167 Ribosomal_S13 PF00416.17 107 0.0012 13.9 0.1 1 1 8e-06 0.0026 12.8 0.1 22 72 7 54 5 81 0.75 # 882 # 1382 # 1 # ID=11_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.493 2_49 - 595 DEAD PF00270.24 169 9.8e-05 16.5 0.7 1 1 3.8e-06 0.0012 12.9 0.7 4 105 8 107 5 222 0.77 # 42806 # 44590 # -1 # ID=2_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 9_4 - 301 NAD_binding_2 PF03446.10 163 1.4e-40 133.3 3.7 1 1 6.4e-43 2.1e-40 132.8 3.7 2 162 5 166 4 167 0.96 # 2105 # 3007 # 1 # ID=9_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 4_11 - 99 HTH_31 PF13560.1 64 1.6e-08 29.3 0.0 1 1 5.7e-11 1.9e-08 29.0 0.0 5 56 17 67 13 77 0.85 # 11099 # 11395 # 1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 2_49 - 595 UvrD_C_2 PF13538.1 104 2.8e-12 41.3 0.0 1 1 4e-14 6.6e-12 40.1 0.0 47 103 496 562 450 563 0.79 # 42806 # 44590 # -1 # ID=2_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 4_4 - 680 UvrD_C_2 PF13538.1 104 6.6e-11 36.9 0.0 1 1 1.4e-12 2.4e-10 35.1 0.0 23 104 505 607 490 607 0.83 # 2958 # 4997 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 3_7 - 203 TIGR00755 TIGR00755 256 8.2e-05 16.2 0.1 1 1 4.8e-07 0.00016 15.3 0.1 32 86 83 139 61 150 0.86 # 4348 # 4956 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.499 3_52 - 418 HTH_OrfB_IS605 PF12323.3 46 0.00082 13.3 0.0 1 2 0.00072 0.24 5.4 0.1 24 38 40 54 40 55 0.89 # 51589 # 52842 # 1 # ID=3_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 3_52 - 418 HTH_OrfB_IS605 PF12323.3 46 0.00082 13.3 0.0 2 2 0.00036 0.12 6.4 0.0 17 37 53 73 52 76 0.85 # 51589 # 52842 # 1 # ID=3_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 10_1 - 508 HTH_36 PF13730.1 55 0.00023 15.9 0.2 1 2 6.1e-05 0.0067 11.2 0.0 12 48 8 42 5 42 0.85 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 10_1 - 508 HTH_36 PF13730.1 55 0.00023 15.9 0.2 2 2 0.038 4.2 2.2 0.0 25 51 74 109 59 110 0.73 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 3_52 - 418 HTH_36 PF13730.1 55 0.00093 13.9 0.1 1 1 2.8e-05 0.003 12.3 0.0 28 54 52 78 31 79 0.91 # 51589 # 52842 # 1 # ID=3_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 3_26 - 363 HTH_36 PF13730.1 55 0.0099 10.6 2.0 1 1 0.00028 0.031 9.1 0.8 6 55 220 273 217 273 0.83 # 21617 # 22705 # -1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.447 3_58 - 346 StbA PF06406.6 318 3e-132 434.9 0.7 1 1 1e-134 3.4e-132 434.7 0.7 1 317 22 340 22 341 0.98 # 56949 # 57986 # 1 # ID=3_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.384 10_2 - 247 NACHT PF05729.7 166 0.0024 12.1 1.5 1 1 4.7e-05 0.015 9.5 0.4 3 24 103 124 101 205 0.90 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 10_2 - 247 AAA_17 PF13207.1 121 7.5e-05 18.1 0.3 1 1 6.5e-07 0.00021 16.7 0.1 2 49 103 154 102 223 0.67 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 10_2 - 247 TIGR03346 TIGR03346 853 0.0017 11.0 0.0 1 1 7.2e-06 0.0024 10.5 0.0 194 220 100 126 86 169 0.88 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 4_25 - 562 FAD_binding_2 PF00890.19 417 3.1e-06 20.8 5.3 1 3 9.5e-09 3.1e-06 20.8 5.3 2 32 101 131 100 138 0.91 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_25 - 562 FAD_binding_2 PF00890.19 417 3.1e-06 20.8 5.3 2 3 0.034 11 -0.8 0.2 142 204 311 366 286 382 0.67 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_25 - 562 FAD_binding_2 PF00890.19 417 3.1e-06 20.8 5.3 3 3 0.0019 0.61 3.4 0.1 373 402 374 405 368 419 0.86 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 2_18 - 214 Bd3614-deam PF14439.1 136 0.00037 15.0 0.1 1 1 1.6e-06 0.00054 14.4 0.1 3 68 47 112 45 122 0.77 # 14342 # 14983 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.483 10_2 - 247 AAA_25 PF13481.1 194 1.1e-05 19.5 0.0 1 2 1.3e-06 0.00021 15.3 0.0 24 58 90 125 76 135 0.82 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 10_2 - 247 AAA_25 PF13481.1 194 1.1e-05 19.5 0.0 2 2 0.021 3.4 1.6 0.0 131 151 150 170 122 173 0.78 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 2_49 - 595 AAA_25 PF13481.1 194 0.0011 12.9 0.0 1 1 3.5e-05 0.0058 10.6 0.0 17 63 3 46 1 62 0.78 # 42806 # 44590 # -1 # ID=2_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 4_4 - 680 Viral_helicase1 PF01443.13 234 6e-11 36.8 0.0 1 3 7.7e-07 0.00013 16.2 0.0 2 60 21 78 20 86 0.84 # 2958 # 4997 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 4_4 - 680 Viral_helicase1 PF01443.13 234 6e-11 36.8 0.0 2 3 0.00023 0.037 8.1 0.0 62 118 209 263 186 343 0.73 # 2958 # 4997 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 4_4 - 680 Viral_helicase1 PF01443.13 234 6e-11 36.8 0.0 3 3 0.0011 0.17 5.9 0.0 213 232 572 606 528 608 0.62 # 2958 # 4997 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 2_49 - 595 Viral_helicase1 PF01443.13 234 9.1e-08 26.4 0.1 1 3 0.0057 0.93 3.5 0.0 2 21 20 39 19 91 0.63 # 42806 # 44590 # -1 # ID=2_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_49 - 595 Viral_helicase1 PF01443.13 234 9.1e-08 26.4 0.1 2 3 0.0086 1.4 2.9 0.0 40 135 167 261 132 297 0.74 # 42806 # 44590 # -1 # ID=2_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_49 - 595 Viral_helicase1 PF01443.13 234 9.1e-08 26.4 0.1 3 3 7e-07 0.00011 16.3 0.0 183 232 494 562 401 563 0.72 # 42806 # 44590 # -1 # ID=2_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 10_2 - 247 RuvB_N PF05496.7 234 7.3e-06 19.7 0.2 1 1 5.2e-08 1.7e-05 18.5 0.1 51 114 101 174 95 223 0.75 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 10_2 - 247 AAA_14 PF13173.1 128 2e-05 19.1 0.1 1 1 1.6e-07 5.1e-05 17.8 0.0 2 96 100 200 99 210 0.70 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 4_16 - 196 Transposase_20 PF02371.11 87 1.4e-24 80.6 0.2 1 1 2.3e-26 2.6e-24 79.8 0.2 2 78 71 147 70 157 0.94 # 14222 # 14809 # -1 # ID=4_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 8_5 - 335 Transposase_20 PF02371.11 87 3.6e-24 79.3 0.2 1 1 7e-26 7.6e-24 78.3 0.2 2 78 210 286 209 296 0.94 # 3241 # 4245 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_17 - 413 Transposase_20 PF02371.11 87 2.9e-17 57.2 0.0 1 1 9.1e-19 1e-16 55.5 0.0 3 87 275 359 273 359 0.94 # 9185 # 10423 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_77 - 468 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.00011 15.9 0.7 1 2 1.8e-05 0.0029 11.4 0.3 19 51 18 51 13 52 0.93 # 59377 # 60780 # 1 # ID=1_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_77 - 468 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.00011 15.9 0.7 2 2 0.016 2.6 1.9 0.0 40 51 109 120 106 121 0.83 # 59377 # 60780 # 1 # ID=1_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_16 - 447 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.00053 13.8 0.1 1 2 7.8e-05 0.013 9.3 0.1 19 51 17 50 12 51 0.93 # 7423 # 8763 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_16 - 447 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.00053 13.8 0.1 2 2 0.019 3.2 1.7 0.0 7 27 66 86 65 90 0.89 # 7423 # 8763 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 4_19 - 145 MerR PF00376.18 38 6.2e-16 52.3 0.1 1 1 1.2e-17 1e-15 51.7 0.1 1 38 4 41 4 41 0.99 # 16382 # 16816 # -1 # ID=4_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 4_29 - 152 MerR PF00376.18 38 3.2e-14 46.8 0.1 1 1 7.9e-16 6.5e-14 45.9 0.1 1 38 9 46 9 46 0.99 # 24188 # 24643 # 1 # ID=4_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.610 4_24 - 122 MerR PF00376.18 38 1.2e-06 22.6 0.1 1 1 2.2e-08 1.8e-06 22.0 0.1 2 38 6 42 5 42 0.89 # 20900 # 21265 # -1 # ID=4_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.672 9_3 - 254 MerR PF00376.18 38 0.0026 11.9 0.3 1 1 0.00025 0.02 9.1 0.1 1 18 21 38 21 53 0.80 # 1081 # 1842 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 10_2 - 247 AAA_33 PF13671.1 143 0.00027 15.4 0.1 1 2 0.072 24 -0.6 0.1 103 122 37 56 6 76 0.58 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 10_2 - 247 AAA_33 PF13671.1 143 0.00027 15.4 0.1 2 2 3.3e-06 0.0011 13.4 0.0 2 19 103 120 103 200 0.77 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 5_13 - 273 ThiS-like PF14453.1 57 0.0026 12.2 0.0 1 1 1.7e-05 0.0055 11.2 0.0 25 54 165 194 146 196 0.94 # 7845 # 8663 # -1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 9_3 - 254 PaaX PF07848.7 70 9.7e-06 20.1 0.2 1 1 5.5e-08 1.8e-05 19.3 0.2 15 68 14 64 10 66 0.85 # 1081 # 1842 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 3_21 - 254 MTS PF05175.9 170 2.4e-08 28.1 0.0 1 1 2.3e-10 3.9e-08 27.4 0.0 35 144 104 205 89 224 0.72 # 14905 # 15666 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 3_32 - 564 MTS PF05175.9 170 1e-06 22.8 0.0 1 1 1.1e-08 1.8e-06 22.0 0.0 94 156 475 532 447 543 0.80 # 28271 # 29962 # -1 # ID=3_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 1_1 - 92 Arg_repressor PF01316.16 70 0.0025 12.0 0.0 1 1 1.1e-05 0.0037 11.4 0.0 23 46 29 52 26 55 0.92 # 1 # 276 # -1 # ID=1_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 2_45 - 353 AAA_2 PF07724.9 171 1.6e-05 19.5 0.0 1 1 1.1e-07 3.7e-05 18.3 0.0 5 83 98 177 95 184 0.74 # 38950 # 40008 # -1 # ID=2_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.408 10_2 - 247 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00033 15.0 0.1 1 2 0.0004 0.13 6.5 0.0 2 30 103 131 102 133 0.83 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 10_2 - 247 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00033 15.0 0.1 2 2 0.00053 0.17 6.1 0.0 89 112 156 178 139 205 0.70 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 4_25 - 562 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 3.4e-06 21.3 2.4 1 2 9.3e-06 0.0015 12.7 0.3 16 50 94 128 80 131 0.87 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_25 - 562 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 3.4e-06 21.3 2.4 2 2 0.00023 0.038 8.1 0.1 19 60 269 310 260 341 0.84 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 9_4 - 301 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 0.00043 14.5 1.6 1 2 8.4e-06 0.0014 12.8 0.1 21 66 5 50 2 62 0.90 # 2105 # 3007 # 1 # ID=9_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 9_4 - 301 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 0.00043 14.5 1.6 2 2 0.056 9.2 0.4 0.2 13 42 84 113 72 117 0.84 # 2105 # 3007 # 1 # ID=9_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 6_5 - 478 DNA_methylase PF00145.12 335 7.3e-79 259.8 0.0 1 1 8.9e-81 1.5e-78 258.8 0.0 1 331 96 457 96 460 0.86 # 3836 # 5269 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.480 5_8 - 476 DNA_methylase PF00145.12 335 1.1e-75 249.4 0.0 1 1 8.4e-78 1.4e-75 249.0 0.0 1 333 92 455 92 457 0.87 # 3366 # 4793 # 1 # ID=5_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 1_67 - 126 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 1.1e-75 246.5 1.5 1 1 3.7e-78 1.2e-75 246.4 1.5 7 131 1 125 1 125 1.00 # 54824 # 55201 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.542 9_4 - 301 3HCDH_N PF02737.13 180 8.2e-07 23.4 0.7 1 1 2.1e-08 3.5e-06 21.3 0.7 1 40 6 45 6 116 0.91 # 2105 # 3007 # 1 # ID=9_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 4_25 - 562 3HCDH_N PF02737.13 180 0.053 7.7 6.6 1 2 0.017 2.8 2.1 2.8 1 30 100 129 100 133 0.93 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_25 - 562 3HCDH_N PF02737.13 180 0.053 7.7 6.6 2 2 0.0006 0.098 6.9 0.1 2 36 273 307 272 359 0.75 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_66 - 92 zinc_ribbon_5 PF13719.1 37 3.7e-05 17.9 2.9 1 1 3.2e-07 0.00011 16.4 2.9 3 36 6 40 5 41 0.83 # 54504 # 54779 # 1 # ID=1_66;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 4_25 - 562 Glyco_transf_4 PF13439.1 177 0.00049 14.4 0.5 1 1 2.7e-06 0.00088 13.6 0.1 13 39 277 303 274 335 0.84 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 18_1 - 185 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 1.4e-52 172.0 0.0 1 1 1e-54 1.7e-52 171.7 0.0 4 139 25 162 23 163 0.99 # 2 # 556 # 1 # ID=18_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.532 1_1 - 92 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 3.6e-09 31.3 0.2 1 1 4.1e-11 6.7e-09 30.4 0.2 4 21 75 92 73 92 0.97 # 1 # 276 # -1 # ID=1_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 4_11 - 99 HTH_26 PF13443.1 63 8.5e-06 20.5 0.0 1 1 4.4e-08 1.4e-05 19.8 0.0 7 55 23 70 20 70 0.92 # 11099 # 11395 # 1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 3_39 - 292 TrfA PF07042.6 282 2.9e-06 20.9 0.0 1 1 1e-08 3.4e-06 20.6 0.0 84 173 77 170 34 231 0.79 # 36115 # 36990 # 1 # ID=3_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 4_20 - 802 RuvA_C PF07499.8 47 0.0049 11.7 0.1 1 1 1.5e-05 0.0049 11.7 0.1 2 23 151 172 150 184 0.87 # 16902 # 19307 # 1 # ID=4_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 1_66 - 92 Zn_Tnp_IS1595 PF12760.2 46 0.00057 14.3 2.3 1 1 3.4e-06 0.0011 13.4 2.3 21 46 8 38 5 38 0.74 # 54504 # 54779 # 1 # ID=1_66;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 9_3 - 254 HTH_11 PF08279.7 55 3.1e-12 40.6 0.3 1 1 5e-14 5.5e-12 39.8 0.3 1 53 6 55 6 57 0.89 # 1081 # 1842 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 10_1 - 508 HTH_11 PF08279.7 55 6.8e-06 20.3 3.7 1 2 4.4e-06 0.00049 14.4 0.1 9 37 13 41 3 47 0.83 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 10_1 - 508 HTH_11 PF08279.7 55 6.8e-06 20.3 3.7 2 2 0.0028 0.31 5.4 0.1 26 42 94 110 66 113 0.82 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 2_15 - 156 HTH_11 PF08279.7 55 1e-05 19.7 0.0 1 1 1.9e-07 2.1e-05 18.7 0.0 4 42 9 49 6 62 0.82 # 12751 # 13218 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.502 4_17 - 308 DDE_Tnp_1_5 PF13737.1 112 3.4e-47 153.9 0.2 1 1 9.2e-49 1.5e-46 151.8 0.0 1 112 19 130 19 130 0.96 # 14892 # 15815 # -1 # ID=4_17;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.541 15_1 - 246 DDE_Tnp_1_5 PF13737.1 112 4.1e-26 85.9 0.1 1 2 6e-27 9.8e-25 81.5 0.0 45 112 1 68 1 68 0.94 # 3 # 740 # 1 # ID=15_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.549 15_1 - 246 DDE_Tnp_1_5 PF13737.1 112 4.1e-26 85.9 0.1 2 2 0.044 7.2 1.4 0.0 42 68 201 229 171 235 0.82 # 3 # 740 # 1 # ID=15_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.549 9_3 - 254 MarR_2 PF12802.2 62 5e-07 23.9 2.4 1 1 1.4e-08 1.2e-06 22.8 0.7 8 54 8 52 5 65 0.92 # 1081 # 1842 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 10_1 - 508 MarR_2 PF12802.2 62 7.5e-05 17.0 0.2 1 2 0.0019 0.16 6.3 0.0 18 40 16 38 12 42 0.80 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 10_1 - 508 MarR_2 PF12802.2 62 7.5e-05 17.0 0.2 2 2 0.00074 0.061 7.7 0.0 5 31 439 463 434 469 0.91 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 4_11 - 99 MarR_2 PF12802.2 62 0.00012 16.3 0.0 1 1 2.2e-06 0.00018 15.7 0.0 15 41 22 46 7 46 0.83 # 11099 # 11395 # 1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 2_15 - 156 MarR_2 PF12802.2 62 0.00079 13.7 0.1 1 1 2.6e-05 0.0021 12.3 0.1 11 47 13 48 5 49 0.84 # 12751 # 13218 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.502 9_3 - 254 HTH_5 PF01022.15 47 6.8e-05 17.1 0.4 1 1 9.3e-07 0.00031 15.0 0.2 7 45 10 49 8 51 0.90 # 1081 # 1842 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 9_3 - 254 TrmB PF01978.14 68 7.6e-05 17.0 0.2 1 1 9.4e-07 0.00016 16.0 0.2 15 54 11 51 10 62 0.90 # 1081 # 1842 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 4_43 - 186 TrmB PF01978.14 68 0.00018 15.8 0.0 1 1 2.3e-06 0.00037 14.8 0.0 19 44 155 180 150 181 0.89 # 32252 # 32809 # -1 # ID=4_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 4_25 - 562 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 2.3e-42 139.7 0.0 1 1 1.6e-44 5.2e-42 138.6 0.0 1 199 100 407 100 409 0.96 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 2_9 - 353 ATP-grasp_4 PF13535.1 184 1.5e-26 87.9 0.0 1 2 0.063 21 -0.6 0.0 107 155 35 77 23 92 0.66 # 6501 # 7559 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.501 2_9 - 353 ATP-grasp_4 PF13535.1 184 1.5e-26 87.9 0.0 2 2 2.3e-28 7.5e-26 85.6 0.0 2 182 114 293 113 296 0.93 # 6501 # 7559 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.501 3_52 - 418 HTH_Crp_2 PF13545.1 76 0.00035 14.9 0.0 1 1 5.3e-06 0.00087 13.7 0.0 21 58 42 79 28 89 0.88 # 51589 # 52842 # 1 # ID=3_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 4_11 - 99 HTH_Crp_2 PF13545.1 76 0.00096 13.5 0.0 1 1 1e-05 0.0017 12.8 0.0 28 48 26 46 20 47 0.93 # 11099 # 11395 # 1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 11_2 - 167 HHH_2 PF12826.2 64 0.00088 13.8 0.1 1 1 7.1e-06 0.0023 12.4 0.0 9 52 6 51 5 60 0.88 # 882 # 1382 # 1 # ID=11_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.493 9_3 - 254 HTH_Mga PF08280.6 59 0.00045 14.6 0.0 1 1 6.2e-06 0.001 13.4 0.0 4 44 4 44 3 50 0.94 # 1081 # 1842 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 10_1 - 508 HTH_Mga PF08280.6 59 0.0035 11.7 0.0 1 2 0.0037 0.61 4.5 0.0 20 42 20 42 12 43 0.87 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 10_1 - 508 HTH_Mga PF08280.6 59 0.0035 11.7 0.0 2 2 0.0068 1.1 3.7 0.0 28 46 92 110 84 113 0.86 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 4_25 - 562 DAO PF01266.19 358 2.2e-11 37.8 7.5 1 2 1.9e-08 6.2e-06 19.9 1.5 2 35 101 134 100 161 0.85 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_25 - 562 DAO PF01266.19 358 2.2e-11 37.8 7.5 2 2 7.7e-09 2.5e-06 21.1 0.5 151 239 314 400 274 529 0.80 # 21283 # 22968 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_60 - 204 LptE PF04390.7 155 6.5e-06 20.5 0.0 1 1 3.5e-08 1.1e-05 19.7 0.0 2 80 8 88 7 126 0.80 # 49018 # 49629 # -1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.466 2_25 - 392 SAC3_GANP PF03399.11 204 0.002 12.3 1.0 1 1 1.2e-05 0.0039 11.3 0.1 43 104 191 252 183 254 0.85 # 21899 # 23074 # 1 # ID=2_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.457 9_3 - 254 DUF1670 PF07900.6 220 0.00035 14.4 0.1 1 1 1.5e-06 0.0005 13.9 0.1 101 203 15 117 7 124 0.79 # 1081 # 1842 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 3_50 - 894 AAA_10 PF12846.2 304 2.8e-65 215.3 0.0 1 1 5e-67 4.1e-65 214.7 0.0 1 303 456 812 456 813 0.93 # 45069 # 47750 # 1 # ID=3_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.423 1_44 - 695 AAA_10 PF12846.2 304 1.1e-16 55.7 0.0 1 1 2.7e-18 2.2e-16 54.7 0.0 2 296 199 578 198 585 0.73 # 28650 # 30734 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 10_2 - 247 AAA_10 PF12846.2 304 0.00039 14.5 0.0 1 1 6.9e-06 0.00057 13.9 0.0 2 33 101 132 100 195 0.92 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 2_49 - 595 AAA_10 PF12846.2 304 0.00093 13.2 0.3 1 1 4.7e-05 0.0038 11.2 0.0 1 25 16 40 16 49 0.80 # 42806 # 44590 # -1 # ID=2_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 9_3 - 254 HTH_20 PF12840.2 61 1.9e-06 22.2 1.5 1 1 5.4e-08 4.5e-06 21.0 0.1 14 57 9 52 7 55 0.93 # 1081 # 1842 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 4_43 - 186 HTH_20 PF12840.2 61 6.6e-06 20.5 0.2 1 2 0.015 1.2 3.6 0.0 33 52 8 27 4 28 0.91 # 32252 # 32809 # -1 # ID=4_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 4_43 - 186 HTH_20 PF12840.2 61 6.6e-06 20.5 0.2 2 2 3.6e-05 0.003 12.0 0.1 3 43 110 177 108 180 0.91 # 32252 # 32809 # -1 # ID=4_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 10_1 - 508 HTH_20 PF12840.2 61 2.8e-05 18.5 0.2 1 2 0.00038 0.031 8.7 0.0 21 46 16 41 10 42 0.92 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 10_1 - 508 HTH_20 PF12840.2 61 2.8e-05 18.5 0.2 2 2 0.0089 0.73 4.3 0.1 10 34 439 463 435 472 0.86 # 220 # 1743 # 1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 2_15 - 156 HTH_20 PF12840.2 61 0.00019 15.8 0.4 1 2 8.7e-05 0.0071 10.8 0.0 19 50 17 48 7 49 0.91 # 12751 # 13218 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.502 2_15 - 156 HTH_20 PF12840.2 61 0.00019 15.8 0.4 2 2 0.036 3 2.4 0.1 7 20 108 121 103 142 0.72 # 12751 # 13218 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.502 3_7 - 203 RrnaAD PF00398.15 262 4.5e-05 17.1 0.0 1 1 2.1e-07 6.9e-05 16.5 0.0 47 92 98 144 80 183 0.85 # 4348 # 4956 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.499 3_21 - 254 Methyltransf_18 PF12847.2 112 6.2e-06 21.4 0.0 1 1 3.5e-08 1.1e-05 20.5 0.0 3 107 102 198 100 203 0.77 # 14905 # 15666 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 3_13 - 157 DnaJ_CXXCXGXG PF00684.14 66 1e-05 20.2 0.8 1 1 1.9e-07 2.1e-05 19.1 0.8 1 31 35 65 18 75 0.67 # 8273 # 8743 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 3_36 - 239 DnaJ_CXXCXGXG PF00684.14 66 1.2e-05 19.9 1.7 1 1 1.8e-07 2e-05 19.2 1.7 36 64 27 54 17 56 0.85 # 33653 # 34369 # -1 # ID=3_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 4_32 - 103 DnaJ_CXXCXGXG PF00684.14 66 1.9e-05 19.3 1.8 1 1 3.3e-05 0.0036 12.0 1.8 17 64 8 57 2 67 0.48 # 26295 # 26603 # 1 # ID=4_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.524 2_49 - 595 UvrD_C PF13361.1 351 5.2e-42 139.1 0.0 1 1 5.9e-44 9.7e-42 138.2 0.0 2 348 254 564 253 567 0.86 # 42806 # 44590 # -1 # ID=2_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 4_4 - 680 UvrD_C PF13361.1 351 9.1e-23 75.8 0.0 1 2 0.0018 0.3 5.0 0.0 74 118 332 377 289 388 0.79 # 2958 # 4997 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 4_4 - 680 UvrD_C PF13361.1 351 9.1e-23 75.8 0.0 2 2 2e-22 3.3e-20 67.4 0.0 290 347 538 607 519 611 0.91 # 2958 # 4997 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 3_21 - 254 Methyltransf_11 PF08241.7 95 0.00071 14.7 0.0 1 1 4.7e-06 0.0015 13.6 0.0 5 86 109 191 105 198 0.82 # 14905 # 15666 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 3_52 - 418 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.9e-09 31.5 0.6 1 2 0.0088 2.9 1.4 0.0 214 274 14 76 6 85 0.80 # 51589 # 52842 # 1 # ID=3_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 3_52 - 418 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.9e-09 31.5 0.6 2 2 2.4e-10 8e-08 26.2 0.1 8 136 122 269 115 274 0.80 # 51589 # 52842 # 1 # ID=3_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 1_66 - 92 DUF2387 PF09526.5 71 0.00058 14.4 0.2 1 1 2.3e-06 0.00074 14.0 0.2 10 47 7 47 5 72 0.76 # 54504 # 54779 # 1 # ID=1_66;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 3_52 - 418 AAA_31 PF13614.1 157 6.5e-08 27.2 0.4 1 2 9.4e-08 3.1e-05 18.5 0.0 9 128 123 270 121 292 0.83 # 51589 # 52842 # 1 # ID=3_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 3_52 - 418 AAA_31 PF13614.1 157 6.5e-08 27.2 0.4 2 2 0.00088 0.29 5.6 0.1 14 89 299 381 284 410 0.72 # 51589 # 52842 # 1 # ID=3_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 7_3 - 280 Pterin_bind PF00809.17 210 8.4e-58 189.7 0.0 1 1 3e-60 1e-57 189.5 0.0 1 210 7 216 7 216 0.98 # 768 # 1607 # -1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.617 10_2 - 247 IstB_IS21 PF01695.12 178 1.1e-65 215.0 0.0 1 1 5.3e-68 1.7e-65 214.3 0.0 2 177 55 230 54 231 0.99 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_77 - 468 FaeA PF04703.7 62 0.00069 14.4 0.1 1 1 8.7e-06 0.0014 13.4 0.1 13 56 25 68 11 72 0.82 # 59377 # 60780 # 1 # ID=1_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 3_6 - 417 FaeA PF04703.7 62 0.0017 13.1 0.1 1 1 2.2e-05 0.0036 12.1 0.1 31 54 59 82 52 87 0.90 # 2927 # 4177 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 4_4 - 680 AAA_11 PF13086.1 236 0.00078 13.6 0.1 1 1 2.1e-05 0.0035 11.5 0.0 17 72 17 67 4 146 0.73 # 2958 # 4997 # -1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 10_2 - 247 AAA_11 PF13086.1 236 0.0033 11.6 0.3 1 2 0.00032 0.053 7.6 0.0 14 41 97 124 48 148 0.83 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 10_2 - 247 AAA_11 PF13086.1 236 0.0033 11.6 0.3 2 2 0.029 4.8 1.2 0.0 184 200 154 169 145 173 0.84 # 1730 # 2470 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 2_47 - 126 SSB PF00436.20 104 0.0017 12.8 0.1 1 2 3.3e-05 0.011 10.2 0.1 2 83 8 87 7 94 0.74 # 41104 # 41481 # -1 # ID=2_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.368 2_47 - 126 SSB PF00436.20 104 0.0017 12.8 0.1 2 2 0.033 11 0.6 0.0 43 60 92 109 88 112 0.83 # 41104 # 41481 # -1 # ID=2_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.368 3_21 - 254 MetW PF07021.7 193 0.00023 15.1 0.0 1 1 2.1e-06 0.00034 14.6 0.0 13 102 100 192 90 202 0.77 # 14905 # 15666 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 3_32 - 564 MetW PF07021.7 193 0.0022 12.0 0.0 1 1 2.3e-05 0.0038 11.2 0.0 18 83 424 487 410 499 0.85 # 28271 # 29962 # -1 # ID=3_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 1_77 - 468 HTH_21 PF13276.1 60 0.00073 14.1 0.0 1 1 2.2e-06 0.00073 14.1 0.0 29 59 99 129 76 130 0.80 # 59377 # 60780 # 1 # ID=1_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/b7df03e3-ec40-49df-9e87-03299456b28c # Target file: checkm_output/bins/pm1039/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm1039/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/b7df03e3-ec40-49df-9e87-03299456b28c checkm_output/bins/pm1039/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 09:33:19 2017 # [ok]